Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409W553

Protein Details
Accession A0A409W553    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37TDSAVSPSKAKKNRRKITRKTAGNAGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-30KAKKNRRKITRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
CDD cd22391  KH-I_PNO1_rpt1  
cd22392  KH-I_PNO1_rpt2  
Amino Acid Sequences MVVTHITPMDTDSAVSPSKAKKNRRKITRKTAGNAGPSSSQSHRSEDNDEEMSFGTHDALSTPQAGSSSAPTQNADDEDELMIDTDPTALTTSNDAPAFPPLAPGADKTTLKSETRRIPIPPHRMTPLKKDWLNIFGPLTEILGLQVRMNVQRRCVEIRTSKHTKDIGAIQKGADFIKAYALGFDVNDAIALLRLDDLYLDSFEIKDVKTLHGDHLSRAIGRIAGQDGKTKFTIENTTRTRIVLADTKIHIMGSFQNIKIARDAIVSLILGSPPGKVYAGLRTVSSRMKQRAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.19
4 0.24
5 0.33
6 0.41
7 0.51
8 0.58
9 0.69
10 0.79
11 0.85
12 0.89
13 0.9
14 0.93
15 0.93
16 0.91
17 0.85
18 0.84
19 0.79
20 0.75
21 0.65
22 0.57
23 0.49
24 0.41
25 0.41
26 0.34
27 0.35
28 0.3
29 0.33
30 0.34
31 0.35
32 0.39
33 0.37
34 0.39
35 0.34
36 0.32
37 0.29
38 0.25
39 0.22
40 0.17
41 0.14
42 0.1
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.12
55 0.16
56 0.16
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.2
61 0.2
62 0.19
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.06
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.08
79 0.09
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.12
87 0.12
88 0.08
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.13
93 0.15
94 0.16
95 0.16
96 0.2
97 0.22
98 0.23
99 0.26
100 0.28
101 0.32
102 0.36
103 0.37
104 0.36
105 0.42
106 0.49
107 0.55
108 0.53
109 0.48
110 0.48
111 0.51
112 0.52
113 0.51
114 0.49
115 0.47
116 0.45
117 0.44
118 0.42
119 0.4
120 0.39
121 0.32
122 0.24
123 0.16
124 0.16
125 0.14
126 0.12
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.1
136 0.17
137 0.17
138 0.19
139 0.21
140 0.24
141 0.27
142 0.28
143 0.29
144 0.31
145 0.35
146 0.41
147 0.44
148 0.43
149 0.44
150 0.44
151 0.38
152 0.34
153 0.37
154 0.36
155 0.32
156 0.32
157 0.27
158 0.26
159 0.27
160 0.24
161 0.17
162 0.1
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.15
197 0.17
198 0.19
199 0.25
200 0.26
201 0.24
202 0.27
203 0.26
204 0.23
205 0.23
206 0.2
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.22
214 0.22
215 0.25
216 0.25
217 0.25
218 0.23
219 0.22
220 0.31
221 0.27
222 0.36
223 0.37
224 0.42
225 0.41
226 0.41
227 0.38
228 0.29
229 0.3
230 0.28
231 0.26
232 0.26
233 0.27
234 0.28
235 0.28
236 0.27
237 0.23
238 0.17
239 0.18
240 0.2
241 0.24
242 0.22
243 0.28
244 0.29
245 0.3
246 0.31
247 0.28
248 0.21
249 0.17
250 0.18
251 0.13
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.12
265 0.18
266 0.22
267 0.22
268 0.23
269 0.25
270 0.28
271 0.34
272 0.38
273 0.4