Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YQ16

Protein Details
Accession A0A409YQ16    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
551-574EDLQQGKKRRQAPPSKAAKKSSPKHydrophilic
618-648VLPKREQSARIHDKKYKNKAVTIPRRAKRVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
539-542KRKK
556-586GKKRRQAPPSKAAKKSSPKSQSRSVAGKKKK
621-649KREQSARIHDKKYKNKAVTIPRRAKRVTK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSLSSITDEEDTFVKTSFTADEETFLEAYIPLWRAKYYAASSTARKGEKKVWVTKEPYPKFITKFYAENDLKPQEKQLQGKMYRWFLNRTKDAEKTASNRHTKPVSDLKKPRAMHAFQIFTEEKKDEIMKLRQEKTNTTSPMNNLSPFKESSKELWDALSPEAKDEYSRKASEKNELIKRGPTEQDIESETSGSIRNQANIIRNTVAALSNLAGHHWLGHGDVAFFVMGAHRKKEGELTTFYGSVSNDPNFASKGFHRSVPNFKADIGDPFKIWAESVIPGKQKDLPSMQSSTAHMETPDSFVLGFIEGYPVLPALDLDKITPHAAKNLLEKYIAAAWRRSAGKNPESAVPWNCLGELNRYCILKDPGPFARFASLDPASVSTGDAYSILKTILVEQQRGARALQFKSDDEEQSAEVPQVDKVDFSPPRPKGSSFLGLPVSRSTPEPTADMVDFSPPRPKGSSFLGPPVSRPPVSRSTPESTVGMSFEGCHQTASPSQQQTAQLETDNEKEGEGTAETCPELYQNQSEAEDNGGASFRKRKKPAEDNEAGEDLQQGKKRRQAPPSKAAKKSSPKSQSRSVAGKKKKLTQVTNSGSVIKATNESNSASNGGQRKGAAQVLPKREQSARIHDKKYKNKAVTIPRRAKRVTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.14
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.16
14 0.12
15 0.12
16 0.14
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.18
23 0.24
24 0.23
25 0.26
26 0.3
27 0.34
28 0.37
29 0.43
30 0.49
31 0.48
32 0.47
33 0.46
34 0.48
35 0.54
36 0.59
37 0.62
38 0.62
39 0.66
40 0.69
41 0.72
42 0.76
43 0.7
44 0.67
45 0.63
46 0.61
47 0.56
48 0.56
49 0.54
50 0.47
51 0.47
52 0.44
53 0.49
54 0.44
55 0.44
56 0.46
57 0.46
58 0.44
59 0.4
60 0.43
61 0.41
62 0.46
63 0.49
64 0.49
65 0.52
66 0.55
67 0.6
68 0.61
69 0.59
70 0.59
71 0.57
72 0.57
73 0.54
74 0.59
75 0.59
76 0.58
77 0.58
78 0.55
79 0.57
80 0.54
81 0.53
82 0.48
83 0.53
84 0.56
85 0.57
86 0.55
87 0.57
88 0.57
89 0.52
90 0.54
91 0.55
92 0.53
93 0.56
94 0.63
95 0.64
96 0.68
97 0.68
98 0.66
99 0.65
100 0.6
101 0.58
102 0.57
103 0.52
104 0.44
105 0.5
106 0.44
107 0.37
108 0.38
109 0.3
110 0.22
111 0.22
112 0.23
113 0.2
114 0.26
115 0.32
116 0.37
117 0.46
118 0.51
119 0.53
120 0.54
121 0.56
122 0.53
123 0.55
124 0.5
125 0.45
126 0.43
127 0.41
128 0.45
129 0.43
130 0.41
131 0.34
132 0.33
133 0.33
134 0.31
135 0.31
136 0.27
137 0.27
138 0.26
139 0.3
140 0.3
141 0.27
142 0.25
143 0.24
144 0.23
145 0.23
146 0.24
147 0.18
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.23
154 0.25
155 0.27
156 0.28
157 0.33
158 0.36
159 0.42
160 0.47
161 0.49
162 0.51
163 0.53
164 0.53
165 0.52
166 0.52
167 0.48
168 0.43
169 0.36
170 0.32
171 0.27
172 0.28
173 0.26
174 0.25
175 0.2
176 0.18
177 0.16
178 0.13
179 0.14
180 0.11
181 0.15
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.2
186 0.26
187 0.27
188 0.29
189 0.24
190 0.23
191 0.22
192 0.22
193 0.19
194 0.12
195 0.11
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.1
216 0.12
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.21
222 0.22
223 0.21
224 0.23
225 0.26
226 0.26
227 0.26
228 0.26
229 0.22
230 0.19
231 0.17
232 0.17
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.17
242 0.18
243 0.22
244 0.25
245 0.28
246 0.36
247 0.38
248 0.4
249 0.34
250 0.33
251 0.31
252 0.27
253 0.3
254 0.25
255 0.22
256 0.18
257 0.18
258 0.19
259 0.17
260 0.16
261 0.1
262 0.07
263 0.09
264 0.11
265 0.14
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.22
270 0.21
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.23
275 0.25
276 0.25
277 0.22
278 0.22
279 0.23
280 0.2
281 0.17
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.12
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.1
312 0.11
313 0.13
314 0.17
315 0.18
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.15
320 0.17
321 0.18
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.17
326 0.19
327 0.19
328 0.21
329 0.26
330 0.27
331 0.3
332 0.31
333 0.29
334 0.29
335 0.31
336 0.27
337 0.23
338 0.2
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.13
343 0.17
344 0.17
345 0.18
346 0.2
347 0.2
348 0.2
349 0.23
350 0.25
351 0.21
352 0.21
353 0.22
354 0.26
355 0.26
356 0.27
357 0.23
358 0.23
359 0.2
360 0.19
361 0.2
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.07
380 0.12
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.19
385 0.2
386 0.21
387 0.2
388 0.18
389 0.21
390 0.21
391 0.25
392 0.22
393 0.21
394 0.24
395 0.26
396 0.23
397 0.2
398 0.2
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.09
410 0.16
411 0.17
412 0.21
413 0.29
414 0.3
415 0.35
416 0.37
417 0.37
418 0.33
419 0.37
420 0.39
421 0.3
422 0.32
423 0.31
424 0.29
425 0.29
426 0.27
427 0.23
428 0.19
429 0.19
430 0.19
431 0.16
432 0.17
433 0.17
434 0.17
435 0.18
436 0.17
437 0.17
438 0.14
439 0.17
440 0.16
441 0.16
442 0.23
443 0.2
444 0.23
445 0.24
446 0.25
447 0.23
448 0.29
449 0.35
450 0.3
451 0.36
452 0.4
453 0.38
454 0.38
455 0.41
456 0.39
457 0.33
458 0.32
459 0.31
460 0.33
461 0.37
462 0.39
463 0.39
464 0.4
465 0.42
466 0.42
467 0.37
468 0.31
469 0.28
470 0.24
471 0.19
472 0.13
473 0.1
474 0.11
475 0.14
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.14
480 0.17
481 0.22
482 0.26
483 0.25
484 0.26
485 0.3
486 0.33
487 0.33
488 0.32
489 0.28
490 0.23
491 0.23
492 0.24
493 0.23
494 0.22
495 0.2
496 0.17
497 0.16
498 0.14
499 0.14
500 0.12
501 0.11
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.11
510 0.13
511 0.14
512 0.15
513 0.17
514 0.18
515 0.17
516 0.18
517 0.16
518 0.13
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.13
523 0.21
524 0.28
525 0.37
526 0.44
527 0.51
528 0.6
529 0.7
530 0.77
531 0.78
532 0.77
533 0.72
534 0.7
535 0.64
536 0.53
537 0.43
538 0.36
539 0.28
540 0.26
541 0.27
542 0.27
543 0.31
544 0.38
545 0.47
546 0.52
547 0.6
548 0.66
549 0.7
550 0.76
551 0.82
552 0.84
553 0.83
554 0.81
555 0.8
556 0.8
557 0.78
558 0.78
559 0.77
560 0.77
561 0.76
562 0.79
563 0.77
564 0.74
565 0.77
566 0.76
567 0.76
568 0.76
569 0.79
570 0.76
571 0.78
572 0.79
573 0.78
574 0.76
575 0.75
576 0.76
577 0.73
578 0.73
579 0.65
580 0.58
581 0.49
582 0.43
583 0.35
584 0.25
585 0.22
586 0.17
587 0.18
588 0.18
589 0.2
590 0.2
591 0.2
592 0.21
593 0.19
594 0.24
595 0.27
596 0.26
597 0.27
598 0.26
599 0.26
600 0.27
601 0.31
602 0.28
603 0.32
604 0.39
605 0.45
606 0.51
607 0.51
608 0.52
609 0.51
610 0.55
611 0.54
612 0.56
613 0.59
614 0.62
615 0.68
616 0.72
617 0.8
618 0.82
619 0.86
620 0.85
621 0.8
622 0.79
623 0.8
624 0.82
625 0.83
626 0.83
627 0.83
628 0.79
629 0.81