Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YMX7

Protein Details
Accession A0A409YMX7    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-79VDNDTPAPPAKKKRKRTPKSKRDGYAAQKHydrophilic
125-150PKSLSKSAKKKLREQKRKQKIESAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-72PAKKKRKRTPKSKR
129-160SKSAKKKLREQKRKQKIESAKESRRLKRIKQK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTRVTNFGRKRTYLQAGFSHDNDPVTTQPEASTSTATVQSNTTDAVTDQAVDNDTPAPPAKKKRKRTPKSKRDGYAAQKAAEAAKLNGGVSAEGAPAESLAQPSDGEEREGEASVDAGDTSTSTPKSLSKSAKKKLREQKRKQKIESAKESRRLKRIKQKAAETTCFVCREKGHAAKDCPTTQNGEKPAKVVGICYRCGSTKHSLSKCKKPANPEDPYPYASCFVCNGKGHLASACPQNKAKGIYPNGGCCKMCGSTAHLAKDCDVRKKVTTDPTNLVGTGDAAGADEDDFHLLKRKTTEIDRDEKKEAKVKQMLDIRTGKHSGVVRAFGSVQAPPKKVVVFKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.56
3 0.57
4 0.58
5 0.54
6 0.47
7 0.39
8 0.36
9 0.31
10 0.27
11 0.2
12 0.2
13 0.18
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.15
21 0.18
22 0.22
23 0.22
24 0.21
25 0.19
26 0.18
27 0.18
28 0.18
29 0.15
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.15
44 0.18
45 0.23
46 0.34
47 0.45
48 0.53
49 0.64
50 0.73
51 0.82
52 0.88
53 0.93
54 0.94
55 0.94
56 0.95
57 0.94
58 0.88
59 0.85
60 0.83
61 0.8
62 0.78
63 0.71
64 0.6
65 0.51
66 0.46
67 0.39
68 0.32
69 0.25
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.11
92 0.1
93 0.11
94 0.1
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.12
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.12
113 0.16
114 0.22
115 0.3
116 0.38
117 0.47
118 0.56
119 0.63
120 0.66
121 0.72
122 0.75
123 0.78
124 0.8
125 0.81
126 0.83
127 0.86
128 0.91
129 0.84
130 0.83
131 0.81
132 0.79
133 0.79
134 0.77
135 0.73
136 0.72
137 0.77
138 0.72
139 0.72
140 0.68
141 0.66
142 0.67
143 0.7
144 0.71
145 0.69
146 0.71
147 0.71
148 0.72
149 0.66
150 0.58
151 0.5
152 0.44
153 0.4
154 0.33
155 0.26
156 0.2
157 0.21
158 0.25
159 0.28
160 0.29
161 0.33
162 0.34
163 0.38
164 0.41
165 0.39
166 0.34
167 0.29
168 0.29
169 0.26
170 0.29
171 0.3
172 0.29
173 0.28
174 0.27
175 0.27
176 0.24
177 0.22
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.21
186 0.24
187 0.23
188 0.28
189 0.36
190 0.42
191 0.51
192 0.56
193 0.65
194 0.69
195 0.71
196 0.67
197 0.66
198 0.71
199 0.69
200 0.68
201 0.63
202 0.61
203 0.55
204 0.54
205 0.47
206 0.37
207 0.3
208 0.25
209 0.21
210 0.16
211 0.16
212 0.19
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.19
219 0.19
220 0.16
221 0.24
222 0.25
223 0.25
224 0.26
225 0.27
226 0.3
227 0.32
228 0.33
229 0.33
230 0.34
231 0.38
232 0.4
233 0.45
234 0.46
235 0.46
236 0.42
237 0.34
238 0.33
239 0.26
240 0.26
241 0.2
242 0.2
243 0.25
244 0.3
245 0.34
246 0.33
247 0.33
248 0.33
249 0.39
250 0.38
251 0.38
252 0.37
253 0.36
254 0.37
255 0.4
256 0.45
257 0.48
258 0.5
259 0.47
260 0.48
261 0.49
262 0.46
263 0.42
264 0.36
265 0.26
266 0.2
267 0.15
268 0.11
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.15
280 0.16
281 0.19
282 0.22
283 0.25
284 0.29
285 0.35
286 0.45
287 0.43
288 0.53
289 0.57
290 0.6
291 0.63
292 0.63
293 0.61
294 0.59
295 0.56
296 0.56
297 0.56
298 0.52
299 0.54
300 0.57
301 0.54
302 0.54
303 0.56
304 0.48
305 0.48
306 0.48
307 0.39
308 0.37
309 0.38
310 0.37
311 0.36
312 0.37
313 0.31
314 0.32
315 0.32
316 0.28
317 0.26
318 0.23
319 0.28
320 0.31
321 0.33
322 0.32
323 0.35
324 0.37