Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YWQ6

Protein Details
Accession A0A409YWQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-73EHRSRFPDYKYRPRKKGELSTARKRRRTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-72YRPRKKGELSTARKRRRT
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, cyto 4, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MKSLDTPNIKGLDAPEISKLASRIWHAGPDLRDHYKQLAEEAAVEHRSRFPDYKYRPRKKGELSTARKRRRTGNTAKTVRGSQSCAVAHPDPLPAASTHTNPYWVWSNTPIGLAVGPSVNDQAPRVDDACFNEIQPYPIPIDMTSSVSASAVGDLLQYSQQDEMFTQAWYQVPAQMNNEWMHLKDAPWDNLMPKIQPSRQFLAYQIQHEDNLGGNFTPGSQPSDLPMTYEIQHGDISGDSLILGAQTNGFPTAYPFLASMAFQHIEQGIDIGVEEILYPGACENNEGGWLNNYEGNGNSSNIFP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.21
4 0.22
5 0.22
6 0.22
7 0.17
8 0.19
9 0.21
10 0.23
11 0.24
12 0.27
13 0.27
14 0.32
15 0.32
16 0.35
17 0.38
18 0.38
19 0.38
20 0.37
21 0.39
22 0.37
23 0.35
24 0.3
25 0.27
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.19
32 0.19
33 0.19
34 0.22
35 0.25
36 0.26
37 0.27
38 0.36
39 0.44
40 0.55
41 0.63
42 0.7
43 0.74
44 0.78
45 0.82
46 0.81
47 0.82
48 0.82
49 0.82
50 0.8
51 0.83
52 0.87
53 0.87
54 0.84
55 0.77
56 0.75
57 0.74
58 0.75
59 0.75
60 0.75
61 0.76
62 0.76
63 0.76
64 0.69
65 0.62
66 0.56
67 0.48
68 0.41
69 0.31
70 0.32
71 0.29
72 0.27
73 0.29
74 0.26
75 0.25
76 0.21
77 0.21
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.1
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.19
88 0.17
89 0.2
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.21
94 0.22
95 0.2
96 0.21
97 0.18
98 0.12
99 0.11
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.11
129 0.1
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.07
137 0.06
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.16
162 0.16
163 0.19
164 0.18
165 0.2
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.19
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.18
177 0.22
178 0.23
179 0.17
180 0.17
181 0.21
182 0.24
183 0.29
184 0.34
185 0.34
186 0.36
187 0.36
188 0.35
189 0.38
190 0.37
191 0.33
192 0.31
193 0.28
194 0.25
195 0.25
196 0.23
197 0.16
198 0.14
199 0.12
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.17
217 0.16
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.12
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.18
277 0.18
278 0.19
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.2
283 0.18
284 0.18