Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409XYT3

Protein Details
Accession A0A409XYT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-77TTPTPPSPAPQSPREKRKPSSQKAAPKTKKARKLKPFEKSNHVRPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-69PREKRKPSSQKAAPKTKKARKLKPFEK
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 6.5, extr 6, cyto_mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MLSAVAARRAALASQQAQSPDASLPVASSSTTPTPPSPAPQSPREKRKPSSQKAAPKTKKARKLKPFEKSNHVRPAAVADEFKDQTEVIEVISESDEDGSDSAMSVLEDAFSGPVPQPSDKAAGKRAWSPSQPLVESSDEEDDDDADAAVDVASLFPRLPHSLWQSEIEQDEGQILTSFDARPGHNFFDLTDEECRQLGLSSKTTVVALGDDDTLASLGTCTLAVLHGSINMFGMTLLASSKFYPIYAPRSAPLPVLRPAMKASSTLVPGNISTRLQDLLQFRTIIAFQELRTNVEGLGLVCRTFQDTFKPARFEKAGTQELSEDLPGLYMVRQQTKECRPFSLPPTWSTALDSIQPQDDMSSGTYIIKGPKNSGKSSFARSLTNRLLQFYRRVAFLECDVGQSEFTPGGMVSLNIISEPIFGPPFTHPTLPNYAHYIGSNTPRSSPSHYLDAILALIQTYRADVQTPAIDDEDDDPRIFDIIPLVVNTMGWSKGLGADLTQKIESILEATDVFDIQVPTRDEYGFSTSTRNNAPQNEYAAYHDQSLAGQTSARIHVLEPVASSAILSSYTAADHRTLSILSYFHAQFPADASPKELQQITATSWDVSRPLCAVPPFQVDCSIAFDKVVLTGAGSEDVVEEEVGRVLNGAIVAFVRCEPGTVDVDVDPSKAMGIPYSRHQAPPSPASSQCVGLGLTRGVSPPITVPGKEGSSKVTTYLQILTPLPQSVLIDARVLVKGELELPVWGMLDFRNFDGKDADMGRIGSVEKDNVPYLQWGKAAEGVLGGDRRRVRRNLMRRGQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.27
4 0.27
5 0.27
6 0.25
7 0.19
8 0.16
9 0.15
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.1
15 0.1
16 0.14
17 0.17
18 0.19
19 0.22
20 0.22
21 0.27
22 0.29
23 0.34
24 0.37
25 0.42
26 0.46
27 0.53
28 0.63
29 0.67
30 0.76
31 0.8
32 0.81
33 0.79
34 0.84
35 0.86
36 0.84
37 0.85
38 0.84
39 0.84
40 0.86
41 0.91
42 0.88
43 0.88
44 0.89
45 0.88
46 0.89
47 0.89
48 0.9
49 0.89
50 0.92
51 0.91
52 0.9
53 0.9
54 0.87
55 0.87
56 0.86
57 0.84
58 0.83
59 0.75
60 0.65
61 0.56
62 0.54
63 0.47
64 0.4
65 0.31
66 0.23
67 0.28
68 0.28
69 0.27
70 0.23
71 0.19
72 0.17
73 0.19
74 0.17
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.11
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.07
100 0.07
101 0.11
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.18
106 0.24
107 0.26
108 0.29
109 0.33
110 0.34
111 0.36
112 0.41
113 0.45
114 0.46
115 0.45
116 0.47
117 0.47
118 0.49
119 0.47
120 0.41
121 0.39
122 0.34
123 0.33
124 0.29
125 0.25
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.09
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.18
148 0.24
149 0.26
150 0.29
151 0.31
152 0.3
153 0.3
154 0.3
155 0.26
156 0.2
157 0.17
158 0.16
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.13
168 0.13
169 0.17
170 0.21
171 0.23
172 0.23
173 0.23
174 0.21
175 0.22
176 0.23
177 0.22
178 0.21
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.14
184 0.13
185 0.16
186 0.16
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.14
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.1
232 0.13
233 0.19
234 0.21
235 0.22
236 0.21
237 0.23
238 0.24
239 0.24
240 0.23
241 0.21
242 0.21
243 0.25
244 0.25
245 0.24
246 0.25
247 0.24
248 0.22
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.12
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.18
271 0.18
272 0.14
273 0.14
274 0.12
275 0.1
276 0.17
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.08
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.13
294 0.18
295 0.23
296 0.26
297 0.31
298 0.29
299 0.33
300 0.33
301 0.3
302 0.31
303 0.34
304 0.34
305 0.3
306 0.31
307 0.26
308 0.25
309 0.24
310 0.18
311 0.11
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.07
318 0.09
319 0.13
320 0.14
321 0.16
322 0.24
323 0.32
324 0.4
325 0.38
326 0.4
327 0.4
328 0.43
329 0.46
330 0.47
331 0.4
332 0.34
333 0.4
334 0.37
335 0.33
336 0.3
337 0.27
338 0.19
339 0.19
340 0.18
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.16
358 0.21
359 0.25
360 0.26
361 0.28
362 0.3
363 0.3
364 0.35
365 0.37
366 0.34
367 0.34
368 0.34
369 0.36
370 0.34
371 0.37
372 0.32
373 0.28
374 0.28
375 0.26
376 0.28
377 0.25
378 0.23
379 0.18
380 0.19
381 0.18
382 0.17
383 0.16
384 0.16
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.07
411 0.08
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.14
416 0.16
417 0.23
418 0.23
419 0.23
420 0.23
421 0.23
422 0.21
423 0.21
424 0.2
425 0.16
426 0.2
427 0.22
428 0.19
429 0.2
430 0.21
431 0.23
432 0.27
433 0.29
434 0.27
435 0.27
436 0.27
437 0.26
438 0.25
439 0.23
440 0.17
441 0.12
442 0.09
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.12
461 0.11
462 0.11
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.05
479 0.06
480 0.05
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.12
486 0.13
487 0.15
488 0.14
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.15
509 0.14
510 0.16
511 0.2
512 0.16
513 0.16
514 0.19
515 0.18
516 0.21
517 0.23
518 0.24
519 0.24
520 0.26
521 0.3
522 0.29
523 0.32
524 0.3
525 0.28
526 0.28
527 0.28
528 0.25
529 0.21
530 0.19
531 0.16
532 0.14
533 0.15
534 0.12
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.09
539 0.1
540 0.11
541 0.1
542 0.09
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.12
547 0.12
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.15
573 0.14
574 0.12
575 0.14
576 0.19
577 0.17
578 0.16
579 0.19
580 0.19
581 0.2
582 0.23
583 0.21
584 0.16
585 0.16
586 0.17
587 0.15
588 0.18
589 0.18
590 0.15
591 0.15
592 0.15
593 0.15
594 0.14
595 0.13
596 0.11
597 0.11
598 0.14
599 0.15
600 0.16
601 0.18
602 0.24
603 0.24
604 0.24
605 0.25
606 0.23
607 0.22
608 0.27
609 0.25
610 0.19
611 0.17
612 0.16
613 0.14
614 0.14
615 0.14
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.06
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.09
645 0.09
646 0.12
647 0.15
648 0.14
649 0.16
650 0.13
651 0.17
652 0.16
653 0.16
654 0.12
655 0.1
656 0.1
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.12
661 0.14
662 0.2
663 0.27
664 0.28
665 0.3
666 0.32
667 0.36
668 0.39
669 0.43
670 0.41
671 0.39
672 0.38
673 0.4
674 0.4
675 0.34
676 0.28
677 0.23
678 0.2
679 0.16
680 0.17
681 0.13
682 0.13
683 0.12
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.11
688 0.1
689 0.17
690 0.19
691 0.18
692 0.2
693 0.23
694 0.26
695 0.27
696 0.27
697 0.24
698 0.25
699 0.26
700 0.26
701 0.25
702 0.24
703 0.24
704 0.26
705 0.23
706 0.23
707 0.23
708 0.23
709 0.22
710 0.21
711 0.2
712 0.18
713 0.17
714 0.15
715 0.17
716 0.15
717 0.14
718 0.14
719 0.16
720 0.16
721 0.16
722 0.14
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.13
727 0.11
728 0.1
729 0.1
730 0.11
731 0.11
732 0.1
733 0.09
734 0.09
735 0.12
736 0.13
737 0.14
738 0.22
739 0.21
740 0.23
741 0.24
742 0.24
743 0.26
744 0.26
745 0.26
746 0.2
747 0.2
748 0.19
749 0.18
750 0.18
751 0.16
752 0.16
753 0.17
754 0.17
755 0.2
756 0.22
757 0.21
758 0.22
759 0.25
760 0.25
761 0.25
762 0.25
763 0.23
764 0.23
765 0.27
766 0.26
767 0.2
768 0.18
769 0.15
770 0.18
771 0.21
772 0.19
773 0.22
774 0.28
775 0.34
776 0.41
777 0.45
778 0.51
779 0.58
780 0.68
781 0.73