Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VSJ6

Protein Details
Accession A0A409VSJ6    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-37SSSRSNSPEPQVRQNKRKREGVSRKKKEEIVSHydrophilic
59-85AEEQVLSHKERRKKKKEEKLAAKLAESHydrophilic
352-373DGSTRKVKGTPRSNRPKGHSEEBasic
398-437ASAVNSSPKKQRDNKERGGAKPEGVRQKGPKSRPKPGAALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-32NKRKREGVSRKKK
67-95KERRKKKKEEKLAAKLAESGKALKKRKLK
342-369RRGAPKGKSADGSTRKVKGTPRSNRPKG
405-436PKKQRDNKERGGAKPEGVRQKGPKSRPKPGAA
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSSASSSRSNSPEPQVRQNKRKREGVSRKKKEEIVSDDSDSESDNSASEHENDEPSTAEEQVLSHKERRKKKKEEKLAAKLAESGKALKKRKLKDGTAQVVDASSATTKRQNSVWVGNMSYKTTQESLKAFFKGCGEITRIHMPTKAPSGPGMKPENRGFAYVDFATSDAKVAAIALSEQPLLGRKLLIKDGDDFKGRPAAITGNLSFSDPALAHKTHSKTAQKILRAQKQPPAPTLFFGNLGFETTEESIRQLLEAHRLKKKGKEVATDPEDADAKPKEKDNWIRKVRMGTFEDSGLCKGFAFVDFTSVEHATAALINPKNHHLNGRNLVVEYASPDAVRRGAPKGKSADGSTRKVKGTPRSNRPKGHSEETKEADHKPEEDAHTTSEPAVDVAEASAVNSSPKKQRDNKERGGAKPEGVRQKGPKSRPKPGAALALAKRESAAIVPSQGQKITF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.63
3 0.67
4 0.72
5 0.78
6 0.83
7 0.84
8 0.83
9 0.86
10 0.83
11 0.83
12 0.84
13 0.85
14 0.86
15 0.86
16 0.86
17 0.84
18 0.83
19 0.77
20 0.75
21 0.72
22 0.68
23 0.62
24 0.57
25 0.51
26 0.46
27 0.39
28 0.31
29 0.25
30 0.19
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.18
40 0.18
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.12
49 0.17
50 0.21
51 0.23
52 0.28
53 0.35
54 0.44
55 0.54
56 0.65
57 0.69
58 0.76
59 0.83
60 0.87
61 0.91
62 0.94
63 0.94
64 0.93
65 0.92
66 0.82
67 0.72
68 0.66
69 0.56
70 0.49
71 0.39
72 0.34
73 0.32
74 0.39
75 0.43
76 0.45
77 0.52
78 0.55
79 0.64
80 0.68
81 0.67
82 0.68
83 0.73
84 0.74
85 0.68
86 0.62
87 0.52
88 0.43
89 0.36
90 0.26
91 0.17
92 0.1
93 0.08
94 0.1
95 0.15
96 0.16
97 0.18
98 0.2
99 0.24
100 0.27
101 0.32
102 0.36
103 0.32
104 0.33
105 0.35
106 0.35
107 0.32
108 0.28
109 0.24
110 0.2
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.21
115 0.23
116 0.26
117 0.28
118 0.26
119 0.26
120 0.26
121 0.24
122 0.22
123 0.21
124 0.19
125 0.19
126 0.22
127 0.28
128 0.28
129 0.26
130 0.27
131 0.26
132 0.26
133 0.3
134 0.27
135 0.21
136 0.23
137 0.27
138 0.26
139 0.32
140 0.36
141 0.33
142 0.37
143 0.39
144 0.41
145 0.37
146 0.37
147 0.32
148 0.25
149 0.26
150 0.2
151 0.18
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.12
175 0.15
176 0.16
177 0.14
178 0.17
179 0.21
180 0.22
181 0.23
182 0.21
183 0.19
184 0.22
185 0.21
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.16
191 0.15
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.16
204 0.19
205 0.2
206 0.27
207 0.29
208 0.28
209 0.36
210 0.4
211 0.38
212 0.44
213 0.5
214 0.52
215 0.53
216 0.52
217 0.5
218 0.51
219 0.5
220 0.45
221 0.42
222 0.33
223 0.3
224 0.3
225 0.24
226 0.2
227 0.18
228 0.15
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.16
244 0.22
245 0.26
246 0.3
247 0.35
248 0.37
249 0.41
250 0.47
251 0.46
252 0.45
253 0.46
254 0.45
255 0.5
256 0.52
257 0.48
258 0.41
259 0.34
260 0.31
261 0.25
262 0.24
263 0.18
264 0.15
265 0.15
266 0.18
267 0.19
268 0.26
269 0.37
270 0.42
271 0.5
272 0.55
273 0.57
274 0.57
275 0.62
276 0.57
277 0.54
278 0.49
279 0.41
280 0.36
281 0.33
282 0.32
283 0.26
284 0.23
285 0.16
286 0.13
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.1
292 0.09
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.1
300 0.1
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.12
305 0.15
306 0.16
307 0.18
308 0.22
309 0.25
310 0.26
311 0.32
312 0.3
313 0.36
314 0.4
315 0.42
316 0.39
317 0.35
318 0.35
319 0.28
320 0.23
321 0.17
322 0.13
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.13
330 0.18
331 0.24
332 0.26
333 0.32
334 0.35
335 0.37
336 0.39
337 0.39
338 0.43
339 0.43
340 0.48
341 0.48
342 0.48
343 0.46
344 0.47
345 0.51
346 0.51
347 0.55
348 0.59
349 0.64
350 0.7
351 0.78
352 0.81
353 0.81
354 0.8
355 0.77
356 0.76
357 0.74
358 0.69
359 0.69
360 0.66
361 0.65
362 0.58
363 0.53
364 0.49
365 0.43
366 0.37
367 0.31
368 0.33
369 0.31
370 0.32
371 0.32
372 0.3
373 0.29
374 0.29
375 0.26
376 0.21
377 0.17
378 0.13
379 0.12
380 0.08
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.09
389 0.11
390 0.16
391 0.23
392 0.3
393 0.39
394 0.48
395 0.59
396 0.67
397 0.75
398 0.81
399 0.83
400 0.84
401 0.79
402 0.77
403 0.69
404 0.63
405 0.6
406 0.58
407 0.58
408 0.54
409 0.56
410 0.56
411 0.64
412 0.69
413 0.71
414 0.74
415 0.73
416 0.79
417 0.82
418 0.81
419 0.77
420 0.73
421 0.73
422 0.65
423 0.65
424 0.59
425 0.58
426 0.52
427 0.45
428 0.4
429 0.31
430 0.28
431 0.2
432 0.19
433 0.13
434 0.15
435 0.2
436 0.24
437 0.27