Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409X6N4

Protein Details
Accession A0A409X6N4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-61AQPSPRPEQPPPAKKRKKNNQKGKNRANQHNQPRGQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-51PEQPPPAKKRKKNNQKGKNR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MSTRPVVSYDDITLPYDPVEPPAAAAQPSPRPEQPPPAKKRKKNNQKGKNRANQHNQPRGQQQQNKLTNEGARSTSHQHQQEEYDESMQDDYSYAEGDAEEGEEEEEESRELTHDEIWDDSALVYAWESAMEEYEAYHGPGEDWKKQPVKKSPLWYNVPPDLSKKAAKAPAATAAVGPTASAADGNDDEAEADSKPLDFDTFVPTHDPSLYPAASSSSALPADVAAGQAPQVDYVPEGGVPGGVVSQDEAFQRALSATYWAGYWTAMYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.18
4 0.15
5 0.15
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.17
10 0.17
11 0.16
12 0.17
13 0.2
14 0.24
15 0.27
16 0.31
17 0.32
18 0.36
19 0.4
20 0.49
21 0.55
22 0.59
23 0.65
24 0.71
25 0.79
26 0.81
27 0.89
28 0.89
29 0.9
30 0.91
31 0.92
32 0.92
33 0.93
34 0.95
35 0.95
36 0.93
37 0.91
38 0.9
39 0.89
40 0.88
41 0.88
42 0.87
43 0.79
44 0.75
45 0.74
46 0.73
47 0.72
48 0.69
49 0.67
50 0.68
51 0.72
52 0.69
53 0.63
54 0.57
55 0.5
56 0.45
57 0.39
58 0.3
59 0.24
60 0.24
61 0.28
62 0.3
63 0.34
64 0.37
65 0.36
66 0.36
67 0.37
68 0.37
69 0.36
70 0.31
71 0.25
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.15
76 0.12
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.09
128 0.12
129 0.16
130 0.17
131 0.23
132 0.29
133 0.31
134 0.39
135 0.44
136 0.49
137 0.5
138 0.57
139 0.59
140 0.62
141 0.65
142 0.61
143 0.57
144 0.53
145 0.49
146 0.42
147 0.36
148 0.31
149 0.29
150 0.27
151 0.23
152 0.25
153 0.27
154 0.27
155 0.26
156 0.24
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.19
161 0.15
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.13
188 0.13
189 0.14
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.18
197 0.17
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1