Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409X0W9

Protein Details
Accession A0A409X0W9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
561-580SAPAPSVAVRRNPRRNTRKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-472EIKRAEKEATRREKAAERAAKKAADDLRKEEAKQARERKKAAREEAGRGRGRGRGRGRGRGEGRGRGRGGGRGRGRGRA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR007889  HTH_Psq  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05225  HTH_psq  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MPESAAGSASPAPSRPDSPVDVGALDHDTRLNLAVTAVQEGRTGDNGKPLSLRQICAFYSVKRSTLQGRLSGAKSRKEAHAHERLLSEAEEDVLADWAKTLGRRGLPVTLDMLAEHASEIAGTKVGANWPRKFMERHPDLKIKKTSSLEECRARSLNRTVVADFFDMLKDVIEARQKAFKPATIISAFTKSGIWPLDPLAIPDAAYEPAKNTTTQAALPVSADLTPLLEAIDEVVTTSTQASNDDPISVNSSITNRSDVSTLSTTMQRYRLVGIPPMLPITASRSDLRTQIGQLRALLDEVKVQLEKDHAIKILMVDDNQRLRRILYEKETHKTKTYASSSEGRHMTSAEQLEALALAELRGMWKTIMKDAAFKTALKLRRKLIEDAEKEAALEIKRAEKEATRREKAAERAAKKAADDLRKEEAKQARERKKAAREEAGRGRGRGRGRGRGRGEGRGRGRGGGRGRGRGRAIGIGEADRAPVEGAGAEQEDPDPTLFDDEWKIMRHISCDVPARTSTTQPQTQPPPLLNVASLLPSSLPSTISLDLSSPSSSQIVVTGGSAPAPSVAVRRNPRRNTRKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.3
4 0.32
5 0.35
6 0.36
7 0.33
8 0.3
9 0.27
10 0.25
11 0.24
12 0.19
13 0.16
14 0.14
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.13
19 0.09
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.17
29 0.19
30 0.21
31 0.18
32 0.25
33 0.25
34 0.25
35 0.27
36 0.26
37 0.32
38 0.33
39 0.34
40 0.29
41 0.33
42 0.32
43 0.35
44 0.37
45 0.29
46 0.35
47 0.35
48 0.35
49 0.32
50 0.35
51 0.36
52 0.41
53 0.43
54 0.38
55 0.4
56 0.43
57 0.45
58 0.5
59 0.49
60 0.47
61 0.47
62 0.46
63 0.49
64 0.5
65 0.53
66 0.54
67 0.58
68 0.54
69 0.54
70 0.51
71 0.45
72 0.4
73 0.34
74 0.26
75 0.16
76 0.14
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.12
88 0.15
89 0.17
90 0.2
91 0.22
92 0.26
93 0.25
94 0.26
95 0.25
96 0.21
97 0.19
98 0.16
99 0.15
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.07
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.12
113 0.18
114 0.25
115 0.27
116 0.31
117 0.34
118 0.38
119 0.4
120 0.42
121 0.46
122 0.47
123 0.51
124 0.53
125 0.6
126 0.59
127 0.64
128 0.65
129 0.58
130 0.57
131 0.54
132 0.53
133 0.53
134 0.58
135 0.57
136 0.57
137 0.55
138 0.52
139 0.52
140 0.47
141 0.44
142 0.41
143 0.39
144 0.35
145 0.36
146 0.32
147 0.3
148 0.31
149 0.26
150 0.21
151 0.16
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.08
156 0.06
157 0.06
158 0.09
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.24
163 0.24
164 0.29
165 0.3
166 0.29
167 0.28
168 0.28
169 0.32
170 0.25
171 0.27
172 0.23
173 0.25
174 0.23
175 0.2
176 0.19
177 0.13
178 0.16
179 0.15
180 0.13
181 0.1
182 0.11
183 0.15
184 0.14
185 0.15
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.11
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.15
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.15
251 0.15
252 0.17
253 0.19
254 0.16
255 0.15
256 0.16
257 0.18
258 0.17
259 0.19
260 0.18
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.14
265 0.1
266 0.09
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.15
272 0.16
273 0.18
274 0.19
275 0.15
276 0.15
277 0.18
278 0.19
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.13
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.13
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.17
309 0.17
310 0.21
311 0.22
312 0.23
313 0.24
314 0.31
315 0.34
316 0.39
317 0.43
318 0.41
319 0.4
320 0.38
321 0.33
322 0.34
323 0.33
324 0.3
325 0.3
326 0.34
327 0.33
328 0.38
329 0.37
330 0.29
331 0.26
332 0.24
333 0.21
334 0.19
335 0.18
336 0.12
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.04
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.07
352 0.08
353 0.11
354 0.16
355 0.15
356 0.2
357 0.21
358 0.27
359 0.25
360 0.25
361 0.25
362 0.27
363 0.34
364 0.35
365 0.39
366 0.36
367 0.42
368 0.46
369 0.46
370 0.48
371 0.5
372 0.47
373 0.48
374 0.46
375 0.39
376 0.35
377 0.32
378 0.27
379 0.17
380 0.16
381 0.12
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.18
386 0.2
387 0.28
388 0.37
389 0.45
390 0.43
391 0.44
392 0.47
393 0.52
394 0.52
395 0.54
396 0.52
397 0.46
398 0.48
399 0.5
400 0.48
401 0.42
402 0.43
403 0.4
404 0.38
405 0.38
406 0.37
407 0.41
408 0.42
409 0.43
410 0.44
411 0.44
412 0.43
413 0.49
414 0.55
415 0.58
416 0.63
417 0.68
418 0.69
419 0.73
420 0.75
421 0.72
422 0.72
423 0.67
424 0.68
425 0.71
426 0.71
427 0.64
428 0.56
429 0.51
430 0.47
431 0.46
432 0.46
433 0.43
434 0.45
435 0.49
436 0.57
437 0.6
438 0.64
439 0.64
440 0.64
441 0.64
442 0.63
443 0.61
444 0.59
445 0.55
446 0.49
447 0.47
448 0.44
449 0.44
450 0.44
451 0.44
452 0.46
453 0.47
454 0.5
455 0.5
456 0.45
457 0.43
458 0.38
459 0.34
460 0.27
461 0.26
462 0.21
463 0.21
464 0.18
465 0.17
466 0.12
467 0.11
468 0.09
469 0.07
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.11
484 0.11
485 0.13
486 0.15
487 0.16
488 0.19
489 0.2
490 0.21
491 0.21
492 0.22
493 0.23
494 0.24
495 0.25
496 0.28
497 0.34
498 0.34
499 0.34
500 0.34
501 0.37
502 0.36
503 0.37
504 0.39
505 0.39
506 0.44
507 0.44
508 0.51
509 0.53
510 0.57
511 0.57
512 0.5
513 0.48
514 0.45
515 0.42
516 0.34
517 0.28
518 0.23
519 0.2
520 0.18
521 0.13
522 0.11
523 0.11
524 0.12
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.14
529 0.15
530 0.16
531 0.16
532 0.15
533 0.16
534 0.17
535 0.17
536 0.13
537 0.14
538 0.14
539 0.13
540 0.12
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.11
548 0.11
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.12
554 0.17
555 0.26
556 0.36
557 0.47
558 0.57
559 0.66
560 0.77