Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VGV6

Protein Details
Accession A0A409VGV6    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
748-774LWGKHSSPSIRSPRKRKARADIWYERLHydrophilic
886-909SPGSKCSSCQLWKKKIPQEGRLHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-434RRKRKGA
758-765RSPRKRKA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
Amino Acid Sequences MEAQDRTKERVDIPFSLSVSSIIAGLFYSCIRSVHSFCSLVREISKVRPTLPGTRPKKNAGQPDYPALQVFSRWVAELRRRFDPLPPNTTTICFRMLFPEEDVYRKYDIQESKMTQLLEQCYGFEAEVFANWSLEEASGCLGQELRIVLERSCPQLDGPISSLSLAEVDELLSELASKSGFSHHSVTSKYPKAQRRSRSAIIRTLFRQLSPEDASVLTQIILKDLRPLMYPLTEFHYTTALTKFNAASVNMLSKEHAMNVWDPSKMMSKFYRMRASLDEAAAFADQSSNERCDIGPTINIPVAIPKSEKGQGCDHALSFFEGSERVWAETKYDGERAQIHVEIMDDKSSRIRIFSKSKRDSTQDRYAVHDIIRRALRLSPATLHREAWKGSISKNVIIDAEMVAFRGDEVDEFWRIRQLIENTAHGIRRKRKGAGHKSSYEHESMDSEANQEYTLGLVIFDIIYLDCRSLVYRPYTYRRKVLENLVETESGKVILAARYPIYMTKHNPVKELQRIFADHIASHQEGLVLKADDSSYNDYKRPWVKLKKDYIPGYGDSLDLVILGASWEKSRGRSLRVPPTTFTTFYIGAVNTKLDSSANPAYKYPTSTSTRTSPRTLDEVRPSFHMYFTASYGLSRDELEEVNFLIKNADASQFKKDPPYDLTHPSSLSPPATLLRTPLAVSLFGAGFTKAPGSQHYELRFPRIEKVYRPTERSWKDTTSLDDLHKVACAAVGRDRSDKDIKDWANSLWGKHSSPSIRSPRKRKARADIWYERLDTLTKKAKVCHAKSIFTAEDKWPMPHDTAQPLTSRTNLPKSHALHSDLWGKTVDDGAQHGMALLTPPAQHEIAVQKGANRVSSQRTTSPAAVPTQGDLRASRWMGTLVWFTSPGSKCSSCQLWKKKIPQEGRLHSLESLLVGCGRMSRADVPKQGIVIIDENDEDAGKWREKVAGILRMHGNHVPVVILGCKSTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.39
4 0.36
5 0.27
6 0.22
7 0.19
8 0.14
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.14
19 0.19
20 0.22
21 0.26
22 0.31
23 0.31
24 0.3
25 0.38
26 0.37
27 0.34
28 0.33
29 0.33
30 0.31
31 0.37
32 0.44
33 0.38
34 0.37
35 0.42
36 0.45
37 0.5
38 0.55
39 0.57
40 0.58
41 0.66
42 0.7
43 0.69
44 0.74
45 0.72
46 0.74
47 0.71
48 0.72
49 0.66
50 0.68
51 0.63
52 0.55
53 0.47
54 0.38
55 0.31
56 0.24
57 0.22
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.18
62 0.23
63 0.32
64 0.39
65 0.42
66 0.44
67 0.48
68 0.49
69 0.54
70 0.57
71 0.55
72 0.55
73 0.53
74 0.52
75 0.49
76 0.5
77 0.46
78 0.38
79 0.35
80 0.28
81 0.25
82 0.28
83 0.3
84 0.29
85 0.28
86 0.33
87 0.3
88 0.32
89 0.33
90 0.3
91 0.29
92 0.28
93 0.27
94 0.28
95 0.31
96 0.33
97 0.39
98 0.4
99 0.4
100 0.43
101 0.41
102 0.35
103 0.36
104 0.34
105 0.3
106 0.27
107 0.23
108 0.21
109 0.22
110 0.2
111 0.15
112 0.13
113 0.09
114 0.09
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.2
137 0.23
138 0.25
139 0.26
140 0.25
141 0.21
142 0.26
143 0.27
144 0.23
145 0.23
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.19
150 0.12
151 0.12
152 0.09
153 0.07
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.1
167 0.12
168 0.15
169 0.19
170 0.21
171 0.25
172 0.27
173 0.32
174 0.37
175 0.41
176 0.44
177 0.49
178 0.55
179 0.61
180 0.68
181 0.71
182 0.72
183 0.75
184 0.76
185 0.77
186 0.74
187 0.72
188 0.67
189 0.63
190 0.55
191 0.54
192 0.47
193 0.38
194 0.36
195 0.28
196 0.3
197 0.28
198 0.26
199 0.2
200 0.19
201 0.2
202 0.17
203 0.17
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.19
218 0.16
219 0.2
220 0.21
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.16
228 0.14
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.14
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.11
245 0.12
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.17
251 0.23
252 0.22
253 0.24
254 0.22
255 0.29
256 0.35
257 0.41
258 0.47
259 0.42
260 0.44
261 0.43
262 0.48
263 0.43
264 0.37
265 0.3
266 0.23
267 0.22
268 0.19
269 0.15
270 0.09
271 0.06
272 0.06
273 0.08
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.16
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.16
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.12
293 0.15
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.26
298 0.28
299 0.31
300 0.32
301 0.28
302 0.23
303 0.22
304 0.2
305 0.16
306 0.12
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.15
318 0.15
319 0.17
320 0.16
321 0.17
322 0.19
323 0.2
324 0.2
325 0.19
326 0.16
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.12
331 0.12
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.14
336 0.13
337 0.14
338 0.17
339 0.21
340 0.31
341 0.39
342 0.48
343 0.53
344 0.58
345 0.6
346 0.63
347 0.64
348 0.62
349 0.63
350 0.58
351 0.52
352 0.53
353 0.5
354 0.46
355 0.4
356 0.36
357 0.26
358 0.26
359 0.26
360 0.2
361 0.19
362 0.2
363 0.21
364 0.19
365 0.2
366 0.19
367 0.22
368 0.27
369 0.27
370 0.27
371 0.26
372 0.27
373 0.26
374 0.24
375 0.23
376 0.19
377 0.18
378 0.24
379 0.23
380 0.23
381 0.23
382 0.22
383 0.18
384 0.17
385 0.17
386 0.1
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.05
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.16
405 0.16
406 0.21
407 0.22
408 0.23
409 0.23
410 0.25
411 0.27
412 0.25
413 0.3
414 0.31
415 0.36
416 0.39
417 0.41
418 0.46
419 0.55
420 0.62
421 0.65
422 0.65
423 0.63
424 0.62
425 0.6
426 0.56
427 0.46
428 0.35
429 0.26
430 0.2
431 0.16
432 0.14
433 0.12
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.09
458 0.11
459 0.14
460 0.18
461 0.26
462 0.34
463 0.36
464 0.42
465 0.42
466 0.44
467 0.44
468 0.47
469 0.45
470 0.39
471 0.4
472 0.35
473 0.33
474 0.28
475 0.25
476 0.18
477 0.12
478 0.09
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.09
488 0.11
489 0.14
490 0.16
491 0.23
492 0.28
493 0.29
494 0.3
495 0.31
496 0.34
497 0.38
498 0.38
499 0.32
500 0.28
501 0.29
502 0.29
503 0.29
504 0.23
505 0.15
506 0.14
507 0.16
508 0.14
509 0.13
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.1
514 0.11
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.1
521 0.14
522 0.15
523 0.17
524 0.18
525 0.18
526 0.24
527 0.27
528 0.31
529 0.35
530 0.41
531 0.48
532 0.56
533 0.64
534 0.65
535 0.69
536 0.65
537 0.6
538 0.53
539 0.46
540 0.39
541 0.31
542 0.24
543 0.16
544 0.14
545 0.1
546 0.07
547 0.06
548 0.03
549 0.02
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.04
554 0.06
555 0.07
556 0.08
557 0.14
558 0.17
559 0.22
560 0.29
561 0.36
562 0.45
563 0.5
564 0.51
565 0.46
566 0.5
567 0.48
568 0.41
569 0.36
570 0.29
571 0.23
572 0.22
573 0.22
574 0.16
575 0.14
576 0.13
577 0.12
578 0.09
579 0.08
580 0.08
581 0.06
582 0.06
583 0.12
584 0.17
585 0.2
586 0.2
587 0.21
588 0.24
589 0.25
590 0.27
591 0.23
592 0.23
593 0.26
594 0.27
595 0.3
596 0.33
597 0.39
598 0.41
599 0.41
600 0.37
601 0.35
602 0.39
603 0.39
604 0.38
605 0.4
606 0.39
607 0.38
608 0.38
609 0.39
610 0.33
611 0.3
612 0.25
613 0.18
614 0.16
615 0.16
616 0.15
617 0.12
618 0.11
619 0.12
620 0.11
621 0.1
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.08
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.13
637 0.13
638 0.15
639 0.22
640 0.24
641 0.25
642 0.31
643 0.3
644 0.29
645 0.31
646 0.36
647 0.35
648 0.38
649 0.41
650 0.37
651 0.37
652 0.34
653 0.32
654 0.27
655 0.23
656 0.17
657 0.14
658 0.14
659 0.15
660 0.14
661 0.14
662 0.13
663 0.13
664 0.13
665 0.14
666 0.13
667 0.11
668 0.11
669 0.11
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.08
677 0.07
678 0.08
679 0.1
680 0.17
681 0.2
682 0.25
683 0.27
684 0.33
685 0.33
686 0.39
687 0.4
688 0.34
689 0.38
690 0.39
691 0.41
692 0.39
693 0.45
694 0.49
695 0.51
696 0.55
697 0.53
698 0.56
699 0.57
700 0.58
701 0.56
702 0.48
703 0.46
704 0.43
705 0.42
706 0.38
707 0.37
708 0.33
709 0.31
710 0.29
711 0.26
712 0.24
713 0.2
714 0.14
715 0.12
716 0.11
717 0.1
718 0.14
719 0.18
720 0.2
721 0.24
722 0.25
723 0.29
724 0.34
725 0.33
726 0.32
727 0.37
728 0.36
729 0.36
730 0.36
731 0.31
732 0.34
733 0.34
734 0.31
735 0.28
736 0.3
737 0.27
738 0.27
739 0.32
740 0.28
741 0.3
742 0.39
743 0.44
744 0.52
745 0.61
746 0.69
747 0.74
748 0.81
749 0.86
750 0.85
751 0.85
752 0.84
753 0.84
754 0.83
755 0.82
756 0.77
757 0.71
758 0.64
759 0.54
760 0.45
761 0.39
762 0.31
763 0.29
764 0.32
765 0.33
766 0.34
767 0.37
768 0.45
769 0.53
770 0.55
771 0.59
772 0.55
773 0.53
774 0.52
775 0.55
776 0.49
777 0.41
778 0.4
779 0.32
780 0.33
781 0.32
782 0.31
783 0.27
784 0.28
785 0.28
786 0.29
787 0.32
788 0.31
789 0.32
790 0.33
791 0.32
792 0.33
793 0.32
794 0.3
795 0.31
796 0.31
797 0.36
798 0.36
799 0.39
800 0.44
801 0.46
802 0.5
803 0.49
804 0.49
805 0.43
806 0.44
807 0.48
808 0.4
809 0.38
810 0.33
811 0.28
812 0.23
813 0.23
814 0.19
815 0.12
816 0.13
817 0.14
818 0.14
819 0.13
820 0.12
821 0.1
822 0.1
823 0.09
824 0.08
825 0.07
826 0.07
827 0.09
828 0.12
829 0.12
830 0.12
831 0.14
832 0.19
833 0.2
834 0.23
835 0.23
836 0.22
837 0.27
838 0.29
839 0.28
840 0.25
841 0.26
842 0.3
843 0.35
844 0.37
845 0.36
846 0.39
847 0.42
848 0.42
849 0.42
850 0.38
851 0.35
852 0.33
853 0.3
854 0.28
855 0.26
856 0.25
857 0.23
858 0.21
859 0.2
860 0.24
861 0.25
862 0.24
863 0.21
864 0.21
865 0.2
866 0.22
867 0.23
868 0.17
869 0.18
870 0.18
871 0.17
872 0.25
873 0.26
874 0.25
875 0.28
876 0.28
877 0.28
878 0.34
879 0.42
880 0.41
881 0.5
882 0.59
883 0.63
884 0.7
885 0.79
886 0.81
887 0.82
888 0.82
889 0.82
890 0.82
891 0.8
892 0.77
893 0.7
894 0.64
895 0.55
896 0.47
897 0.37
898 0.27
899 0.2
900 0.14
901 0.11
902 0.1
903 0.09
904 0.1
905 0.11
906 0.11
907 0.13
908 0.2
909 0.27
910 0.34
911 0.39
912 0.43
913 0.44
914 0.43
915 0.41
916 0.35
917 0.3
918 0.26
919 0.22
920 0.18
921 0.16
922 0.16
923 0.16
924 0.15
925 0.12
926 0.14
927 0.18
928 0.18
929 0.19
930 0.2
931 0.24
932 0.24
933 0.31
934 0.34
935 0.38
936 0.37
937 0.42
938 0.45
939 0.43
940 0.46
941 0.41
942 0.35
943 0.27
944 0.26
945 0.21
946 0.16
947 0.16
948 0.15
949 0.14