FuNGI

A0A409W1V3

Protein Details

Accession

A0A409W1V3

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-49	LLKLLASTKKKSQRDPRPYNPLGLK	Hydrophilic
117-146	EWEVGFKRNKDKGKEKRPFKGPKARSRFWI	Basic
310-334	VLRQREEKKRREAERKEKEKNTKST	Basic
346-369	ADPSSAERPKPRPRPRPRTVAKDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
123-143	KRNKDKGKEKRPFKGPKARSR
269-273	RKKKK
294-298	RKRRK
313-332	QREEKKRREAERKEKEKNTK
353-363	RPKPRPRPRPR
462-489	RKARSRASSRAKSRSRSTSVRPRSTREK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MSSADPSTLCPYCDLPLPSDPSPLLLKLLASTKKKSQRDPRPYNPLGLKAPLTTFISVCQRHRFESQILPEAEKKGWPKAIEWEALAGRVMKMHDILKALIEDPGDHYLDAEKPVDEWEVGFKRNKDKGKEKRPFKGPKARSRFWIELMDEVKKKGMRAVSGVRGQFANFEKAQPGYYGEQGSVIIHQTLYNMFPLESIDPTLTAPLTANEFLERILVPEVALRLIMEDKGLDSDLEEDIDEALEILRDSSSYGVAMFPEDGGEWGGNRKKKKGSGGDDDQLGVGDLIVMERARKRRKELEEEDEREMEVLRQREEKKRREAERKEKEKNTKSTPRDNAIEQMETADPSSAERPKPRPRPRPRTVAKDSSAMSIVDTRTDAEDEPRPTRGRDKTRSRSRSVATVSDNGRRPSSEERRRSPSASESRVFEDNELRRTPDVGWESDASNRAVVNGNVDINDTTRKARSRASSRAKSRSRSTSVRPRSTREKSRDSKMDVEEDRVGGAVSDEDDEVEVSELITAKTPVQTEKRRAVVDVDDEPTPKAPPAHAPRPAAPVAPLLAARQRALQRQGSNASNSSTGERKHAGPPQLGMTRRATNVSTTTFGRERERSTHRTATNVDERSAKKDSMGSDPGFRWLLDDTSQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.26
3	0.31
4	0.37
5	0.35
6	0.37
7	0.35
8	0.32
9	0.33
10	0.29
11	0.25
12	0.19
13	0.18
14	0.17
15	0.25
16	0.3
17	0.32
18	0.37
19	0.45
20	0.54
21	0.61
22	0.69
23	0.72
24	0.75
25	0.81
26	0.87
27	0.87
28	0.88
29	0.83
30	0.81
31	0.75
32	0.71
33	0.63
34	0.57
35	0.48
36	0.4
37	0.38
38	0.33
39	0.31
40	0.26
41	0.22
42	0.23
43	0.3
44	0.32
45	0.36
46	0.41
47	0.42
48	0.44
49	0.48
50	0.48
51	0.44
52	0.48
53	0.49
54	0.48
55	0.47
56	0.47
57	0.47
58	0.45
59	0.41
60	0.38
61	0.35
62	0.33
63	0.36
64	0.34
65	0.33
66	0.38
67	0.43
68	0.4
69	0.37
70	0.35
71	0.3
72	0.3
73	0.28
74	0.2
75	0.15
76	0.15
77	0.15
78	0.11
79	0.13
80	0.14
81	0.16
82	0.17
83	0.17
84	0.17
85	0.17
86	0.17
87	0.16
88	0.15
89	0.13
90	0.14
91	0.16
92	0.15
93	0.14
94	0.14
95	0.14
96	0.16
97	0.17
98	0.15
99	0.12
100	0.12
101	0.14
102	0.15
103	0.12
104	0.11
105	0.17
106	0.19
107	0.23
108	0.27
109	0.29
110	0.37
111	0.45
112	0.52
113	0.53
114	0.6
115	0.68
116	0.74
117	0.81
118	0.81
119	0.83
120	0.86
121	0.87
122	0.86
123	0.87
124	0.85
125	0.86
126	0.87
127	0.8
128	0.77
129	0.75
130	0.68
131	0.61
132	0.58
133	0.48
134	0.44
135	0.44
136	0.44
137	0.36
138	0.33
139	0.34
140	0.28
141	0.28
142	0.26
143	0.26
144	0.22
145	0.26
146	0.32
147	0.34
148	0.39
149	0.39
150	0.36
151	0.33
152	0.31
153	0.3
154	0.26
155	0.24
156	0.19
157	0.2
158	0.2
159	0.21
160	0.22
161	0.17
162	0.18
163	0.15
164	0.17
165	0.17
166	0.15
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.11
171	0.1
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.07
176	0.08
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.09
183	0.1
184	0.09
185	0.1
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.06
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.09
202	0.07
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.07
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.06
228	0.05
229	0.04
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.09
253	0.14
254	0.18
255	0.2
256	0.25
257	0.29
258	0.34
259	0.42
260	0.47
261	0.49
262	0.54
263	0.58
264	0.56
265	0.51
266	0.47
267	0.39
268	0.29
269	0.22
270	0.13
271	0.06
272	0.04
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.08
279	0.16
280	0.23
281	0.26
282	0.32
283	0.41
284	0.48
285	0.57
286	0.6
287	0.61
288	0.63
289	0.64
290	0.61
291	0.52
292	0.45
293	0.35
294	0.29
295	0.21
296	0.15
297	0.13
298	0.12
299	0.18
300	0.22
301	0.31
302	0.4
303	0.45
304	0.51
305	0.59
306	0.66
307	0.71
308	0.77
309	0.79
310	0.81
311	0.84
312	0.82
313	0.82
314	0.83
315	0.8
316	0.77
317	0.75
318	0.74
319	0.69
320	0.7
321	0.67
322	0.62
323	0.56
324	0.5
325	0.46
326	0.38
327	0.33
328	0.24
329	0.21
330	0.16
331	0.14
332	0.13
333	0.08
334	0.06
335	0.07
336	0.1
337	0.12
338	0.14
339	0.2
340	0.27
341	0.37
342	0.48
343	0.57
344	0.65
345	0.73
346	0.81
347	0.82
348	0.86
349	0.82
350	0.81
351	0.78
352	0.75
353	0.66
354	0.59
355	0.54
356	0.44
357	0.39
358	0.29
359	0.22
360	0.16
361	0.14
362	0.11
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.15
370	0.18
371	0.19
372	0.23
373	0.23
374	0.24
375	0.32
376	0.37
377	0.42
378	0.48
379	0.57
380	0.64
381	0.74
382	0.79
383	0.76
384	0.74
385	0.66
386	0.64
387	0.56
388	0.5
389	0.42
390	0.41
391	0.39
392	0.39
393	0.42
394	0.36
395	0.33
396	0.29
397	0.29
398	0.34
399	0.42
400	0.45
401	0.5
402	0.54
403	0.61
404	0.64
405	0.63
406	0.56
407	0.54
408	0.53
409	0.5
410	0.46
411	0.41
412	0.41
413	0.42
414	0.39
415	0.31
416	0.3
417	0.28
418	0.3
419	0.29
420	0.28
421	0.25
422	0.26
423	0.25
424	0.24
425	0.24
426	0.2
427	0.22
428	0.21
429	0.22
430	0.23
431	0.25
432	0.18
433	0.16
434	0.14
435	0.13
436	0.14
437	0.13
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.12
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.14
446	0.12
447	0.13
448	0.17
449	0.2
450	0.21
451	0.27
452	0.34
453	0.4
454	0.49
455	0.58
456	0.63
457	0.69
458	0.77
459	0.78
460	0.76
461	0.74
462	0.73
463	0.7
464	0.66
465	0.67
466	0.68
467	0.71
468	0.75
469	0.72
470	0.69
471	0.72
472	0.76
473	0.77
474	0.74
475	0.74
476	0.7
477	0.76
478	0.77
479	0.72
480	0.7
481	0.63
482	0.63
483	0.54
484	0.52
485	0.45
486	0.37
487	0.31
488	0.24
489	0.2
490	0.12
491	0.11
492	0.06
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.06
502	0.05
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.11
510	0.13
511	0.18
512	0.26
513	0.35
514	0.41
515	0.47
516	0.52
517	0.51
518	0.51
519	0.48
520	0.43
521	0.4
522	0.37
523	0.32
524	0.27
525	0.27
526	0.27
527	0.25
528	0.21
529	0.18
530	0.15
531	0.15
532	0.23
533	0.32
534	0.39
535	0.45
536	0.49
537	0.5
538	0.55
539	0.54
540	0.46
541	0.38
542	0.31
543	0.25
544	0.22
545	0.19
546	0.15
547	0.19
548	0.19
549	0.19
550	0.23
551	0.27
552	0.32
553	0.38
554	0.43
555	0.41
556	0.46
557	0.51
558	0.49
559	0.48
560	0.43
561	0.39
562	0.34
563	0.32
564	0.29
565	0.28
566	0.26
567	0.27
568	0.28
569	0.29
570	0.35
571	0.41
572	0.43
573	0.41
574	0.42
575	0.45
576	0.49
577	0.48
578	0.44
579	0.42
580	0.41
581	0.4
582	0.41
583	0.34
584	0.31
585	0.33
586	0.33
587	0.31
588	0.27
589	0.32
590	0.32
591	0.35
592	0.38
593	0.39
594	0.4
595	0.46
596	0.53
597	0.53
598	0.57
599	0.63
600	0.58
601	0.59
602	0.57
603	0.57
604	0.58
605	0.55
606	0.49
607	0.48
608	0.48
609	0.48
610	0.49
611	0.41
612	0.33
613	0.35
614	0.36
615	0.36
616	0.41
617	0.37
618	0.39
619	0.39
620	0.41
621	0.38
622	0.35
623	0.29
624	0.24
625	0.24

A0A409W1V3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer