Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VXV9

Protein Details
Accession A0A409VXV9    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-75HDATSLPPRNLKRKKPVYAESSSHydrophilic
147-166QLPESKSRPVGRKRKVKAESHydrophilic
168-189SDTPMKPATKSRKKVKEEDSTSHydrophilic
206-226LETKSPSKAKAKKKEEQDEEQHydrophilic
687-712KLRHALFKMDPKHKKNPKYKDDESDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-219KSRPVGRKRKVKAESGSDTPMKPATKSRKKVKEEDSTSEAEMPKAKRLRKTKAELETKSPSKAKAKKK
346-362AKKKAMTSEEKKAVKKA
401-401K
687-687K
689-690RH
694-702KMDPKHKKN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR025834  TopoI_C_dom  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF14370  Topo_C_assoc  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
cd03488  Topoisomer_IB_N_htopoI_like  
Amino Acid Sequences MTSEPSMVLDKRRSSTAQNGHSGSAKLNGNHALKDEDVATSDDDLPLSQTTRHDATSLPPRNLKRKKPVYAESSSEDDTPLASSPAKPVRANGKGRPKQETGASDAPGPSEDASTNRRATNGGSSRPARKKVKEESASASDEDEDDQLPESKSRPVGRKRKVKAESGSDTPMKPATKSRKKVKEEDSTSEAEMPKAKRLRKTKAELETKSPSKAKAKKKEEQDEEQEEVFKWWENTDPNGDGSVKWTTLEHNGVLFPPPYEPLPTTVKMKYNGKPVNLPPEAEEVAGFYAALLETEHARDSTFNKNFFEDWKTVMKKHPPLDGTKIINFELCDFRPMYEHFEAEKAKKKAMTSEEKKAVKKAKEEMEAKYATCLLDGRKEKVGNFRVEPPGLFRGRGDHPKKGALKFRVRPEDITLNIGEGAPIPVPNMPGKWKAIQHDNTVTWLANWTENINGNHKYVFLAAGSSLKGQSDMQKFEKARELKQNHVDRIRQNYTADLKSKVMADRQRATAMYFIDKLALRAGNEKGEDEADTVGCCSLRCEHVTLEAPDFIIFDFLGKDSIRYYNRVQVDPQVFKNIRIFKDNKNDDDNLFDRVTTTSLNKHLTNEMKGLTAKVFRTFNASFTFQRLLDEEDLTNASLQEKLNAYNRANRKVAILCNHQRSVPKTHDQSMEKMRYKHRAFKYERMKLRHALFKMDPKHKKNPKYKDDESDLDDDWIIEHENNLKLKEIEKAEKKFAKENEKLQEEGKPVQKDSVLRERLADIEEDFVRLAKERGTGKATLKRERPEEKIEEAIDKLTEKIKAFKLQIVDRDEGKEVALGTSKINYLDPRYVPFVPLWSDLPSECGLIDRITAAWCQIHDFPIEKIFSKTLMTKFPWAMEVDKDWKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.52
3 0.54
4 0.55
5 0.57
6 0.56
7 0.54
8 0.54
9 0.49
10 0.4
11 0.37
12 0.34
13 0.27
14 0.3
15 0.35
16 0.34
17 0.34
18 0.35
19 0.31
20 0.27
21 0.28
22 0.24
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.2
38 0.22
39 0.23
40 0.21
41 0.21
42 0.27
43 0.35
44 0.41
45 0.41
46 0.46
47 0.52
48 0.63
49 0.72
50 0.74
51 0.75
52 0.77
53 0.82
54 0.84
55 0.85
56 0.82
57 0.79
58 0.74
59 0.68
60 0.62
61 0.54
62 0.45
63 0.37
64 0.29
65 0.23
66 0.19
67 0.15
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.19
72 0.26
73 0.3
74 0.29
75 0.34
76 0.42
77 0.5
78 0.57
79 0.58
80 0.63
81 0.65
82 0.7
83 0.72
84 0.65
85 0.6
86 0.6
87 0.54
88 0.51
89 0.48
90 0.45
91 0.4
92 0.37
93 0.33
94 0.26
95 0.24
96 0.17
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.19
101 0.23
102 0.26
103 0.26
104 0.26
105 0.25
106 0.27
107 0.33
108 0.35
109 0.35
110 0.39
111 0.43
112 0.53
113 0.59
114 0.66
115 0.65
116 0.66
117 0.7
118 0.72
119 0.78
120 0.74
121 0.71
122 0.69
123 0.65
124 0.6
125 0.52
126 0.42
127 0.32
128 0.27
129 0.23
130 0.17
131 0.12
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.18
139 0.23
140 0.3
141 0.38
142 0.46
143 0.55
144 0.64
145 0.73
146 0.76
147 0.81
148 0.8
149 0.79
150 0.76
151 0.74
152 0.7
153 0.64
154 0.63
155 0.55
156 0.5
157 0.43
158 0.4
159 0.32
160 0.28
161 0.32
162 0.38
163 0.45
164 0.55
165 0.63
166 0.69
167 0.75
168 0.83
169 0.83
170 0.83
171 0.79
172 0.76
173 0.7
174 0.62
175 0.56
176 0.51
177 0.42
178 0.33
179 0.32
180 0.26
181 0.3
182 0.34
183 0.38
184 0.42
185 0.51
186 0.6
187 0.64
188 0.71
189 0.71
190 0.75
191 0.8
192 0.74
193 0.72
194 0.71
195 0.64
196 0.62
197 0.55
198 0.5
199 0.5
200 0.56
201 0.59
202 0.61
203 0.67
204 0.69
205 0.77
206 0.83
207 0.8
208 0.79
209 0.77
210 0.72
211 0.66
212 0.59
213 0.5
214 0.4
215 0.34
216 0.26
217 0.19
218 0.14
219 0.11
220 0.15
221 0.16
222 0.18
223 0.21
224 0.22
225 0.21
226 0.22
227 0.22
228 0.18
229 0.18
230 0.18
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.16
236 0.18
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.17
242 0.15
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.15
250 0.2
251 0.21
252 0.25
253 0.27
254 0.31
255 0.34
256 0.4
257 0.4
258 0.46
259 0.48
260 0.46
261 0.49
262 0.47
263 0.52
264 0.46
265 0.42
266 0.34
267 0.34
268 0.32
269 0.26
270 0.22
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.09
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.11
288 0.21
289 0.25
290 0.26
291 0.27
292 0.29
293 0.29
294 0.31
295 0.32
296 0.23
297 0.22
298 0.28
299 0.29
300 0.3
301 0.35
302 0.4
303 0.42
304 0.45
305 0.47
306 0.42
307 0.44
308 0.48
309 0.49
310 0.44
311 0.4
312 0.38
313 0.32
314 0.31
315 0.26
316 0.22
317 0.2
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.22
325 0.19
326 0.2
327 0.18
328 0.22
329 0.24
330 0.25
331 0.33
332 0.28
333 0.28
334 0.29
335 0.29
336 0.32
337 0.37
338 0.44
339 0.41
340 0.48
341 0.55
342 0.58
343 0.58
344 0.58
345 0.58
346 0.51
347 0.5
348 0.49
349 0.47
350 0.5
351 0.52
352 0.48
353 0.46
354 0.43
355 0.38
356 0.32
357 0.26
358 0.18
359 0.15
360 0.14
361 0.09
362 0.16
363 0.18
364 0.2
365 0.24
366 0.25
367 0.26
368 0.34
369 0.39
370 0.35
371 0.34
372 0.37
373 0.36
374 0.35
375 0.34
376 0.28
377 0.28
378 0.25
379 0.23
380 0.18
381 0.19
382 0.23
383 0.33
384 0.34
385 0.33
386 0.34
387 0.41
388 0.45
389 0.46
390 0.49
391 0.47
392 0.52
393 0.53
394 0.6
395 0.61
396 0.57
397 0.54
398 0.51
399 0.48
400 0.39
401 0.35
402 0.27
403 0.19
404 0.18
405 0.16
406 0.12
407 0.07
408 0.07
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.1
417 0.12
418 0.14
419 0.17
420 0.19
421 0.21
422 0.28
423 0.31
424 0.32
425 0.33
426 0.32
427 0.3
428 0.28
429 0.25
430 0.17
431 0.15
432 0.12
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.12
438 0.14
439 0.16
440 0.17
441 0.17
442 0.17
443 0.16
444 0.15
445 0.11
446 0.11
447 0.07
448 0.06
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.14
458 0.16
459 0.2
460 0.22
461 0.28
462 0.29
463 0.3
464 0.37
465 0.32
466 0.33
467 0.39
468 0.41
469 0.41
470 0.5
471 0.54
472 0.51
473 0.54
474 0.54
475 0.47
476 0.52
477 0.5
478 0.42
479 0.36
480 0.35
481 0.35
482 0.34
483 0.32
484 0.26
485 0.23
486 0.22
487 0.23
488 0.21
489 0.22
490 0.23
491 0.27
492 0.28
493 0.29
494 0.3
495 0.28
496 0.28
497 0.25
498 0.21
499 0.17
500 0.15
501 0.13
502 0.14
503 0.14
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.11
508 0.14
509 0.15
510 0.15
511 0.15
512 0.15
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.1
517 0.1
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.08
526 0.1
527 0.11
528 0.13
529 0.13
530 0.17
531 0.21
532 0.21
533 0.2
534 0.18
535 0.17
536 0.15
537 0.15
538 0.11
539 0.08
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.14
549 0.16
550 0.19
551 0.21
552 0.26
553 0.3
554 0.31
555 0.3
556 0.32
557 0.37
558 0.36
559 0.35
560 0.38
561 0.35
562 0.35
563 0.41
564 0.4
565 0.35
566 0.39
567 0.41
568 0.4
569 0.5
570 0.53
571 0.5
572 0.49
573 0.49
574 0.43
575 0.45
576 0.38
577 0.31
578 0.26
579 0.22
580 0.18
581 0.17
582 0.17
583 0.13
584 0.14
585 0.13
586 0.18
587 0.22
588 0.22
589 0.23
590 0.28
591 0.3
592 0.31
593 0.29
594 0.25
595 0.24
596 0.23
597 0.23
598 0.19
599 0.19
600 0.18
601 0.2
602 0.2
603 0.18
604 0.25
605 0.25
606 0.25
607 0.26
608 0.28
609 0.25
610 0.27
611 0.3
612 0.22
613 0.23
614 0.22
615 0.21
616 0.19
617 0.2
618 0.16
619 0.15
620 0.16
621 0.15
622 0.14
623 0.1
624 0.09
625 0.1
626 0.1
627 0.12
628 0.12
629 0.15
630 0.2
631 0.26
632 0.27
633 0.33
634 0.39
635 0.42
636 0.43
637 0.4
638 0.38
639 0.38
640 0.41
641 0.4
642 0.43
643 0.44
644 0.5
645 0.5
646 0.49
647 0.49
648 0.48
649 0.48
650 0.45
651 0.46
652 0.44
653 0.49
654 0.54
655 0.52
656 0.54
657 0.57
658 0.6
659 0.57
660 0.58
661 0.58
662 0.61
663 0.63
664 0.66
665 0.65
666 0.66
667 0.67
668 0.72
669 0.76
670 0.76
671 0.79
672 0.76
673 0.73
674 0.69
675 0.68
676 0.66
677 0.56
678 0.54
679 0.5
680 0.52
681 0.57
682 0.6
683 0.64
684 0.62
685 0.72
686 0.74
687 0.8
688 0.82
689 0.83
690 0.83
691 0.83
692 0.83
693 0.81
694 0.78
695 0.72
696 0.66
697 0.59
698 0.49
699 0.41
700 0.34
701 0.25
702 0.18
703 0.15
704 0.12
705 0.08
706 0.09
707 0.12
708 0.17
709 0.19
710 0.19
711 0.21
712 0.21
713 0.22
714 0.27
715 0.29
716 0.33
717 0.4
718 0.44
719 0.51
720 0.55
721 0.57
722 0.58
723 0.6
724 0.61
725 0.59
726 0.62
727 0.62
728 0.61
729 0.6
730 0.53
731 0.52
732 0.46
733 0.46
734 0.45
735 0.39
736 0.36
737 0.37
738 0.39
739 0.37
740 0.4
741 0.44
742 0.4
743 0.37
744 0.38
745 0.36
746 0.35
747 0.33
748 0.27
749 0.17
750 0.17
751 0.17
752 0.16
753 0.15
754 0.14
755 0.13
756 0.13
757 0.13
758 0.11
759 0.17
760 0.18
761 0.23
762 0.26
763 0.3
764 0.36
765 0.44
766 0.49
767 0.53
768 0.57
769 0.59
770 0.64
771 0.66
772 0.66
773 0.65
774 0.64
775 0.59
776 0.57
777 0.52
778 0.46
779 0.41
780 0.36
781 0.28
782 0.24
783 0.21
784 0.19
785 0.22
786 0.21
787 0.26
788 0.31
789 0.37
790 0.38
791 0.41
792 0.44
793 0.45
794 0.51
795 0.5
796 0.48
797 0.42
798 0.43
799 0.41
800 0.34
801 0.29
802 0.23
803 0.18
804 0.17
805 0.17
806 0.15
807 0.14
808 0.16
809 0.17
810 0.16
811 0.18
812 0.2
813 0.22
814 0.29
815 0.29
816 0.31
817 0.36
818 0.36
819 0.35
820 0.32
821 0.31
822 0.28
823 0.28
824 0.26
825 0.23
826 0.24
827 0.22
828 0.25
829 0.22
830 0.18
831 0.16
832 0.15
833 0.14
834 0.13
835 0.13
836 0.11
837 0.11
838 0.12
839 0.12
840 0.12
841 0.13
842 0.13
843 0.17
844 0.18
845 0.19
846 0.21
847 0.22
848 0.22
849 0.27
850 0.29
851 0.26
852 0.28
853 0.27
854 0.26
855 0.28
856 0.32
857 0.3
858 0.36
859 0.38
860 0.41
861 0.42
862 0.42
863 0.42
864 0.38
865 0.36
866 0.32
867 0.35