Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YXL4

Protein Details
Accession A0A409YXL4    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
433-465AAKSGNRRPGWNKPKRGKLEKGVPRPRKPDIEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-61KAKAKGKRR
379-388KRKKQAKAER
434-460AKSGNRRPGWNKPKRGKLEKGVPRPRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences MSLPPAVIFKGEHFQTSWKQDNPLNASLGHSKKGYTDGEIGVEWIKDFDEKTKAKAKGKRRLLLVDGHNSHYTRAFLEHARKNRIRVLCYPSHSTHLYQGLDVVIFGPLKRAWSKFRDEFERKTGRAIGKTHFLAVYAQAHLEALTKENIEAAFKKTGVVPFNPDVITEAMMAPSHTTSTQSGLPVPLSSPVRVMSDMIHRVLARQASELDEEMETEDEDVLEISSPRTHDELPLPLTPMRAAVNDLSSTSLAHLVSSSPPRASSSIPLFQPNTISPFKSYNKDLLELEPHTENEARLQRALQEAEERDRRRKNAMVEMQGVTVLQNMYVRQANTHLHSREEEQKKKGEGNRLFGDGMARYLDGDEFYFNVVRLDEEAKRKKQAKAERQVARETRAQALAAWKKQEDERKARNTEIRRVYHDAVKEWEAERDAAKSGNRRPGWNKPKRGKLEKGVPRPRKPDIEDSDEEQEQEDEEEEENDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.41
4 0.46
5 0.41
6 0.45
7 0.47
8 0.54
9 0.55
10 0.52
11 0.45
12 0.38
13 0.39
14 0.43
15 0.42
16 0.37
17 0.3
18 0.27
19 0.27
20 0.32
21 0.3
22 0.26
23 0.27
24 0.25
25 0.27
26 0.26
27 0.25
28 0.21
29 0.19
30 0.15
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.14
36 0.22
37 0.24
38 0.29
39 0.38
40 0.45
41 0.52
42 0.6
43 0.66
44 0.67
45 0.76
46 0.77
47 0.73
48 0.72
49 0.66
50 0.67
51 0.63
52 0.62
53 0.55
54 0.52
55 0.5
56 0.44
57 0.42
58 0.36
59 0.3
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.23
64 0.32
65 0.39
66 0.45
67 0.54
68 0.56
69 0.57
70 0.62
71 0.62
72 0.57
73 0.56
74 0.56
75 0.54
76 0.55
77 0.58
78 0.52
79 0.51
80 0.48
81 0.43
82 0.4
83 0.38
84 0.34
85 0.27
86 0.26
87 0.22
88 0.19
89 0.17
90 0.12
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.09
96 0.13
97 0.17
98 0.2
99 0.24
100 0.3
101 0.39
102 0.42
103 0.48
104 0.55
105 0.58
106 0.6
107 0.63
108 0.66
109 0.57
110 0.54
111 0.54
112 0.49
113 0.48
114 0.46
115 0.4
116 0.38
117 0.39
118 0.37
119 0.3
120 0.26
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.11
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.17
144 0.21
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.22
149 0.25
150 0.24
151 0.22
152 0.2
153 0.17
154 0.17
155 0.12
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.11
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.18
190 0.18
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.12
219 0.15
220 0.17
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.17
225 0.15
226 0.14
227 0.12
228 0.09
229 0.1
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.16
252 0.18
253 0.22
254 0.23
255 0.25
256 0.24
257 0.23
258 0.24
259 0.2
260 0.21
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.22
265 0.25
266 0.26
267 0.27
268 0.28
269 0.28
270 0.3
271 0.29
272 0.25
273 0.26
274 0.23
275 0.23
276 0.19
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.15
281 0.17
282 0.21
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.19
287 0.21
288 0.22
289 0.16
290 0.17
291 0.18
292 0.23
293 0.31
294 0.32
295 0.37
296 0.42
297 0.43
298 0.44
299 0.47
300 0.46
301 0.48
302 0.52
303 0.49
304 0.47
305 0.46
306 0.4
307 0.35
308 0.3
309 0.2
310 0.15
311 0.1
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.09
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.15
320 0.18
321 0.2
322 0.28
323 0.26
324 0.26
325 0.27
326 0.31
327 0.37
328 0.44
329 0.47
330 0.44
331 0.48
332 0.49
333 0.54
334 0.56
335 0.56
336 0.51
337 0.52
338 0.51
339 0.48
340 0.45
341 0.38
342 0.35
343 0.25
344 0.21
345 0.14
346 0.11
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.07
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.1
361 0.14
362 0.17
363 0.26
364 0.35
365 0.39
366 0.47
367 0.53
368 0.56
369 0.62
370 0.67
371 0.69
372 0.71
373 0.77
374 0.76
375 0.74
376 0.78
377 0.72
378 0.65
379 0.6
380 0.52
381 0.46
382 0.39
383 0.36
384 0.29
385 0.35
386 0.38
387 0.37
388 0.38
389 0.34
390 0.35
391 0.41
392 0.48
393 0.48
394 0.5
395 0.56
396 0.61
397 0.65
398 0.69
399 0.72
400 0.69
401 0.7
402 0.69
403 0.65
404 0.62
405 0.65
406 0.62
407 0.59
408 0.56
409 0.49
410 0.44
411 0.41
412 0.38
413 0.32
414 0.31
415 0.28
416 0.26
417 0.24
418 0.21
419 0.2
420 0.2
421 0.24
422 0.29
423 0.34
424 0.43
425 0.44
426 0.5
427 0.56
428 0.64
429 0.71
430 0.73
431 0.77
432 0.76
433 0.84
434 0.87
435 0.9
436 0.88
437 0.87
438 0.87
439 0.87
440 0.88
441 0.88
442 0.88
443 0.88
444 0.86
445 0.84
446 0.82
447 0.78
448 0.77
449 0.73
450 0.72
451 0.67
452 0.65
453 0.63
454 0.55
455 0.48
456 0.39
457 0.32
458 0.24
459 0.2
460 0.16
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.12