Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YQ68

Protein Details
Accession A0A409YQ68    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-58PIITPKRKSRMRGSERAPKRPKNASTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-54PKRKSRMRGSERAPKRPK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, pero 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040648  HMGXB3_CxC4  
Pfam View protein in Pfam  
PF18717  CxC4  
Amino Acid Sequences MDCDSPPPIIRYEKPPDSPLNIQYTWDEAEEAPIITPKRKSRMRGSERAPKRPKNASTLVKQSVGSRSDETRGSVAQGTAPPLPTPDAADVREPNDVANDMDASWFPLTDYDGGMGLGESEDVSSQEIRLEQDLEGGRLEQDLGGGEDPFPDFVAAVLSGECSMYQLTEQLYVVSGWNSKKQEATGSWYHMQSSNTHSEMLCLCPDADDKDVPCLHARFISDPISRTFFTKALQVDDNRCFLFYRCEEASGDSHQNLFSVPSQTRFSNVKHRAVVEHRGDDTGEGRWKCNRDPGATSCPHIVAARHSLQQHLKGDWNARDDGVREGQEDNVSYGGVYSEADGIVESVSYTPLPPPVWARIPSDPPAGPRATFKEVPSILRLDESSTCCCSKPRCMFNPLAPIIQKRCIVYTLTGAEETTIEVQKCSLCSHRFIGPDCQKVGIFNLNNRTLLAHDLLDDYSSAFSSSETPFVAWVQTVAQRYETRQCPIPFMSDKLFRQSWFSYMRLMELGTDMVCTKCGPTPDVTIWDGVTVAFSKKNLLPTLCPPTEPGPTSVARENVRLVPSLQMIDRRDLRLKMLSVLKGPKLSLLFEGGSLPGTNDPNFERNKALIERWAKIPDLLQGLRSINQSLANTFELHFGLHAVRSARVVPPVYYKFFTQLAAHENAIQFIPPIAFDGLRHFIRHPSKDAALKLRHTPALKALLHHEYLSGEIAPDTLAMCEWLYVRARATYLAMKVHNAPSPTETDVDVPAKPWLETGSCYGMPQIRDRPTYPGIIYESGLDQGGLDSTEPDVCRKYYSTYSKNRLTGGLINLHKMESGTESDYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.58
3 0.59
4 0.59
5 0.61
6 0.58
7 0.56
8 0.48
9 0.45
10 0.41
11 0.38
12 0.33
13 0.28
14 0.23
15 0.16
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.14
20 0.17
21 0.18
22 0.21
23 0.29
24 0.33
25 0.42
26 0.48
27 0.55
28 0.61
29 0.71
30 0.76
31 0.79
32 0.8
33 0.81
34 0.83
35 0.87
36 0.86
37 0.83
38 0.82
39 0.82
40 0.79
41 0.77
42 0.78
43 0.75
44 0.73
45 0.74
46 0.7
47 0.63
48 0.58
49 0.53
50 0.51
51 0.44
52 0.4
53 0.34
54 0.32
55 0.33
56 0.34
57 0.32
58 0.28
59 0.26
60 0.25
61 0.24
62 0.21
63 0.21
64 0.21
65 0.22
66 0.22
67 0.22
68 0.2
69 0.19
70 0.21
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.28
77 0.28
78 0.28
79 0.31
80 0.28
81 0.23
82 0.21
83 0.21
84 0.16
85 0.15
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.13
117 0.14
118 0.12
119 0.18
120 0.19
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.14
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.14
163 0.14
164 0.21
165 0.23
166 0.23
167 0.24
168 0.25
169 0.29
170 0.27
171 0.32
172 0.31
173 0.34
174 0.36
175 0.35
176 0.36
177 0.33
178 0.32
179 0.27
180 0.28
181 0.28
182 0.26
183 0.26
184 0.25
185 0.24
186 0.24
187 0.24
188 0.18
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.2
198 0.21
199 0.21
200 0.24
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.19
206 0.21
207 0.27
208 0.25
209 0.26
210 0.28
211 0.29
212 0.28
213 0.27
214 0.27
215 0.21
216 0.2
217 0.23
218 0.21
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.3
223 0.32
224 0.33
225 0.29
226 0.28
227 0.25
228 0.21
229 0.25
230 0.21
231 0.24
232 0.22
233 0.24
234 0.24
235 0.25
236 0.26
237 0.24
238 0.25
239 0.2
240 0.2
241 0.18
242 0.17
243 0.15
244 0.14
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.17
249 0.19
250 0.19
251 0.23
252 0.25
253 0.26
254 0.32
255 0.38
256 0.41
257 0.4
258 0.41
259 0.43
260 0.44
261 0.49
262 0.43
263 0.4
264 0.35
265 0.33
266 0.31
267 0.27
268 0.24
269 0.19
270 0.21
271 0.18
272 0.19
273 0.23
274 0.26
275 0.27
276 0.33
277 0.33
278 0.3
279 0.35
280 0.39
281 0.43
282 0.41
283 0.42
284 0.35
285 0.31
286 0.29
287 0.24
288 0.19
289 0.14
290 0.18
291 0.19
292 0.22
293 0.22
294 0.25
295 0.27
296 0.32
297 0.31
298 0.27
299 0.28
300 0.27
301 0.32
302 0.31
303 0.31
304 0.26
305 0.24
306 0.23
307 0.21
308 0.21
309 0.19
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.12
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.11
342 0.14
343 0.18
344 0.19
345 0.23
346 0.24
347 0.27
348 0.28
349 0.3
350 0.27
351 0.24
352 0.26
353 0.23
354 0.2
355 0.19
356 0.21
357 0.23
358 0.25
359 0.23
360 0.27
361 0.27
362 0.28
363 0.27
364 0.24
365 0.19
366 0.17
367 0.17
368 0.12
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.17
375 0.2
376 0.2
377 0.26
378 0.32
379 0.37
380 0.4
381 0.44
382 0.46
383 0.47
384 0.53
385 0.45
386 0.4
387 0.33
388 0.31
389 0.28
390 0.29
391 0.27
392 0.19
393 0.19
394 0.18
395 0.18
396 0.16
397 0.16
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.07
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.14
414 0.13
415 0.16
416 0.19
417 0.22
418 0.24
419 0.25
420 0.34
421 0.34
422 0.36
423 0.34
424 0.33
425 0.29
426 0.27
427 0.27
428 0.23
429 0.18
430 0.18
431 0.23
432 0.24
433 0.24
434 0.24
435 0.22
436 0.16
437 0.17
438 0.15
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.05
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.14
466 0.14
467 0.17
468 0.24
469 0.25
470 0.24
471 0.3
472 0.3
473 0.3
474 0.31
475 0.33
476 0.28
477 0.28
478 0.29
479 0.28
480 0.28
481 0.3
482 0.31
483 0.26
484 0.29
485 0.27
486 0.27
487 0.25
488 0.25
489 0.23
490 0.22
491 0.23
492 0.18
493 0.17
494 0.13
495 0.1
496 0.1
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.11
507 0.12
508 0.16
509 0.17
510 0.21
511 0.2
512 0.19
513 0.18
514 0.16
515 0.14
516 0.1
517 0.09
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.1
523 0.12
524 0.17
525 0.19
526 0.19
527 0.21
528 0.26
529 0.35
530 0.32
531 0.31
532 0.29
533 0.3
534 0.32
535 0.31
536 0.27
537 0.22
538 0.22
539 0.25
540 0.25
541 0.27
542 0.24
543 0.24
544 0.24
545 0.24
546 0.24
547 0.22
548 0.2
549 0.18
550 0.17
551 0.17
552 0.16
553 0.18
554 0.19
555 0.23
556 0.25
557 0.27
558 0.3
559 0.29
560 0.31
561 0.3
562 0.29
563 0.29
564 0.31
565 0.29
566 0.3
567 0.33
568 0.32
569 0.29
570 0.28
571 0.26
572 0.22
573 0.22
574 0.18
575 0.17
576 0.15
577 0.14
578 0.14
579 0.11
580 0.11
581 0.1
582 0.09
583 0.09
584 0.11
585 0.11
586 0.12
587 0.14
588 0.19
589 0.21
590 0.22
591 0.22
592 0.21
593 0.26
594 0.26
595 0.26
596 0.28
597 0.31
598 0.31
599 0.33
600 0.35
601 0.3
602 0.28
603 0.28
604 0.24
605 0.26
606 0.23
607 0.2
608 0.21
609 0.22
610 0.24
611 0.24
612 0.2
613 0.16
614 0.19
615 0.18
616 0.16
617 0.18
618 0.16
619 0.16
620 0.16
621 0.17
622 0.13
623 0.13
624 0.12
625 0.1
626 0.1
627 0.09
628 0.11
629 0.11
630 0.11
631 0.12
632 0.14
633 0.15
634 0.18
635 0.19
636 0.18
637 0.25
638 0.29
639 0.32
640 0.32
641 0.31
642 0.3
643 0.29
644 0.3
645 0.23
646 0.22
647 0.23
648 0.24
649 0.24
650 0.24
651 0.23
652 0.22
653 0.2
654 0.17
655 0.12
656 0.1
657 0.1
658 0.07
659 0.09
660 0.09
661 0.09
662 0.1
663 0.15
664 0.2
665 0.2
666 0.22
667 0.21
668 0.29
669 0.37
670 0.4
671 0.4
672 0.4
673 0.44
674 0.48
675 0.52
676 0.52
677 0.5
678 0.49
679 0.5
680 0.5
681 0.5
682 0.46
683 0.43
684 0.4
685 0.43
686 0.4
687 0.36
688 0.36
689 0.36
690 0.36
691 0.34
692 0.29
693 0.2
694 0.2
695 0.19
696 0.14
697 0.1
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.05
704 0.05
705 0.06
706 0.06
707 0.07
708 0.07
709 0.11
710 0.13
711 0.14
712 0.16
713 0.16
714 0.17
715 0.17
716 0.2
717 0.21
718 0.22
719 0.26
720 0.26
721 0.27
722 0.3
723 0.33
724 0.34
725 0.3
726 0.29
727 0.26
728 0.29
729 0.29
730 0.26
731 0.22
732 0.21
733 0.24
734 0.24
735 0.22
736 0.19
737 0.2
738 0.2
739 0.19
740 0.18
741 0.16
742 0.16
743 0.18
744 0.21
745 0.24
746 0.23
747 0.23
748 0.26
749 0.27
750 0.28
751 0.32
752 0.37
753 0.37
754 0.41
755 0.43
756 0.47
757 0.46
758 0.48
759 0.42
760 0.38
761 0.36
762 0.33
763 0.31
764 0.26
765 0.24
766 0.2
767 0.19
768 0.14
769 0.1
770 0.09
771 0.09
772 0.08
773 0.07
774 0.07
775 0.08
776 0.12
777 0.13
778 0.15
779 0.18
780 0.18
781 0.22
782 0.23
783 0.28
784 0.33
785 0.43
786 0.5
787 0.58
788 0.66
789 0.7
790 0.72
791 0.68
792 0.61
793 0.55
794 0.51
795 0.46
796 0.46
797 0.39
798 0.39
799 0.38
800 0.36
801 0.32
802 0.26
803 0.22
804 0.16
805 0.18