Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JX71

Protein Details
Accession G8JX71    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-159VSQGIVTKKGKKAKKRKTSGKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-159KKGKKAKKRKTSGKT
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG erc:Ecym_8158  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSRKLKKTNLFSKDIASLLYAYGDSPQPLPETVQCVDELVVGYLTDICTSAYKCAQTVHRTKIKVEDFRFVLRNDAVKLGRAEELIAINKVIVDARKQFDNSEGKSLKRVNNKEEDLDDIPEEDGEDLSDIISMRNPVSQGIVTKKGKKAKKRKTSGKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.38
3 0.28
4 0.21
5 0.16
6 0.15
7 0.11
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.14
17 0.14
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.14
25 0.13
26 0.09
27 0.08
28 0.06
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.07
36 0.07
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.15
42 0.2
43 0.26
44 0.32
45 0.38
46 0.42
47 0.43
48 0.43
49 0.48
50 0.49
51 0.5
52 0.46
53 0.43
54 0.39
55 0.41
56 0.42
57 0.34
58 0.3
59 0.23
60 0.22
61 0.18
62 0.19
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.11
82 0.13
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.22
87 0.28
88 0.27
89 0.32
90 0.32
91 0.3
92 0.35
93 0.4
94 0.4
95 0.43
96 0.46
97 0.44
98 0.5
99 0.52
100 0.49
101 0.45
102 0.45
103 0.37
104 0.34
105 0.28
106 0.2
107 0.18
108 0.15
109 0.14
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.13
126 0.14
127 0.18
128 0.23
129 0.31
130 0.36
131 0.43
132 0.49
133 0.56
134 0.63
135 0.69
136 0.75
137 0.77
138 0.82
139 0.86