Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I6NDX7

Protein Details
Accession I6NDX7    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-85TTKRYHFTKAELKAKRRKRSGSGPWGKWHydrophilic
376-401IGVYSMKPKYKKHTKKIFKGHHSAGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-79LKAKRRKRSGS
387-387K
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.333, cyto 8, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG erc:Ecym_5528  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MPLVNNYSSTSEFEDEDSCNISDAKDSNPKGLRSKHIPASGQVVSTNNVTFSSLGSGTTKRYHFTKAELKAKRRKRSGSGPWGKWESSSDSDNNYEDGGIGSSHQYALDEGDFHSDDGADDGGEDIETSTFYGEKEKDYLGRGYLHTPSDIDINFNKEPLSFQCYLPKKIINVYDGHENGTTALKFLPKSGHLFLSGGNDNKLKIWDLYHDRRLLRDFCGHQKPIRDFNFTTDSKQFTSVSYDKFLKIWDTEKGAIIHRTKLTSVPNCVTFHPINNYELVVGLLNSEIKHYDTRDNYKNGLIQTYDHHTSSIIALKFFPNGSKFISSSEDKTIRIWDNQINIPIKQISDTAQHSMPWIEIHPEHNYFATQSMDNSIGVYSMKPKYKKHTKKIFKGHHSAGYGIRFDISPDGRYIASGDSMGRLFIWDWKTCRILKQFNAGTKDPLTNVAWNPQETSKVICSGNSGKIFLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.22
4 0.23
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.15
9 0.17
10 0.17
11 0.22
12 0.28
13 0.29
14 0.36
15 0.42
16 0.47
17 0.51
18 0.56
19 0.58
20 0.57
21 0.64
22 0.64
23 0.65
24 0.63
25 0.57
26 0.57
27 0.5
28 0.43
29 0.36
30 0.3
31 0.25
32 0.24
33 0.22
34 0.16
35 0.15
36 0.15
37 0.13
38 0.12
39 0.14
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.16
44 0.19
45 0.25
46 0.26
47 0.25
48 0.27
49 0.33
50 0.32
51 0.38
52 0.44
53 0.47
54 0.56
55 0.62
56 0.69
57 0.72
58 0.8
59 0.83
60 0.83
61 0.81
62 0.79
63 0.81
64 0.82
65 0.84
66 0.84
67 0.79
68 0.77
69 0.74
70 0.66
71 0.56
72 0.48
73 0.43
74 0.36
75 0.36
76 0.3
77 0.29
78 0.31
79 0.3
80 0.28
81 0.22
82 0.18
83 0.14
84 0.12
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.14
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.21
127 0.18
128 0.2
129 0.2
130 0.21
131 0.23
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.16
139 0.14
140 0.19
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.15
145 0.17
146 0.16
147 0.22
148 0.18
149 0.18
150 0.27
151 0.31
152 0.34
153 0.35
154 0.35
155 0.3
156 0.32
157 0.35
158 0.28
159 0.26
160 0.25
161 0.29
162 0.27
163 0.27
164 0.23
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.16
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.18
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.18
181 0.18
182 0.2
183 0.2
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.12
191 0.1
192 0.1
193 0.14
194 0.22
195 0.28
196 0.32
197 0.36
198 0.35
199 0.36
200 0.39
201 0.35
202 0.3
203 0.3
204 0.28
205 0.31
206 0.38
207 0.38
208 0.36
209 0.41
210 0.41
211 0.45
212 0.45
213 0.42
214 0.35
215 0.38
216 0.43
217 0.37
218 0.37
219 0.3
220 0.29
221 0.25
222 0.26
223 0.23
224 0.16
225 0.22
226 0.21
227 0.2
228 0.22
229 0.22
230 0.21
231 0.21
232 0.21
233 0.16
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.16
238 0.16
239 0.18
240 0.19
241 0.19
242 0.23
243 0.22
244 0.24
245 0.21
246 0.21
247 0.2
248 0.22
249 0.27
250 0.24
251 0.27
252 0.26
253 0.28
254 0.29
255 0.29
256 0.31
257 0.25
258 0.24
259 0.25
260 0.25
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.15
265 0.14
266 0.12
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.11
278 0.17
279 0.21
280 0.28
281 0.34
282 0.37
283 0.37
284 0.37
285 0.38
286 0.33
287 0.3
288 0.23
289 0.18
290 0.18
291 0.22
292 0.22
293 0.19
294 0.19
295 0.17
296 0.17
297 0.18
298 0.21
299 0.16
300 0.14
301 0.15
302 0.15
303 0.17
304 0.16
305 0.17
306 0.13
307 0.14
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.23
313 0.22
314 0.24
315 0.29
316 0.29
317 0.27
318 0.28
319 0.31
320 0.29
321 0.29
322 0.3
323 0.27
324 0.29
325 0.31
326 0.36
327 0.33
328 0.3
329 0.31
330 0.27
331 0.24
332 0.2
333 0.19
334 0.15
335 0.17
336 0.2
337 0.2
338 0.2
339 0.2
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.14
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.2
349 0.21
350 0.22
351 0.21
352 0.21
353 0.18
354 0.18
355 0.18
356 0.14
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.13
367 0.18
368 0.25
369 0.3
370 0.35
371 0.45
372 0.56
373 0.66
374 0.71
375 0.77
376 0.81
377 0.86
378 0.93
379 0.93
380 0.91
381 0.89
382 0.84
383 0.8
384 0.71
385 0.63
386 0.56
387 0.5
388 0.41
389 0.32
390 0.27
391 0.2
392 0.19
393 0.23
394 0.2
395 0.18
396 0.18
397 0.2
398 0.19
399 0.19
400 0.19
401 0.14
402 0.13
403 0.12
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.16
412 0.2
413 0.23
414 0.26
415 0.31
416 0.36
417 0.37
418 0.45
419 0.47
420 0.52
421 0.52
422 0.59
423 0.61
424 0.63
425 0.67
426 0.61
427 0.56
428 0.51
429 0.48
430 0.39
431 0.37
432 0.32
433 0.31
434 0.31
435 0.34
436 0.35
437 0.33
438 0.36
439 0.33
440 0.35
441 0.3
442 0.34
443 0.29
444 0.3
445 0.3
446 0.27
447 0.31
448 0.33
449 0.4
450 0.37
451 0.35