Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VHW5

Protein Details
Accession A0A409VHW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-422VYGRGRRGFERQHRREEEKRKAMMSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-418GRGRRGFERQHRREEEKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039146  GPANK1  
Amino Acid Sequences MATVTHYIHSDYNPEDRELLEQETGQTSEDQQLGKPADPEEEWRREASRLPSQRVQKPAPRFVPAAVTYDEWGSSQGTLPKHEPSTSNSLGSSVSGWYRSLTGTTPAPSPSTSRPKEASSITRPSSVPTDSVASPAPQKVELRNKNNWFITKVIQSEPSSSSSTPAPSLADILARDPPPLPSQAKYTPPVFLEIGPSNKGFGMLQRSGWNEGEPLGPDVIRRKPVEDLLPDEDILSLENRDRKGKPREVIPSSLKFSSRREVVEVKVEDSEDVSELRSVDVIDLTLSDSELDDAEEFKSNVDVHDGDAKLEEGEYQNPPDSVPPSPPGHTSLDDTSAYGRKALLTPIATVLKSDRLGIGLKAKTVGPYKASQKRVTHNAAALAAHVKAAEESRIRRQVYGRGRRGFERQHRREEEKRKAMMSYLKGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.27
4 0.29
5 0.28
6 0.28
7 0.22
8 0.2
9 0.2
10 0.22
11 0.22
12 0.19
13 0.17
14 0.15
15 0.19
16 0.21
17 0.2
18 0.18
19 0.24
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.31
27 0.33
28 0.37
29 0.37
30 0.37
31 0.38
32 0.36
33 0.41
34 0.41
35 0.43
36 0.45
37 0.51
38 0.56
39 0.62
40 0.67
41 0.7
42 0.7
43 0.68
44 0.69
45 0.71
46 0.69
47 0.65
48 0.59
49 0.52
50 0.52
51 0.45
52 0.4
53 0.32
54 0.28
55 0.24
56 0.23
57 0.22
58 0.15
59 0.14
60 0.11
61 0.1
62 0.12
63 0.16
64 0.17
65 0.2
66 0.22
67 0.26
68 0.28
69 0.29
70 0.29
71 0.29
72 0.37
73 0.35
74 0.34
75 0.29
76 0.27
77 0.25
78 0.24
79 0.19
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.12
88 0.11
89 0.13
90 0.15
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.18
96 0.21
97 0.26
98 0.34
99 0.35
100 0.38
101 0.4
102 0.41
103 0.44
104 0.45
105 0.44
106 0.41
107 0.46
108 0.43
109 0.44
110 0.42
111 0.4
112 0.38
113 0.31
114 0.25
115 0.19
116 0.21
117 0.17
118 0.19
119 0.17
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.17
126 0.22
127 0.32
128 0.4
129 0.45
130 0.52
131 0.56
132 0.6
133 0.62
134 0.57
135 0.48
136 0.41
137 0.39
138 0.34
139 0.32
140 0.27
141 0.28
142 0.26
143 0.27
144 0.27
145 0.26
146 0.24
147 0.22
148 0.21
149 0.18
150 0.18
151 0.16
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.17
167 0.18
168 0.16
169 0.21
170 0.24
171 0.28
172 0.29
173 0.29
174 0.27
175 0.26
176 0.27
177 0.22
178 0.18
179 0.18
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.1
188 0.1
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.17
193 0.19
194 0.21
195 0.21
196 0.19
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.11
206 0.13
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.19
211 0.22
212 0.25
213 0.23
214 0.24
215 0.23
216 0.23
217 0.22
218 0.2
219 0.18
220 0.14
221 0.12
222 0.08
223 0.06
224 0.07
225 0.11
226 0.12
227 0.16
228 0.18
229 0.26
230 0.35
231 0.41
232 0.42
233 0.46
234 0.53
235 0.53
236 0.57
237 0.54
238 0.5
239 0.46
240 0.45
241 0.4
242 0.34
243 0.33
244 0.32
245 0.29
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.28
250 0.33
251 0.31
252 0.27
253 0.25
254 0.24
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.08
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.21
311 0.22
312 0.24
313 0.25
314 0.27
315 0.28
316 0.28
317 0.29
318 0.26
319 0.26
320 0.25
321 0.23
322 0.23
323 0.23
324 0.21
325 0.18
326 0.17
327 0.14
328 0.15
329 0.17
330 0.18
331 0.16
332 0.17
333 0.21
334 0.23
335 0.21
336 0.21
337 0.21
338 0.21
339 0.2
340 0.2
341 0.16
342 0.15
343 0.17
344 0.18
345 0.24
346 0.21
347 0.21
348 0.22
349 0.22
350 0.25
351 0.28
352 0.28
353 0.24
354 0.29
355 0.39
356 0.46
357 0.52
358 0.55
359 0.58
360 0.64
361 0.69
362 0.7
363 0.64
364 0.58
365 0.55
366 0.49
367 0.42
368 0.35
369 0.28
370 0.21
371 0.16
372 0.13
373 0.1
374 0.09
375 0.11
376 0.15
377 0.18
378 0.23
379 0.32
380 0.4
381 0.42
382 0.44
383 0.47
384 0.51
385 0.57
386 0.63
387 0.63
388 0.63
389 0.66
390 0.67
391 0.72
392 0.73
393 0.73
394 0.74
395 0.72
396 0.75
397 0.8
398 0.83
399 0.85
400 0.85
401 0.85
402 0.84
403 0.81
404 0.73
405 0.66
406 0.63
407 0.62