Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YMW9

Protein Details
Accession A0A409YMW9    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-104SASGGSSNRRHKKKSSEGSGPKSKTHydrophilic
397-426SATPSKPKPSTSKKKRYKEVKKMEQRVRTAHydrophilic
628-649STSHNTPKAKSKTKKTPNYSGSHydrophilic
795-819GVGVMKSPKKDKEKAKKLEKHDSMSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-103RRHKKKSSEGSGPKSK
402-418KPKPSTSKKKRYKEVKK
802-811PKKDKEKAKK
Subcellular Location(s) cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5, mito 4, extr 3, plas 2, pero 2, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
Amino Acid Sequences MNLQDVLKSTWFQQTAPFIVVILVPTLAVFLSKFLRQLWYSFSSFNLPLTLEVFGAYRSLRMGLESLGLSWLWSNSSSGSASGGSSNRRHKKKSSEGSGPKSKTIRSRSDQIALRNVGKQKQDTYDSESDDAQYYPGLVNISGTYCFMNSTLQAMASLSYLQPQIEAIQAKAEALDVPTPVIDALQELFTTLNTPKSRYNALRPEGMISALSCPPPLSSGSKDSATLYRTSSSLFNSREHQDAQELFQLVSECIKNEMAAVDRESQRDRGIAAVLDFTKKDGEKVDDEDLALASKSVFDGLTANRRSCVVCGYTEAVMHFGFDNWQLAVPRLATSCRLEDCLEDYTRLEILKDCICRNCSILATHKRLLQELKTLEEALANPAASTDPSSSSMPSTSATPSKPKPSTSKKKRYKEVKKMEQRVRTAIEEGRIEDDALLEGVRLEKVVSPASTKQAMIARPPPVLALHLNRSVHYGNFAAKNTIRVLFPEVLDLTPYTTSGSLSTVPTSSISTPSPPPTQTTFSSPSPFQFQASSGVSDVDSSISSSQPPRRSTTPTPETYANGHQRTIYRLAAVVCHYGQHSFGHYICYRRKPRRLGGKWLPPTLVDPLKFEEESDEEDGGAKKPNGSTSHNTPKAKSKTKKTPNYSGSSSLGESRYYWEDHTEELAGTGRGWLRISDDSVSECGIESVLAEGSGAFMLYYEKAVHPKPGVYLPKERPEKDAKTSQSRSRGHLENGHHVEDDRSTVDGDADGDAFSIGSEETLKPEMRVMDLNLNLNHLHLNGNGSVGSLMSEVGVGVMKSPKKDKEKAKKLEKHDSMSMSAILPLPSSASSVSSSSSLSRRFGARIIRSVNAKRRADPSSTAALSSSTSTSPPTSTLGLTTPLASPSQNGESIEEGQDMDEQAWADMTASAPSILPTQSTHKSYPLGSKSTKVLHHRPAGAKMQLAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.33
4 0.31
5 0.23
6 0.22
7 0.22
8 0.17
9 0.12
10 0.09
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.05
17 0.07
18 0.11
19 0.12
20 0.14
21 0.15
22 0.22
23 0.22
24 0.24
25 0.28
26 0.31
27 0.32
28 0.31
29 0.31
30 0.31
31 0.3
32 0.29
33 0.24
34 0.19
35 0.18
36 0.19
37 0.18
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.13
67 0.12
68 0.12
69 0.15
70 0.18
71 0.21
72 0.28
73 0.38
74 0.47
75 0.54
76 0.6
77 0.64
78 0.71
79 0.77
80 0.8
81 0.79
82 0.8
83 0.82
84 0.86
85 0.88
86 0.8
87 0.75
88 0.68
89 0.64
90 0.62
91 0.61
92 0.61
93 0.57
94 0.62
95 0.61
96 0.66
97 0.66
98 0.62
99 0.62
100 0.57
101 0.53
102 0.51
103 0.51
104 0.48
105 0.48
106 0.47
107 0.43
108 0.45
109 0.48
110 0.45
111 0.48
112 0.48
113 0.46
114 0.44
115 0.39
116 0.35
117 0.3
118 0.27
119 0.19
120 0.14
121 0.11
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.13
153 0.14
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.16
180 0.17
181 0.2
182 0.23
183 0.27
184 0.35
185 0.38
186 0.46
187 0.48
188 0.5
189 0.52
190 0.49
191 0.48
192 0.41
193 0.36
194 0.27
195 0.18
196 0.18
197 0.15
198 0.15
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.17
206 0.22
207 0.24
208 0.25
209 0.26
210 0.27
211 0.27
212 0.25
213 0.23
214 0.21
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.24
221 0.25
222 0.25
223 0.28
224 0.3
225 0.32
226 0.32
227 0.29
228 0.27
229 0.25
230 0.25
231 0.25
232 0.24
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.15
237 0.17
238 0.15
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.18
249 0.2
250 0.22
251 0.24
252 0.24
253 0.23
254 0.22
255 0.2
256 0.16
257 0.15
258 0.13
259 0.11
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.18
270 0.19
271 0.23
272 0.25
273 0.22
274 0.22
275 0.21
276 0.18
277 0.15
278 0.12
279 0.08
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.07
287 0.09
288 0.18
289 0.21
290 0.21
291 0.21
292 0.22
293 0.23
294 0.21
295 0.22
296 0.15
297 0.13
298 0.15
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.14
304 0.12
305 0.12
306 0.09
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.18
328 0.19
329 0.18
330 0.16
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.12
336 0.09
337 0.11
338 0.15
339 0.18
340 0.18
341 0.21
342 0.23
343 0.23
344 0.24
345 0.23
346 0.2
347 0.19
348 0.27
349 0.31
350 0.35
351 0.37
352 0.38
353 0.37
354 0.38
355 0.38
356 0.3
357 0.29
358 0.24
359 0.24
360 0.22
361 0.22
362 0.2
363 0.18
364 0.16
365 0.12
366 0.11
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.14
385 0.15
386 0.2
387 0.22
388 0.3
389 0.32
390 0.34
391 0.41
392 0.49
393 0.59
394 0.64
395 0.72
396 0.75
397 0.82
398 0.87
399 0.9
400 0.9
401 0.89
402 0.89
403 0.89
404 0.89
405 0.9
406 0.88
407 0.84
408 0.75
409 0.68
410 0.6
411 0.5
412 0.43
413 0.34
414 0.29
415 0.22
416 0.2
417 0.18
418 0.15
419 0.14
420 0.11
421 0.1
422 0.07
423 0.06
424 0.05
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.06
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.12
437 0.15
438 0.16
439 0.14
440 0.16
441 0.18
442 0.18
443 0.19
444 0.22
445 0.21
446 0.2
447 0.21
448 0.18
449 0.15
450 0.16
451 0.15
452 0.13
453 0.14
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.21
458 0.2
459 0.17
460 0.16
461 0.14
462 0.12
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.14
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.14
471 0.12
472 0.15
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.13
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.11
499 0.13
500 0.17
501 0.18
502 0.18
503 0.2
504 0.21
505 0.25
506 0.24
507 0.27
508 0.28
509 0.28
510 0.3
511 0.28
512 0.25
513 0.27
514 0.26
515 0.21
516 0.17
517 0.16
518 0.18
519 0.19
520 0.18
521 0.13
522 0.13
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.11
533 0.17
534 0.23
535 0.25
536 0.29
537 0.31
538 0.39
539 0.43
540 0.48
541 0.5
542 0.46
543 0.47
544 0.44
545 0.43
546 0.39
547 0.41
548 0.39
549 0.33
550 0.31
551 0.29
552 0.29
553 0.31
554 0.31
555 0.24
556 0.17
557 0.17
558 0.17
559 0.17
560 0.17
561 0.15
562 0.11
563 0.12
564 0.12
565 0.1
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.16
572 0.17
573 0.23
574 0.28
575 0.37
576 0.44
577 0.51
578 0.59
579 0.62
580 0.69
581 0.75
582 0.75
583 0.76
584 0.76
585 0.77
586 0.75
587 0.69
588 0.61
589 0.49
590 0.45
591 0.4
592 0.34
593 0.25
594 0.21
595 0.21
596 0.24
597 0.23
598 0.21
599 0.18
600 0.15
601 0.18
602 0.18
603 0.16
604 0.13
605 0.14
606 0.15
607 0.14
608 0.16
609 0.13
610 0.12
611 0.13
612 0.18
613 0.21
614 0.25
615 0.3
616 0.35
617 0.46
618 0.53
619 0.53
620 0.5
621 0.56
622 0.6
623 0.65
624 0.64
625 0.63
626 0.67
627 0.76
628 0.84
629 0.82
630 0.83
631 0.8
632 0.78
633 0.71
634 0.64
635 0.56
636 0.47
637 0.41
638 0.33
639 0.27
640 0.22
641 0.19
642 0.18
643 0.18
644 0.17
645 0.17
646 0.16
647 0.16
648 0.16
649 0.17
650 0.15
651 0.12
652 0.12
653 0.12
654 0.1
655 0.09
656 0.1
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.1
661 0.12
662 0.13
663 0.15
664 0.14
665 0.14
666 0.15
667 0.15
668 0.15
669 0.12
670 0.1
671 0.08
672 0.07
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.03
684 0.03
685 0.04
686 0.05
687 0.06
688 0.07
689 0.08
690 0.13
691 0.14
692 0.18
693 0.18
694 0.19
695 0.21
696 0.27
697 0.32
698 0.33
699 0.42
700 0.44
701 0.52
702 0.59
703 0.57
704 0.56
705 0.58
706 0.59
707 0.56
708 0.59
709 0.56
710 0.59
711 0.64
712 0.65
713 0.66
714 0.63
715 0.61
716 0.59
717 0.58
718 0.52
719 0.53
720 0.5
721 0.5
722 0.51
723 0.48
724 0.42
725 0.37
726 0.34
727 0.27
728 0.25
729 0.15
730 0.12
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.1
735 0.1
736 0.08
737 0.08
738 0.07
739 0.06
740 0.06
741 0.06
742 0.05
743 0.05
744 0.04
745 0.04
746 0.06
747 0.06
748 0.09
749 0.12
750 0.13
751 0.13
752 0.16
753 0.16
754 0.16
755 0.18
756 0.18
757 0.22
758 0.24
759 0.28
760 0.26
761 0.27
762 0.25
763 0.23
764 0.21
765 0.15
766 0.14
767 0.1
768 0.13
769 0.11
770 0.12
771 0.11
772 0.11
773 0.1
774 0.09
775 0.08
776 0.06
777 0.06
778 0.05
779 0.05
780 0.04
781 0.05
782 0.05
783 0.04
784 0.06
785 0.12
786 0.14
787 0.18
788 0.24
789 0.32
790 0.4
791 0.49
792 0.58
793 0.64
794 0.73
795 0.8
796 0.86
797 0.86
798 0.86
799 0.89
800 0.85
801 0.79
802 0.75
803 0.67
804 0.58
805 0.51
806 0.44
807 0.33
808 0.27
809 0.23
810 0.17
811 0.13
812 0.11
813 0.11
814 0.1
815 0.11
816 0.09
817 0.1
818 0.11
819 0.12
820 0.13
821 0.13
822 0.13
823 0.16
824 0.21
825 0.22
826 0.22
827 0.25
828 0.26
829 0.27
830 0.31
831 0.37
832 0.37
833 0.42
834 0.44
835 0.45
836 0.5
837 0.57
838 0.62
839 0.62
840 0.6
841 0.57
842 0.59
843 0.59
844 0.56
845 0.52
846 0.47
847 0.46
848 0.43
849 0.39
850 0.34
851 0.3
852 0.26
853 0.23
854 0.2
855 0.12
856 0.13
857 0.15
858 0.16
859 0.16
860 0.17
861 0.18
862 0.18
863 0.17
864 0.18
865 0.18
866 0.19
867 0.19
868 0.18
869 0.17
870 0.16
871 0.17
872 0.15
873 0.15
874 0.17
875 0.2
876 0.21
877 0.21
878 0.21
879 0.23
880 0.26
881 0.26
882 0.22
883 0.18
884 0.16
885 0.17
886 0.15
887 0.13
888 0.12
889 0.1
890 0.09
891 0.1
892 0.09
893 0.08
894 0.08
895 0.09
896 0.08
897 0.08
898 0.08
899 0.08
900 0.09
901 0.11
902 0.1
903 0.11
904 0.13
905 0.2
906 0.26
907 0.31
908 0.33
909 0.35
910 0.37
911 0.4
912 0.47
913 0.46
914 0.47
915 0.44
916 0.46
917 0.48
918 0.52
919 0.56
920 0.55
921 0.58
922 0.6
923 0.65
924 0.69
925 0.69
926 0.69
927 0.69
928 0.64