Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VPU7

Protein Details
Accession A0A409VPU7    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-48KPRAVDGSTKKRRVVRRRGRARGELDSDBasic
154-181TTVPDTGKARKPKKVNKAKRAKEARATSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-42HKPRAVDGSTKKRRVVRRRGRAR
161-177KARKPKKVNKAKRAKEA
253-267RGRGRGRGRGFAMRG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MPAPLLSQSSTRTANKAASHKPRAVDGSTKKRRVVRRRGRARGELDSDEEIEREAVTDSDSDADDDISSTDSATEDSDTEPVSEDVVTHDRAHLPTPRNSKSPETVVKEETGKVNGDVPSFFSAPGDWADMVTDEKVHGPADLPVIEFANFSGTTVPDTGKARKPKKVNKAKRAKEARATSADSTHEAAAPPIDSAPSQSESRHQRVSSQSARQAYQHKLETDPSFVPTIGNFWGHDDRLIDTELRSLSGWWRGRGRGRGRGFAMRGRGGFSRADQRGQGGDDAAAMKEEDLPPIERVWTHDGFEELKRKEEQRRAEQFAAKNVQSSPKREGFVGGRGGFVSGRGRGGFVPRARFAVQPTPHSPSLVTMPGRVRFAMKPELMWTKHHEAFLYFDPALKPRPGHGPSYRVKLPGHESGIVRTAPAPRASSRPSTSKVKIDGSEAGDKYFVVRLPKRAGKEPESLTTKEDETPIEEVFKVRPQLVAAPPIVLPGQGASSSTATETKASVQSTVDAGPSALPDSTLRSQLEQLSLEPVAEDPVRQAKTEEAVLRRTSISESAAADQAHEENTAPDRPALAPLQTTFSPPPPAPSQPISQRSPPYGSPYGYSLPLGVALNQHGMPYEVATGHPVYLQPPPMYNPRPLIPSHYPSSLYVPGHMHQPSPDFLAQPPSHTPPVNGFIDPATGTPIFSFPRQTSRVEIRAPDGKPKPVSRTSSNLRTAAPSFQPSRTSSNSENGYYAQSASEATNSPYEHASGAAPVDDPGQAGMTGMMYPYQPTYYYPEHYGYPQYVDMSQAGQYDMYSMDQTPQGTVYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.42
3 0.47
4 0.53
5 0.57
6 0.62
7 0.64
8 0.62
9 0.62
10 0.6
11 0.55
12 0.55
13 0.55
14 0.58
15 0.64
16 0.68
17 0.69
18 0.72
19 0.78
20 0.79
21 0.81
22 0.81
23 0.81
24 0.86
25 0.91
26 0.92
27 0.9
28 0.85
29 0.83
30 0.78
31 0.7
32 0.63
33 0.55
34 0.48
35 0.39
36 0.33
37 0.25
38 0.19
39 0.15
40 0.12
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.13
73 0.16
74 0.18
75 0.16
76 0.18
77 0.21
78 0.22
79 0.26
80 0.3
81 0.32
82 0.38
83 0.47
84 0.49
85 0.51
86 0.54
87 0.56
88 0.54
89 0.58
90 0.58
91 0.56
92 0.56
93 0.54
94 0.53
95 0.5
96 0.46
97 0.4
98 0.34
99 0.28
100 0.24
101 0.26
102 0.24
103 0.23
104 0.21
105 0.21
106 0.22
107 0.21
108 0.2
109 0.16
110 0.14
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.18
146 0.23
147 0.3
148 0.4
149 0.45
150 0.52
151 0.62
152 0.68
153 0.75
154 0.81
155 0.84
156 0.85
157 0.9
158 0.9
159 0.9
160 0.9
161 0.86
162 0.85
163 0.8
164 0.76
165 0.7
166 0.65
167 0.56
168 0.49
169 0.43
170 0.36
171 0.31
172 0.25
173 0.2
174 0.16
175 0.15
176 0.13
177 0.11
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.09
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.22
188 0.3
189 0.35
190 0.39
191 0.36
192 0.38
193 0.43
194 0.51
195 0.51
196 0.5
197 0.51
198 0.49
199 0.5
200 0.49
201 0.49
202 0.45
203 0.44
204 0.42
205 0.37
206 0.36
207 0.39
208 0.37
209 0.35
210 0.31
211 0.26
212 0.23
213 0.21
214 0.19
215 0.14
216 0.15
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.14
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.13
229 0.11
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.2
237 0.23
238 0.23
239 0.26
240 0.3
241 0.36
242 0.44
243 0.48
244 0.5
245 0.5
246 0.53
247 0.53
248 0.55
249 0.51
250 0.47
251 0.45
252 0.38
253 0.35
254 0.31
255 0.29
256 0.24
257 0.23
258 0.21
259 0.25
260 0.24
261 0.25
262 0.23
263 0.23
264 0.23
265 0.23
266 0.21
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.14
285 0.19
286 0.18
287 0.17
288 0.17
289 0.18
290 0.2
291 0.23
292 0.28
293 0.22
294 0.25
295 0.26
296 0.3
297 0.37
298 0.42
299 0.46
300 0.49
301 0.56
302 0.59
303 0.61
304 0.63
305 0.57
306 0.56
307 0.53
308 0.42
309 0.36
310 0.3
311 0.34
312 0.32
313 0.34
314 0.33
315 0.33
316 0.33
317 0.32
318 0.34
319 0.28
320 0.29
321 0.31
322 0.26
323 0.22
324 0.21
325 0.21
326 0.18
327 0.16
328 0.14
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.13
335 0.18
336 0.19
337 0.22
338 0.22
339 0.25
340 0.25
341 0.26
342 0.26
343 0.29
344 0.28
345 0.29
346 0.32
347 0.34
348 0.33
349 0.32
350 0.29
351 0.21
352 0.22
353 0.21
354 0.18
355 0.16
356 0.19
357 0.2
358 0.21
359 0.2
360 0.2
361 0.17
362 0.2
363 0.23
364 0.2
365 0.18
366 0.21
367 0.27
368 0.25
369 0.27
370 0.28
371 0.29
372 0.31
373 0.31
374 0.28
375 0.22
376 0.24
377 0.24
378 0.22
379 0.16
380 0.14
381 0.15
382 0.16
383 0.17
384 0.15
385 0.14
386 0.12
387 0.2
388 0.21
389 0.26
390 0.28
391 0.33
392 0.35
393 0.41
394 0.4
395 0.35
396 0.33
397 0.3
398 0.32
399 0.29
400 0.28
401 0.25
402 0.24
403 0.22
404 0.25
405 0.22
406 0.18
407 0.14
408 0.14
409 0.13
410 0.15
411 0.15
412 0.14
413 0.18
414 0.21
415 0.25
416 0.25
417 0.28
418 0.31
419 0.36
420 0.37
421 0.37
422 0.38
423 0.36
424 0.34
425 0.32
426 0.31
427 0.27
428 0.3
429 0.26
430 0.23
431 0.2
432 0.19
433 0.17
434 0.16
435 0.14
436 0.14
437 0.16
438 0.2
439 0.26
440 0.31
441 0.33
442 0.38
443 0.42
444 0.4
445 0.45
446 0.43
447 0.43
448 0.44
449 0.42
450 0.36
451 0.32
452 0.29
453 0.23
454 0.22
455 0.16
456 0.13
457 0.14
458 0.13
459 0.12
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.14
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.16
469 0.17
470 0.2
471 0.17
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.11
477 0.09
478 0.05
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.1
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.12
495 0.13
496 0.13
497 0.14
498 0.11
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.11
508 0.12
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.18
513 0.19
514 0.21
515 0.17
516 0.16
517 0.15
518 0.14
519 0.13
520 0.11
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.14
527 0.15
528 0.15
529 0.16
530 0.15
531 0.17
532 0.21
533 0.24
534 0.2
535 0.23
536 0.24
537 0.25
538 0.24
539 0.22
540 0.2
541 0.17
542 0.15
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.17
547 0.16
548 0.15
549 0.14
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.09
554 0.08
555 0.11
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.15
562 0.15
563 0.13
564 0.14
565 0.14
566 0.17
567 0.16
568 0.19
569 0.18
570 0.19
571 0.22
572 0.21
573 0.25
574 0.25
575 0.28
576 0.29
577 0.3
578 0.34
579 0.38
580 0.45
581 0.44
582 0.46
583 0.46
584 0.45
585 0.46
586 0.42
587 0.41
588 0.38
589 0.35
590 0.31
591 0.31
592 0.29
593 0.26
594 0.25
595 0.17
596 0.13
597 0.14
598 0.13
599 0.1
600 0.1
601 0.1
602 0.12
603 0.11
604 0.11
605 0.09
606 0.1
607 0.1
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.08
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.13
619 0.17
620 0.16
621 0.17
622 0.2
623 0.28
624 0.31
625 0.33
626 0.34
627 0.32
628 0.35
629 0.34
630 0.38
631 0.37
632 0.39
633 0.39
634 0.37
635 0.37
636 0.35
637 0.39
638 0.37
639 0.3
640 0.28
641 0.27
642 0.26
643 0.3
644 0.29
645 0.25
646 0.21
647 0.24
648 0.22
649 0.24
650 0.25
651 0.2
652 0.2
653 0.28
654 0.27
655 0.28
656 0.31
657 0.31
658 0.34
659 0.33
660 0.34
661 0.29
662 0.35
663 0.33
664 0.29
665 0.25
666 0.21
667 0.22
668 0.21
669 0.16
670 0.15
671 0.12
672 0.12
673 0.12
674 0.15
675 0.15
676 0.16
677 0.21
678 0.18
679 0.27
680 0.29
681 0.31
682 0.35
683 0.4
684 0.45
685 0.44
686 0.44
687 0.42
688 0.47
689 0.46
690 0.49
691 0.46
692 0.47
693 0.5
694 0.53
695 0.56
696 0.56
697 0.61
698 0.56
699 0.61
700 0.62
701 0.65
702 0.65
703 0.6
704 0.53
705 0.51
706 0.48
707 0.44
708 0.4
709 0.37
710 0.35
711 0.35
712 0.39
713 0.37
714 0.42
715 0.41
716 0.43
717 0.41
718 0.45
719 0.46
720 0.43
721 0.41
722 0.36
723 0.35
724 0.29
725 0.26
726 0.18
727 0.14
728 0.14
729 0.13
730 0.14
731 0.12
732 0.14
733 0.17
734 0.18
735 0.19
736 0.19
737 0.19
738 0.17
739 0.16
740 0.15
741 0.12
742 0.12
743 0.11
744 0.1
745 0.1
746 0.11
747 0.1
748 0.09
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.08
753 0.08
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.08
760 0.1
761 0.11
762 0.11
763 0.13
764 0.2
765 0.24
766 0.28
767 0.3
768 0.31
769 0.32
770 0.34
771 0.37
772 0.32
773 0.31
774 0.29
775 0.27
776 0.25
777 0.25
778 0.23
779 0.2
780 0.2
781 0.17
782 0.16
783 0.14
784 0.13
785 0.12
786 0.12
787 0.12
788 0.12
789 0.11
790 0.13
791 0.16
792 0.17
793 0.16