Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409X0I1

Protein Details
Accession A0A409X0I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-90LTRPLHCSRSHHRQRTQSPCCLPSHydrophilic
400-422DFGHYSKDCKKKKFNDRMRAVLEHydrophilic
1092-1111DAVSNWPKPHNKKDVQQFLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR000477  RT_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50878  RT_POL  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MPLTRAMDKRTENSFSPLQTLDDPSAPSTSEPPAVAHPSNNSDIESHVFTREQPPHLNSSHSRGRSLTRPLHCSRSHHRQRTQSPCCLPSRGPSPRSHDQNGFHPTAPTAYDWLTAMRDQQAFIRNQQLLQARQNRDMLASFQASIQTQLAASVRPTAVPPAAPAVPVPTASKMKLADPDRFEGDPQDIERFLNSVTNIFMAQPAAARWSDNLYRDLREGRFTFTTWEAFEDRFRETFGNPYAKKEAQQKLMSIIQGQQSAEDFFIEFDNLRHEADMGEEASVFAVCQAARPALIEAAARRDPEPTTYLKWKTAILQADQQARHNSTRHSLLPSAPPRFPLSRLNFRHRTSPSSTVASTGSVKPSYSQPSENVNPSSSTTSRPSTSSQPPTTRKCWGCGDFGHYSKDCKKKKFNDRMRAVLEHIDGLDDAYETLTTNAETIRKFAVEEPESNSEEGEIRRVNGTSSSDMICVDTLHQHATPSLQIVPPPFKHHPATCVEVPDREAHKNRTRNPTANGELLYSVHDEPPPPPSHVHAPSPSIPCMHKLRVPAEQKVLEQIRCLPSSSPKIKDILVRWAHAGRQPEIDDSLIRSILFLDEHLSLQILRQLKEPKAQLQGVGVGDYKDWSLVLPIHLSSLDGRIEVLEKEGLVDCGASGRSRGYIDNKFVDDRNLPTTSLPHPIAVYNVDGSLNRDGAITRTCTFDMRIGDHAERIEFRVTNTGSSNVILGLGWLGHHNPLVDWKLGKLFFTRCPIECGIDAPSATPLVSHPCNLLEDKTHNLTSPTNAGPDVENIRCTREDPCPTDDEVEAEWWEILCHELHGNSESMLCVDLNARSVADPTDPWDFAPIFAKAEFDQLPPKRPWDHAIKLKPDAKPISSKIYPLSRAEQVELDRFIEEHLLSGRIRPSKSPIASPFFFVKKKDGSLRPVQDYRRLNDMTVKNRYPLLLVSELMDKLKGAKYFTKLDIRWGYNNIRIKEGDEHKAAFITNRGLFEPLVMFFGLMNSPVTFQNMMNDLFRELLLTGHVIIYMDDILIFSDDLTTHCILTRQVLKVLEDNKLYLKPEKCVFEALEVKYLGVIVSHGCLKMDPKKVDAVSNWPKPHNKKDVQQFLEFVNFQYFTALHRIRSIPIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.42
3 0.41
4 0.37
5 0.33
6 0.31
7 0.32
8 0.29
9 0.27
10 0.27
11 0.24
12 0.24
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.2
19 0.2
20 0.24
21 0.29
22 0.3
23 0.3
24 0.31
25 0.33
26 0.37
27 0.36
28 0.32
29 0.26
30 0.27
31 0.27
32 0.27
33 0.23
34 0.22
35 0.22
36 0.23
37 0.31
38 0.35
39 0.37
40 0.39
41 0.41
42 0.45
43 0.46
44 0.51
45 0.45
46 0.47
47 0.51
48 0.47
49 0.46
50 0.42
51 0.46
52 0.46
53 0.52
54 0.54
55 0.52
56 0.58
57 0.6
58 0.66
59 0.65
60 0.66
61 0.65
62 0.68
63 0.71
64 0.73
65 0.77
66 0.79
67 0.85
68 0.88
69 0.87
70 0.86
71 0.82
72 0.78
73 0.74
74 0.68
75 0.6
76 0.56
77 0.58
78 0.58
79 0.56
80 0.56
81 0.6
82 0.65
83 0.71
84 0.7
85 0.67
86 0.62
87 0.65
88 0.65
89 0.6
90 0.52
91 0.45
92 0.39
93 0.33
94 0.31
95 0.23
96 0.19
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.24
108 0.3
109 0.3
110 0.33
111 0.38
112 0.34
113 0.33
114 0.39
115 0.41
116 0.38
117 0.45
118 0.51
119 0.47
120 0.51
121 0.53
122 0.48
123 0.43
124 0.39
125 0.32
126 0.28
127 0.25
128 0.2
129 0.19
130 0.2
131 0.18
132 0.19
133 0.17
134 0.13
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.12
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.2
158 0.21
159 0.25
160 0.23
161 0.25
162 0.32
163 0.34
164 0.36
165 0.37
166 0.4
167 0.4
168 0.4
169 0.37
170 0.32
171 0.3
172 0.26
173 0.24
174 0.23
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.17
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.16
197 0.19
198 0.21
199 0.25
200 0.25
201 0.27
202 0.29
203 0.34
204 0.3
205 0.33
206 0.32
207 0.32
208 0.32
209 0.3
210 0.31
211 0.28
212 0.28
213 0.22
214 0.24
215 0.21
216 0.2
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.19
221 0.21
222 0.19
223 0.18
224 0.23
225 0.26
226 0.34
227 0.32
228 0.36
229 0.41
230 0.41
231 0.45
232 0.48
233 0.49
234 0.48
235 0.5
236 0.46
237 0.45
238 0.47
239 0.42
240 0.34
241 0.31
242 0.25
243 0.25
244 0.24
245 0.2
246 0.17
247 0.18
248 0.16
249 0.13
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.15
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.21
292 0.19
293 0.23
294 0.3
295 0.32
296 0.33
297 0.34
298 0.32
299 0.33
300 0.35
301 0.34
302 0.28
303 0.31
304 0.34
305 0.39
306 0.39
307 0.39
308 0.38
309 0.37
310 0.38
311 0.35
312 0.32
313 0.29
314 0.33
315 0.32
316 0.31
317 0.3
318 0.29
319 0.36
320 0.41
321 0.42
322 0.38
323 0.37
324 0.37
325 0.37
326 0.37
327 0.38
328 0.38
329 0.44
330 0.5
331 0.57
332 0.6
333 0.6
334 0.66
335 0.59
336 0.57
337 0.52
338 0.52
339 0.47
340 0.43
341 0.41
342 0.34
343 0.32
344 0.28
345 0.25
346 0.2
347 0.19
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.2
352 0.24
353 0.24
354 0.24
355 0.24
356 0.3
357 0.34
358 0.36
359 0.34
360 0.29
361 0.27
362 0.27
363 0.29
364 0.23
365 0.23
366 0.23
367 0.24
368 0.24
369 0.25
370 0.27
371 0.29
372 0.36
373 0.41
374 0.44
375 0.49
376 0.55
377 0.59
378 0.6
379 0.62
380 0.55
381 0.51
382 0.52
383 0.46
384 0.43
385 0.38
386 0.41
387 0.37
388 0.37
389 0.37
390 0.3
391 0.32
392 0.36
393 0.45
394 0.45
395 0.48
396 0.56
397 0.62
398 0.72
399 0.79
400 0.82
401 0.83
402 0.83
403 0.82
404 0.77
405 0.68
406 0.59
407 0.5
408 0.4
409 0.3
410 0.23
411 0.16
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.08
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.13
432 0.2
433 0.19
434 0.2
435 0.23
436 0.27
437 0.28
438 0.27
439 0.24
440 0.17
441 0.17
442 0.16
443 0.15
444 0.11
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.14
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.11
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.1
470 0.09
471 0.1
472 0.12
473 0.16
474 0.17
475 0.23
476 0.24
477 0.26
478 0.29
479 0.29
480 0.31
481 0.3
482 0.34
483 0.28
484 0.3
485 0.27
486 0.24
487 0.25
488 0.25
489 0.25
490 0.25
491 0.28
492 0.31
493 0.38
494 0.45
495 0.51
496 0.56
497 0.59
498 0.58
499 0.58
500 0.58
501 0.53
502 0.47
503 0.4
504 0.31
505 0.26
506 0.21
507 0.18
508 0.13
509 0.11
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.15
515 0.16
516 0.15
517 0.15
518 0.17
519 0.23
520 0.25
521 0.28
522 0.24
523 0.26
524 0.29
525 0.31
526 0.29
527 0.25
528 0.22
529 0.23
530 0.26
531 0.24
532 0.22
533 0.23
534 0.25
535 0.31
536 0.35
537 0.33
538 0.33
539 0.33
540 0.3
541 0.33
542 0.33
543 0.25
544 0.22
545 0.23
546 0.22
547 0.21
548 0.22
549 0.16
550 0.19
551 0.26
552 0.3
553 0.29
554 0.28
555 0.28
556 0.29
557 0.33
558 0.3
559 0.31
560 0.29
561 0.26
562 0.27
563 0.26
564 0.26
565 0.25
566 0.25
567 0.17
568 0.17
569 0.17
570 0.16
571 0.16
572 0.16
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.06
589 0.06
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.15
594 0.19
595 0.21
596 0.26
597 0.27
598 0.28
599 0.31
600 0.31
601 0.27
602 0.23
603 0.24
604 0.19
605 0.18
606 0.14
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.05
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.06
632 0.05
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.06
637 0.06
638 0.04
639 0.05
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.07
645 0.08
646 0.1
647 0.15
648 0.19
649 0.22
650 0.24
651 0.25
652 0.26
653 0.25
654 0.26
655 0.22
656 0.2
657 0.21
658 0.2
659 0.19
660 0.17
661 0.2
662 0.19
663 0.22
664 0.2
665 0.17
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.15
670 0.14
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.1
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.12
683 0.12
684 0.11
685 0.14
686 0.14
687 0.14
688 0.15
689 0.17
690 0.18
691 0.17
692 0.19
693 0.2
694 0.2
695 0.2
696 0.2
697 0.17
698 0.15
699 0.15
700 0.15
701 0.12
702 0.12
703 0.17
704 0.17
705 0.18
706 0.19
707 0.18
708 0.16
709 0.16
710 0.16
711 0.09
712 0.09
713 0.07
714 0.06
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.1
725 0.12
726 0.13
727 0.13
728 0.13
729 0.17
730 0.17
731 0.18
732 0.17
733 0.18
734 0.22
735 0.27
736 0.3
737 0.26
738 0.3
739 0.31
740 0.29
741 0.26
742 0.23
743 0.21
744 0.19
745 0.18
746 0.14
747 0.13
748 0.11
749 0.11
750 0.09
751 0.07
752 0.11
753 0.12
754 0.12
755 0.13
756 0.13
757 0.16
758 0.16
759 0.17
760 0.15
761 0.16
762 0.2
763 0.23
764 0.22
765 0.21
766 0.22
767 0.22
768 0.2
769 0.22
770 0.19
771 0.16
772 0.16
773 0.16
774 0.15
775 0.17
776 0.19
777 0.16
778 0.18
779 0.18
780 0.2
781 0.2
782 0.21
783 0.21
784 0.24
785 0.3
786 0.31
787 0.34
788 0.35
789 0.35
790 0.36
791 0.33
792 0.27
793 0.21
794 0.18
795 0.15
796 0.12
797 0.11
798 0.09
799 0.09
800 0.07
801 0.07
802 0.05
803 0.06
804 0.07
805 0.07
806 0.08
807 0.1
808 0.1
809 0.09
810 0.1
811 0.09
812 0.08
813 0.08
814 0.07
815 0.06
816 0.07
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.09
823 0.1
824 0.1
825 0.09
826 0.11
827 0.15
828 0.14
829 0.14
830 0.17
831 0.16
832 0.16
833 0.19
834 0.17
835 0.14
836 0.14
837 0.16
838 0.13
839 0.17
840 0.17
841 0.16
842 0.24
843 0.25
844 0.31
845 0.32
846 0.36
847 0.35
848 0.36
849 0.4
850 0.4
851 0.47
852 0.5
853 0.57
854 0.58
855 0.63
856 0.66
857 0.63
858 0.61
859 0.56
860 0.49
861 0.48
862 0.45
863 0.46
864 0.41
865 0.41
866 0.39
867 0.41
868 0.42
869 0.38
870 0.39
871 0.36
872 0.36
873 0.36
874 0.34
875 0.3
876 0.3
877 0.28
878 0.25
879 0.2
880 0.18
881 0.17
882 0.16
883 0.13
884 0.11
885 0.11
886 0.12
887 0.12
888 0.15
889 0.2
890 0.23
891 0.24
892 0.25
893 0.31
894 0.37
895 0.4
896 0.44
897 0.45
898 0.47
899 0.47
900 0.48
901 0.47
902 0.44
903 0.45
904 0.39
905 0.39
906 0.35
907 0.4
908 0.46
909 0.46
910 0.47
911 0.55
912 0.59
913 0.61
914 0.64
915 0.62
916 0.62
917 0.61
918 0.57
919 0.55
920 0.49
921 0.42
922 0.45
923 0.49
924 0.48
925 0.52
926 0.5
927 0.44
928 0.44
929 0.44
930 0.36
931 0.3
932 0.27
933 0.2
934 0.19
935 0.19
936 0.2
937 0.21
938 0.2
939 0.18
940 0.13
941 0.14
942 0.18
943 0.18
944 0.19
945 0.24
946 0.29
947 0.34
948 0.4
949 0.46
950 0.42
951 0.49
952 0.53
953 0.52
954 0.51
955 0.52
956 0.51
957 0.49
958 0.56
959 0.49
960 0.44
961 0.4
962 0.4
963 0.43
964 0.44
965 0.43
966 0.38
967 0.38
968 0.35
969 0.36
970 0.33
971 0.25
972 0.22
973 0.22
974 0.22
975 0.22
976 0.22
977 0.23
978 0.22
979 0.22
980 0.21
981 0.15
982 0.14
983 0.12
984 0.11
985 0.09
986 0.11
987 0.1
988 0.09
989 0.09
990 0.08
991 0.1
992 0.11
993 0.13
994 0.14
995 0.14
996 0.17
997 0.19
998 0.21
999 0.21
1000 0.21
1001 0.19
1002 0.18
1003 0.18
1004 0.14
1005 0.11
1006 0.1
1007 0.1
1008 0.09
1009 0.09
1010 0.08
1011 0.09
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.07
1017 0.06
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.07
1021 0.07
1022 0.05
1023 0.06
1024 0.07
1025 0.08
1026 0.12
1027 0.12
1028 0.11
1029 0.12
1030 0.14
1031 0.14
1032 0.21
1033 0.27
1034 0.26
1035 0.3
1036 0.32
1037 0.33
1038 0.38
1039 0.41
1040 0.39
1041 0.34
1042 0.33
1043 0.32
1044 0.33
1045 0.34
1046 0.36
1047 0.35
1048 0.36
1049 0.4
1050 0.43
1051 0.41
1052 0.42
1053 0.4
1054 0.4
1055 0.45
1056 0.41
1057 0.4
1058 0.36
1059 0.34
1060 0.29
1061 0.28
1062 0.2
1063 0.13
1064 0.11
1065 0.06
1066 0.09
1067 0.11
1068 0.11
1069 0.12
1070 0.13
1071 0.19
1072 0.27
1073 0.35
1074 0.36
1075 0.36
1076 0.43
1077 0.45
1078 0.49
1079 0.46
1080 0.48
1081 0.49
1082 0.56
1083 0.58
1084 0.58
1085 0.65
1086 0.68
1087 0.75
1088 0.75
1089 0.73
1090 0.73
1091 0.79
1092 0.83
1093 0.79
1094 0.75
1095 0.67
1096 0.59
1097 0.58
1098 0.49
1099 0.4
1100 0.34
1101 0.29
1102 0.25
1103 0.25
1104 0.22
1105 0.17
1106 0.27
1107 0.28
1108 0.24
1109 0.29
1110 0.31