Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WJ17

Protein Details
Accession A0A409WJ17    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSIARSTSKKRKRDVSPEAQFRLSHydrophilic
43-65VPPSTHFKCYAKKKLKAEEKAGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-282KKK
426-431PRMRRK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSIARSTSKKRKRDVSPEAQFRLSESATGKVGPLLVSYPALDVPPSTHFKCYAKKKLKAEEKAGAEDEQEVFVVGETNSVEIVSNEEETRKAAESGCHYVVAVRNKRTGTISLLPSAKSPHILTRTVKALKSLPSLAAPSKLEYLDAKNTLGETFGTKKQKANIKAQQRNKIDVGAMEGVMDHLMNSIEKGAQGLLTAEESQEAADKNRLIPPFSADATDPAEVYPLHDIIPEAEWKALSISSFDAAQTDRERIALLPYRKSDWVNSHLKALANSTSKSKKKKMKILLYISAMLAFRQVAQQKSLEKEKVSERLGAVPGVTVESLITRFTETVRGSSSLQFTSATKTNLLTHIFALCLKVDDYASDTAVIAHDLSMPVSEVNQLFKSLGCKITKLGERERARLGLPDSSADDKRAVLTAPVQFPKPRMRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.87
4 0.88
5 0.84
6 0.76
7 0.65
8 0.56
9 0.51
10 0.4
11 0.33
12 0.26
13 0.24
14 0.23
15 0.23
16 0.21
17 0.17
18 0.18
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.1
30 0.11
31 0.16
32 0.22
33 0.23
34 0.25
35 0.29
36 0.34
37 0.43
38 0.51
39 0.57
40 0.61
41 0.68
42 0.74
43 0.8
44 0.85
45 0.85
46 0.82
47 0.79
48 0.73
49 0.69
50 0.62
51 0.52
52 0.42
53 0.35
54 0.28
55 0.2
56 0.16
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.17
81 0.21
82 0.27
83 0.27
84 0.25
85 0.23
86 0.25
87 0.29
88 0.35
89 0.36
90 0.34
91 0.38
92 0.38
93 0.4
94 0.4
95 0.36
96 0.33
97 0.33
98 0.32
99 0.32
100 0.33
101 0.32
102 0.3
103 0.31
104 0.25
105 0.21
106 0.2
107 0.21
108 0.24
109 0.28
110 0.29
111 0.3
112 0.38
113 0.39
114 0.38
115 0.34
116 0.33
117 0.33
118 0.35
119 0.32
120 0.25
121 0.22
122 0.25
123 0.23
124 0.23
125 0.2
126 0.18
127 0.18
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.19
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.12
140 0.1
141 0.13
142 0.19
143 0.24
144 0.25
145 0.28
146 0.34
147 0.41
148 0.44
149 0.5
150 0.52
151 0.58
152 0.65
153 0.71
154 0.75
155 0.7
156 0.68
157 0.59
158 0.52
159 0.41
160 0.32
161 0.28
162 0.19
163 0.15
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.11
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.06
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.1
241 0.14
242 0.19
243 0.2
244 0.23
245 0.25
246 0.27
247 0.29
248 0.3
249 0.29
250 0.28
251 0.32
252 0.35
253 0.34
254 0.34
255 0.34
256 0.34
257 0.3
258 0.27
259 0.25
260 0.21
261 0.21
262 0.25
263 0.31
264 0.37
265 0.44
266 0.51
267 0.54
268 0.61
269 0.7
270 0.74
271 0.75
272 0.79
273 0.79
274 0.76
275 0.7
276 0.62
277 0.52
278 0.44
279 0.33
280 0.23
281 0.16
282 0.1
283 0.08
284 0.12
285 0.15
286 0.15
287 0.17
288 0.2
289 0.23
290 0.28
291 0.34
292 0.32
293 0.29
294 0.32
295 0.35
296 0.39
297 0.38
298 0.36
299 0.3
300 0.32
301 0.32
302 0.29
303 0.23
304 0.16
305 0.15
306 0.12
307 0.11
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.15
318 0.15
319 0.16
320 0.19
321 0.21
322 0.22
323 0.25
324 0.27
325 0.21
326 0.21
327 0.2
328 0.18
329 0.21
330 0.24
331 0.21
332 0.2
333 0.21
334 0.23
335 0.26
336 0.28
337 0.24
338 0.21
339 0.2
340 0.19
341 0.18
342 0.17
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.07
361 0.08
362 0.07
363 0.08
364 0.07
365 0.08
366 0.11
367 0.11
368 0.14
369 0.15
370 0.16
371 0.15
372 0.17
373 0.2
374 0.2
375 0.26
376 0.24
377 0.25
378 0.26
379 0.34
380 0.39
381 0.42
382 0.46
383 0.5
384 0.54
385 0.57
386 0.6
387 0.53
388 0.48
389 0.47
390 0.42
391 0.37
392 0.33
393 0.31
394 0.3
395 0.33
396 0.33
397 0.3
398 0.28
399 0.23
400 0.24
401 0.23
402 0.19
403 0.16
404 0.2
405 0.25
406 0.32
407 0.34
408 0.37
409 0.38
410 0.42
411 0.51