Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VU30

Protein Details
Accession A0A409VU30    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-158SLKTEYSKEKYKKRKEAKYHKIFTTHydrophilic
277-297GQVKSERQKHRLNKRKAISDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-148KKRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 10.333, cyto 7.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSTFKISKTEQKSRDPGIVHSGDQVLVRLLNGEIKCVKVEKNSNVVIGKFGSFYANDLIGQPYGVSYEIVDKKLKYHAPRTMEEVEDTDATNEYINDGEFVQPLTVDEIQALKRAGVHANDIIKKQIEQHANYSLKTEYSKEKYKKRKEAKYHKIFTTIEPTLFNVAEYWWAKDQNRLRDLRIDSLSQILNMANIRPGGKYLAVDDASGLLVAGILERMGGQGKLITICHTDSPPAYPVLDQMNFDPSVKDVLKSLNWATAEEDYVPILPPSEAPEGQVKSERQKHRLNKRKAISDLLSNTREELFSGEFDSLLVASEYDPLSILERLSPYVAGSAPIVVHSPFSSVIVELQAKLRNIPQYLSPTVTETWLRQYQVLPGRTHPMMAMSGSGGFILQTIKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.63
3 0.56
4 0.55
5 0.5
6 0.42
7 0.37
8 0.34
9 0.28
10 0.26
11 0.24
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.11
16 0.1
17 0.15
18 0.15
19 0.19
20 0.19
21 0.2
22 0.22
23 0.24
24 0.26
25 0.28
26 0.37
27 0.38
28 0.44
29 0.45
30 0.48
31 0.48
32 0.45
33 0.39
34 0.32
35 0.27
36 0.2
37 0.18
38 0.15
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.13
47 0.13
48 0.11
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.15
55 0.18
56 0.21
57 0.24
58 0.23
59 0.25
60 0.33
61 0.39
62 0.37
63 0.42
64 0.47
65 0.5
66 0.52
67 0.56
68 0.53
69 0.48
70 0.42
71 0.35
72 0.3
73 0.24
74 0.23
75 0.17
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.15
98 0.14
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.16
103 0.14
104 0.17
105 0.18
106 0.23
107 0.26
108 0.26
109 0.26
110 0.24
111 0.23
112 0.24
113 0.28
114 0.28
115 0.27
116 0.31
117 0.37
118 0.38
119 0.38
120 0.37
121 0.3
122 0.25
123 0.24
124 0.23
125 0.21
126 0.26
127 0.36
128 0.41
129 0.51
130 0.6
131 0.69
132 0.77
133 0.8
134 0.84
135 0.85
136 0.89
137 0.91
138 0.91
139 0.87
140 0.78
141 0.75
142 0.65
143 0.56
144 0.53
145 0.43
146 0.33
147 0.27
148 0.26
149 0.21
150 0.2
151 0.17
152 0.1
153 0.08
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.17
159 0.17
160 0.24
161 0.29
162 0.33
163 0.38
164 0.38
165 0.38
166 0.42
167 0.43
168 0.41
169 0.38
170 0.3
171 0.24
172 0.25
173 0.23
174 0.16
175 0.15
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.12
226 0.15
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.16
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.11
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.14
240 0.14
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.15
248 0.15
249 0.13
250 0.13
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.1
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.2
263 0.21
264 0.22
265 0.27
266 0.25
267 0.3
268 0.4
269 0.45
270 0.46
271 0.55
272 0.63
273 0.69
274 0.78
275 0.79
276 0.8
277 0.8
278 0.82
279 0.75
280 0.73
281 0.63
282 0.6
283 0.56
284 0.52
285 0.47
286 0.39
287 0.37
288 0.3
289 0.28
290 0.21
291 0.17
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.11
335 0.14
336 0.15
337 0.14
338 0.18
339 0.21
340 0.21
341 0.23
342 0.26
343 0.28
344 0.28
345 0.29
346 0.3
347 0.33
348 0.35
349 0.36
350 0.33
351 0.3
352 0.3
353 0.31
354 0.28
355 0.23
356 0.28
357 0.3
358 0.3
359 0.29
360 0.29
361 0.34
362 0.41
363 0.45
364 0.4
365 0.38
366 0.43
367 0.42
368 0.41
369 0.33
370 0.27
371 0.23
372 0.21
373 0.18
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.09
379 0.07
380 0.07