Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VIM3

Protein Details
Accession A0A409VIM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-185IPLSHISPPSRQRRRRRLPGAPDSDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-175RRRRR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7.5, cyto_mito 7, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022775  AP_mu_sigma_su  
IPR000804  Clathrin_sm-chain_CS  
IPR010770  Ecd  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030117  C:membrane coat  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF01217  Clat_adaptor_s  
PF07093  SGT1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00989  CLAT_ADAPTOR_S  
Amino Acid Sequences MKQGAGPRFLPWSCTTMDIFNRPHSIADDTLVYTIYPPENASDRPSVISLAASISSYVESLLPNFIWHRDKFEVKLAQNPDGEGWVLESRMRIGDCVDDEWLAVWLLKQISSRWDLVISTYDSDGEFLLIEAAEALPSWVQPSNSENRVWIYNSRLHLIPLSHISPPSRQRRRRRLPGAPDSDDDVDIHHEDFISVQDAIKLVRDPSVETLAPAEVENLVWHRISGYPEAAKTHLHVTKAYLPIDISKALISNPGLVQKAVEAFYTRDAIQLRAAHRMSRFPPDKSVLTSVRMTRTAYAQLQGQKFFPPKIFGQWKEKEGTKEWRWRDVGMKIVGRILHNTFVSQSHVRNRLWASRCFTKKVKAVEVPKTSPKTAYAEASKEALRRDPDYQTYIKNLVSAGYFKGEVEGSELWKQLENKAATTYIEVRRTDDATRQSFASQVDDALASNNLADHLDLEEDSDDWLNVDAEQFERMLEDAQRHPKAKAADKDSNAMDVDTNSQVSEEDRVASQQAKQLKELASKVEGFIQGQGELEGALFEDEKASDDELFSEEEDLSASESEPETPPQTQEARSAEAQAAMDKLVPPLEPSDYGKMPPSFHSASQRVAPTNIYTEVIEESGKDQSADKTQRKPVRPPIIPRDKYDGVDSDDESDEENMEDDESDEDRPQVVGEVEIDMAEEEEEFLEFSRQALGISDEQWADIIKDRKERNAFLPASAMKPTAGAKKASEKGEKSEARTHIPRVPEPGPRPNVNPNLDSFEAVMKALDEALATTKQTAPAANKDAKGKGKEKARDENPMDVDTEDIEAAMDRELKSALEGYESDSEQPSDYGNNLVEREHLRCFSAVNTSGVSRLTKFYTPLHQSPQSVVQKIFSLVSTRPAGLCNFLDAPELEEFLGFKGDEDERWRVVYRNYATLYFVFVVDGSESELGILDLIQVFVESLDRAFENVCELDLVFHFDEVHHILGEIIQGGLVLETNVEEIDVAVQEAARTRKESFSSSNPLSLGGGGIGARGGNITTPLGWLTGKLTGVGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.28
4 0.33
5 0.36
6 0.37
7 0.4
8 0.43
9 0.4
10 0.4
11 0.36
12 0.35
13 0.28
14 0.27
15 0.24
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.16
20 0.13
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.12
25 0.15
26 0.19
27 0.21
28 0.25
29 0.26
30 0.26
31 0.27
32 0.27
33 0.25
34 0.21
35 0.2
36 0.16
37 0.13
38 0.12
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.12
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.19
53 0.25
54 0.25
55 0.31
56 0.35
57 0.39
58 0.4
59 0.47
60 0.51
61 0.46
62 0.54
63 0.51
64 0.51
65 0.47
66 0.45
67 0.37
68 0.3
69 0.28
70 0.2
71 0.18
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.16
78 0.16
79 0.13
80 0.13
81 0.17
82 0.18
83 0.19
84 0.19
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.15
89 0.11
90 0.09
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.19
98 0.23
99 0.24
100 0.21
101 0.22
102 0.2
103 0.21
104 0.24
105 0.2
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.14
112 0.1
113 0.08
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.07
126 0.09
127 0.1
128 0.12
129 0.17
130 0.24
131 0.27
132 0.28
133 0.27
134 0.28
135 0.3
136 0.31
137 0.29
138 0.27
139 0.3
140 0.31
141 0.33
142 0.31
143 0.29
144 0.29
145 0.26
146 0.25
147 0.24
148 0.24
149 0.22
150 0.24
151 0.25
152 0.29
153 0.38
154 0.46
155 0.52
156 0.59
157 0.68
158 0.78
159 0.87
160 0.91
161 0.92
162 0.91
163 0.91
164 0.92
165 0.89
166 0.82
167 0.73
168 0.66
169 0.58
170 0.48
171 0.37
172 0.27
173 0.21
174 0.18
175 0.16
176 0.12
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.1
190 0.13
191 0.13
192 0.14
193 0.17
194 0.22
195 0.2
196 0.19
197 0.2
198 0.17
199 0.17
200 0.15
201 0.12
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.14
212 0.16
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.23
217 0.23
218 0.21
219 0.2
220 0.25
221 0.24
222 0.23
223 0.22
224 0.25
225 0.31
226 0.34
227 0.33
228 0.27
229 0.24
230 0.25
231 0.26
232 0.23
233 0.16
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.14
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.19
258 0.22
259 0.22
260 0.27
261 0.28
262 0.28
263 0.29
264 0.34
265 0.32
266 0.38
267 0.41
268 0.35
269 0.4
270 0.41
271 0.42
272 0.39
273 0.43
274 0.35
275 0.34
276 0.36
277 0.33
278 0.32
279 0.32
280 0.3
281 0.25
282 0.25
283 0.26
284 0.24
285 0.22
286 0.23
287 0.28
288 0.29
289 0.3
290 0.28
291 0.28
292 0.29
293 0.3
294 0.27
295 0.25
296 0.23
297 0.31
298 0.39
299 0.38
300 0.45
301 0.48
302 0.49
303 0.49
304 0.52
305 0.46
306 0.44
307 0.49
308 0.47
309 0.52
310 0.51
311 0.55
312 0.53
313 0.51
314 0.51
315 0.44
316 0.43
317 0.39
318 0.38
319 0.3
320 0.31
321 0.31
322 0.26
323 0.26
324 0.21
325 0.19
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.15
330 0.19
331 0.19
332 0.21
333 0.25
334 0.3
335 0.3
336 0.34
337 0.35
338 0.4
339 0.42
340 0.44
341 0.43
342 0.46
343 0.49
344 0.5
345 0.51
346 0.49
347 0.51
348 0.5
349 0.51
350 0.5
351 0.53
352 0.57
353 0.6
354 0.57
355 0.58
356 0.56
357 0.5
358 0.44
359 0.39
360 0.34
361 0.3
362 0.3
363 0.26
364 0.24
365 0.25
366 0.26
367 0.25
368 0.22
369 0.21
370 0.21
371 0.2
372 0.21
373 0.23
374 0.25
375 0.26
376 0.29
377 0.3
378 0.28
379 0.28
380 0.28
381 0.24
382 0.21
383 0.18
384 0.15
385 0.13
386 0.13
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.14
399 0.13
400 0.16
401 0.16
402 0.15
403 0.22
404 0.2
405 0.19
406 0.19
407 0.2
408 0.17
409 0.19
410 0.23
411 0.2
412 0.25
413 0.24
414 0.25
415 0.26
416 0.28
417 0.27
418 0.26
419 0.28
420 0.26
421 0.27
422 0.25
423 0.24
424 0.24
425 0.23
426 0.2
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.09
465 0.13
466 0.21
467 0.24
468 0.25
469 0.25
470 0.28
471 0.32
472 0.36
473 0.38
474 0.39
475 0.42
476 0.42
477 0.45
478 0.41
479 0.38
480 0.31
481 0.25
482 0.17
483 0.11
484 0.12
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.09
499 0.11
500 0.16
501 0.16
502 0.17
503 0.2
504 0.21
505 0.23
506 0.23
507 0.21
508 0.18
509 0.18
510 0.17
511 0.16
512 0.15
513 0.12
514 0.12
515 0.11
516 0.09
517 0.08
518 0.08
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.04
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.13
555 0.15
556 0.14
557 0.19
558 0.19
559 0.21
560 0.2
561 0.21
562 0.18
563 0.17
564 0.16
565 0.12
566 0.11
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.08
576 0.09
577 0.11
578 0.14
579 0.14
580 0.15
581 0.19
582 0.19
583 0.19
584 0.19
585 0.23
586 0.21
587 0.23
588 0.29
589 0.27
590 0.27
591 0.3
592 0.3
593 0.25
594 0.24
595 0.23
596 0.17
597 0.17
598 0.16
599 0.13
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.1
604 0.09
605 0.07
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.09
612 0.17
613 0.26
614 0.29
615 0.35
616 0.43
617 0.51
618 0.55
619 0.61
620 0.63
621 0.65
622 0.66
623 0.67
624 0.69
625 0.73
626 0.71
627 0.66
628 0.64
629 0.56
630 0.51
631 0.45
632 0.37
633 0.29
634 0.28
635 0.25
636 0.2
637 0.18
638 0.17
639 0.15
640 0.13
641 0.1
642 0.08
643 0.08
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.06
649 0.07
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.05
665 0.05
666 0.04
667 0.04
668 0.03
669 0.03
670 0.03
671 0.03
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.09
681 0.09
682 0.1
683 0.12
684 0.11
685 0.11
686 0.11
687 0.1
688 0.08
689 0.13
690 0.17
691 0.18
692 0.26
693 0.27
694 0.35
695 0.39
696 0.41
697 0.4
698 0.45
699 0.42
700 0.35
701 0.39
702 0.33
703 0.3
704 0.29
705 0.25
706 0.15
707 0.16
708 0.18
709 0.19
710 0.2
711 0.2
712 0.21
713 0.29
714 0.35
715 0.39
716 0.43
717 0.39
718 0.41
719 0.49
720 0.5
721 0.47
722 0.49
723 0.46
724 0.46
725 0.48
726 0.47
727 0.41
728 0.43
729 0.39
730 0.38
731 0.39
732 0.41
733 0.42
734 0.47
735 0.49
736 0.47
737 0.5
738 0.51
739 0.56
740 0.51
741 0.47
742 0.4
743 0.4
744 0.38
745 0.35
746 0.27
747 0.2
748 0.17
749 0.16
750 0.14
751 0.08
752 0.07
753 0.07
754 0.06
755 0.04
756 0.04
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.09
761 0.1
762 0.12
763 0.13
764 0.15
765 0.17
766 0.22
767 0.28
768 0.31
769 0.33
770 0.35
771 0.4
772 0.44
773 0.47
774 0.45
775 0.45
776 0.5
777 0.55
778 0.58
779 0.62
780 0.6
781 0.64
782 0.63
783 0.64
784 0.57
785 0.51
786 0.45
787 0.34
788 0.3
789 0.21
790 0.18
791 0.11
792 0.08
793 0.07
794 0.06
795 0.06
796 0.07
797 0.09
798 0.08
799 0.09
800 0.09
801 0.09
802 0.1
803 0.11
804 0.11
805 0.1
806 0.1
807 0.13
808 0.16
809 0.16
810 0.17
811 0.16
812 0.17
813 0.15
814 0.15
815 0.12
816 0.1
817 0.11
818 0.12
819 0.12
820 0.14
821 0.14
822 0.14
823 0.17
824 0.18
825 0.21
826 0.22
827 0.21
828 0.2
829 0.2
830 0.21
831 0.19
832 0.23
833 0.22
834 0.2
835 0.21
836 0.19
837 0.2
838 0.21
839 0.21
840 0.16
841 0.16
842 0.18
843 0.19
844 0.21
845 0.24
846 0.31
847 0.37
848 0.4
849 0.45
850 0.46
851 0.46
852 0.46
853 0.52
854 0.49
855 0.45
856 0.41
857 0.35
858 0.33
859 0.33
860 0.3
861 0.21
862 0.18
863 0.16
864 0.21
865 0.21
866 0.21
867 0.2
868 0.21
869 0.21
870 0.22
871 0.21
872 0.19
873 0.18
874 0.18
875 0.19
876 0.17
877 0.19
878 0.16
879 0.16
880 0.12
881 0.12
882 0.11
883 0.1
884 0.12
885 0.08
886 0.08
887 0.11
888 0.12
889 0.14
890 0.2
891 0.23
892 0.23
893 0.26
894 0.27
895 0.26
896 0.28
897 0.35
898 0.33
899 0.36
900 0.37
901 0.35
902 0.36
903 0.34
904 0.34
905 0.26
906 0.23
907 0.15
908 0.13
909 0.13
910 0.11
911 0.11
912 0.09
913 0.08
914 0.08
915 0.08
916 0.08
917 0.07
918 0.06
919 0.06
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.06
928 0.05
929 0.05
930 0.07
931 0.07
932 0.08
933 0.09
934 0.09
935 0.12
936 0.12
937 0.12
938 0.11
939 0.11
940 0.12
941 0.12
942 0.17
943 0.14
944 0.14
945 0.14
946 0.13
947 0.17
948 0.17
949 0.18
950 0.12
951 0.12
952 0.12
953 0.12
954 0.13
955 0.1
956 0.07
957 0.05
958 0.05
959 0.05
960 0.05
961 0.05
962 0.04
963 0.04
964 0.04
965 0.05
966 0.05
967 0.05
968 0.04
969 0.04
970 0.06
971 0.06
972 0.06
973 0.06
974 0.06
975 0.07
976 0.12
977 0.15
978 0.17
979 0.2
980 0.22
981 0.28
982 0.31
983 0.36
984 0.38
985 0.42
986 0.49
987 0.49
988 0.49
989 0.43
990 0.41
991 0.36
992 0.3
993 0.22
994 0.13
995 0.11
996 0.08
997 0.08
998 0.07
999 0.06
1000 0.06
1001 0.06
1002 0.06
1003 0.05
1004 0.07
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.1
1008 0.1
1009 0.11
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.12
1013 0.15
1014 0.15
1015 0.14