Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VZD2

Protein Details
Accession A0A409VZD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-110ATDVCKTNTKRKHQAEQAKARKRGGHydrophilic
578-606QIVREGEPAKKKKKGKSKNKTPPSYWYLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-111RKHQAEQAKARKRGGG
585-597PAKKKKKGKSKNK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 9, cysk 7, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
Amino Acid Sequences MSADVQMAPPVLDPVTPAATNSVNPAQQAVQQHLFTFPPFPEPPPGLTIMPFKDFKEHGIAVQPGPGDVEVDALGIPTIPLKVRHATDVCKTNTKRKHQAEQAKARKRGGGAKSVPWYEDWEQSEAARFATGVNPHSPRFERIQAAATDFANGRKWPVHYASETGPKFIFEKFLRYIGIPDGTILREGTKKSKKEEEEEEMSDDDDDDEMDDEEENEEGGAPGVQVDDMTGIIMDKEIPGRMKMTANEEKLLTFFHDPEKSIRIFLSSYARQMGFIWSDPNLDCMARIMEFFVSFLLRSKVLPENERSLRKSLEVINVAKKELPNTSAIAKAFPDVFSRACGACWGWKAEGYQVITLDESTTADAPGSKVEDAVEEQKQPETTSGWGSSSGWGAPAGDSPWNVGVSDGSGWGGWGGSVIPESIPEPSPWDGIKQDSLMSLLGPTVLPLTHTTGIVEKSMRRIKAILPLPTNPPRPPPQPEGFYEPDAAAVESDFDRAFVKVVLEPMPIDWDGGEVLAYSKPEILGTSKAPATAADGATTTAPKPHDPLTDEIQLLIEPKPETIELLSVGMGLGGTWVQIVREGEPAKKKKKGKSKNKTPPSYWYLDTLGVVIPSFWTIKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.15
4 0.15
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.23
9 0.25
10 0.22
11 0.22
12 0.24
13 0.22
14 0.25
15 0.28
16 0.29
17 0.29
18 0.29
19 0.3
20 0.3
21 0.29
22 0.26
23 0.26
24 0.2
25 0.22
26 0.23
27 0.25
28 0.3
29 0.31
30 0.33
31 0.33
32 0.36
33 0.29
34 0.3
35 0.33
36 0.3
37 0.32
38 0.31
39 0.29
40 0.32
41 0.31
42 0.32
43 0.34
44 0.31
45 0.28
46 0.33
47 0.35
48 0.29
49 0.31
50 0.28
51 0.2
52 0.2
53 0.19
54 0.12
55 0.09
56 0.1
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.08
67 0.1
68 0.14
69 0.2
70 0.21
71 0.29
72 0.31
73 0.35
74 0.4
75 0.46
76 0.46
77 0.51
78 0.53
79 0.56
80 0.62
81 0.67
82 0.71
83 0.7
84 0.76
85 0.77
86 0.84
87 0.85
88 0.87
89 0.88
90 0.87
91 0.85
92 0.77
93 0.7
94 0.63
95 0.61
96 0.54
97 0.54
98 0.48
99 0.49
100 0.53
101 0.5
102 0.47
103 0.39
104 0.41
105 0.34
106 0.36
107 0.32
108 0.28
109 0.28
110 0.27
111 0.3
112 0.24
113 0.22
114 0.15
115 0.12
116 0.11
117 0.14
118 0.17
119 0.16
120 0.21
121 0.24
122 0.25
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.33
127 0.36
128 0.33
129 0.32
130 0.36
131 0.32
132 0.33
133 0.31
134 0.26
135 0.23
136 0.2
137 0.2
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.17
142 0.19
143 0.22
144 0.25
145 0.28
146 0.26
147 0.3
148 0.32
149 0.38
150 0.37
151 0.34
152 0.3
153 0.26
154 0.26
155 0.23
156 0.26
157 0.17
158 0.23
159 0.23
160 0.25
161 0.25
162 0.24
163 0.26
164 0.21
165 0.21
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.24
176 0.3
177 0.33
178 0.38
179 0.47
180 0.49
181 0.52
182 0.57
183 0.54
184 0.52
185 0.5
186 0.47
187 0.38
188 0.34
189 0.28
190 0.21
191 0.14
192 0.08
193 0.07
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.22
232 0.27
233 0.28
234 0.28
235 0.27
236 0.26
237 0.24
238 0.22
239 0.17
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.21
247 0.2
248 0.19
249 0.18
250 0.15
251 0.14
252 0.15
253 0.2
254 0.17
255 0.18
256 0.19
257 0.19
258 0.18
259 0.18
260 0.18
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.1
287 0.15
288 0.17
289 0.19
290 0.21
291 0.27
292 0.32
293 0.36
294 0.35
295 0.32
296 0.3
297 0.28
298 0.28
299 0.24
300 0.24
301 0.24
302 0.24
303 0.27
304 0.27
305 0.27
306 0.26
307 0.23
308 0.2
309 0.17
310 0.16
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.13
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.15
337 0.18
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.12
344 0.1
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.12
361 0.13
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.12
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.14
416 0.16
417 0.15
418 0.17
419 0.18
420 0.15
421 0.15
422 0.13
423 0.14
424 0.11
425 0.1
426 0.08
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.13
439 0.15
440 0.16
441 0.17
442 0.17
443 0.14
444 0.22
445 0.28
446 0.28
447 0.27
448 0.28
449 0.28
450 0.36
451 0.4
452 0.39
453 0.37
454 0.39
455 0.45
456 0.51
457 0.53
458 0.45
459 0.46
460 0.46
461 0.48
462 0.52
463 0.52
464 0.51
465 0.51
466 0.53
467 0.54
468 0.51
469 0.47
470 0.42
471 0.34
472 0.28
473 0.24
474 0.2
475 0.13
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.13
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.16
494 0.15
495 0.13
496 0.11
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.1
510 0.11
511 0.14
512 0.15
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.19
517 0.18
518 0.19
519 0.2
520 0.18
521 0.15
522 0.15
523 0.15
524 0.16
525 0.17
526 0.13
527 0.13
528 0.15
529 0.15
530 0.18
531 0.22
532 0.27
533 0.29
534 0.33
535 0.35
536 0.39
537 0.37
538 0.34
539 0.3
540 0.25
541 0.23
542 0.19
543 0.17
544 0.12
545 0.13
546 0.15
547 0.14
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.12
552 0.13
553 0.12
554 0.1
555 0.1
556 0.08
557 0.07
558 0.05
559 0.04
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.09
566 0.1
567 0.11
568 0.18
569 0.21
570 0.27
571 0.38
572 0.47
573 0.52
574 0.6
575 0.67
576 0.7
577 0.79
578 0.84
579 0.85
580 0.87
581 0.9
582 0.92
583 0.95
584 0.94
585 0.88
586 0.86
587 0.82
588 0.76
589 0.67
590 0.6
591 0.52
592 0.44
593 0.39
594 0.3
595 0.24
596 0.19
597 0.17
598 0.12
599 0.1
600 0.1