Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YW89

Protein Details
Accession A0A409YW89    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-42QETGSTKNRPRSGRPKKVTERLERALHydrophilic
90-123LTDDHKRKRKHWAELYRRFRKRQWRKPIWSDECYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-53KNRPRSGRPKKVTERLERALIRNAVKERRKP
94-115HKRKRKHWAELYRRFRKRQWRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MTDIPYSTAKTLWHKYQETGSTKNRPRSGRPKKVTERLERALIRNAVKERRKPFRELGNAMPGNLSEGTIRNVLDEHGYHRRIARKVPYLTDDHKRKRKHWAELYRRFRKRQWRKPIWSDECYIYLGDSRGKVYVTRLAEEEYNENCLVPKFKQSSLRVMIWGCIAKGKKGPLVVLEYPGGKGGGMNSERYITQVLEGALKPFFQELKQARRGPIFQQDGAASHRSKETLKWLSDHGIPLMDHPPNSPDLSPIEPVWHELKTIIRARPHPPTSAPELIQAVKDAWEMLPISVIDKYIDSMPERVQAVLDADGGHTGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.54
4 0.59
5 0.57
6 0.58
7 0.58
8 0.6
9 0.66
10 0.72
11 0.72
12 0.68
13 0.73
14 0.76
15 0.79
16 0.8
17 0.8
18 0.82
19 0.85
20 0.89
21 0.88
22 0.87
23 0.85
24 0.78
25 0.79
26 0.72
27 0.65
28 0.63
29 0.59
30 0.51
31 0.48
32 0.5
33 0.51
34 0.55
35 0.6
36 0.61
37 0.66
38 0.68
39 0.68
40 0.69
41 0.69
42 0.71
43 0.67
44 0.65
45 0.64
46 0.6
47 0.53
48 0.47
49 0.36
50 0.29
51 0.24
52 0.19
53 0.09
54 0.1
55 0.12
56 0.14
57 0.14
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.15
64 0.22
65 0.23
66 0.24
67 0.28
68 0.35
69 0.35
70 0.41
71 0.44
72 0.45
73 0.47
74 0.5
75 0.49
76 0.48
77 0.5
78 0.53
79 0.55
80 0.56
81 0.61
82 0.63
83 0.62
84 0.68
85 0.72
86 0.72
87 0.73
88 0.74
89 0.77
90 0.82
91 0.9
92 0.89
93 0.87
94 0.81
95 0.77
96 0.77
97 0.77
98 0.77
99 0.78
100 0.78
101 0.81
102 0.86
103 0.9
104 0.86
105 0.78
106 0.7
107 0.6
108 0.51
109 0.42
110 0.33
111 0.22
112 0.16
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.19
129 0.13
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.11
137 0.17
138 0.17
139 0.2
140 0.28
141 0.3
142 0.36
143 0.39
144 0.39
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.22
149 0.2
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.15
160 0.2
161 0.19
162 0.19
163 0.18
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.13
168 0.07
169 0.07
170 0.05
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.07
192 0.16
193 0.2
194 0.29
195 0.37
196 0.4
197 0.42
198 0.45
199 0.46
200 0.42
201 0.46
202 0.41
203 0.33
204 0.32
205 0.3
206 0.28
207 0.29
208 0.29
209 0.2
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.18
214 0.18
215 0.25
216 0.28
217 0.29
218 0.3
219 0.31
220 0.33
221 0.34
222 0.33
223 0.25
224 0.2
225 0.18
226 0.19
227 0.22
228 0.2
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.18
233 0.2
234 0.18
235 0.15
236 0.17
237 0.19
238 0.2
239 0.19
240 0.2
241 0.18
242 0.21
243 0.21
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.19
248 0.23
249 0.3
250 0.31
251 0.35
252 0.4
253 0.45
254 0.53
255 0.53
256 0.49
257 0.46
258 0.47
259 0.49
260 0.49
261 0.45
262 0.38
263 0.38
264 0.35
265 0.32
266 0.28
267 0.21
268 0.17
269 0.16
270 0.13
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.13
283 0.13
284 0.16
285 0.16
286 0.19
287 0.2
288 0.24
289 0.25
290 0.24
291 0.22
292 0.2
293 0.2
294 0.18
295 0.17
296 0.12
297 0.11