Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VTB1

Protein Details
Accession A0A409VTB1    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-280STAGRKSVDKKSPKKPRKSAATDDTSHydrophilic
309-328EDEKPPKKAKKDPALASKANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-162PPSGPKKGRPARGRSASPSRR
245-273RKNPQKKKATSTAGRKSVDKKSPKKPRKS
313-325PPKKAKKDPALAS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR023779  Chromodomain_CS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR008111  RNA-bd_8  
IPR000504  RRM_dom  
IPR033744  RRM_RBM8  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
PS50102  RRM  
CDD cd12324  RRM_RBM8  
Amino Acid Sequences MSDDEMNIDDMASGGAVRRRGRGFQNTGGNDATITAESTYDRVETTTKDSDTKAARSVEGWIVLVTNVHEEATEEDVQDKFAEFGEIKNLHLNLDRRTGYVKGYALVEYETMTEAQAAIDGASGTPLLEQVIQCDYAFVRPPPSGPKKGRPARGRSASPSRRSDQSVKVAEKSKVKVDQGDPESEGSDGESEYEIEEVLDARRGFFPEGRMGYYVKWKGYGPEDNSWVDEKDIENAQDLVNEFWRKNPQKKKATSTAGRKSVDKKSPKKPRKSAATDDTSDAGESATKKRGRKSSTHKVESEDEMDVDEDEKPPKKAKKDPALASKANSKKANTTTPEEPEIRVGNMKKYMGMPSWEGLVKTIDTVERDEETGELRIFFTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.11
3 0.16
4 0.18
5 0.25
6 0.28
7 0.34
8 0.42
9 0.49
10 0.53
11 0.56
12 0.64
13 0.59
14 0.59
15 0.54
16 0.46
17 0.36
18 0.29
19 0.23
20 0.13
21 0.12
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.13
32 0.2
33 0.24
34 0.25
35 0.27
36 0.28
37 0.33
38 0.36
39 0.37
40 0.36
41 0.32
42 0.31
43 0.29
44 0.32
45 0.28
46 0.24
47 0.22
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.1
59 0.14
60 0.14
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.13
67 0.09
68 0.08
69 0.11
70 0.09
71 0.1
72 0.17
73 0.18
74 0.18
75 0.22
76 0.22
77 0.2
78 0.26
79 0.29
80 0.24
81 0.3
82 0.3
83 0.27
84 0.29
85 0.29
86 0.25
87 0.26
88 0.24
89 0.18
90 0.19
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.11
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.23
130 0.3
131 0.37
132 0.4
133 0.48
134 0.56
135 0.63
136 0.71
137 0.7
138 0.7
139 0.71
140 0.73
141 0.67
142 0.64
143 0.67
144 0.66
145 0.65
146 0.62
147 0.55
148 0.51
149 0.53
150 0.51
151 0.46
152 0.47
153 0.47
154 0.44
155 0.45
156 0.46
157 0.45
158 0.44
159 0.4
160 0.36
161 0.34
162 0.33
163 0.33
164 0.31
165 0.35
166 0.32
167 0.32
168 0.28
169 0.24
170 0.24
171 0.19
172 0.17
173 0.09
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.14
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.23
201 0.24
202 0.19
203 0.2
204 0.19
205 0.2
206 0.24
207 0.29
208 0.26
209 0.27
210 0.3
211 0.29
212 0.3
213 0.29
214 0.25
215 0.19
216 0.15
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.13
228 0.15
229 0.14
230 0.17
231 0.27
232 0.32
233 0.41
234 0.5
235 0.56
236 0.64
237 0.71
238 0.76
239 0.75
240 0.78
241 0.77
242 0.77
243 0.76
244 0.74
245 0.69
246 0.65
247 0.62
248 0.62
249 0.62
250 0.62
251 0.61
252 0.64
253 0.74
254 0.8
255 0.85
256 0.85
257 0.85
258 0.86
259 0.85
260 0.84
261 0.81
262 0.78
263 0.69
264 0.62
265 0.53
266 0.43
267 0.35
268 0.25
269 0.16
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.2
274 0.25
275 0.29
276 0.36
277 0.45
278 0.48
279 0.56
280 0.63
281 0.66
282 0.72
283 0.76
284 0.71
285 0.67
286 0.65
287 0.59
288 0.52
289 0.41
290 0.31
291 0.24
292 0.22
293 0.18
294 0.14
295 0.12
296 0.1
297 0.14
298 0.17
299 0.19
300 0.27
301 0.34
302 0.41
303 0.49
304 0.58
305 0.64
306 0.71
307 0.77
308 0.8
309 0.81
310 0.76
311 0.7
312 0.69
313 0.64
314 0.63
315 0.58
316 0.5
317 0.5
318 0.53
319 0.59
320 0.54
321 0.54
322 0.53
323 0.53
324 0.57
325 0.51
326 0.46
327 0.42
328 0.39
329 0.34
330 0.35
331 0.32
332 0.32
333 0.35
334 0.35
335 0.33
336 0.33
337 0.36
338 0.32
339 0.34
340 0.3
341 0.26
342 0.29
343 0.29
344 0.26
345 0.23
346 0.22
347 0.18
348 0.16
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.19
353 0.2
354 0.2
355 0.2
356 0.2
357 0.19
358 0.19
359 0.21
360 0.19
361 0.16