FuNGI

A0A409XXN8

Protein Details

Accession

A0A409XXN8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
262-401	DESDEQPSKKKKRKKTSEESDDDRSRSRRKRKKHAPSDEESSESESESKRKSKKKKRATSTAHSESESDLDTRVKKSKKKRSRSSDSESSSDEEERRRAKSKKKKKRASSESDSSGSDSDEPRKKSKSRSLKRSSSPTVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-297	SKKKKRKKTSEESDDDRSRSRRKRKKHAP
308-319	ESKRKSKKKKRA
334-345	RVKKSKKKRSRS
355-369	EERRRAKSKKKKKRA
383-393	PRKKSKSRSLK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSKRPPNELESRLHQAALSTPNNEITAKQAEAVIPDATARQNALNFLLAVGLFKPLKSSSGQISFRAVSKEEIVATKGLSGEENLVLSHIKAAGNEGIWTKHLKAKTSLHQTVIDRCLKTLTQKNLIKRVPSVQHITRKIYMLAGLEPSISLTGGPWYTDNELDTEFIKHLMDACYKLISDISFPKRRNGAEGALYPISNAPQYPTAESIRHSLRKARLTETDLSVEHVEMLLNVLVLDGKIEKIPAFGSALWNTDAIPDGDESDEQPSKKKKRKKTSEESDDDRSRSRRKRKKHAPSDEESSESESESKRKSKKKKRATSTAHSESESDLDTRVKKSKKKRSRSSDSESSSDEEERRRAKSKKKKKRASSESDSSGSDSDEPRKKSKSRSLKRSSSPTVAFDEFDTSSGGSVYRAIREAPATLSLTEAPCGLCPSFEFCKEGGPVNPQQCVYYGDWLVKGNIQNTEDT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.35
3	0.35
4	0.36
5	0.32
6	0.26
7	0.26
8	0.28
9	0.29
10	0.29
11	0.24
12	0.21
13	0.22
14	0.21
15	0.2
16	0.2
17	0.19
18	0.2
19	0.22
20	0.17
21	0.12
22	0.12
23	0.14
24	0.13
25	0.14
26	0.13
27	0.13
28	0.14
29	0.16
30	0.17
31	0.17
32	0.16
33	0.15
34	0.14
35	0.12
36	0.11
37	0.1
38	0.13
39	0.11
40	0.11
41	0.14
42	0.14
43	0.16
44	0.17
45	0.2
46	0.23
47	0.32
48	0.35
49	0.33
50	0.37
51	0.37
52	0.37
53	0.37
54	0.31
55	0.24
56	0.24
57	0.24
58	0.21
59	0.21
60	0.2
61	0.18
62	0.17
63	0.16
64	0.14
65	0.13
66	0.11
67	0.1
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.1
72	0.1
73	0.1
74	0.09
75	0.1
76	0.09
77	0.09
78	0.09
79	0.11
80	0.12
81	0.12
82	0.14
83	0.14
84	0.13
85	0.14
86	0.17
87	0.16
88	0.2
89	0.22
90	0.24
91	0.29
92	0.35
93	0.43
94	0.51
95	0.52
96	0.5
97	0.53
98	0.52
99	0.52
100	0.52
101	0.49
102	0.39
103	0.36
104	0.35
105	0.31
106	0.36
107	0.38
108	0.37
109	0.41
110	0.46
111	0.52
112	0.59
113	0.61
114	0.56
115	0.5
116	0.51
117	0.46
118	0.46
119	0.47
120	0.44
121	0.51
122	0.53
123	0.55
124	0.5
125	0.46
126	0.42
127	0.35
128	0.3
129	0.22
130	0.19
131	0.15
132	0.12
133	0.11
134	0.1
135	0.09
136	0.08
137	0.06
138	0.05
139	0.04
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.07
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.09
154	0.1
155	0.09
156	0.08
157	0.09
158	0.11
159	0.12
160	0.12
161	0.13
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.12
166	0.1
167	0.1
168	0.17
169	0.24
170	0.3
171	0.31
172	0.35
173	0.39
174	0.39
175	0.41
176	0.36
177	0.31
178	0.28
179	0.29
180	0.28
181	0.24
182	0.24
183	0.2
184	0.17
185	0.14
186	0.1
187	0.09
188	0.07
189	0.1
190	0.11
191	0.12
192	0.14
193	0.16
194	0.16
195	0.18
196	0.2
197	0.22
198	0.25
199	0.25
200	0.28
201	0.32
202	0.37
203	0.39
204	0.38
205	0.37
206	0.38
207	0.39
208	0.35
209	0.31
210	0.25
211	0.24
212	0.21
213	0.16
214	0.12
215	0.1
216	0.07
217	0.05
218	0.06
219	0.04
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.1
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.1
252	0.12
253	0.12
254	0.17
255	0.25
256	0.34
257	0.43
258	0.51
259	0.58
260	0.67
261	0.79
262	0.84
263	0.86
264	0.88
265	0.9
266	0.87
267	0.82
268	0.79
269	0.71
270	0.62
271	0.55
272	0.49
273	0.48
274	0.5
275	0.56
276	0.57
277	0.64
278	0.74
279	0.81
280	0.87
281	0.89
282	0.91
283	0.88
284	0.85
285	0.82
286	0.73
287	0.64
288	0.53
289	0.45
290	0.34
291	0.27
292	0.23
293	0.16
294	0.19
295	0.21
296	0.28
297	0.33
298	0.42
299	0.53
300	0.62
301	0.72
302	0.79
303	0.85
304	0.87
305	0.9
306	0.89
307	0.88
308	0.87
309	0.84
310	0.75
311	0.65
312	0.56
313	0.45
314	0.38
315	0.29
316	0.19
317	0.13
318	0.14
319	0.15
320	0.18
321	0.25
322	0.3
323	0.37
324	0.48
325	0.58
326	0.66
327	0.75
328	0.82
329	0.85
330	0.89
331	0.9
332	0.88
333	0.87
334	0.81
335	0.72
336	0.64
337	0.55
338	0.46
339	0.4
340	0.34
341	0.27
342	0.29
343	0.3
344	0.32
345	0.39
346	0.44
347	0.52
348	0.61
349	0.69
350	0.74
351	0.82
352	0.88
353	0.9
354	0.94
355	0.94
356	0.93
357	0.91
358	0.87
359	0.82
360	0.73
361	0.63
362	0.53
363	0.43
364	0.34
365	0.28
366	0.22
367	0.25
368	0.3
369	0.33
370	0.38
371	0.45
372	0.49
373	0.56
374	0.63
375	0.66
376	0.7
377	0.77
378	0.81
379	0.84
380	0.87
381	0.87
382	0.83
383	0.79
384	0.72
385	0.64
386	0.6
387	0.51
388	0.44
389	0.35
390	0.32
391	0.24
392	0.22
393	0.2
394	0.13
395	0.12
396	0.12
397	0.11
398	0.08
399	0.11
400	0.12
401	0.13
402	0.14
403	0.15
404	0.17
405	0.18
406	0.19
407	0.17
408	0.19
409	0.19
410	0.18
411	0.19
412	0.2
413	0.19
414	0.18
415	0.17
416	0.14
417	0.13
418	0.16
419	0.14
420	0.12
421	0.13
422	0.19
423	0.23
424	0.24
425	0.26
426	0.23
427	0.29
428	0.3
429	0.33
430	0.3
431	0.32
432	0.38
433	0.39
434	0.43
435	0.38
436	0.37
437	0.35
438	0.36
439	0.32
440	0.3
441	0.28
442	0.27
443	0.28
444	0.29
445	0.29
446	0.29
447	0.3
448	0.27
449	0.31

A0A409XXN8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer