Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WBG9

Protein Details
Accession A0A409WBG9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MADNRRPRKRARVSPVRRSLYIHydrophilic
222-242QTWVRVCKPPKKYKMYQGDIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-12RPRKRAR
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10.5, cyto 7.5, plas 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005824  KOW  
IPR005100  NGN-domain  
IPR036735  NGN_dom_sf  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR039659  SPT5  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0032784  P:regulation of DNA-templated transcription elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03439  Spt5-NGN  
Amino Acid Sequences MADNRRPRKRARVSPVRRSLYILEKTWLFSGCKPANPFLDLEAQVEEDEEDVDSELEAEIFGVDEIEDEEEDVLSHRVLAQAVNETTGNVFWDQVVGRLEAQIHNLGRRILQDSETEDGGPTLPKPSDLLFEIPCTVGKEEALVFKLMTMAFALQDPKTFARSIFARKTMPGRVYVEVPSMERAKAIARIVPDLRGSKIQLVPQDWMTRLLQVAPRPAIKAQTWVRVCKPPKKYKMYQGDIAFVVKVERSRIQICLPQRYEVTEGEEGDALRPRRRLPVLVELDVLKAKLEQLKAKGEVIDHTDQGYLLMDGPVDMVTYGTHIWPIADEFRFFLGCTLLDDHLRASTQAMILKNALRPGDRVKVTAGSLLGLCGTVAELSEDTVDVHIESLDIRETVLLTEIRAYFKEGDLVRVKGGAWKDVVGWVTEVRDLRATVHRNDKHEEDAIALINLEFYEEVEMMQLRPIVPPAVRAFKEARALFERQSMRENPNAKYHGKQVMVTGGHHLKGVRGTIRDTTAAGDAIVEVHLFNLPRQKIPLKMLRIFRGNNLHAMIDGFQRADSETSSSGSSSAGPSRLVNYPALTPMQDTMVCPSTPLPVEPSSNEDPAWDPSSATPRTIADADIEPPFWLSDERFMGVRVQLIERGGDPFRRMEFKGIAGDTVTVQDRMQTRSFALTKVIPILANRKDDILACFAEGDHFGRMFKVKTFGSDKCVVRPLGMKSGKGEKLLTLETSSLVIVYPPTPHIHTLMVVDTEIVSFYFLEDEFGGSSRQTTYGVKKMIERIIIPALDEVEIGLAGVMGPSFRLNDFYFLLCADLRGRQHALEQIIVVDAFDVYDRFCFSVEVLEQGTREKYSVVSNFTVGGNGWGRDVNDSRAIQVISIFPAAAFNFGPEVWTVKNKDVMNCPFGWCTIEALGRYDPEKGGHIILWELGLIIEFPAGSLVLITSACITHSNTPACVEEGKYRASFTQYAAGALFRFVDYDFRTEADLKSEDKAKYEEMCRLKSSHWERGFGLLTKITDIWPSKQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.93
3 0.88
4 0.78
5 0.72
6 0.66
7 0.65
8 0.61
9 0.52
10 0.46
11 0.41
12 0.42
13 0.39
14 0.38
15 0.31
16 0.27
17 0.35
18 0.35
19 0.4
20 0.42
21 0.45
22 0.45
23 0.45
24 0.42
25 0.35
26 0.38
27 0.33
28 0.3
29 0.25
30 0.23
31 0.2
32 0.2
33 0.17
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.04
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.17
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.1
77 0.1
78 0.08
79 0.11
80 0.11
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.18
87 0.17
88 0.19
89 0.22
90 0.22
91 0.23
92 0.25
93 0.25
94 0.24
95 0.26
96 0.27
97 0.23
98 0.23
99 0.23
100 0.25
101 0.27
102 0.26
103 0.24
104 0.2
105 0.18
106 0.17
107 0.15
108 0.12
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.18
115 0.19
116 0.23
117 0.2
118 0.21
119 0.22
120 0.21
121 0.21
122 0.2
123 0.19
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.14
132 0.14
133 0.16
134 0.14
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.1
140 0.13
141 0.11
142 0.13
143 0.16
144 0.16
145 0.19
146 0.19
147 0.17
148 0.21
149 0.25
150 0.33
151 0.36
152 0.39
153 0.39
154 0.42
155 0.47
156 0.48
157 0.45
158 0.42
159 0.38
160 0.36
161 0.37
162 0.35
163 0.32
164 0.27
165 0.26
166 0.24
167 0.22
168 0.2
169 0.17
170 0.16
171 0.16
172 0.19
173 0.19
174 0.17
175 0.17
176 0.22
177 0.23
178 0.25
179 0.27
180 0.25
181 0.26
182 0.26
183 0.26
184 0.27
185 0.29
186 0.3
187 0.31
188 0.31
189 0.31
190 0.32
191 0.34
192 0.29
193 0.29
194 0.26
195 0.23
196 0.21
197 0.22
198 0.22
199 0.21
200 0.26
201 0.26
202 0.27
203 0.28
204 0.29
205 0.3
206 0.26
207 0.32
208 0.31
209 0.37
210 0.39
211 0.42
212 0.45
213 0.5
214 0.56
215 0.56
216 0.63
217 0.64
218 0.7
219 0.75
220 0.78
221 0.79
222 0.83
223 0.8
224 0.77
225 0.68
226 0.62
227 0.53
228 0.47
229 0.36
230 0.25
231 0.2
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.18
237 0.2
238 0.22
239 0.24
240 0.29
241 0.33
242 0.4
243 0.39
244 0.37
245 0.36
246 0.37
247 0.36
248 0.32
249 0.32
250 0.24
251 0.22
252 0.21
253 0.21
254 0.19
255 0.17
256 0.21
257 0.18
258 0.2
259 0.22
260 0.22
261 0.29
262 0.31
263 0.33
264 0.33
265 0.41
266 0.43
267 0.42
268 0.41
269 0.34
270 0.33
271 0.3
272 0.25
273 0.15
274 0.09
275 0.1
276 0.13
277 0.15
278 0.18
279 0.22
280 0.27
281 0.29
282 0.3
283 0.29
284 0.25
285 0.24
286 0.26
287 0.24
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.14
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.08
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.09
322 0.08
323 0.09
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.18
343 0.15
344 0.17
345 0.2
346 0.26
347 0.25
348 0.24
349 0.23
350 0.24
351 0.24
352 0.24
353 0.19
354 0.12
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.06
359 0.06
360 0.04
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.11
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.17
395 0.15
396 0.19
397 0.21
398 0.21
399 0.19
400 0.19
401 0.19
402 0.17
403 0.17
404 0.14
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.13
409 0.13
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.11
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.12
420 0.18
421 0.21
422 0.22
423 0.32
424 0.35
425 0.37
426 0.4
427 0.4
428 0.36
429 0.34
430 0.3
431 0.21
432 0.18
433 0.15
434 0.12
435 0.1
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.1
456 0.12
457 0.18
458 0.18
459 0.2
460 0.22
461 0.23
462 0.3
463 0.27
464 0.28
465 0.26
466 0.27
467 0.25
468 0.3
469 0.29
470 0.24
471 0.28
472 0.27
473 0.26
474 0.3
475 0.33
476 0.28
477 0.33
478 0.36
479 0.33
480 0.32
481 0.34
482 0.34
483 0.31
484 0.3
485 0.24
486 0.25
487 0.25
488 0.23
489 0.22
490 0.17
491 0.16
492 0.16
493 0.16
494 0.11
495 0.12
496 0.13
497 0.11
498 0.11
499 0.12
500 0.13
501 0.14
502 0.14
503 0.13
504 0.13
505 0.11
506 0.1
507 0.08
508 0.07
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.04
513 0.03
514 0.03
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.11
519 0.12
520 0.13
521 0.16
522 0.17
523 0.19
524 0.25
525 0.31
526 0.31
527 0.36
528 0.39
529 0.4
530 0.43
531 0.41
532 0.39
533 0.4
534 0.35
535 0.31
536 0.28
537 0.24
538 0.19
539 0.19
540 0.16
541 0.1
542 0.09
543 0.07
544 0.06
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.11
563 0.13
564 0.14
565 0.14
566 0.13
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.11
571 0.1
572 0.09
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.1
577 0.12
578 0.11
579 0.11
580 0.11
581 0.12
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.12
586 0.14
587 0.14
588 0.2
589 0.2
590 0.21
591 0.2
592 0.17
593 0.17
594 0.19
595 0.21
596 0.15
597 0.12
598 0.13
599 0.2
600 0.2
601 0.18
602 0.17
603 0.15
604 0.17
605 0.17
606 0.16
607 0.11
608 0.12
609 0.13
610 0.12
611 0.12
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.08
616 0.08
617 0.06
618 0.1
619 0.1
620 0.11
621 0.11
622 0.12
623 0.13
624 0.12
625 0.14
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.11
631 0.1
632 0.13
633 0.12
634 0.13
635 0.13
636 0.14
637 0.15
638 0.19
639 0.19
640 0.2
641 0.2
642 0.21
643 0.23
644 0.21
645 0.2
646 0.16
647 0.16
648 0.12
649 0.13
650 0.12
651 0.08
652 0.08
653 0.12
654 0.13
655 0.17
656 0.18
657 0.17
658 0.17
659 0.22
660 0.23
661 0.2
662 0.21
663 0.18
664 0.17
665 0.18
666 0.18
667 0.13
668 0.14
669 0.2
670 0.22
671 0.23
672 0.23
673 0.22
674 0.22
675 0.22
676 0.23
677 0.19
678 0.14
679 0.12
680 0.12
681 0.11
682 0.11
683 0.11
684 0.1
685 0.09
686 0.09
687 0.08
688 0.09
689 0.12
690 0.12
691 0.13
692 0.16
693 0.15
694 0.2
695 0.25
696 0.26
697 0.3
698 0.37
699 0.36
700 0.35
701 0.4
702 0.35
703 0.31
704 0.34
705 0.31
706 0.34
707 0.35
708 0.32
709 0.3
710 0.38
711 0.39
712 0.36
713 0.33
714 0.24
715 0.25
716 0.26
717 0.24
718 0.16
719 0.14
720 0.13
721 0.13
722 0.12
723 0.08
724 0.07
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.08
730 0.11
731 0.12
732 0.13
733 0.15
734 0.15
735 0.15
736 0.15
737 0.15
738 0.13
739 0.11
740 0.11
741 0.09
742 0.08
743 0.07
744 0.06
745 0.05
746 0.04
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.07
751 0.06
752 0.07
753 0.07
754 0.08
755 0.08
756 0.07
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.1
761 0.13
762 0.18
763 0.24
764 0.28
765 0.28
766 0.31
767 0.36
768 0.37
769 0.36
770 0.31
771 0.28
772 0.29
773 0.28
774 0.25
775 0.2
776 0.17
777 0.14
778 0.13
779 0.1
780 0.06
781 0.05
782 0.05
783 0.04
784 0.03
785 0.02
786 0.03
787 0.03
788 0.02
789 0.03
790 0.04
791 0.05
792 0.05
793 0.09
794 0.1
795 0.13
796 0.15
797 0.16
798 0.16
799 0.15
800 0.16
801 0.12
802 0.13
803 0.11
804 0.14
805 0.14
806 0.18
807 0.19
808 0.18
809 0.21
810 0.25
811 0.25
812 0.21
813 0.2
814 0.16
815 0.16
816 0.15
817 0.12
818 0.08
819 0.06
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.06
825 0.07
826 0.07
827 0.08
828 0.08
829 0.08
830 0.13
831 0.13
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.16
836 0.18
837 0.19
838 0.14
839 0.14
840 0.13
841 0.12
842 0.18
843 0.22
844 0.24
845 0.24
846 0.24
847 0.25
848 0.24
849 0.24
850 0.17
851 0.18
852 0.15
853 0.14
854 0.14
855 0.14
856 0.15
857 0.19
858 0.21
859 0.2
860 0.24
861 0.24
862 0.24
863 0.26
864 0.26
865 0.21
866 0.21
867 0.18
868 0.14
869 0.14
870 0.13
871 0.09
872 0.11
873 0.11
874 0.12
875 0.1
876 0.09
877 0.1
878 0.1
879 0.11
880 0.09
881 0.12
882 0.12
883 0.18
884 0.21
885 0.23
886 0.3
887 0.31
888 0.36
889 0.42
890 0.45
891 0.44
892 0.43
893 0.42
894 0.37
895 0.35
896 0.32
897 0.24
898 0.21
899 0.19
900 0.21
901 0.18
902 0.21
903 0.22
904 0.21
905 0.21
906 0.21
907 0.19
908 0.18
909 0.2
910 0.18
911 0.19
912 0.18
913 0.17
914 0.16
915 0.15
916 0.14
917 0.11
918 0.09
919 0.07
920 0.06
921 0.05
922 0.05
923 0.04
924 0.04
925 0.04
926 0.04
927 0.05
928 0.04
929 0.04
930 0.04
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.06
935 0.06
936 0.07
937 0.09
938 0.12
939 0.16
940 0.23
941 0.25
942 0.25
943 0.28
944 0.29
945 0.29
946 0.28
947 0.25
948 0.26
949 0.26
950 0.3
951 0.28
952 0.28
953 0.28
954 0.31
955 0.3
956 0.26
957 0.3
958 0.26
959 0.27
960 0.26
961 0.25
962 0.2
963 0.19
964 0.17
965 0.1
966 0.1
967 0.09
968 0.15
969 0.16
970 0.19
971 0.19
972 0.19
973 0.22
974 0.24
975 0.24
976 0.24
977 0.24
978 0.22
979 0.26
980 0.32
981 0.3
982 0.31
983 0.33
984 0.31
985 0.36
986 0.38
987 0.42
988 0.43
989 0.46
990 0.46
991 0.46
992 0.44
993 0.48
994 0.52
995 0.54
996 0.51
997 0.5
998 0.49
999 0.53
1000 0.55
1001 0.47
1002 0.43
1003 0.36
1004 0.32
1005 0.31
1006 0.3
1007 0.24
1008 0.27
1009 0.28