Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VCA5

Protein Details
Accession A0A409VCA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-98GSPPNTTVADKKRKRREKEKERKAKVRDERKACGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-95KKRKRREKEKERKAKVRDERK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MNHAGDDLEDDFVLDDTVALSGDEDTEPVVTRLDDEDVFVDPGSEDDGQGGEDEDDAEDWNGINGSPPNTTVADKKRKRREKEKERKAKVRDERKACGWRSNVPYNQKRKLAEAAEDLQGSIAEQSPRELSDYLHSVQTKSFPNHSSIELEDIRIPGAFYLSLLWKCKLKLTIQTESSIADTTQWTGPRNLDHLVDFISKTLPTLRLRLGQRSKSNGAPTLLYVAGAALRVADVCRVLKTKQLRGDKGGEVAKLFAKHFKLSQHVTYLKQTKIGAAVGTPGRLGKLLNETDALNISALSHIILDITHKDSKNRNLLEIPETRDEIFQTVLKNEGILKGIKEGKIQVVLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.08
18 0.09
19 0.11
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.13
27 0.12
28 0.09
29 0.09
30 0.11
31 0.1
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.08
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.15
56 0.16
57 0.18
58 0.23
59 0.31
60 0.4
61 0.47
62 0.57
63 0.66
64 0.74
65 0.82
66 0.86
67 0.88
68 0.88
69 0.92
70 0.93
71 0.93
72 0.93
73 0.93
74 0.89
75 0.88
76 0.86
77 0.86
78 0.84
79 0.8
80 0.76
81 0.75
82 0.77
83 0.69
84 0.66
85 0.58
86 0.56
87 0.56
88 0.59
89 0.57
90 0.58
91 0.64
92 0.66
93 0.7
94 0.67
95 0.61
96 0.56
97 0.56
98 0.48
99 0.43
100 0.39
101 0.34
102 0.31
103 0.29
104 0.26
105 0.19
106 0.16
107 0.13
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.12
119 0.15
120 0.15
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.21
126 0.22
127 0.21
128 0.24
129 0.22
130 0.25
131 0.26
132 0.27
133 0.24
134 0.2
135 0.23
136 0.19
137 0.18
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.07
149 0.09
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.24
158 0.28
159 0.34
160 0.33
161 0.34
162 0.32
163 0.3
164 0.28
165 0.2
166 0.14
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.13
190 0.14
191 0.16
192 0.18
193 0.24
194 0.26
195 0.35
196 0.4
197 0.43
198 0.46
199 0.5
200 0.51
201 0.48
202 0.48
203 0.42
204 0.36
205 0.3
206 0.25
207 0.22
208 0.19
209 0.15
210 0.12
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.11
224 0.12
225 0.18
226 0.24
227 0.3
228 0.37
229 0.45
230 0.46
231 0.49
232 0.53
233 0.49
234 0.48
235 0.44
236 0.36
237 0.28
238 0.26
239 0.24
240 0.21
241 0.21
242 0.2
243 0.2
244 0.21
245 0.23
246 0.26
247 0.29
248 0.32
249 0.34
250 0.36
251 0.37
252 0.38
253 0.44
254 0.47
255 0.41
256 0.41
257 0.38
258 0.32
259 0.31
260 0.29
261 0.21
262 0.14
263 0.19
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.19
276 0.19
277 0.2
278 0.21
279 0.19
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.09
292 0.14
293 0.2
294 0.22
295 0.27
296 0.35
297 0.44
298 0.51
299 0.5
300 0.5
301 0.48
302 0.51
303 0.52
304 0.5
305 0.47
306 0.42
307 0.42
308 0.38
309 0.35
310 0.32
311 0.27
312 0.24
313 0.21
314 0.19
315 0.19
316 0.2
317 0.19
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.19
322 0.18
323 0.18
324 0.22
325 0.28
326 0.29
327 0.3
328 0.31
329 0.33