Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VJX5

Protein Details
Accession A0A409VJX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
570-595YRAAQRKAGKSRKSNIKDPNAPKKPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
574-592QRKAGKSRKSNIKDPNAPK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009346  GRIM-19  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070469  C:respirasome  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06212  GRIM-19  
PF00505  HMG_box  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MIRRFVDGVQWKPARDFTRRFYPRPCRAVLPSPPPFKRATMSVPYRQDMPPPGGFETVKYKRNLPLKGPGAYVILGGVTAICAYGFYRLGKGNLERRELQREKVWSRIHLVPLLTAEGDRDMYRRQQAALAREKAIMKDVPGWESFLVVTDHTGIPMAIRVVIRSHLSRSILGPARALRISSRSLMYLHDAPMNDDLSDHLIFDFEDVPQVPSAPYQWDAYADIEPDVKPTYAFSPIAAMAHYEFGAPQPFYDTGAMYNPAEDTASSAPLDLATWINDPDLSGMNSPSSPIPIPSPLSDTNLSAASSFAAYQDHTPFSPDAAFSPTTFAALHPLPRSVSPASPFEDARTVRPRVHSVVSPRDMSLQPPSWATQLWDAPSPHRTPNLTRPSIRHSPMTDAPTLRQRIPLRRGSLSSGQLFQSSSAPSHVETLVPAMTRTYSRRADSVSVSDDRDATVRRKKRSPEDETPAPTTGRATDTPLKSVLRPPKLAPSAWQLYFTDWIQKQQASGTRKLNVAQAAKEAGQEYACLSAAEKEPYKRRSQAMKEAREKEHEAYMRSLTPEDIKRENLYRAAQRKAGKSRKSNIKDPNAPKKPLSAYFMFLQRIRANPRLVSDIFGDETETTKQSVLAAAKWRSMTDAERQPFLAQAEQEKMEYEAARRLYEEGTTGFGSSINFSILPGSPHFPVKMESESESEGFTTDDGSERPVRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.51
4 0.49
5 0.57
6 0.63
7 0.65
8 0.69
9 0.74
10 0.75
11 0.75
12 0.72
13 0.67
14 0.67
15 0.72
16 0.7
17 0.69
18 0.68
19 0.71
20 0.69
21 0.66
22 0.62
23 0.55
24 0.5
25 0.45
26 0.43
27 0.43
28 0.49
29 0.55
30 0.58
31 0.57
32 0.57
33 0.52
34 0.51
35 0.45
36 0.44
37 0.39
38 0.36
39 0.37
40 0.36
41 0.36
42 0.33
43 0.38
44 0.39
45 0.41
46 0.4
47 0.42
48 0.46
49 0.54
50 0.57
51 0.52
52 0.55
53 0.55
54 0.56
55 0.53
56 0.47
57 0.41
58 0.35
59 0.29
60 0.19
61 0.13
62 0.09
63 0.08
64 0.06
65 0.04
66 0.03
67 0.03
68 0.03
69 0.03
70 0.04
71 0.07
72 0.09
73 0.1
74 0.14
75 0.16
76 0.18
77 0.23
78 0.29
79 0.35
80 0.39
81 0.44
82 0.46
83 0.49
84 0.58
85 0.56
86 0.54
87 0.52
88 0.55
89 0.53
90 0.56
91 0.56
92 0.48
93 0.51
94 0.52
95 0.48
96 0.43
97 0.4
98 0.32
99 0.29
100 0.28
101 0.22
102 0.16
103 0.13
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.18
110 0.24
111 0.25
112 0.24
113 0.28
114 0.33
115 0.39
116 0.45
117 0.44
118 0.4
119 0.42
120 0.43
121 0.38
122 0.37
123 0.3
124 0.22
125 0.25
126 0.25
127 0.24
128 0.23
129 0.25
130 0.2
131 0.2
132 0.18
133 0.13
134 0.12
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.13
150 0.15
151 0.15
152 0.18
153 0.2
154 0.21
155 0.22
156 0.22
157 0.28
158 0.3
159 0.29
160 0.29
161 0.27
162 0.29
163 0.28
164 0.27
165 0.2
166 0.19
167 0.21
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.22
174 0.21
175 0.2
176 0.2
177 0.19
178 0.2
179 0.21
180 0.2
181 0.16
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.14
220 0.14
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.12
226 0.11
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.1
242 0.12
243 0.14
244 0.11
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.17
283 0.17
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.11
291 0.11
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.14
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.16
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.17
328 0.18
329 0.19
330 0.19
331 0.17
332 0.2
333 0.19
334 0.21
335 0.25
336 0.24
337 0.25
338 0.27
339 0.28
340 0.26
341 0.27
342 0.26
343 0.25
344 0.31
345 0.32
346 0.3
347 0.28
348 0.28
349 0.27
350 0.25
351 0.24
352 0.19
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.2
366 0.22
367 0.2
368 0.21
369 0.22
370 0.23
371 0.32
372 0.39
373 0.4
374 0.4
375 0.41
376 0.46
377 0.5
378 0.48
379 0.41
380 0.34
381 0.35
382 0.37
383 0.38
384 0.33
385 0.27
386 0.27
387 0.3
388 0.31
389 0.26
390 0.29
391 0.3
392 0.36
393 0.42
394 0.46
395 0.44
396 0.43
397 0.44
398 0.42
399 0.43
400 0.38
401 0.33
402 0.29
403 0.25
404 0.23
405 0.22
406 0.18
407 0.15
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.12
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.1
424 0.12
425 0.17
426 0.2
427 0.21
428 0.22
429 0.25
430 0.26
431 0.26
432 0.27
433 0.24
434 0.23
435 0.22
436 0.21
437 0.19
438 0.17
439 0.17
440 0.16
441 0.18
442 0.26
443 0.31
444 0.37
445 0.43
446 0.5
447 0.58
448 0.66
449 0.69
450 0.69
451 0.71
452 0.72
453 0.7
454 0.66
455 0.58
456 0.48
457 0.39
458 0.3
459 0.23
460 0.2
461 0.16
462 0.18
463 0.24
464 0.25
465 0.27
466 0.29
467 0.28
468 0.26
469 0.33
470 0.37
471 0.35
472 0.36
473 0.36
474 0.42
475 0.44
476 0.43
477 0.39
478 0.37
479 0.37
480 0.35
481 0.36
482 0.27
483 0.26
484 0.28
485 0.26
486 0.26
487 0.21
488 0.24
489 0.25
490 0.25
491 0.23
492 0.25
493 0.32
494 0.29
495 0.35
496 0.36
497 0.36
498 0.37
499 0.38
500 0.38
501 0.36
502 0.34
503 0.28
504 0.26
505 0.25
506 0.24
507 0.23
508 0.2
509 0.15
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.11
518 0.13
519 0.17
520 0.2
521 0.24
522 0.32
523 0.37
524 0.43
525 0.44
526 0.49
527 0.55
528 0.59
529 0.64
530 0.66
531 0.72
532 0.75
533 0.77
534 0.74
535 0.69
536 0.66
537 0.57
538 0.55
539 0.48
540 0.41
541 0.37
542 0.36
543 0.32
544 0.29
545 0.28
546 0.21
547 0.24
548 0.26
549 0.29
550 0.29
551 0.3
552 0.33
553 0.36
554 0.38
555 0.36
556 0.37
557 0.41
558 0.44
559 0.45
560 0.48
561 0.49
562 0.55
563 0.61
564 0.65
565 0.65
566 0.68
567 0.73
568 0.78
569 0.8
570 0.8
571 0.8
572 0.8
573 0.82
574 0.83
575 0.84
576 0.81
577 0.78
578 0.7
579 0.67
580 0.62
581 0.57
582 0.53
583 0.44
584 0.39
585 0.39
586 0.43
587 0.4
588 0.35
589 0.36
590 0.33
591 0.37
592 0.4
593 0.42
594 0.4
595 0.39
596 0.41
597 0.41
598 0.39
599 0.35
600 0.3
601 0.27
602 0.24
603 0.22
604 0.21
605 0.15
606 0.17
607 0.17
608 0.16
609 0.14
610 0.13
611 0.13
612 0.12
613 0.17
614 0.17
615 0.19
616 0.27
617 0.28
618 0.31
619 0.32
620 0.31
621 0.29
622 0.3
623 0.29
624 0.29
625 0.37
626 0.36
627 0.37
628 0.38
629 0.36
630 0.36
631 0.35
632 0.3
633 0.22
634 0.24
635 0.27
636 0.27
637 0.26
638 0.24
639 0.24
640 0.23
641 0.22
642 0.2
643 0.22
644 0.23
645 0.23
646 0.23
647 0.24
648 0.22
649 0.21
650 0.21
651 0.16
652 0.17
653 0.17
654 0.16
655 0.14
656 0.14
657 0.14
658 0.14
659 0.13
660 0.12
661 0.11
662 0.11
663 0.13
664 0.13
665 0.15
666 0.17
667 0.19
668 0.2
669 0.23
670 0.24
671 0.23
672 0.24
673 0.26
674 0.27
675 0.27
676 0.28
677 0.28
678 0.3
679 0.29
680 0.27
681 0.23
682 0.19
683 0.17
684 0.14
685 0.12
686 0.09
687 0.11
688 0.11
689 0.16