Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409W8T1

Protein Details
Accession A0A409W8T1    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-132VEIAKPSEQKDKEKKEKKAKRRPGRRGSKAVPGEBasic
151-178PESGDAAKPKKKKKKATRKAKKAAAEGTBasic
193-216GEGAVKKPRTRKPKVTRPPRAAGEBasic
252-273VVSARIVRRRWGKPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-128QKDKEKKEKKAKRRPGRRGSKA
156-173AAKPKKKKKKATRKAKKA
197-212VKKPRTRKPKVTRPPR
259-269RRRWGKPRKSK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 10.333, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025239  DUF4187  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13821  DUF4187  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAQAATVTENGAPVRQEKVEETPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVASDILSAQVIQRGNRSAGYGFVALATEEAAKKAVEALNKKELDGRAVIVEIAKPSEQKDKEKKEKKAKRRPGRRGSKAVPGEVSEAEANGEAPKPEGEAAPESGDAAKPKKKKKKATRKAKKAAAEGTTDAAASATEGEAANGEGAVKKPRTRKPKVTRPPRAAGEDPAGEPSKTMLFVANLGFSVDDAGLSALFTEAGINVVSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDVGSEEEQQKAIAALEGKEVGGRPIAVKIALKNEQNRTKSRRQREVEAREEALSKSLFERAKEEEAAGIGSGNKALSIMMKMGFKPGQSLGNADPLEEPAESRPEDSTGSLSPAPAPASAAGTESKGPDERTSSPSPGADLEGQQQHVTTTTTTTTHTKHKTEPLPLHEWAGKKGIGLGKRARSPGVVERLAKMAKMAEDTTHRDFRERARDEYKNRQAEGRLGPAQLTCRTLDEQAGKSFNVLWLNPNNQETFPAGLIDALTMHSNLAVTNEHQGDSIQARLRKQMQEDALQPIDPDALTSVPDSNSLSGSGQMKSSSSAAVRAEDQFSPELLEEATQFLRLQAQDRLHLVLSYLREKHYYCFWCGIKYDSEEELQSQCPGTEEDDHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.18
4 0.18
5 0.2
6 0.22
7 0.28
8 0.35
9 0.37
10 0.39
11 0.4
12 0.4
13 0.4
14 0.36
15 0.31
16 0.22
17 0.25
18 0.23
19 0.19
20 0.18
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.19
25 0.14
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.12
46 0.14
47 0.15
48 0.19
49 0.21
50 0.22
51 0.23
52 0.25
53 0.21
54 0.2
55 0.22
56 0.19
57 0.15
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.13
70 0.15
71 0.2
72 0.25
73 0.31
74 0.4
75 0.4
76 0.41
77 0.42
78 0.4
79 0.36
80 0.32
81 0.28
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.14
86 0.15
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.15
92 0.24
93 0.28
94 0.36
95 0.46
96 0.55
97 0.65
98 0.74
99 0.82
100 0.84
101 0.9
102 0.91
103 0.92
104 0.93
105 0.93
106 0.94
107 0.95
108 0.95
109 0.95
110 0.93
111 0.92
112 0.85
113 0.84
114 0.77
115 0.69
116 0.6
117 0.5
118 0.43
119 0.33
120 0.31
121 0.21
122 0.16
123 0.14
124 0.12
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.18
144 0.24
145 0.3
146 0.41
147 0.51
148 0.6
149 0.7
150 0.79
151 0.85
152 0.89
153 0.93
154 0.94
155 0.94
156 0.95
157 0.92
158 0.87
159 0.82
160 0.78
161 0.69
162 0.61
163 0.51
164 0.42
165 0.33
166 0.26
167 0.2
168 0.13
169 0.1
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.07
183 0.12
184 0.14
185 0.19
186 0.28
187 0.37
188 0.47
189 0.55
190 0.65
191 0.7
192 0.79
193 0.85
194 0.88
195 0.9
196 0.88
197 0.86
198 0.8
199 0.75
200 0.66
201 0.58
202 0.51
203 0.42
204 0.34
205 0.3
206 0.26
207 0.2
208 0.18
209 0.16
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.1
244 0.11
245 0.17
246 0.26
247 0.34
248 0.45
249 0.55
250 0.64
251 0.7
252 0.81
253 0.85
254 0.83
255 0.8
256 0.78
257 0.75
258 0.67
259 0.58
260 0.48
261 0.38
262 0.31
263 0.28
264 0.2
265 0.14
266 0.11
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.13
291 0.17
292 0.2
293 0.24
294 0.31
295 0.38
296 0.41
297 0.46
298 0.49
299 0.55
300 0.61
301 0.65
302 0.68
303 0.64
304 0.69
305 0.73
306 0.74
307 0.69
308 0.63
309 0.55
310 0.46
311 0.44
312 0.34
313 0.26
314 0.18
315 0.12
316 0.1
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.16
321 0.17
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.09
329 0.07
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.13
350 0.16
351 0.14
352 0.2
353 0.19
354 0.18
355 0.17
356 0.15
357 0.16
358 0.13
359 0.13
360 0.07
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.1
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.15
391 0.18
392 0.23
393 0.26
394 0.26
395 0.26
396 0.25
397 0.25
398 0.21
399 0.2
400 0.15
401 0.12
402 0.15
403 0.16
404 0.16
405 0.15
406 0.15
407 0.13
408 0.13
409 0.13
410 0.09
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.12
415 0.15
416 0.17
417 0.24
418 0.29
419 0.31
420 0.35
421 0.42
422 0.45
423 0.5
424 0.54
425 0.52
426 0.52
427 0.49
428 0.48
429 0.42
430 0.38
431 0.32
432 0.29
433 0.23
434 0.17
435 0.21
436 0.22
437 0.21
438 0.25
439 0.3
440 0.33
441 0.37
442 0.38
443 0.35
444 0.32
445 0.33
446 0.35
447 0.36
448 0.34
449 0.31
450 0.31
451 0.35
452 0.34
453 0.3
454 0.23
455 0.17
456 0.14
457 0.15
458 0.14
459 0.13
460 0.17
461 0.23
462 0.28
463 0.32
464 0.31
465 0.31
466 0.32
467 0.37
468 0.44
469 0.42
470 0.43
471 0.46
472 0.54
473 0.58
474 0.67
475 0.7
476 0.65
477 0.62
478 0.59
479 0.53
480 0.52
481 0.49
482 0.44
483 0.38
484 0.32
485 0.32
486 0.29
487 0.31
488 0.26
489 0.24
490 0.18
491 0.18
492 0.19
493 0.19
494 0.23
495 0.24
496 0.26
497 0.28
498 0.29
499 0.26
500 0.25
501 0.25
502 0.23
503 0.21
504 0.18
505 0.19
506 0.22
507 0.26
508 0.29
509 0.3
510 0.29
511 0.26
512 0.28
513 0.25
514 0.22
515 0.18
516 0.15
517 0.13
518 0.11
519 0.11
520 0.09
521 0.08
522 0.06
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.08
531 0.08
532 0.14
533 0.15
534 0.15
535 0.16
536 0.16
537 0.17
538 0.17
539 0.21
540 0.21
541 0.23
542 0.25
543 0.32
544 0.38
545 0.4
546 0.42
547 0.44
548 0.43
549 0.46
550 0.47
551 0.47
552 0.42
553 0.37
554 0.33
555 0.26
556 0.22
557 0.17
558 0.14
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.11
564 0.1
565 0.12
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.14
570 0.13
571 0.15
572 0.17
573 0.17
574 0.17
575 0.16
576 0.16
577 0.17
578 0.17
579 0.16
580 0.15
581 0.18
582 0.18
583 0.19
584 0.21
585 0.22
586 0.24
587 0.22
588 0.24
589 0.21
590 0.2
591 0.19
592 0.17
593 0.15
594 0.12
595 0.12
596 0.1
597 0.12
598 0.12
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.16
603 0.17
604 0.19
605 0.23
606 0.25
607 0.28
608 0.3
609 0.32
610 0.28
611 0.27
612 0.25
613 0.23
614 0.24
615 0.27
616 0.28
617 0.28
618 0.31
619 0.32
620 0.34
621 0.39
622 0.39
623 0.36
624 0.42
625 0.42
626 0.43
627 0.43
628 0.44
629 0.39
630 0.39
631 0.39
632 0.33
633 0.33
634 0.3
635 0.31
636 0.3
637 0.26
638 0.23
639 0.2
640 0.18
641 0.17
642 0.17
643 0.18