FuNGI

A0A409YLE1

Protein Details

Accession

A0A409YLE1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-125	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPRIIYPVVEEEESTIPDTNGDSITVPLNITTANPNGVEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPATEEEMMLEIFSYTERIVNMIRPRSIIADGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEEARKESVLLWEAMGKELSEDEKNTVPWDSNAITPGTPFMDLLATSLRYWVVQKMNTDPGWRKMQVILSDAGVPGEGEHKIMDFIRRQRSSPTHDPNTKHVIYGLDADLIMLALATHEPNFRVLREDVFANDTSPNACRICGQEGHYAAQCTGTKAEIVKKPPSKKPFIFLDVAILREYLEVELEVPAVPFRFNLEMAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLRIWKQELPRMGGYLTNHGKLELSRAQIILEGLARREDDIFRRRREAEERQDQNAKRRKIEQERRNDFSAGPSQTMALSAPPSAPSSVPSIHPSLPQRPNFTSFAANADSIGLGAAPTAESIQNTPTAMQALAGSNRDVVANRRAIRMANMSAAEVLKAELSGLSPVKPSAPPPLPSPPPVVDALDAQNNIPGLGTDLQNDATPLAAPQPSVELPVDPDADAMPVSDDIENSDGLETDTLAGTKRKFEEGPAADDVVDDVVTVEEDDEEEEGVTPSLALKVNPDGTVEQEDTVKLWEPGYKERYYRQKFGVELTDTEFRKKITKSYMEGLSWVLHYYYQGTPSWKWYYPYHFAPFASDFEDVDKMDIKFELGQPFKPFEQLMGVFPAASRKHIPEVFQRLMIDEDSPIIDFYPPTFQIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQDRLLDAMALEYPKLTEEEIRRNRWGNNIIYASVDHPIYPFYEKLYGKRKSQDPVVIDTALSHGIAGSVLPNPECIPGSTYYSPLTKQGLPDIKNDCSLSVLYFFPKQLTPHRSVILPGTKRPPRVLSASDLEVTRNGGRGRGRGGWDRGGGNSNRGTGMDRNRNDPFHTRPNNYGQNYGNDRAGPGSANRGGYGHSGGYGGRGGGSYQPNTYSSRPPPYQSQQGPFNSYANSGGYGARSDYGGYGGYGGYGDSSYQRSDYNSYGSYGNATRNGYEAHSTANSYSSYNNGGYGGYGSSNNSGYQSRGGASHAGYNSRGRGRTW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.62
3	0.66
4	0.66
5	0.62
6	0.59
7	0.58
8	0.53
9	0.44
10	0.4
11	0.35
12	0.31
13	0.28
14	0.23
15	0.18
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.14
20	0.13
21	0.13
22	0.11
23	0.12
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.11
28	0.11
29	0.1
30	0.11
31	0.14
32	0.14
33	0.15
34	0.15
35	0.16
36	0.18
37	0.19
38	0.19
39	0.16
40	0.16
41	0.15
42	0.15
43	0.16
44	0.13
45	0.13
46	0.11
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.31
59	0.35
60	0.39
61	0.38
62	0.38
63	0.36
64	0.4
65	0.33
66	0.3
67	0.25
68	0.21
69	0.19
70	0.15
71	0.12
72	0.08
73	0.07
74	0.06
75	0.07
76	0.06
77	0.08
78	0.08
79	0.1
80	0.12
81	0.19
82	0.27
83	0.31
84	0.32
85	0.32
86	0.33
87	0.34
88	0.34
89	0.28
90	0.22
91	0.23
92	0.23
93	0.28
94	0.28
95	0.25
96	0.24
97	0.27
98	0.33
99	0.34
100	0.43
101	0.47
102	0.55
103	0.66
104	0.74
105	0.8
106	0.82
107	0.79
108	0.76
109	0.77
110	0.77
111	0.75
112	0.78
113	0.72
114	0.68
115	0.72
116	0.67
117	0.62
118	0.61
119	0.55
120	0.5
121	0.48
122	0.44
123	0.39
124	0.41
125	0.38
126	0.29
127	0.26
128	0.23
129	0.21
130	0.21
131	0.18
132	0.13
133	0.11
134	0.12
135	0.14
136	0.14
137	0.15
138	0.16
139	0.19
140	0.19
141	0.2
142	0.2
143	0.19
144	0.17
145	0.2
146	0.19
147	0.18
148	0.19
149	0.19
150	0.18
151	0.16
152	0.17
153	0.14
154	0.13
155	0.11
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.11
160	0.12
161	0.12
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.18
168	0.21
169	0.23
170	0.25
171	0.3
172	0.37
173	0.37
174	0.43
175	0.41
176	0.41
177	0.46
178	0.44
179	0.4
180	0.37
181	0.41
182	0.37
183	0.36
184	0.31
185	0.24
186	0.25
187	0.23
188	0.19
189	0.14
190	0.1
191	0.08
192	0.09
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.09
198	0.11
199	0.15
200	0.2
201	0.27
202	0.37
203	0.39
204	0.4
205	0.47
206	0.53
207	0.57
208	0.61
209	0.63
210	0.62
211	0.68
212	0.7
213	0.68
214	0.69
215	0.61
216	0.5
217	0.42
218	0.34
219	0.28
220	0.28
221	0.22
222	0.14
223	0.14
224	0.13
225	0.11
226	0.09
227	0.08
228	0.04
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.07
235	0.07
236	0.12
237	0.13
238	0.13
239	0.17
240	0.18
241	0.19
242	0.2
243	0.2
244	0.18
245	0.2
246	0.2
247	0.17
248	0.16
249	0.14
250	0.14
251	0.14
252	0.16
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.16
257	0.2
258	0.22
259	0.25
260	0.28
261	0.3
262	0.32
263	0.32
264	0.3
265	0.25
266	0.26
267	0.23
268	0.18
269	0.17
270	0.15
271	0.14
272	0.16
273	0.23
274	0.24
275	0.29
276	0.36
277	0.44
278	0.51
279	0.59
280	0.64
281	0.66
282	0.63
283	0.64
284	0.61
285	0.58
286	0.53
287	0.44
288	0.44
289	0.36
290	0.35
291	0.29
292	0.22
293	0.17
294	0.14
295	0.15
296	0.07
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.11
315	0.13
316	0.11
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.05
322	0.05
323	0.03
324	0.02
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.04
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.12
337	0.12
338	0.13
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.11
343	0.11
344	0.07
345	0.05
346	0.08
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.11
351	0.15
352	0.18
353	0.23
354	0.24
355	0.27
356	0.28
357	0.29
358	0.27
359	0.25
360	0.23
361	0.27
362	0.26
363	0.23
364	0.22
365	0.21
366	0.21
367	0.18
368	0.23
369	0.19
370	0.19
371	0.18
372	0.18
373	0.18
374	0.18
375	0.18
376	0.13
377	0.12
378	0.1
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.11
384	0.12
385	0.16
386	0.25
387	0.32
388	0.34
389	0.39
390	0.4
391	0.43
392	0.49
393	0.52
394	0.53
395	0.57
396	0.58
397	0.57
398	0.64
399	0.61
400	0.63
401	0.62
402	0.56
403	0.49
404	0.52
405	0.57
406	0.6
407	0.68
408	0.67
409	0.7
410	0.74
411	0.75
412	0.7
413	0.62
414	0.5
415	0.44
416	0.42
417	0.32
418	0.25
419	0.21
420	0.19
421	0.17
422	0.17
423	0.14
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.11
434	0.12
435	0.14
436	0.15
437	0.17
438	0.17
439	0.22
440	0.24
441	0.3
442	0.36
443	0.38
444	0.41
445	0.4
446	0.44
447	0.42
448	0.4
449	0.33
450	0.26
451	0.25
452	0.21
453	0.19
454	0.14
455	0.12
456	0.1
457	0.08
458	0.07
459	0.04
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.02
464	0.02
465	0.03
466	0.04
467	0.04
468	0.05
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.1
487	0.13
488	0.18
489	0.19
490	0.2
491	0.21
492	0.21
493	0.22
494	0.22
495	0.19
496	0.15
497	0.14
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.11
502	0.08
503	0.07
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.03
508	0.03
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.07
514	0.08
515	0.08
516	0.09
517	0.15
518	0.18
519	0.19
520	0.22
521	0.29
522	0.29
523	0.31
524	0.33
525	0.27
526	0.26
527	0.25
528	0.22
529	0.16
530	0.15
531	0.15
532	0.13
533	0.12
534	0.1
535	0.1
536	0.09
537	0.09
538	0.07
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.09
548	0.07
549	0.05
550	0.05
551	0.04
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.07
557	0.07
558	0.09
559	0.09
560	0.07
561	0.08
562	0.1
563	0.1
564	0.08
565	0.08
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.06
570	0.04
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.07
589	0.08
590	0.1
591	0.12
592	0.14
593	0.14
594	0.15
595	0.23
596	0.23
597	0.27
598	0.25
599	0.24
600	0.21
601	0.21
602	0.2
603	0.11
604	0.09
605	0.04
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.09
628	0.11
629	0.11
630	0.12
631	0.1
632	0.11
633	0.14
634	0.13
635	0.12
636	0.11
637	0.11
638	0.1
639	0.1
640	0.1
641	0.07
642	0.07
643	0.09
644	0.11
645	0.18
646	0.22
647	0.24
648	0.25
649	0.31
650	0.42
651	0.45
652	0.47
653	0.45
654	0.44
655	0.42
656	0.43
657	0.43
658	0.33
659	0.29
660	0.28
661	0.3
662	0.26
663	0.27
664	0.25
665	0.2
666	0.24
667	0.24
668	0.25
669	0.27
670	0.32
671	0.34
672	0.38
673	0.41
674	0.36
675	0.36
676	0.32
677	0.25
678	0.19
679	0.16
680	0.11
681	0.07
682	0.07
683	0.1
684	0.09
685	0.11
686	0.12
687	0.15
688	0.16
689	0.21
690	0.26
691	0.24
692	0.27
693	0.28
694	0.33
695	0.35
696	0.4
697	0.38
698	0.36
699	0.34
700	0.34
701	0.33
702	0.27
703	0.24
704	0.19
705	0.15
706	0.15
707	0.16
708	0.13
709	0.12
710	0.14
711	0.11
712	0.11
713	0.11
714	0.1
715	0.11
716	0.14
717	0.2
718	0.19
719	0.21
720	0.23
721	0.26
722	0.25
723	0.25
724	0.22
725	0.16
726	0.18
727	0.17
728	0.16
729	0.16
730	0.15
731	0.13
732	0.13
733	0.19
734	0.15
735	0.16
736	0.17
737	0.16
738	0.22
739	0.24
740	0.27
741	0.3
742	0.38
743	0.37
744	0.37
745	0.35
746	0.3
747	0.3
748	0.27
749	0.19
750	0.11
751	0.1
752	0.08
753	0.09
754	0.08
755	0.07
756	0.07
757	0.06
758	0.07
759	0.11
760	0.11
761	0.14
762	0.14
763	0.14
764	0.17
765	0.26
766	0.29
767	0.27
768	0.28
769	0.25
770	0.27
771	0.3
772	0.27
773	0.2
774	0.16
775	0.15
776	0.16
777	0.18
778	0.15
779	0.13
780	0.11
781	0.11
782	0.11
783	0.1
784	0.07
785	0.06
786	0.07
787	0.08
788	0.08
789	0.08
790	0.07
791	0.07
792	0.08
793	0.08
794	0.07
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.11
801	0.16
802	0.27
803	0.35
804	0.4
805	0.43
806	0.45
807	0.47
808	0.49
809	0.5
810	0.42
811	0.41
812	0.38
813	0.34
814	0.32
815	0.31
816	0.24
817	0.2
818	0.17
819	0.11
820	0.09
821	0.09
822	0.1
823	0.12
824	0.11
825	0.12
826	0.2
827	0.21
828	0.27
829	0.36
830	0.4
831	0.43
832	0.5
833	0.53
834	0.5
835	0.56
836	0.56
837	0.49
838	0.5
839	0.48
840	0.4
841	0.35
842	0.3
843	0.25
844	0.19
845	0.15
846	0.09
847	0.06
848	0.05
849	0.05
850	0.05
851	0.05
852	0.06
853	0.07
854	0.07
855	0.08
856	0.09
857	0.11
858	0.11
859	0.11
860	0.12
861	0.13
862	0.2
863	0.2
864	0.21
865	0.22
866	0.23
867	0.23
868	0.24
869	0.26
870	0.21
871	0.21
872	0.28
873	0.34
874	0.34
875	0.39
876	0.41
877	0.39
878	0.4
879	0.39
880	0.31
881	0.25
882	0.24
883	0.19
884	0.16
885	0.15
886	0.14
887	0.16
888	0.16
889	0.16
890	0.18
891	0.2
892	0.28
893	0.33
894	0.36
895	0.39
896	0.4
897	0.39
898	0.38
899	0.42
900	0.42
901	0.39
902	0.38
903	0.44
904	0.47
905	0.5
906	0.52
907	0.49
908	0.44
909	0.47
910	0.44
911	0.4
912	0.4
913	0.39
914	0.37
915	0.33
916	0.3
917	0.24
918	0.24
919	0.19
920	0.2
921	0.17
922	0.2
923	0.22
924	0.24
925	0.28
926	0.31
927	0.35
928	0.38
929	0.42
930	0.42
931	0.43
932	0.41
933	0.38
934	0.4
935	0.36
936	0.33
937	0.3
938	0.27
939	0.25
940	0.24
941	0.25
942	0.25
943	0.34
944	0.39
945	0.39
946	0.44
947	0.48
948	0.5
949	0.51
950	0.51
951	0.49
952	0.5
953	0.56
954	0.54
955	0.55
956	0.62
957	0.67
958	0.63
959	0.61
960	0.53
961	0.53
962	0.56
963	0.52
964	0.45
965	0.36
966	0.34
967	0.3
968	0.27
969	0.2
970	0.15
971	0.19
972	0.21
973	0.21
974	0.21
975	0.2
976	0.21
977	0.21
978	0.22
979	0.16
980	0.12
981	0.12
982	0.12
983	0.13
984	0.12
985	0.1
986	0.08
987	0.08
988	0.08
989	0.14
990	0.19
991	0.19
992	0.2
993	0.22
994	0.24
995	0.28
996	0.31
997	0.33
998	0.36
999	0.43
1000	0.45
1001	0.47
1002	0.54
1003	0.57
1004	0.64
1005	0.63
1006	0.63
1007	0.62
1008	0.63
1009	0.65
1010	0.58
1011	0.52
1012	0.43
1013	0.37
1014	0.32
1015	0.25
1016	0.22
1017	0.17
1018	0.16
1019	0.15
1020	0.15
1021	0.15
1022	0.13
1023	0.12
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.1
1028	0.09
1029	0.09
1030	0.08
1031	0.08
1032	0.07
1033	0.07
1034	0.06
1035	0.06
1036	0.07
1037	0.08
1038	0.11
1039	0.12
1040	0.13
1041	0.15
1042	0.17
1043	0.21
1044	0.23
1045	0.26
1046	0.25
1047	0.25
1048	0.25
1049	0.24
1050	0.25
1051	0.24
1052	0.25
1053	0.25
1054	0.25
1055	0.24
1056	0.25
1057	0.26
1058	0.24
1059	0.25
1060	0.21
1061	0.21
1062	0.21
1063	0.22
1064	0.21
1065	0.22
1066	0.21
1067	0.19
1068	0.19
1069	0.17
1070	0.2
1071	0.18
1072	0.18
1073	0.16
1074	0.15
1075	0.15
1076	0.15
1077	0.13
1078	0.11
1079	0.11
1080	0.13
1081	0.15
1082	0.16
1083	0.16
1084	0.17
1085	0.18
1086	0.18
1087	0.2
1088	0.2
1089	0.19
1090	0.18
1091	0.2
1092	0.2
1093	0.2
1094	0.25
1095	0.25
1096	0.26
1097	0.28
1098	0.3
1099	0.35
1100	0.39

A0A409YLE1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer