Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409XX48

Protein Details
Accession A0A409XX48    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
915-936QSRIEAARQKRQQEKERQDALEHydrophilic
971-1020DSDEEREKERKPRKAKKPKSEAPSGDEAETKEKKKRRGKLKKSGSEQGDEBasic
1028-1052EEEVEKPAKKRIAKKRVVRDDDDEDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
976-1013REKERKPRKAKKPKSEAPSGDEAETKEKKKRRGKLKKS
1033-1043KPAKKRIAKKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF14559  TPR_19  
PF13174  TPR_6  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MDDTSLPGRTIDIELGGQEVISIDLENLDPNPDDVLDLLKDGQCTIYVWTKLAAEYWRRGYLEAAERIALTAIESFQANDSAASLGPIYPLLANLQVARARRAPKLVLQDAREDDMTREKPKEDYYREAAQYLNTGERIGAESGEGVSVTLTFLTRGIQQLATRSMDDAMRSFEGVLAEKPTNVVALLGKARILYARRNFKEALRLFQDVLRYNPSCIPDPRIGIGLCLWAMDHKERARENPSEWSAQLLLGLDLINTSKGDGISEEKKVKSYAAGTKMIEKAFQANNRSAAAANALFEFFLKKGNHSRALKLAERTIQFADTLTILTEGYLRAGRVSHASGSLAQAMKFYNSAVEGQPKNVIGAIGMAQMQMLNDEMAAAIHTLDILLQPPNPQRSLEATVMLASLRAYPRPGVSSSDFAQEKIRARELFDRVAKSLDLEDSRSRGQSKLSRGIADDIEMHLEIASLWQEESLERMGKALKDALRISQASGNVDPRLINNAGVLYYLEGNLGEARSSYETALTNAGSLSSDIAEGLSTTALYNLARVYEDVGEENTAKDAYDKLLSRHPEYIDAKIRQAQMLTNLNRANDAHDLLKQALASQGSNLNLRAFYTYFLIHSNSHKVAKEFVFATLKDHDKHDVYSLCAAAWIHYHQSRESRDSSPKGIEERKRGFQRAAEFYEKALQLDPLCAFAAQGLAIITAEDALGAMGGVFSRINAYEESTKRIQNSREALDIFAKVRESINDGSVYSNIGHCYYARDEYDRAIESYETASTKFYSGHNVSVLLCLCRSWYAKAMKDQSFPAMKNALKYAQAALHIHPNDKAILYNIAMIQQKSAELLFSINVAKRSLQDLQKAIDSAAHAQKLFASLAADKSAVIPYDRDIADNRRKYGDGLLRRAEEHLANQRQHEAETQSRIEAARQKRQQEKERQDALERERLEALRLEAEKLAEERRLAREQALEWIREVKMDSDEEREKERKPRKAKKPKSEAPSGDEAETKEKKKRRGKLKKSGSEQGDEEPGMFSEEEEVEKPAKKRIAKKRVVRDDDDEDIAGPRKKQFKSKEMLSDTDDEMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.13
4 0.1
5 0.08
6 0.08
7 0.07
8 0.06
9 0.06
10 0.05
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.13
23 0.11
24 0.12
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.13
31 0.13
32 0.16
33 0.21
34 0.21
35 0.21
36 0.23
37 0.23
38 0.22
39 0.25
40 0.28
41 0.26
42 0.32
43 0.37
44 0.4
45 0.4
46 0.4
47 0.39
48 0.4
49 0.42
50 0.4
51 0.36
52 0.31
53 0.3
54 0.3
55 0.28
56 0.2
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.15
83 0.17
84 0.19
85 0.22
86 0.27
87 0.3
88 0.33
89 0.37
90 0.36
91 0.4
92 0.48
93 0.52
94 0.52
95 0.51
96 0.54
97 0.51
98 0.51
99 0.46
100 0.37
101 0.3
102 0.33
103 0.36
104 0.34
105 0.35
106 0.33
107 0.36
108 0.42
109 0.5
110 0.47
111 0.5
112 0.51
113 0.56
114 0.56
115 0.54
116 0.46
117 0.37
118 0.35
119 0.29
120 0.26
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.16
125 0.17
126 0.14
127 0.12
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.08
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.09
143 0.11
144 0.13
145 0.16
146 0.17
147 0.21
148 0.25
149 0.25
150 0.24
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.21
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.11
172 0.08
173 0.11
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.15
180 0.17
181 0.23
182 0.3
183 0.41
184 0.42
185 0.47
186 0.48
187 0.47
188 0.55
189 0.48
190 0.47
191 0.41
192 0.41
193 0.38
194 0.38
195 0.41
196 0.33
197 0.33
198 0.33
199 0.28
200 0.28
201 0.31
202 0.32
203 0.32
204 0.32
205 0.35
206 0.32
207 0.33
208 0.32
209 0.32
210 0.29
211 0.25
212 0.23
213 0.19
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.08
218 0.11
219 0.13
220 0.18
221 0.19
222 0.25
223 0.28
224 0.33
225 0.38
226 0.39
227 0.39
228 0.42
229 0.43
230 0.4
231 0.38
232 0.35
233 0.3
234 0.26
235 0.24
236 0.15
237 0.12
238 0.09
239 0.09
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.13
251 0.16
252 0.22
253 0.26
254 0.25
255 0.27
256 0.27
257 0.26
258 0.24
259 0.27
260 0.29
261 0.3
262 0.34
263 0.33
264 0.37
265 0.4
266 0.38
267 0.33
268 0.26
269 0.26
270 0.26
271 0.31
272 0.3
273 0.29
274 0.31
275 0.31
276 0.31
277 0.25
278 0.2
279 0.18
280 0.14
281 0.12
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.07
288 0.14
289 0.13
290 0.17
291 0.25
292 0.31
293 0.4
294 0.41
295 0.43
296 0.43
297 0.49
298 0.49
299 0.44
300 0.42
301 0.39
302 0.37
303 0.37
304 0.31
305 0.26
306 0.22
307 0.19
308 0.16
309 0.11
310 0.1
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.16
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.17
349 0.15
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.03
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.1
378 0.14
379 0.17
380 0.18
381 0.18
382 0.19
383 0.23
384 0.27
385 0.24
386 0.21
387 0.18
388 0.18
389 0.17
390 0.16
391 0.11
392 0.06
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.13
400 0.14
401 0.16
402 0.17
403 0.2
404 0.2
405 0.26
406 0.25
407 0.23
408 0.25
409 0.24
410 0.27
411 0.26
412 0.3
413 0.24
414 0.27
415 0.33
416 0.34
417 0.36
418 0.35
419 0.34
420 0.3
421 0.31
422 0.28
423 0.21
424 0.19
425 0.15
426 0.12
427 0.14
428 0.14
429 0.16
430 0.17
431 0.18
432 0.18
433 0.16
434 0.21
435 0.23
436 0.28
437 0.34
438 0.35
439 0.34
440 0.34
441 0.35
442 0.3
443 0.25
444 0.2
445 0.12
446 0.11
447 0.1
448 0.09
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.13
468 0.13
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.19
473 0.19
474 0.19
475 0.18
476 0.17
477 0.16
478 0.17
479 0.17
480 0.14
481 0.14
482 0.13
483 0.11
484 0.14
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.06
504 0.07
505 0.06
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.04
518 0.04
519 0.03
520 0.04
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.1
550 0.1
551 0.12
552 0.17
553 0.19
554 0.21
555 0.24
556 0.23
557 0.26
558 0.27
559 0.31
560 0.33
561 0.32
562 0.31
563 0.32
564 0.32
565 0.26
566 0.25
567 0.2
568 0.18
569 0.25
570 0.25
571 0.25
572 0.26
573 0.25
574 0.26
575 0.25
576 0.22
577 0.15
578 0.16
579 0.12
580 0.12
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.11
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.1
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.1
596 0.1
597 0.11
598 0.09
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.09
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.14
607 0.18
608 0.19
609 0.21
610 0.22
611 0.21
612 0.23
613 0.22
614 0.23
615 0.19
616 0.19
617 0.19
618 0.18
619 0.2
620 0.2
621 0.22
622 0.21
623 0.22
624 0.22
625 0.2
626 0.21
627 0.22
628 0.19
629 0.18
630 0.18
631 0.17
632 0.14
633 0.14
634 0.13
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.11
639 0.13
640 0.14
641 0.15
642 0.21
643 0.24
644 0.27
645 0.3
646 0.31
647 0.35
648 0.37
649 0.38
650 0.35
651 0.34
652 0.35
653 0.4
654 0.41
655 0.43
656 0.46
657 0.51
658 0.54
659 0.54
660 0.51
661 0.47
662 0.48
663 0.45
664 0.45
665 0.4
666 0.36
667 0.34
668 0.37
669 0.33
670 0.27
671 0.21
672 0.17
673 0.13
674 0.15
675 0.14
676 0.11
677 0.11
678 0.1
679 0.09
680 0.08
681 0.08
682 0.05
683 0.06
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.03
690 0.03
691 0.03
692 0.02
693 0.02
694 0.02
695 0.02
696 0.02
697 0.02
698 0.02
699 0.03
700 0.03
701 0.03
702 0.04
703 0.04
704 0.06
705 0.06
706 0.09
707 0.16
708 0.18
709 0.23
710 0.25
711 0.27
712 0.28
713 0.33
714 0.33
715 0.33
716 0.37
717 0.34
718 0.36
719 0.34
720 0.33
721 0.3
722 0.29
723 0.22
724 0.19
725 0.16
726 0.13
727 0.13
728 0.12
729 0.15
730 0.14
731 0.15
732 0.15
733 0.15
734 0.15
735 0.15
736 0.15
737 0.11
738 0.11
739 0.1
740 0.1
741 0.1
742 0.09
743 0.13
744 0.14
745 0.17
746 0.17
747 0.19
748 0.19
749 0.2
750 0.24
751 0.21
752 0.19
753 0.17
754 0.16
755 0.14
756 0.14
757 0.15
758 0.11
759 0.11
760 0.11
761 0.11
762 0.12
763 0.12
764 0.12
765 0.18
766 0.19
767 0.21
768 0.21
769 0.21
770 0.21
771 0.22
772 0.22
773 0.15
774 0.13
775 0.11
776 0.11
777 0.13
778 0.15
779 0.14
780 0.21
781 0.27
782 0.31
783 0.39
784 0.47
785 0.47
786 0.48
787 0.47
788 0.46
789 0.44
790 0.4
791 0.36
792 0.34
793 0.31
794 0.3
795 0.32
796 0.28
797 0.24
798 0.25
799 0.23
800 0.19
801 0.22
802 0.21
803 0.2
804 0.26
805 0.25
806 0.25
807 0.24
808 0.23
809 0.21
810 0.2
811 0.19
812 0.13
813 0.14
814 0.13
815 0.14
816 0.13
817 0.16
818 0.18
819 0.18
820 0.17
821 0.15
822 0.14
823 0.13
824 0.13
825 0.09
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.08
830 0.11
831 0.12
832 0.14
833 0.15
834 0.15
835 0.16
836 0.2
837 0.25
838 0.27
839 0.31
840 0.32
841 0.33
842 0.34
843 0.34
844 0.29
845 0.24
846 0.21
847 0.21
848 0.23
849 0.23
850 0.21
851 0.2
852 0.21
853 0.21
854 0.2
855 0.15
856 0.12
857 0.11
858 0.13
859 0.14
860 0.13
861 0.11
862 0.12
863 0.13
864 0.12
865 0.12
866 0.11
867 0.11
868 0.17
869 0.17
870 0.18
871 0.2
872 0.28
873 0.37
874 0.42
875 0.43
876 0.4
877 0.41
878 0.41
879 0.46
880 0.46
881 0.45
882 0.46
883 0.49
884 0.47
885 0.47
886 0.47
887 0.41
888 0.33
889 0.31
890 0.34
891 0.36
892 0.37
893 0.37
894 0.41
895 0.39
896 0.38
897 0.37
898 0.32
899 0.3
900 0.34
901 0.33
902 0.29
903 0.3
904 0.29
905 0.3
906 0.32
907 0.35
908 0.4
909 0.45
910 0.53
911 0.61
912 0.7
913 0.76
914 0.79
915 0.81
916 0.81
917 0.82
918 0.77
919 0.73
920 0.71
921 0.67
922 0.64
923 0.55
924 0.47
925 0.43
926 0.4
927 0.36
928 0.31
929 0.27
930 0.25
931 0.25
932 0.24
933 0.21
934 0.21
935 0.21
936 0.21
937 0.22
938 0.18
939 0.19
940 0.22
941 0.26
942 0.3
943 0.3
944 0.31
945 0.31
946 0.3
947 0.38
948 0.38
949 0.32
950 0.29
951 0.32
952 0.29
953 0.27
954 0.27
955 0.2
956 0.19
957 0.22
958 0.23
959 0.26
960 0.31
961 0.32
962 0.38
963 0.4
964 0.41
965 0.48
966 0.56
967 0.59
968 0.65
969 0.73
970 0.77
971 0.85
972 0.92
973 0.92
974 0.94
975 0.93
976 0.9
977 0.89
978 0.83
979 0.78
980 0.75
981 0.66
982 0.57
983 0.5
984 0.44
985 0.42
986 0.44
987 0.42
988 0.43
989 0.47
990 0.56
991 0.63
992 0.71
993 0.74
994 0.79
995 0.85
996 0.88
997 0.92
998 0.92
999 0.9
1000 0.9
1001 0.84
1002 0.78
1003 0.69
1004 0.61
1005 0.55
1006 0.45
1007 0.37
1008 0.28
1009 0.23
1010 0.2
1011 0.17
1012 0.13
1013 0.12
1014 0.13
1015 0.14
1016 0.14
1017 0.17
1018 0.18
1019 0.23
1020 0.25
1021 0.3
1022 0.36
1023 0.42
1024 0.51
1025 0.6
1026 0.68
1027 0.73
1028 0.81
1029 0.85
1030 0.89
1031 0.89
1032 0.84
1033 0.8
1034 0.76
1035 0.7
1036 0.63
1037 0.52
1038 0.41
1039 0.37
1040 0.36
1041 0.32
1042 0.28
1043 0.31
1044 0.37
1045 0.41
1046 0.5
1047 0.56
1048 0.6
1049 0.66
1050 0.72
1051 0.76
1052 0.73
1053 0.73
1054 0.67
1055 0.62