Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YTV5

Protein Details
Accession A0A409YTV5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-37FPGSMSSSSKRRKPARGPSRSDRSENKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-32KRRKPARGPSRSDR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047126  RNF141-like  
IPR027370  Znf-RING_euk  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13445  zf-RING_UBOX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16449  RING-HC  
Amino Acid Sequences MARDKPLPVFPGSMSSSSKRRKPARGPSRSDRSENKKSMFTQPATTRSFPPAPSRIHESEAGPSFVPSHRKLQSLSSGLRPSRLENYSKADFHPAEPGEYIPDNRDASNASQPVEYAHMKKEVATLKEEVQDLKKLSRTYIKKYDETKSELAAVLSMLQDKEVELAVMQERSTTNIELLSSIETSIQCQICMELPQNPFSLSPCGHILCLSCLREWFRKAPPTLDSMDMDPEELSDPHFVLMRTKSCPSCRAVVRYRPAPVFMIKAVVSALKKSKPPLPGHLELPVEEDATDYDKNNPWKGIFPSSDEESMDDASEGSAEDFALNTYYSEDDEDLQEELFRMYNRHGAEVPPTMYADSTSDSDNANGSARDYDDEAQSALDDDERNGNHVFLGDSEEEELDYVLPRWTPPTVEIDARSYDISEMNPVHIKLLQRGCTWEMLQNYDISYSHRLGIIVSLHSLDQLYASDDDNDGDSQVDGMNRVFLGWNITLERHDLDGESYMSKVLEDMKENPARWILRPRRGVRGAVDARQLVPADEVIEYQSTDTEVWLDAEPEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.4
4 0.46
5 0.52
6 0.56
7 0.62
8 0.69
9 0.75
10 0.82
11 0.83
12 0.85
13 0.88
14 0.88
15 0.9
16 0.86
17 0.82
18 0.81
19 0.79
20 0.79
21 0.78
22 0.72
23 0.68
24 0.66
25 0.68
26 0.67
27 0.6
28 0.59
29 0.57
30 0.61
31 0.6
32 0.59
33 0.53
34 0.51
35 0.52
36 0.46
37 0.48
38 0.47
39 0.45
40 0.47
41 0.52
42 0.48
43 0.47
44 0.47
45 0.41
46 0.41
47 0.4
48 0.37
49 0.29
50 0.26
51 0.25
52 0.26
53 0.31
54 0.26
55 0.31
56 0.33
57 0.36
58 0.37
59 0.41
60 0.45
61 0.45
62 0.45
63 0.45
64 0.49
65 0.46
66 0.49
67 0.45
68 0.4
69 0.41
70 0.42
71 0.38
72 0.35
73 0.42
74 0.43
75 0.43
76 0.41
77 0.41
78 0.38
79 0.35
80 0.39
81 0.32
82 0.29
83 0.28
84 0.27
85 0.23
86 0.23
87 0.23
88 0.17
89 0.21
90 0.21
91 0.2
92 0.21
93 0.19
94 0.21
95 0.28
96 0.27
97 0.23
98 0.22
99 0.22
100 0.22
101 0.25
102 0.24
103 0.19
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.23
108 0.29
109 0.3
110 0.29
111 0.3
112 0.29
113 0.28
114 0.32
115 0.32
116 0.28
117 0.25
118 0.28
119 0.27
120 0.28
121 0.29
122 0.26
123 0.29
124 0.36
125 0.38
126 0.42
127 0.5
128 0.52
129 0.55
130 0.59
131 0.63
132 0.59
133 0.6
134 0.53
135 0.44
136 0.4
137 0.34
138 0.29
139 0.22
140 0.16
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.12
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.16
181 0.17
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.19
187 0.21
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.19
197 0.18
198 0.16
199 0.17
200 0.21
201 0.25
202 0.28
203 0.29
204 0.31
205 0.36
206 0.37
207 0.38
208 0.36
209 0.35
210 0.34
211 0.31
212 0.26
213 0.2
214 0.2
215 0.17
216 0.15
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.08
227 0.11
228 0.14
229 0.15
230 0.17
231 0.21
232 0.24
233 0.25
234 0.28
235 0.27
236 0.3
237 0.31
238 0.36
239 0.39
240 0.44
241 0.47
242 0.47
243 0.48
244 0.42
245 0.4
246 0.34
247 0.29
248 0.23
249 0.18
250 0.16
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.14
259 0.16
260 0.18
261 0.23
262 0.28
263 0.3
264 0.36
265 0.4
266 0.4
267 0.39
268 0.41
269 0.36
270 0.29
271 0.29
272 0.22
273 0.15
274 0.12
275 0.11
276 0.07
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.1
281 0.14
282 0.17
283 0.18
284 0.19
285 0.17
286 0.2
287 0.22
288 0.25
289 0.22
290 0.23
291 0.25
292 0.26
293 0.26
294 0.22
295 0.21
296 0.16
297 0.16
298 0.12
299 0.09
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.16
334 0.15
335 0.18
336 0.2
337 0.2
338 0.16
339 0.16
340 0.14
341 0.13
342 0.13
343 0.11
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.12
371 0.12
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.08
379 0.12
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.17
398 0.19
399 0.21
400 0.23
401 0.23
402 0.24
403 0.24
404 0.22
405 0.17
406 0.15
407 0.14
408 0.12
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.17
413 0.17
414 0.17
415 0.18
416 0.19
417 0.23
418 0.29
419 0.3
420 0.29
421 0.33
422 0.33
423 0.34
424 0.34
425 0.31
426 0.26
427 0.26
428 0.25
429 0.22
430 0.21
431 0.19
432 0.18
433 0.17
434 0.19
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.15
440 0.18
441 0.17
442 0.14
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.09
449 0.07
450 0.07
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.13
458 0.12
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.13
473 0.12
474 0.14
475 0.15
476 0.16
477 0.16
478 0.18
479 0.19
480 0.15
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.15
485 0.16
486 0.14
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.14
493 0.15
494 0.18
495 0.22
496 0.3
497 0.37
498 0.37
499 0.39
500 0.4
501 0.39
502 0.4
503 0.48
504 0.48
505 0.52
506 0.61
507 0.63
508 0.67
509 0.69
510 0.69
511 0.62
512 0.63
513 0.59
514 0.54
515 0.55
516 0.47
517 0.43
518 0.42
519 0.38
520 0.28
521 0.23
522 0.19
523 0.15
524 0.13
525 0.13
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.11
537 0.12
538 0.12