Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YVL9

Protein Details
Accession A0A409YVL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-95FPGYKYSPRKKGERAKKQRRGRKVERLLATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-90PRKKGERAKKQRRGRKVE
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MSSQCGPPRPSNSWVLFRREFAASVKGLQASEISRLASLVWHAGPALRDHYKQLADEVAAEHRQQFPGYKYSPRKKGERAKKQRRGRKVERLLATPKDTQSRDKERHDTFYPTHVNPYWVWSGNDPALDTLKPAQESCHNLLPYPTLMRSGSDIGVQSSETLLNDESAISTVADQLRSLPSLAPVQPIGTSLDDTWLHSSFEGVSRQSEDSAQLIALASELDTIVRQQTTDPWGTFFQPEPAMEDSGLEHQDTISP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.55
4 0.52
5 0.5
6 0.43
7 0.4
8 0.33
9 0.32
10 0.25
11 0.24
12 0.25
13 0.23
14 0.21
15 0.2
16 0.19
17 0.15
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.18
34 0.19
35 0.2
36 0.23
37 0.28
38 0.28
39 0.27
40 0.27
41 0.22
42 0.19
43 0.19
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.18
54 0.23
55 0.26
56 0.33
57 0.42
58 0.5
59 0.59
60 0.61
61 0.65
62 0.68
63 0.75
64 0.77
65 0.79
66 0.81
67 0.83
68 0.88
69 0.91
70 0.91
71 0.91
72 0.9
73 0.88
74 0.88
75 0.86
76 0.84
77 0.77
78 0.73
79 0.68
80 0.62
81 0.56
82 0.48
83 0.4
84 0.38
85 0.36
86 0.36
87 0.39
88 0.44
89 0.47
90 0.5
91 0.55
92 0.51
93 0.56
94 0.53
95 0.5
96 0.41
97 0.43
98 0.41
99 0.34
100 0.35
101 0.29
102 0.29
103 0.24
104 0.26
105 0.21
106 0.18
107 0.18
108 0.15
109 0.17
110 0.15
111 0.16
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.13
123 0.18
124 0.21
125 0.25
126 0.23
127 0.23
128 0.23
129 0.23
130 0.2
131 0.17
132 0.14
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.09
167 0.1
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.11
177 0.12
178 0.1
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.15
187 0.12
188 0.15
189 0.16
190 0.14
191 0.15
192 0.17
193 0.18
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.14
216 0.19
217 0.24
218 0.24
219 0.25
220 0.27
221 0.29
222 0.3
223 0.27
224 0.26
225 0.24
226 0.24
227 0.25
228 0.25
229 0.25
230 0.22
231 0.22
232 0.19
233 0.2
234 0.21
235 0.17
236 0.14