Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VTN6

Protein Details
Accession A0A409VTN6    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-125DLKQEKPTSRAQRPKLSKLNTHydrophilic
558-582ESTSSYSRSRSQREKRPIPDFKAMHHydrophilic
623-644REKEREVARRMQEKRREREEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
625-676KEREVARRMQEKRREREEEEERELRELRKKTIPKANEVPEWYKEAPKKKEKA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027329  TPX2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005856  C:cytoskeleton  
Pfam View protein in Pfam  
PF06886  TPX2  
Amino Acid Sequences MSLRSFGEEISLRHLPDESDTSFSFQIPGSIAEGDLLADDGLDFFQGANISAGPPNSPPTNPNALLTFSQVTPRPAIQNRAAPESVSPPLFPKASTRYADDKMPDLKQEKPTSRAQRPKLSKLNTEVVGQPRPRFIAPVIAHLPPAEGSPAGARLEALRAQVDCLSDDLHDPSSNDRQELADTGSGRPKGIERPSLEKLRPHTFVEKREKQTRARQKIFDGGIKKTKSICKPKETDKPIFTIGTSSSTIGNDAFTQQAQSDVPKDLHGDQYSLADTTTSSLGDDEAAARLVQYSQKLITSFGSSQQDSDTVPGVNVPPAPVQSWAQQLNFHQDPATGEDTNIAKQETVNDGPLTVSQLSPRKTARPPTPTPPAKQPISPLRPSNKRPVSVADEGRQRKKSRTDASNASAGTSTVVKKYTVSTGSMPSRSQSRTQPKLTASDSATVGVSARDKMKARVNPSARAPVIKSGRTDGKEGVRHASTSAARSNSQRILSRQDTIEPGEHASSLKGKNKASASSLSSSKTVHHGPLRATMPVEFKLHTDSRLEARTRKGNPENESTSSYSRSRSQREKRPIPDFKAMHAALEAEMALRKENVHPTVPLPIKWETEERLKERHKFDEMVREKEREVARRMQEKRREREEEEERELRELRKKTIPKANEVPEWYKEAPKKKEKAISTIGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.22
3 0.23
4 0.27
5 0.22
6 0.24
7 0.24
8 0.27
9 0.27
10 0.27
11 0.24
12 0.18
13 0.18
14 0.15
15 0.16
16 0.14
17 0.14
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.05
25 0.05
26 0.04
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.04
32 0.06
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.17
43 0.19
44 0.2
45 0.2
46 0.25
47 0.33
48 0.33
49 0.34
50 0.31
51 0.32
52 0.31
53 0.33
54 0.29
55 0.21
56 0.25
57 0.26
58 0.26
59 0.26
60 0.28
61 0.32
62 0.34
63 0.4
64 0.41
65 0.45
66 0.46
67 0.49
68 0.47
69 0.39
70 0.36
71 0.34
72 0.32
73 0.27
74 0.24
75 0.2
76 0.24
77 0.24
78 0.23
79 0.24
80 0.27
81 0.33
82 0.35
83 0.38
84 0.4
85 0.42
86 0.46
87 0.42
88 0.41
89 0.39
90 0.39
91 0.4
92 0.36
93 0.4
94 0.44
95 0.52
96 0.51
97 0.5
98 0.58
99 0.62
100 0.7
101 0.73
102 0.72
103 0.74
104 0.77
105 0.82
106 0.82
107 0.77
108 0.74
109 0.7
110 0.69
111 0.6
112 0.54
113 0.5
114 0.46
115 0.47
116 0.44
117 0.4
118 0.35
119 0.36
120 0.34
121 0.31
122 0.27
123 0.29
124 0.26
125 0.32
126 0.32
127 0.3
128 0.3
129 0.27
130 0.27
131 0.17
132 0.17
133 0.11
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.17
160 0.24
161 0.24
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.21
166 0.22
167 0.2
168 0.16
169 0.16
170 0.18
171 0.22
172 0.22
173 0.21
174 0.2
175 0.19
176 0.24
177 0.27
178 0.32
179 0.31
180 0.37
181 0.43
182 0.5
183 0.5
184 0.47
185 0.48
186 0.47
187 0.47
188 0.44
189 0.47
190 0.45
191 0.53
192 0.59
193 0.62
194 0.63
195 0.69
196 0.7
197 0.68
198 0.73
199 0.75
200 0.75
201 0.73
202 0.69
203 0.64
204 0.66
205 0.62
206 0.57
207 0.49
208 0.44
209 0.45
210 0.42
211 0.41
212 0.38
213 0.42
214 0.45
215 0.53
216 0.55
217 0.56
218 0.61
219 0.68
220 0.73
221 0.73
222 0.72
223 0.63
224 0.59
225 0.53
226 0.47
227 0.38
228 0.3
229 0.23
230 0.18
231 0.17
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.13
236 0.11
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.14
252 0.14
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.13
260 0.12
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.13
288 0.16
289 0.19
290 0.18
291 0.18
292 0.17
293 0.17
294 0.14
295 0.14
296 0.11
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.15
311 0.17
312 0.17
313 0.18
314 0.18
315 0.24
316 0.23
317 0.21
318 0.17
319 0.15
320 0.15
321 0.17
322 0.2
323 0.12
324 0.12
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.11
330 0.08
331 0.08
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.08
342 0.08
343 0.1
344 0.15
345 0.16
346 0.2
347 0.21
348 0.24
349 0.27
350 0.35
351 0.39
352 0.43
353 0.45
354 0.48
355 0.58
356 0.57
357 0.56
358 0.57
359 0.55
360 0.48
361 0.45
362 0.45
363 0.44
364 0.46
365 0.47
366 0.44
367 0.46
368 0.53
369 0.55
370 0.6
371 0.55
372 0.51
373 0.48
374 0.47
375 0.46
376 0.44
377 0.43
378 0.38
379 0.41
380 0.44
381 0.49
382 0.51
383 0.46
384 0.46
385 0.5
386 0.54
387 0.54
388 0.56
389 0.56
390 0.56
391 0.57
392 0.56
393 0.48
394 0.39
395 0.31
396 0.24
397 0.19
398 0.14
399 0.12
400 0.1
401 0.11
402 0.1
403 0.11
404 0.12
405 0.15
406 0.15
407 0.16
408 0.17
409 0.21
410 0.25
411 0.26
412 0.25
413 0.22
414 0.26
415 0.26
416 0.28
417 0.31
418 0.38
419 0.43
420 0.47
421 0.51
422 0.48
423 0.51
424 0.48
425 0.44
426 0.35
427 0.31
428 0.28
429 0.23
430 0.21
431 0.16
432 0.14
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.14
438 0.15
439 0.19
440 0.27
441 0.31
442 0.35
443 0.43
444 0.45
445 0.46
446 0.48
447 0.52
448 0.45
449 0.42
450 0.38
451 0.36
452 0.38
453 0.35
454 0.33
455 0.3
456 0.36
457 0.35
458 0.36
459 0.32
460 0.34
461 0.36
462 0.37
463 0.37
464 0.31
465 0.29
466 0.27
467 0.29
468 0.23
469 0.22
470 0.24
471 0.22
472 0.23
473 0.25
474 0.3
475 0.29
476 0.32
477 0.33
478 0.31
479 0.37
480 0.38
481 0.39
482 0.35
483 0.33
484 0.32
485 0.3
486 0.29
487 0.22
488 0.21
489 0.18
490 0.17
491 0.15
492 0.14
493 0.17
494 0.21
495 0.26
496 0.29
497 0.3
498 0.35
499 0.37
500 0.39
501 0.37
502 0.36
503 0.33
504 0.32
505 0.34
506 0.3
507 0.28
508 0.26
509 0.24
510 0.25
511 0.23
512 0.25
513 0.27
514 0.29
515 0.29
516 0.36
517 0.37
518 0.33
519 0.32
520 0.28
521 0.27
522 0.27
523 0.27
524 0.2
525 0.19
526 0.24
527 0.24
528 0.23
529 0.22
530 0.22
531 0.25
532 0.31
533 0.33
534 0.32
535 0.37
536 0.44
537 0.46
538 0.53
539 0.57
540 0.57
541 0.59
542 0.63
543 0.61
544 0.56
545 0.56
546 0.5
547 0.45
548 0.42
549 0.38
550 0.34
551 0.36
552 0.4
553 0.45
554 0.52
555 0.6
556 0.66
557 0.75
558 0.82
559 0.83
560 0.86
561 0.87
562 0.83
563 0.83
564 0.73
565 0.66
566 0.65
567 0.56
568 0.45
569 0.37
570 0.3
571 0.2
572 0.19
573 0.16
574 0.07
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.09
579 0.11
580 0.15
581 0.22
582 0.25
583 0.25
584 0.27
585 0.27
586 0.36
587 0.38
588 0.35
589 0.32
590 0.32
591 0.32
592 0.33
593 0.36
594 0.3
595 0.37
596 0.44
597 0.44
598 0.5
599 0.55
600 0.6
601 0.61
602 0.64
603 0.6
604 0.56
605 0.57
606 0.59
607 0.57
608 0.58
609 0.57
610 0.53
611 0.48
612 0.52
613 0.53
614 0.49
615 0.48
616 0.49
617 0.53
618 0.6
619 0.67
620 0.7
621 0.74
622 0.77
623 0.81
624 0.82
625 0.81
626 0.76
627 0.79
628 0.78
629 0.76
630 0.75
631 0.7
632 0.62
633 0.58
634 0.56
635 0.51
636 0.5
637 0.46
638 0.44
639 0.49
640 0.54
641 0.59
642 0.66
643 0.66
644 0.67
645 0.72
646 0.73
647 0.7
648 0.7
649 0.66
650 0.59
651 0.61
652 0.54
653 0.53
654 0.53
655 0.56
656 0.59
657 0.64
658 0.69
659 0.71
660 0.77
661 0.74
662 0.75