Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XYT3

Protein Details
Accession A0A409XYT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-77TTPTPPSPAPQSPREKRKPSSQKAAPKTKKARKLKPFEKSNHVRPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-69PREKRKPSSQKAAPKTKKARKLKPFEK
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 6.5, extr 6, cyto_mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MLSAVAARRAALASQQAQSPDASLPVASSSTTPTPPSPAPQSPREKRKPSSQKAAPKTKKARKLKPFEKSNHVRPAAVADEFKDQTEVIEVISESDEDGSDSAMSVLEDAFSGPVPQPSDKAAGKRAWSPSQPLVESSDEEDDDDADAAVDVASLFPRLPHSLWQSEIEQDEGQILTSFDARPGHNFFDLTDEECRQLGLSSKTTVVALGDDDTLASLGTCTLAVLHGSINMFGMTLLASSKFYPIYAPRSAPLPVLRPAMKASSTLVPGNISTRLQDLLQFRTIIAFQELRTNVEGLGLVCRTFQDTFKPARFEKAGTQELSEDLPGLYMVRQQTKECRPFSLPPTWSTALDSIQPQDDMSSGTYIIKGPKNSGKSSFARSLTNRLLQFYRRVAFLECDVGQSEFTPGGMVSLNIISEPIFGPPFTHPTLPNYAHYIGSNTPRSSPSHYLDAILALIQTYRADVQTPAIDDEDDDPRIFDIIPLVVNTMGWSKGLGADLTQKIESILEATDVFDIQVPTRDEYGFSTSTRNNAPQNEYAAYHDQSLAGQTSARIHVLEPVASSAILSSYTAADHRTLSILSYFHAQFPADASPKELQQITATSWDVSRPLCAVPPFQVDCSIAFDKVVLTGAGSEDVVEEEVGRVLNGAIVAFVRCEPGTVDVDVDPSKAMGIPYSRHQAPPSPASSQCVGLGLTRGVSPPITVPGKEGSSKVTTYLQILTPLPQSVLIDARVLVKGELELPVWGMLDFRNFDGKDADMGRIGSVEKDNVPYLQWGKAAEGVLGGDRRRVRRNLMRRGQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.27
4 0.27
5 0.27
6 0.25
7 0.19
8 0.16
9 0.15
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.1
15 0.1
16 0.14
17 0.17
18 0.19
19 0.22
20 0.22
21 0.27
22 0.29
23 0.34
24 0.37
25 0.42
26 0.46
27 0.53
28 0.63
29 0.67
30 0.76
31 0.8
32 0.81
33 0.79
34 0.84
35 0.86
36 0.84
37 0.85
38 0.84
39 0.84
40 0.86
41 0.91
42 0.88
43 0.88
44 0.89
45 0.88
46 0.89
47 0.89
48 0.9
49 0.89
50 0.92
51 0.91
52 0.9
53 0.9
54 0.87
55 0.87
56 0.86
57 0.84
58 0.83
59 0.75
60 0.65
61 0.56
62 0.54
63 0.47
64 0.4
65 0.31
66 0.23
67 0.28
68 0.28
69 0.27
70 0.23
71 0.19
72 0.17
73 0.19
74 0.17
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.11
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.07
100 0.07
101 0.11
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.18
106 0.24
107 0.26
108 0.29
109 0.33
110 0.34
111 0.36
112 0.41
113 0.45
114 0.46
115 0.45
116 0.47
117 0.47
118 0.49
119 0.47
120 0.41
121 0.39
122 0.34
123 0.33
124 0.29
125 0.25
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.09
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.18
148 0.24
149 0.26
150 0.29
151 0.31
152 0.3
153 0.3
154 0.3
155 0.26
156 0.2
157 0.17
158 0.16
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.13
168 0.13
169 0.17
170 0.21
171 0.23
172 0.23
173 0.23
174 0.21
175 0.22
176 0.23
177 0.22
178 0.21
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.14
184 0.13
185 0.16
186 0.16
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.14
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.1
232 0.13
233 0.19
234 0.21
235 0.22
236 0.21
237 0.23
238 0.24
239 0.24
240 0.23
241 0.21
242 0.21
243 0.25
244 0.25
245 0.24
246 0.25
247 0.24
248 0.22
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.12
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.18
271 0.18
272 0.14
273 0.14
274 0.12
275 0.1
276 0.17
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.08
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.13
294 0.18
295 0.23
296 0.26
297 0.31
298 0.29
299 0.33
300 0.33
301 0.3
302 0.31
303 0.34
304 0.34
305 0.3
306 0.31
307 0.26
308 0.25
309 0.24
310 0.18
311 0.11
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.07
318 0.09
319 0.13
320 0.14
321 0.16
322 0.24
323 0.32
324 0.4
325 0.38
326 0.4
327 0.4
328 0.43
329 0.46
330 0.47
331 0.4
332 0.34
333 0.4
334 0.37
335 0.33
336 0.3
337 0.27
338 0.19
339 0.19
340 0.18
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.16
358 0.21
359 0.25
360 0.26
361 0.28
362 0.3
363 0.3
364 0.35
365 0.37
366 0.34
367 0.34
368 0.34
369 0.36
370 0.34
371 0.37
372 0.32
373 0.28
374 0.28
375 0.26
376 0.28
377 0.25
378 0.23
379 0.18
380 0.19
381 0.18
382 0.17
383 0.16
384 0.16
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.07
411 0.08
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.14
416 0.16
417 0.23
418 0.23
419 0.23
420 0.23
421 0.23
422 0.21
423 0.21
424 0.2
425 0.16
426 0.2
427 0.22
428 0.19
429 0.2
430 0.21
431 0.23
432 0.27
433 0.29
434 0.27
435 0.27
436 0.27
437 0.26
438 0.25
439 0.23
440 0.17
441 0.12
442 0.09
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.12
461 0.11
462 0.11
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.05
479 0.06
480 0.05
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.12
486 0.13
487 0.15
488 0.14
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.15
509 0.14
510 0.16
511 0.2
512 0.16
513 0.16
514 0.19
515 0.18
516 0.21
517 0.23
518 0.24
519 0.24
520 0.26
521 0.3
522 0.29
523 0.32
524 0.3
525 0.28
526 0.28
527 0.28
528 0.25
529 0.21
530 0.19
531 0.16
532 0.14
533 0.15
534 0.12
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.09
539 0.1
540 0.11
541 0.1
542 0.09
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.12
547 0.12
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.15
573 0.14
574 0.12
575 0.14
576 0.19
577 0.17
578 0.16
579 0.19
580 0.19
581 0.2
582 0.23
583 0.21
584 0.16
585 0.16
586 0.17
587 0.15
588 0.18
589 0.18
590 0.15
591 0.15
592 0.15
593 0.15
594 0.14
595 0.13
596 0.11
597 0.11
598 0.14
599 0.15
600 0.16
601 0.18
602 0.24
603 0.24
604 0.24
605 0.25
606 0.23
607 0.22
608 0.27
609 0.25
610 0.19
611 0.17
612 0.16
613 0.14
614 0.14
615 0.14
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.06
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.09
645 0.09
646 0.12
647 0.15
648 0.14
649 0.16
650 0.13
651 0.17
652 0.16
653 0.16
654 0.12
655 0.1
656 0.1
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.12
661 0.14
662 0.2
663 0.27
664 0.28
665 0.3
666 0.32
667 0.36
668 0.39
669 0.43
670 0.41
671 0.39
672 0.38
673 0.4
674 0.4
675 0.34
676 0.28
677 0.23
678 0.2
679 0.16
680 0.17
681 0.13
682 0.13
683 0.12
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.11
688 0.1
689 0.17
690 0.19
691 0.18
692 0.2
693 0.23
694 0.26
695 0.27
696 0.27
697 0.24
698 0.25
699 0.26
700 0.26
701 0.25
702 0.24
703 0.24
704 0.26
705 0.23
706 0.23
707 0.23
708 0.23
709 0.22
710 0.21
711 0.2
712 0.18
713 0.17
714 0.15
715 0.17
716 0.15
717 0.14
718 0.14
719 0.16
720 0.16
721 0.16
722 0.14
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.13
727 0.11
728 0.1
729 0.1
730 0.11
731 0.11
732 0.1
733 0.09
734 0.09
735 0.12
736 0.13
737 0.14
738 0.22
739 0.21
740 0.23
741 0.24
742 0.24
743 0.26
744 0.26
745 0.26
746 0.2
747 0.2
748 0.19
749 0.18
750 0.18
751 0.16
752 0.16
753 0.17
754 0.17
755 0.2
756 0.22
757 0.21
758 0.22
759 0.25
760 0.25
761 0.25
762 0.25
763 0.23
764 0.23
765 0.27
766 0.26
767 0.2
768 0.18
769 0.15
770 0.18
771 0.21
772 0.19
773 0.22
774 0.28
775 0.34
776 0.41
777 0.45
778 0.51
779 0.58
780 0.68
781 0.73