Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YDM1

Protein Details
Accession A0A409YDM1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-294LLTNCLPNCRRRVKQQARENVPKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11.5, pero 9, cyto_mito 7.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002415  H/ACA_rnp_Nhp2-like  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
IPR000608  UBQ-conjugat_E2  
IPR023313  UBQ-conjugating_AS  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PF00179  UQ_con  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
PS00183  UBC_1  
PS50127  UBC_2  
CDD cd00195  UBCc  
Amino Acid Sequences MADEAHGRAWPLADANLTNQILDLVQQAGQYKQLKKGANEATKTLNRGIAEFIILTADTEPLEILLHLPLLCEEKNVPYIFLPSKAALGRACNVSRPVIAASVTTAVSFLYLSTMSGICRTRLAEERKQWRKDHPFGFYAKPAKAPDGSMNLMEWEVGIPGKAKTAWEGGLYKLTMTFPEDYPSKPPKCKFTPPLFHPNVYPSGTVCLSILDEEKSWKPAITIKQASILLGIQDLLDNPNVNDPAQSDAYTMFKNDKAAYEYDMAVRFRLVLLTNCLPNCRRRVKQQARENVPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.23
4 0.22
5 0.21
6 0.19
7 0.18
8 0.16
9 0.16
10 0.14
11 0.08
12 0.09
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.2
17 0.26
18 0.28
19 0.34
20 0.4
21 0.43
22 0.43
23 0.52
24 0.55
25 0.57
26 0.56
27 0.51
28 0.52
29 0.51
30 0.52
31 0.45
32 0.38
33 0.3
34 0.29
35 0.28
36 0.2
37 0.18
38 0.15
39 0.13
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.15
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.16
71 0.18
72 0.18
73 0.2
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.21
78 0.21
79 0.2
80 0.21
81 0.21
82 0.19
83 0.19
84 0.17
85 0.13
86 0.13
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.21
110 0.27
111 0.32
112 0.39
113 0.49
114 0.57
115 0.62
116 0.62
117 0.64
118 0.66
119 0.67
120 0.63
121 0.57
122 0.51
123 0.49
124 0.49
125 0.44
126 0.39
127 0.32
128 0.3
129 0.27
130 0.25
131 0.22
132 0.21
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.08
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.09
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.21
170 0.29
171 0.31
172 0.36
173 0.39
174 0.44
175 0.5
176 0.58
177 0.6
178 0.62
179 0.67
180 0.67
181 0.75
182 0.69
183 0.64
184 0.56
185 0.5
186 0.44
187 0.36
188 0.29
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.14
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.12
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.2
207 0.26
208 0.32
209 0.34
210 0.33
211 0.37
212 0.37
213 0.36
214 0.31
215 0.25
216 0.15
217 0.12
218 0.11
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.16
232 0.18
233 0.18
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.18
239 0.16
240 0.16
241 0.19
242 0.2
243 0.21
244 0.22
245 0.23
246 0.25
247 0.24
248 0.24
249 0.25
250 0.28
251 0.25
252 0.22
253 0.21
254 0.18
255 0.16
256 0.17
257 0.15
258 0.14
259 0.2
260 0.24
261 0.29
262 0.3
263 0.35
264 0.36
265 0.4
266 0.47
267 0.49
268 0.52
269 0.57
270 0.68
271 0.74
272 0.82
273 0.85
274 0.87