Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409X0I1

Protein Details
Accession A0A409X0I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-90LTRPLHCSRSHHRQRTQSPCCLPSHydrophilic
400-422DFGHYSKDCKKKKFNDRMRAVLEHydrophilic
1092-1111DAVSNWPKPHNKKDVQQFLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR000477  RT_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50878  RT_POL  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MPLTRAMDKRTENSFSPLQTLDDPSAPSTSEPPAVAHPSNNSDIESHVFTREQPPHLNSSHSRGRSLTRPLHCSRSHHRQRTQSPCCLPSRGPSPRSHDQNGFHPTAPTAYDWLTAMRDQQAFIRNQQLLQARQNRDMLASFQASIQTQLAASVRPTAVPPAAPAVPVPTASKMKLADPDRFEGDPQDIERFLNSVTNIFMAQPAAARWSDNLYRDLREGRFTFTTWEAFEDRFRETFGNPYAKKEAQQKLMSIIQGQQSAEDFFIEFDNLRHEADMGEEASVFAVCQAARPALIEAAARRDPEPTTYLKWKTAILQADQQARHNSTRHSLLPSAPPRFPLSRLNFRHRTSPSSTVASTGSVKPSYSQPSENVNPSSSTTSRPSTSSQPPTTRKCWGCGDFGHYSKDCKKKKFNDRMRAVLEHIDGLDDAYETLTTNAETIRKFAVEEPESNSEEGEIRRVNGTSSSDMICVDTLHQHATPSLQIVPPPFKHHPATCVEVPDREAHKNRTRNPTANGELLYSVHDEPPPPPSHVHAPSPSIPCMHKLRVPAEQKVLEQIRCLPSSSPKIKDILVRWAHAGRQPEIDDSLIRSILFLDEHLSLQILRQLKEPKAQLQGVGVGDYKDWSLVLPIHLSSLDGRIEVLEKEGLVDCGASGRSRGYIDNKFVDDRNLPTTSLPHPIAVYNVDGSLNRDGAITRTCTFDMRIGDHAERIEFRVTNTGSSNVILGLGWLGHHNPLVDWKLGKLFFTRCPIECGIDAPSATPLVSHPCNLLEDKTHNLTSPTNAGPDVENIRCTREDPCPTDDEVEAEWWEILCHELHGNSESMLCVDLNARSVADPTDPWDFAPIFAKAEFDQLPPKRPWDHAIKLKPDAKPISSKIYPLSRAEQVELDRFIEEHLLSGRIRPSKSPIASPFFFVKKKDGSLRPVQDYRRLNDMTVKNRYPLLLVSELMDKLKGAKYFTKLDIRWGYNNIRIKEGDEHKAAFITNRGLFEPLVMFFGLMNSPVTFQNMMNDLFRELLLTGHVIIYMDDILIFSDDLTTHCILTRQVLKVLEDNKLYLKPEKCVFEALEVKYLGVIVSHGCLKMDPKKVDAVSNWPKPHNKKDVQQFLEFVNFQYFTALHRIRSIPIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.42
3 0.41
4 0.37
5 0.33
6 0.31
7 0.32
8 0.29
9 0.27
10 0.27
11 0.24
12 0.24
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.2
19 0.2
20 0.24
21 0.29
22 0.3
23 0.3
24 0.31
25 0.33
26 0.37
27 0.36
28 0.32
29 0.26
30 0.27
31 0.27
32 0.27
33 0.23
34 0.22
35 0.22
36 0.23
37 0.31
38 0.35
39 0.37
40 0.39
41 0.41
42 0.45
43 0.46
44 0.51
45 0.45
46 0.47
47 0.51
48 0.47
49 0.46
50 0.42
51 0.46
52 0.46
53 0.52
54 0.54
55 0.52
56 0.58
57 0.6
58 0.66
59 0.65
60 0.66
61 0.65
62 0.68
63 0.71
64 0.73
65 0.77
66 0.79
67 0.85
68 0.88
69 0.87
70 0.86
71 0.82
72 0.78
73 0.74
74 0.68
75 0.6
76 0.56
77 0.58
78 0.58
79 0.56
80 0.56
81 0.6
82 0.65
83 0.71
84 0.7
85 0.67
86 0.62
87 0.65
88 0.65
89 0.6
90 0.52
91 0.45
92 0.39
93 0.33
94 0.31
95 0.23
96 0.19
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.24
108 0.3
109 0.3
110 0.33
111 0.38
112 0.34
113 0.33
114 0.39
115 0.41
116 0.38
117 0.45
118 0.51
119 0.47
120 0.51
121 0.53
122 0.48
123 0.43
124 0.39
125 0.32
126 0.28
127 0.25
128 0.2
129 0.19
130 0.2
131 0.18
132 0.19
133 0.17
134 0.13
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.12
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.2
158 0.21
159 0.25
160 0.23
161 0.25
162 0.32
163 0.34
164 0.36
165 0.37
166 0.4
167 0.4
168 0.4
169 0.37
170 0.32
171 0.3
172 0.26
173 0.24
174 0.23
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.17
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.16
197 0.19
198 0.21
199 0.25
200 0.25
201 0.27
202 0.29
203 0.34
204 0.3
205 0.33
206 0.32
207 0.32
208 0.32
209 0.3
210 0.31
211 0.28
212 0.28
213 0.22
214 0.24
215 0.21
216 0.2
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.19
221 0.21
222 0.19
223 0.18
224 0.23
225 0.26
226 0.34
227 0.32
228 0.36
229 0.41
230 0.41
231 0.45
232 0.48
233 0.49
234 0.48
235 0.5
236 0.46
237 0.45
238 0.47
239 0.42
240 0.34
241 0.31
242 0.25
243 0.25
244 0.24
245 0.2
246 0.17
247 0.18
248 0.16
249 0.13
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.15
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.21
292 0.19
293 0.23
294 0.3
295 0.32
296 0.33
297 0.34
298 0.32
299 0.33
300 0.35
301 0.34
302 0.28
303 0.31
304 0.34
305 0.39
306 0.39
307 0.39
308 0.38
309 0.37
310 0.38
311 0.35
312 0.32
313 0.29
314 0.33
315 0.32
316 0.31
317 0.3
318 0.29
319 0.36
320 0.41
321 0.42
322 0.38
323 0.37
324 0.37
325 0.37
326 0.37
327 0.38
328 0.38
329 0.44
330 0.5
331 0.57
332 0.6
333 0.6
334 0.66
335 0.59
336 0.57
337 0.52
338 0.52
339 0.47
340 0.43
341 0.41
342 0.34
343 0.32
344 0.28
345 0.25
346 0.2
347 0.19
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.2
352 0.24
353 0.24
354 0.24
355 0.24
356 0.3
357 0.34
358 0.36
359 0.34
360 0.29
361 0.27
362 0.27
363 0.29
364 0.23
365 0.23
366 0.23
367 0.24
368 0.24
369 0.25
370 0.27
371 0.29
372 0.36
373 0.41
374 0.44
375 0.49
376 0.55
377 0.59
378 0.6
379 0.62
380 0.55
381 0.51
382 0.52
383 0.46
384 0.43
385 0.38
386 0.41
387 0.37
388 0.37
389 0.37
390 0.3
391 0.32
392 0.36
393 0.45
394 0.45
395 0.48
396 0.56
397 0.62
398 0.72
399 0.79
400 0.82
401 0.83
402 0.83
403 0.82
404 0.77
405 0.68
406 0.59
407 0.5
408 0.4
409 0.3
410 0.23
411 0.16
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.08
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.13
432 0.2
433 0.19
434 0.2
435 0.23
436 0.27
437 0.28
438 0.27
439 0.24
440 0.17
441 0.17
442 0.16
443 0.15
444 0.11
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.14
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.11
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.1
470 0.09
471 0.1
472 0.12
473 0.16
474 0.17
475 0.23
476 0.24
477 0.26
478 0.29
479 0.29
480 0.31
481 0.3
482 0.34
483 0.28
484 0.3
485 0.27
486 0.24
487 0.25
488 0.25
489 0.25
490 0.25
491 0.28
492 0.31
493 0.38
494 0.45
495 0.51
496 0.56
497 0.59
498 0.58
499 0.58
500 0.58
501 0.53
502 0.47
503 0.4
504 0.31
505 0.26
506 0.21
507 0.18
508 0.13
509 0.11
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.15
515 0.16
516 0.15
517 0.15
518 0.17
519 0.23
520 0.25
521 0.28
522 0.24
523 0.26
524 0.29
525 0.31
526 0.29
527 0.25
528 0.22
529 0.23
530 0.26
531 0.24
532 0.22
533 0.23
534 0.25
535 0.31
536 0.35
537 0.33
538 0.33
539 0.33
540 0.3
541 0.33
542 0.33
543 0.25
544 0.22
545 0.23
546 0.22
547 0.21
548 0.22
549 0.16
550 0.19
551 0.26
552 0.3
553 0.29
554 0.28
555 0.28
556 0.29
557 0.33
558 0.3
559 0.31
560 0.29
561 0.26
562 0.27
563 0.26
564 0.26
565 0.25
566 0.25
567 0.17
568 0.17
569 0.17
570 0.16
571 0.16
572 0.16
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.06
589 0.06
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.15
594 0.19
595 0.21
596 0.26
597 0.27
598 0.28
599 0.31
600 0.31
601 0.27
602 0.23
603 0.24
604 0.19
605 0.18
606 0.14
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.05
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.06
632 0.05
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.06
637 0.06
638 0.04
639 0.05
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.07
645 0.08
646 0.1
647 0.15
648 0.19
649 0.22
650 0.24
651 0.25
652 0.26
653 0.25
654 0.26
655 0.22
656 0.2
657 0.21
658 0.2
659 0.19
660 0.17
661 0.2
662 0.19
663 0.22
664 0.2
665 0.17
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.15
670 0.14
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.1
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.12
683 0.12
684 0.11
685 0.14
686 0.14
687 0.14
688 0.15
689 0.17
690 0.18
691 0.17
692 0.19
693 0.2
694 0.2
695 0.2
696 0.2
697 0.17
698 0.15
699 0.15
700 0.15
701 0.12
702 0.12
703 0.17
704 0.17
705 0.18
706 0.19
707 0.18
708 0.16
709 0.16
710 0.16
711 0.09
712 0.09
713 0.07
714 0.06
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.1
725 0.12
726 0.13
727 0.13
728 0.13
729 0.17
730 0.17
731 0.18
732 0.17
733 0.18
734 0.22
735 0.27
736 0.3
737 0.26
738 0.3
739 0.31
740 0.29
741 0.26
742 0.23
743 0.21
744 0.19
745 0.18
746 0.14
747 0.13
748 0.11
749 0.11
750 0.09
751 0.07
752 0.11
753 0.12
754 0.12
755 0.13
756 0.13
757 0.16
758 0.16
759 0.17
760 0.15
761 0.16
762 0.2
763 0.23
764 0.22
765 0.21
766 0.22
767 0.22
768 0.2
769 0.22
770 0.19
771 0.16
772 0.16
773 0.16
774 0.15
775 0.17
776 0.19
777 0.16
778 0.18
779 0.18
780 0.2
781 0.2
782 0.21
783 0.21
784 0.24
785 0.3
786 0.31
787 0.34
788 0.35
789 0.35
790 0.36
791 0.33
792 0.27
793 0.21
794 0.18
795 0.15
796 0.12
797 0.11
798 0.09
799 0.09
800 0.07
801 0.07
802 0.05
803 0.06
804 0.07
805 0.07
806 0.08
807 0.1
808 0.1
809 0.09
810 0.1
811 0.09
812 0.08
813 0.08
814 0.07
815 0.06
816 0.07
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.09
823 0.1
824 0.1
825 0.09
826 0.11
827 0.15
828 0.14
829 0.14
830 0.17
831 0.16
832 0.16
833 0.19
834 0.17
835 0.14
836 0.14
837 0.16
838 0.13
839 0.17
840 0.17
841 0.16
842 0.24
843 0.25
844 0.31
845 0.32
846 0.36
847 0.35
848 0.36
849 0.4
850 0.4
851 0.47
852 0.5
853 0.57
854 0.58
855 0.63
856 0.66
857 0.63
858 0.61
859 0.56
860 0.49
861 0.48
862 0.45
863 0.46
864 0.41
865 0.41
866 0.39
867 0.41
868 0.42
869 0.38
870 0.39
871 0.36
872 0.36
873 0.36
874 0.34
875 0.3
876 0.3
877 0.28
878 0.25
879 0.2
880 0.18
881 0.17
882 0.16
883 0.13
884 0.11
885 0.11
886 0.12
887 0.12
888 0.15
889 0.2
890 0.23
891 0.24
892 0.25
893 0.31
894 0.37
895 0.4
896 0.44
897 0.45
898 0.47
899 0.47
900 0.48
901 0.47
902 0.44
903 0.45
904 0.39
905 0.39
906 0.35
907 0.4
908 0.46
909 0.46
910 0.47
911 0.55
912 0.59
913 0.61
914 0.64
915 0.62
916 0.62
917 0.61
918 0.57
919 0.55
920 0.49
921 0.42
922 0.45
923 0.49
924 0.48
925 0.52
926 0.5
927 0.44
928 0.44
929 0.44
930 0.36
931 0.3
932 0.27
933 0.2
934 0.19
935 0.19
936 0.2
937 0.21
938 0.2
939 0.18
940 0.13
941 0.14
942 0.18
943 0.18
944 0.19
945 0.24
946 0.29
947 0.34
948 0.4
949 0.46
950 0.42
951 0.49
952 0.53
953 0.52
954 0.51
955 0.52
956 0.51
957 0.49
958 0.56
959 0.49
960 0.44
961 0.4
962 0.4
963 0.43
964 0.44
965 0.43
966 0.38
967 0.38
968 0.35
969 0.36
970 0.33
971 0.25
972 0.22
973 0.22
974 0.22
975 0.22
976 0.22
977 0.23
978 0.22
979 0.22
980 0.21
981 0.15
982 0.14
983 0.12
984 0.11
985 0.09
986 0.11
987 0.1
988 0.09
989 0.09
990 0.08
991 0.1
992 0.11
993 0.13
994 0.14
995 0.14
996 0.17
997 0.19
998 0.21
999 0.21
1000 0.21
1001 0.19
1002 0.18
1003 0.18
1004 0.14
1005 0.11
1006 0.1
1007 0.1
1008 0.09
1009 0.09
1010 0.08
1011 0.09
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.07
1017 0.06
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.07
1021 0.07
1022 0.05
1023 0.06
1024 0.07
1025 0.08
1026 0.12
1027 0.12
1028 0.11
1029 0.12
1030 0.14
1031 0.14
1032 0.21
1033 0.27
1034 0.26
1035 0.3
1036 0.32
1037 0.33
1038 0.38
1039 0.41
1040 0.39
1041 0.34
1042 0.33
1043 0.32
1044 0.33
1045 0.34
1046 0.36
1047 0.35
1048 0.36
1049 0.4
1050 0.43
1051 0.41
1052 0.42
1053 0.4
1054 0.4
1055 0.45
1056 0.41
1057 0.4
1058 0.36
1059 0.34
1060 0.29
1061 0.28
1062 0.2
1063 0.13
1064 0.11
1065 0.06
1066 0.09
1067 0.11
1068 0.11
1069 0.12
1070 0.13
1071 0.19
1072 0.27
1073 0.35
1074 0.36
1075 0.36
1076 0.43
1077 0.45
1078 0.49
1079 0.46
1080 0.48
1081 0.49
1082 0.56
1083 0.58
1084 0.58
1085 0.65
1086 0.68
1087 0.75
1088 0.75
1089 0.73
1090 0.73
1091 0.79
1092 0.83
1093 0.79
1094 0.75
1095 0.67
1096 0.59
1097 0.58
1098 0.49
1099 0.4
1100 0.34
1101 0.29
1102 0.25
1103 0.25
1104 0.22
1105 0.17
1106 0.27
1107 0.28
1108 0.24
1109 0.29
1110 0.31