Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JTN4

Protein Details
Accession G8JTN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-38RPPLQYKKPVDYPPEKRRTHBasic
302-324QSKPTQTFYRSRRDRNINSDTTKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG erc:Ecym_4324  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21615  RRM_SNP1_like  
Amino Acid Sequences MSYSMSKFPERVSKLFNPRPPLQYKKPVDYPPEKRRTHFIAPLSSLVFSDTLVRYMQEHPQGSENRHLDKYEEVRSLTARNERLLEAEQAKWVPEEDSNINDTDPFRTIFVGRLPYEVDELELQKQFIKFGDIERVRIVRDKLTNEPKGYAFVLFKDTEGSRKAYREIGVHRGLLIKGRPVIVDIERGRTVKFFKPRRLGGGLGGRGYMKRERLSQLSVLGADHQATKHSVDIDRRSRFGTSSSGGRPQAHAGNYRGMGYKYGSTPQYANGPRFLREGSSYIPPTRPPATNAPVATAANPAQSKPTQTFYRSRRDRNINSDTTKSPSSMDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.67
3 0.69
4 0.67
5 0.67
6 0.71
7 0.71
8 0.71
9 0.7
10 0.71
11 0.72
12 0.73
13 0.75
14 0.74
15 0.74
16 0.76
17 0.77
18 0.77
19 0.81
20 0.76
21 0.7
22 0.71
23 0.69
24 0.67
25 0.63
26 0.58
27 0.56
28 0.55
29 0.55
30 0.48
31 0.41
32 0.33
33 0.26
34 0.21
35 0.13
36 0.15
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.14
42 0.17
43 0.23
44 0.26
45 0.27
46 0.27
47 0.34
48 0.37
49 0.38
50 0.44
51 0.42
52 0.4
53 0.4
54 0.39
55 0.34
56 0.36
57 0.38
58 0.36
59 0.35
60 0.31
61 0.3
62 0.31
63 0.32
64 0.3
65 0.31
66 0.27
67 0.26
68 0.27
69 0.26
70 0.27
71 0.27
72 0.27
73 0.22
74 0.21
75 0.22
76 0.2
77 0.2
78 0.18
79 0.16
80 0.13
81 0.11
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.14
91 0.14
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.19
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.16
105 0.14
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.11
117 0.12
118 0.22
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.24
123 0.22
124 0.25
125 0.25
126 0.2
127 0.23
128 0.25
129 0.3
130 0.38
131 0.42
132 0.39
133 0.4
134 0.35
135 0.33
136 0.3
137 0.24
138 0.16
139 0.12
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.17
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.2
153 0.21
154 0.22
155 0.25
156 0.25
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.21
161 0.19
162 0.17
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.13
169 0.11
170 0.18
171 0.17
172 0.19
173 0.21
174 0.21
175 0.2
176 0.2
177 0.23
178 0.22
179 0.31
180 0.35
181 0.42
182 0.49
183 0.5
184 0.54
185 0.53
186 0.48
187 0.44
188 0.44
189 0.37
190 0.3
191 0.28
192 0.23
193 0.2
194 0.22
195 0.2
196 0.16
197 0.17
198 0.2
199 0.23
200 0.26
201 0.29
202 0.28
203 0.26
204 0.24
205 0.22
206 0.18
207 0.16
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.16
218 0.21
219 0.29
220 0.37
221 0.39
222 0.4
223 0.4
224 0.39
225 0.36
226 0.32
227 0.28
228 0.22
229 0.24
230 0.26
231 0.3
232 0.32
233 0.32
234 0.31
235 0.3
236 0.33
237 0.3
238 0.32
239 0.28
240 0.3
241 0.3
242 0.3
243 0.29
244 0.24
245 0.23
246 0.2
247 0.21
248 0.18
249 0.22
250 0.21
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.29
255 0.31
256 0.31
257 0.34
258 0.35
259 0.34
260 0.36
261 0.34
262 0.27
263 0.25
264 0.26
265 0.22
266 0.28
267 0.3
268 0.31
269 0.32
270 0.31
271 0.34
272 0.36
273 0.35
274 0.33
275 0.38
276 0.39
277 0.43
278 0.42
279 0.4
280 0.38
281 0.36
282 0.32
283 0.27
284 0.23
285 0.22
286 0.22
287 0.19
288 0.22
289 0.23
290 0.27
291 0.27
292 0.33
293 0.34
294 0.38
295 0.48
296 0.49
297 0.59
298 0.64
299 0.69
300 0.72
301 0.77
302 0.81
303 0.81
304 0.83
305 0.81
306 0.77
307 0.74
308 0.66
309 0.61
310 0.55
311 0.46