Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YRP0

Protein Details
Accession A0A409YRP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
547-609VDVHNGRPAPQKRKKQVEDNLGEDLDRNKKTRKAPPAPKAKPAQKTSKPSKGRRGRSDTVTSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
573-602RNKKTRKAPPAPKAKPAQKTSKPSKGRRGR
628-628K
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSLSSITDEEDTFVKTSFTADEETFLEAYIPTWRARYYAGSSTARKGEKKQWVTMEPYPKFIAKFYAEGNLKPHETQLQVKIYRWFLNRTKDGDKIASNRRTNPSAELKKPRATHAFQLFTEENKEDIMKLCQEKTNTTSPMDNLFPFKESSKELWNALSQEAKDDYTRKASEKNELIKKGPSEQDIERNQANIIRNTLAALSNLTGTHWTGHGDVAFFVMGAYRKKDSEIATFWLDSIPCIDCKLCLQLLSGSVSNNSDFASTGFQRSLPNFKAEIGEPFKMWAENIISGGKKKLPSMQSPTADIATQNSGSLVLGFIEGYPVLPLLDVDKITPQDARALLQSYIAAAWKHGAGKRPESSLPWECLGSLDRCRILADPRPFTQFESLDPTSVSTGDTYSILTTILAEQKKGARALQFKFDDELQSADVQQVDKIDFSPPRPKGKQQLHLVERYNRLTLEYIPPGSLVTRPSVPRFTPQSMAGVSPGECRQSPPSSRQQFETVEEKEDGGFAETSSQLDQNESDVEDEGMAGRHSSAGNAKLGEVEVDVHNGRPAPQKRKKQVEDNLGEDLDRNKKTRKAPPAPKAKPAQKTSKPSKGRRGRSDTVTSNKLVKADTKSNVASKDGEKKRVAKPLPMREQSARIHDKKYRNTVVTIYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.14
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.16
14 0.12
15 0.12
16 0.15
17 0.16
18 0.14
19 0.16
20 0.17
21 0.18
22 0.2
23 0.25
24 0.26
25 0.31
26 0.37
27 0.42
28 0.44
29 0.48
30 0.53
31 0.53
32 0.51
33 0.51
34 0.54
35 0.58
36 0.61
37 0.63
38 0.64
39 0.63
40 0.67
41 0.68
42 0.69
43 0.59
44 0.57
45 0.53
46 0.47
47 0.43
48 0.37
49 0.35
50 0.27
51 0.29
52 0.26
53 0.33
54 0.32
55 0.33
56 0.36
57 0.34
58 0.33
59 0.31
60 0.31
61 0.27
62 0.29
63 0.33
64 0.36
65 0.4
66 0.41
67 0.44
68 0.47
69 0.47
70 0.5
71 0.47
72 0.48
73 0.46
74 0.53
75 0.56
76 0.56
77 0.57
78 0.54
79 0.55
80 0.52
81 0.5
82 0.48
83 0.52
84 0.56
85 0.55
86 0.59
87 0.6
88 0.59
89 0.56
90 0.55
91 0.56
92 0.55
93 0.6
94 0.62
95 0.63
96 0.66
97 0.67
98 0.67
99 0.64
100 0.59
101 0.59
102 0.58
103 0.57
104 0.5
105 0.55
106 0.49
107 0.42
108 0.42
109 0.34
110 0.25
111 0.21
112 0.21
113 0.15
114 0.16
115 0.18
116 0.2
117 0.22
118 0.25
119 0.27
120 0.29
121 0.32
122 0.34
123 0.38
124 0.35
125 0.34
126 0.34
127 0.31
128 0.33
129 0.32
130 0.29
131 0.24
132 0.23
133 0.22
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.21
138 0.23
139 0.26
140 0.27
141 0.27
142 0.27
143 0.29
144 0.28
145 0.26
146 0.27
147 0.2
148 0.2
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.2
153 0.21
154 0.24
155 0.27
156 0.26
157 0.31
158 0.32
159 0.38
160 0.44
161 0.5
162 0.51
163 0.53
164 0.53
165 0.51
166 0.5
167 0.48
168 0.44
169 0.37
170 0.33
171 0.33
172 0.39
173 0.38
174 0.4
175 0.34
176 0.31
177 0.3
178 0.3
179 0.31
180 0.24
181 0.23
182 0.2
183 0.19
184 0.18
185 0.19
186 0.15
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.18
215 0.19
216 0.22
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.24
222 0.21
223 0.19
224 0.14
225 0.13
226 0.1
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.1
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.15
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.11
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.14
255 0.16
256 0.21
257 0.19
258 0.21
259 0.2
260 0.2
261 0.21
262 0.2
263 0.24
264 0.22
265 0.21
266 0.18
267 0.19
268 0.18
269 0.16
270 0.16
271 0.12
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.19
283 0.21
284 0.27
285 0.34
286 0.39
287 0.38
288 0.39
289 0.39
290 0.34
291 0.3
292 0.24
293 0.17
294 0.12
295 0.11
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.08
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.09
339 0.11
340 0.17
341 0.18
342 0.24
343 0.26
344 0.28
345 0.28
346 0.27
347 0.32
348 0.29
349 0.29
350 0.24
351 0.23
352 0.2
353 0.2
354 0.2
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.17
363 0.23
364 0.27
365 0.29
366 0.3
367 0.33
368 0.33
369 0.33
370 0.34
371 0.26
372 0.21
373 0.25
374 0.24
375 0.21
376 0.2
377 0.19
378 0.16
379 0.15
380 0.14
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.16
397 0.19
398 0.2
399 0.2
400 0.2
401 0.26
402 0.28
403 0.35
404 0.34
405 0.33
406 0.33
407 0.32
408 0.27
409 0.21
410 0.21
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.1
415 0.11
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.12
423 0.13
424 0.17
425 0.26
426 0.3
427 0.38
428 0.42
429 0.47
430 0.53
431 0.6
432 0.65
433 0.64
434 0.7
435 0.65
436 0.68
437 0.68
438 0.64
439 0.59
440 0.53
441 0.45
442 0.35
443 0.32
444 0.27
445 0.24
446 0.24
447 0.22
448 0.2
449 0.19
450 0.19
451 0.18
452 0.17
453 0.16
454 0.12
455 0.11
456 0.15
457 0.18
458 0.21
459 0.25
460 0.26
461 0.31
462 0.36
463 0.37
464 0.35
465 0.34
466 0.34
467 0.3
468 0.29
469 0.24
470 0.19
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.15
475 0.15
476 0.17
477 0.21
478 0.27
479 0.3
480 0.34
481 0.43
482 0.49
483 0.51
484 0.51
485 0.51
486 0.47
487 0.47
488 0.48
489 0.39
490 0.34
491 0.33
492 0.3
493 0.25
494 0.22
495 0.18
496 0.13
497 0.12
498 0.08
499 0.1
500 0.09
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.1
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.12
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.09
523 0.12
524 0.14
525 0.17
526 0.17
527 0.17
528 0.16
529 0.16
530 0.15
531 0.11
532 0.11
533 0.09
534 0.12
535 0.13
536 0.12
537 0.14
538 0.14
539 0.16
540 0.24
541 0.32
542 0.4
543 0.49
544 0.59
545 0.68
546 0.79
547 0.83
548 0.84
549 0.85
550 0.85
551 0.81
552 0.74
553 0.68
554 0.58
555 0.5
556 0.41
557 0.37
558 0.33
559 0.31
560 0.3
561 0.32
562 0.39
563 0.48
564 0.56
565 0.63
566 0.66
567 0.73
568 0.8
569 0.85
570 0.84
571 0.84
572 0.84
573 0.82
574 0.8
575 0.78
576 0.79
577 0.76
578 0.81
579 0.82
580 0.83
581 0.84
582 0.84
583 0.87
584 0.87
585 0.88
586 0.88
587 0.87
588 0.84
589 0.82
590 0.81
591 0.78
592 0.76
593 0.7
594 0.62
595 0.57
596 0.52
597 0.46
598 0.39
599 0.36
600 0.36
601 0.39
602 0.4
603 0.41
604 0.44
605 0.47
606 0.47
607 0.44
608 0.4
609 0.38
610 0.46
611 0.47
612 0.51
613 0.53
614 0.58
615 0.62
616 0.69
617 0.66
618 0.66
619 0.69
620 0.72
621 0.76
622 0.74
623 0.73
624 0.68
625 0.71
626 0.67
627 0.66
628 0.65
629 0.59
630 0.62
631 0.64
632 0.69
633 0.71
634 0.76
635 0.75
636 0.69
637 0.68