Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409Y2W4

Protein Details
Accession A0A409Y2W4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-37DDEKARYAKRIKLRQLNNTPSIQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.333, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MEQNTAGALGASRVDDEKARYAKRIKLRQLNNTPSIQESAKLDSSLKRHTALIKRIRQSMASDNREQILKDIETLSLEKYIDELAGAVIEGLARCKTERDVWGAVEIISALHQRFPKTFTPALISNLSAAIAAPSRATLASLTPEQREKEDSTRVTRQRPIIRVCSELALVGIIKDAPDRSGAEWIMKALKELLSNDPTLSSLPLLTTFLKSYSRPFLGIVPPAPAKQIDSNSEPGSLSTNVQDHEEHGQFPPMLNEEEELVEQDIRDRFKRMCEGYFDNVCKKLVIEHKRLQEQDKRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLLASCQSLSELLYLPLPTLPTASMKTDSILIGTNTGQSNGDSEEVVTVGGKWEDEEERRFYEDIQDLKDFVPSSVLGVEGETEEEDSKETERERAAREKEEVRKLEEELEKLSEHGSQSGNGDVQPTEHMEDDLTTPTLGTPRAQTPPLSPQLAPQGPSQLLTALLVRLPDATNRVLIDQAAVDFAFLNSKAARKRLIRFLTQVPKNRTDLLPHYSRLIATLNKYMPDIGTEVVAFLDEEFRYLQRKKNVVKELAEVRLKNIVYLSNLTKFRVVPPHVILHMFKVCIDDFSGTNVENVALLLEGCGRFLLRSEDTAERFSTMLELMRRKQSMQHFDQRQLLLLENAYYQCNPPERAPRQEKIRSTMELFIRHLIYDVLSKKTIDKVLKLLRKLDWENDDVKRHLHKVFTKPWKIKYGNIGLLAMLTYDLQRYHPAFAIAVVDQVLEDIRRGLEQNVYSTNQRRLATMKYLGELYIYRLLSSAIIFDTLWSLVTFGHPDGRPLPHQAVPLDMPDDFFRIRLYYVLCKEPLPMDVDFMLSDSLEQAVRPKMELAKTVEQAALAVDEMFNLAFQATTAAEDSGDDSDDDGERREDDDVEEEEGEDTGEVESPIGERAPSPEQEVVLSASNSLQEHLGPSEEAEAEFAKELAKLVTDTSAESRKVDKKTALALWDSAVLPPNIRKKRADEKEDEPEENTANAVGTMAFTVITKKGNKQQTRQIAVPAESALAIQTRSAQLQDKVEQQHLKRLVLNYEQREGAEELKALEARNRAGAIKIRYVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.18
4 0.26
5 0.32
6 0.35
7 0.41
8 0.47
9 0.53
10 0.61
11 0.68
12 0.7
13 0.72
14 0.78
15 0.82
16 0.86
17 0.87
18 0.82
19 0.75
20 0.67
21 0.59
22 0.54
23 0.44
24 0.36
25 0.29
26 0.29
27 0.28
28 0.27
29 0.27
30 0.29
31 0.33
32 0.38
33 0.39
34 0.35
35 0.36
36 0.44
37 0.51
38 0.55
39 0.6
40 0.62
41 0.65
42 0.69
43 0.68
44 0.62
45 0.58
46 0.58
47 0.58
48 0.55
49 0.54
50 0.5
51 0.5
52 0.5
53 0.45
54 0.37
55 0.33
56 0.26
57 0.24
58 0.22
59 0.2
60 0.21
61 0.22
62 0.21
63 0.18
64 0.17
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.12
83 0.15
84 0.21
85 0.25
86 0.3
87 0.32
88 0.32
89 0.34
90 0.33
91 0.29
92 0.22
93 0.18
94 0.12
95 0.1
96 0.12
97 0.1
98 0.14
99 0.17
100 0.19
101 0.21
102 0.26
103 0.3
104 0.34
105 0.37
106 0.34
107 0.38
108 0.38
109 0.4
110 0.37
111 0.32
112 0.25
113 0.23
114 0.21
115 0.15
116 0.12
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.12
128 0.17
129 0.2
130 0.23
131 0.27
132 0.28
133 0.3
134 0.33
135 0.34
136 0.35
137 0.41
138 0.42
139 0.45
140 0.54
141 0.58
142 0.6
143 0.62
144 0.65
145 0.65
146 0.68
147 0.67
148 0.66
149 0.62
150 0.59
151 0.54
152 0.47
153 0.38
154 0.3
155 0.23
156 0.15
157 0.12
158 0.09
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.17
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.2
173 0.21
174 0.2
175 0.19
176 0.16
177 0.17
178 0.18
179 0.2
180 0.24
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.22
185 0.2
186 0.19
187 0.17
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.17
198 0.18
199 0.21
200 0.26
201 0.26
202 0.25
203 0.26
204 0.28
205 0.3
206 0.33
207 0.29
208 0.26
209 0.26
210 0.26
211 0.26
212 0.22
213 0.2
214 0.21
215 0.24
216 0.24
217 0.26
218 0.31
219 0.3
220 0.31
221 0.28
222 0.23
223 0.23
224 0.2
225 0.17
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.21
233 0.21
234 0.2
235 0.18
236 0.21
237 0.19
238 0.19
239 0.19
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.12
252 0.15
253 0.17
254 0.18
255 0.2
256 0.21
257 0.25
258 0.34
259 0.33
260 0.33
261 0.36
262 0.4
263 0.43
264 0.49
265 0.47
266 0.43
267 0.42
268 0.39
269 0.33
270 0.27
271 0.27
272 0.3
273 0.36
274 0.4
275 0.45
276 0.52
277 0.58
278 0.61
279 0.61
280 0.61
281 0.62
282 0.63
283 0.66
284 0.65
285 0.6
286 0.59
287 0.55
288 0.49
289 0.44
290 0.41
291 0.33
292 0.27
293 0.26
294 0.24
295 0.24
296 0.22
297 0.21
298 0.2
299 0.19
300 0.2
301 0.22
302 0.22
303 0.24
304 0.27
305 0.26
306 0.23
307 0.26
308 0.26
309 0.26
310 0.31
311 0.33
312 0.28
313 0.28
314 0.29
315 0.3
316 0.3
317 0.28
318 0.22
319 0.18
320 0.17
321 0.16
322 0.13
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.11
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.12
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.09
367 0.12
368 0.15
369 0.17
370 0.19
371 0.21
372 0.21
373 0.2
374 0.23
375 0.25
376 0.24
377 0.24
378 0.23
379 0.22
380 0.22
381 0.24
382 0.18
383 0.14
384 0.13
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.13
405 0.17
406 0.2
407 0.28
408 0.3
409 0.32
410 0.35
411 0.4
412 0.46
413 0.5
414 0.48
415 0.43
416 0.42
417 0.39
418 0.42
419 0.37
420 0.3
421 0.24
422 0.24
423 0.2
424 0.19
425 0.18
426 0.13
427 0.11
428 0.12
429 0.11
430 0.1
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.1
435 0.11
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.12
456 0.15
457 0.16
458 0.16
459 0.18
460 0.24
461 0.27
462 0.27
463 0.24
464 0.23
465 0.3
466 0.3
467 0.3
468 0.23
469 0.23
470 0.21
471 0.21
472 0.19
473 0.12
474 0.11
475 0.09
476 0.09
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.04
501 0.06
502 0.06
503 0.09
504 0.11
505 0.13
506 0.19
507 0.22
508 0.26
509 0.35
510 0.38
511 0.38
512 0.39
513 0.45
514 0.49
515 0.51
516 0.55
517 0.5
518 0.5
519 0.48
520 0.47
521 0.4
522 0.34
523 0.32
524 0.29
525 0.28
526 0.25
527 0.24
528 0.22
529 0.22
530 0.19
531 0.17
532 0.14
533 0.13
534 0.17
535 0.16
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.13
540 0.12
541 0.11
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.04
549 0.03
550 0.05
551 0.04
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.11
556 0.13
557 0.18
558 0.23
559 0.3
560 0.34
561 0.43
562 0.49
563 0.48
564 0.48
565 0.47
566 0.45
567 0.44
568 0.42
569 0.33
570 0.28
571 0.28
572 0.26
573 0.22
574 0.19
575 0.14
576 0.12
577 0.15
578 0.16
579 0.17
580 0.18
581 0.18
582 0.19
583 0.18
584 0.2
585 0.25
586 0.25
587 0.23
588 0.24
589 0.26
590 0.26
591 0.27
592 0.24
593 0.2
594 0.19
595 0.16
596 0.13
597 0.13
598 0.12
599 0.11
600 0.12
601 0.1
602 0.08
603 0.11
604 0.11
605 0.1
606 0.1
607 0.09
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.04
612 0.03
613 0.03
614 0.03
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.05
622 0.09
623 0.09
624 0.1
625 0.14
626 0.17
627 0.19
628 0.2
629 0.2
630 0.17
631 0.16
632 0.15
633 0.12
634 0.09
635 0.1
636 0.12
637 0.15
638 0.17
639 0.22
640 0.23
641 0.23
642 0.28
643 0.33
644 0.38
645 0.41
646 0.48
647 0.47
648 0.5
649 0.55
650 0.49
651 0.42
652 0.35
653 0.29
654 0.2
655 0.17
656 0.14
657 0.1
658 0.1
659 0.09
660 0.09
661 0.09
662 0.11
663 0.14
664 0.15
665 0.18
666 0.27
667 0.31
668 0.4
669 0.46
670 0.49
671 0.55
672 0.6
673 0.59
674 0.55
675 0.55
676 0.47
677 0.43
678 0.44
679 0.38
680 0.34
681 0.32
682 0.29
683 0.25
684 0.23
685 0.21
686 0.15
687 0.12
688 0.14
689 0.15
690 0.15
691 0.16
692 0.16
693 0.17
694 0.21
695 0.26
696 0.23
697 0.22
698 0.28
699 0.36
700 0.41
701 0.41
702 0.41
703 0.38
704 0.42
705 0.42
706 0.4
707 0.35
708 0.32
709 0.36
710 0.36
711 0.38
712 0.32
713 0.33
714 0.31
715 0.31
716 0.31
717 0.32
718 0.34
719 0.39
720 0.48
721 0.55
722 0.61
723 0.63
724 0.66
725 0.7
726 0.65
727 0.61
728 0.59
729 0.57
730 0.51
731 0.47
732 0.42
733 0.32
734 0.29
735 0.25
736 0.17
737 0.09
738 0.05
739 0.04
740 0.05
741 0.06
742 0.06
743 0.11
744 0.12
745 0.14
746 0.14
747 0.15
748 0.14
749 0.14
750 0.15
751 0.11
752 0.1
753 0.08
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.04
759 0.04
760 0.05
761 0.05
762 0.06
763 0.07
764 0.08
765 0.12
766 0.13
767 0.16
768 0.18
769 0.2
770 0.24
771 0.27
772 0.31
773 0.33
774 0.33
775 0.31
776 0.31
777 0.33
778 0.35
779 0.36
780 0.31
781 0.26
782 0.26
783 0.25
784 0.23
785 0.19
786 0.17
787 0.18
788 0.16
789 0.15
790 0.15
791 0.15
792 0.15
793 0.14
794 0.12
795 0.06
796 0.07
797 0.07
798 0.07
799 0.07
800 0.07
801 0.07
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.08
807 0.08
808 0.14
809 0.14
810 0.16
811 0.19
812 0.22
813 0.23
814 0.27
815 0.3
816 0.27
817 0.29
818 0.28
819 0.28
820 0.25
821 0.24
822 0.21
823 0.17
824 0.15
825 0.13
826 0.16
827 0.13
828 0.12
829 0.12
830 0.11
831 0.12
832 0.13
833 0.15
834 0.2
835 0.23
836 0.27
837 0.27
838 0.26
839 0.27
840 0.26
841 0.25
842 0.21
843 0.18
844 0.16
845 0.15
846 0.15
847 0.13
848 0.13
849 0.11
850 0.08
851 0.07
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.09
857 0.13
858 0.13
859 0.14
860 0.16
861 0.2
862 0.22
863 0.27
864 0.31
865 0.33
866 0.34
867 0.35
868 0.33
869 0.28
870 0.26
871 0.21
872 0.14
873 0.08
874 0.07
875 0.05
876 0.05
877 0.05
878 0.05
879 0.04
880 0.04
881 0.04
882 0.03
883 0.04
884 0.05
885 0.05
886 0.06
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.09
892 0.08
893 0.09
894 0.08
895 0.07
896 0.09
897 0.1
898 0.1
899 0.1
900 0.11
901 0.11
902 0.12
903 0.13
904 0.12
905 0.12
906 0.15
907 0.16
908 0.17
909 0.16
910 0.15
911 0.15
912 0.14
913 0.12
914 0.09
915 0.07
916 0.05
917 0.06
918 0.06
919 0.05
920 0.06
921 0.06
922 0.07
923 0.07
924 0.07
925 0.06
926 0.11
927 0.15
928 0.16
929 0.2
930 0.21
931 0.21
932 0.21
933 0.22
934 0.2
935 0.18
936 0.17
937 0.13
938 0.12
939 0.14
940 0.13
941 0.13
942 0.11
943 0.09
944 0.11
945 0.12
946 0.12
947 0.1
948 0.11
949 0.12
950 0.12
951 0.12
952 0.12
953 0.11
954 0.11
955 0.11
956 0.11
957 0.09
958 0.08
959 0.09
960 0.08
961 0.09
962 0.08
963 0.09
964 0.11
965 0.11
966 0.13
967 0.17
968 0.22
969 0.22
970 0.23
971 0.29
972 0.34
973 0.38
974 0.42
975 0.41
976 0.4
977 0.46
978 0.48
979 0.45
980 0.4
981 0.36
982 0.31
983 0.31
984 0.27
985 0.21
986 0.2
987 0.17
988 0.17
989 0.23
990 0.32
991 0.36
992 0.41
993 0.44
994 0.49
995 0.6
996 0.68
997 0.7
998 0.66
999 0.67
1000 0.73
1001 0.75
1002 0.68
1003 0.59
1004 0.51
1005 0.44
1006 0.37
1007 0.29
1008 0.19
1009 0.13
1010 0.11
1011 0.09
1012 0.07
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.05
1017 0.05
1018 0.08
1019 0.1
1020 0.16
1021 0.19
1022 0.25
1023 0.34
1024 0.45
1025 0.52
1026 0.58
1027 0.66
1028 0.71
1029 0.75
1030 0.7
1031 0.69
1032 0.64
1033 0.57
1034 0.51
1035 0.41
1036 0.31
1037 0.24
1038 0.22
1039 0.16
1040 0.12
1041 0.1
1042 0.09
1043 0.11
1044 0.13
1045 0.14
1046 0.17
1047 0.21
1048 0.24
1049 0.3
1050 0.34
1051 0.38
1052 0.41
1053 0.47
1054 0.52
1055 0.49
1056 0.54
1057 0.53
1058 0.52
1059 0.49
1060 0.49
1061 0.47
1062 0.49
1063 0.56
1064 0.51
1065 0.51
1066 0.49
1067 0.44
1068 0.44
1069 0.4
1070 0.33
1071 0.26
1072 0.22
1073 0.19
1074 0.22
1075 0.23
1076 0.2
1077 0.23
1078 0.24
1079 0.24
1080 0.26
1081 0.27
1082 0.24
1083 0.28
1084 0.35
1085 0.35