FuNGI

A0A409WDZ2

Protein Details

Accession

A0A409WDZ2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
646-672	KEYTSKRCIIYKPGRRLRKGERDPEYS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto 10, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MSERPLKRRKANPFIDVEAGVDELEDAGEDDEPEGDIEPDEDEILWDSVHQHSMLLHESSAAKSNSHWDALLDRAFIRARRQSAAVLLEDGSAGGGLWEVGCRPGREAIVANSTKLQDEAFAVVALPSLPGKVFVFADSREVVSLVLERHSDLNGAVVRPVPAEKVHRIATALNENMQPPYWARIRAKASHWKRYRGDTGLVEDAHGVLTLFLLPRPTFRSNDRSKARQAQSDRSKARQAQSLLDLDTLKDQGLIKQVRLCGDGTFMYSKNRYTLSGLLMIPMDTVDAITGQYVVPTLPEFEKFVRAGVVTPTLRLTTRLMIAPETRRVGARIKVSGGPFVAYHGTIVAVTDEDYSVHLPCLNVTVDIEQRFIRCYFRIGDRVKILYGEKAGCFAWVVEVVMGGDPNITIINQDLGLEMEVKGSQLDFAEDEIQEATLRPLATRRGLRVGEADLNRVYIGKRVMVVGSHRLKGYLGLIRDTTPSGTAIVELDATHRMERVPIDSLVAARDKAETSWRQLEAIPMPMLQPEVPGISLTAGGSDVQQRETLPPPPPLDLYTTESGIPWVLDPALRELSLKARIRSHGAASSAVNVLSADGERVCVLDRFSQSTMWLSPDDLSPAHPTAVKQMVTPLVGELKGGVFCVKEYTSKRCIIYKPGRRLRKGERDPEYSTTHLTQINGGRQHSTSRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.67
3	0.58
4	0.48
5	0.37
6	0.29
7	0.21
8	0.15
9	0.1
10	0.06
11	0.06
12	0.05
13	0.05
14	0.05
15	0.06
16	0.06
17	0.06
18	0.07
19	0.07
20	0.08
21	0.08
22	0.08
23	0.07
24	0.08
25	0.08
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.08
30	0.1
31	0.1
32	0.09
33	0.09
34	0.1
35	0.12
36	0.14
37	0.13
38	0.11
39	0.12
40	0.15
41	0.18
42	0.17
43	0.15
44	0.15
45	0.17
46	0.18
47	0.24
48	0.22
49	0.18
50	0.18
51	0.25
52	0.26
53	0.26
54	0.24
55	0.19
56	0.21
57	0.25
58	0.26
59	0.21
60	0.18
61	0.2
62	0.23
63	0.24
64	0.29
65	0.32
66	0.33
67	0.35
68	0.37
69	0.35
70	0.37
71	0.38
72	0.31
73	0.26
74	0.23
75	0.2
76	0.18
77	0.15
78	0.11
79	0.07
80	0.05
81	0.04
82	0.03
83	0.03
84	0.03
85	0.04
86	0.04
87	0.08
88	0.11
89	0.12
90	0.14
91	0.18
92	0.18
93	0.2
94	0.23
95	0.22
96	0.29
97	0.29
98	0.28
99	0.28
100	0.28
101	0.26
102	0.24
103	0.2
104	0.12
105	0.13
106	0.13
107	0.11
108	0.1
109	0.1
110	0.09
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.07
118	0.08
119	0.1
120	0.1
121	0.11
122	0.14
123	0.14
124	0.17
125	0.16
126	0.16
127	0.15
128	0.14
129	0.12
130	0.11
131	0.12
132	0.1
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.12
139	0.1
140	0.13
141	0.14
142	0.14
143	0.13
144	0.13
145	0.13
146	0.14
147	0.15
148	0.12
149	0.13
150	0.18
151	0.21
152	0.24
153	0.26
154	0.26
155	0.27
156	0.26
157	0.27
158	0.29
159	0.26
160	0.24
161	0.23
162	0.23
163	0.23
164	0.22
165	0.18
166	0.13
167	0.17
168	0.17
169	0.23
170	0.24
171	0.31
172	0.36
173	0.4
174	0.46
175	0.52
176	0.56
177	0.61
178	0.65
179	0.66
180	0.64
181	0.66
182	0.66
183	0.59
184	0.57
185	0.49
186	0.47
187	0.42
188	0.38
189	0.31
190	0.25
191	0.21
192	0.15
193	0.13
194	0.08
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.08
201	0.08
202	0.1
203	0.16
204	0.19
205	0.21
206	0.26
207	0.35
208	0.4
209	0.49
210	0.54
211	0.52
212	0.56
213	0.64
214	0.63
215	0.61
216	0.59
217	0.6
218	0.63
219	0.68
220	0.65
221	0.59
222	0.61
223	0.58
224	0.57
225	0.53
226	0.45
227	0.39
228	0.39
229	0.36
230	0.3
231	0.27
232	0.24
233	0.17
234	0.17
235	0.14
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.1
240	0.17
241	0.18
242	0.18
243	0.21
244	0.23
245	0.22
246	0.23
247	0.22
248	0.14
249	0.15
250	0.14
251	0.13
252	0.14
253	0.13
254	0.15
255	0.16
256	0.16
257	0.16
258	0.17
259	0.16
260	0.16
261	0.18
262	0.17
263	0.2
264	0.19
265	0.18
266	0.17
267	0.16
268	0.13
269	0.1
270	0.08
271	0.04
272	0.04
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.03
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.09
288	0.09
289	0.13
290	0.12
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.15
297	0.12
298	0.12
299	0.13
300	0.13
301	0.13
302	0.14
303	0.14
304	0.1
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.16
310	0.17
311	0.19
312	0.19
313	0.18
314	0.17
315	0.18
316	0.2
317	0.21
318	0.22
319	0.2
320	0.2
321	0.23
322	0.23
323	0.23
324	0.19
325	0.16
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.03
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.09
353	0.11
354	0.11
355	0.13
356	0.11
357	0.11
358	0.13
359	0.14
360	0.14
361	0.11
362	0.13
363	0.14
364	0.18
365	0.26
366	0.26
367	0.29
368	0.29
369	0.3
370	0.28
371	0.27
372	0.24
373	0.17
374	0.18
375	0.15
376	0.12
377	0.13
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.07
427	0.1
428	0.13
429	0.18
430	0.21
431	0.22
432	0.27
433	0.27
434	0.28
435	0.27
436	0.27
437	0.28
438	0.26
439	0.26
440	0.2
441	0.2
442	0.19
443	0.18
444	0.15
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.12
451	0.12
452	0.15
453	0.2
454	0.23
455	0.24
456	0.23
457	0.23
458	0.23
459	0.22
460	0.23
461	0.19
462	0.16
463	0.16
464	0.17
465	0.17
466	0.18
467	0.18
468	0.15
469	0.11
470	0.11
471	0.1
472	0.09
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.07
479	0.09
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.1
484	0.11
485	0.12
486	0.13
487	0.14
488	0.13
489	0.14
490	0.14
491	0.15
492	0.15
493	0.15
494	0.13
495	0.1
496	0.11
497	0.1
498	0.11
499	0.17
500	0.18
501	0.23
502	0.29
503	0.29
504	0.29
505	0.29
506	0.32
507	0.27
508	0.29
509	0.23
510	0.18
511	0.17
512	0.17
513	0.17
514	0.13
515	0.11
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.07
522	0.08
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.11
529	0.12
530	0.12
531	0.13
532	0.14
533	0.17
534	0.2
535	0.24
536	0.24
537	0.29
538	0.3
539	0.31
540	0.32
541	0.3
542	0.3
543	0.29
544	0.3
545	0.26
546	0.25
547	0.23
548	0.22
549	0.21
550	0.18
551	0.14
552	0.09
553	0.08
554	0.07
555	0.08
556	0.09
557	0.13
558	0.14
559	0.14
560	0.14
561	0.15
562	0.2
563	0.28
564	0.31
565	0.31
566	0.34
567	0.36
568	0.42
569	0.43
570	0.42
571	0.37
572	0.34
573	0.33
574	0.29
575	0.29
576	0.24
577	0.21
578	0.17
579	0.12
580	0.11
581	0.09
582	0.09
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.09
589	0.1
590	0.11
591	0.16
592	0.19
593	0.23
594	0.24
595	0.25
596	0.25
597	0.27
598	0.26
599	0.22
600	0.21
601	0.17
602	0.17
603	0.17
604	0.19
605	0.15
606	0.16
607	0.18
608	0.19
609	0.19
610	0.2
611	0.19
612	0.24
613	0.3
614	0.28
615	0.24
616	0.27
617	0.28
618	0.27
619	0.27
620	0.22
621	0.19
622	0.18
623	0.18
624	0.14
625	0.13
626	0.12
627	0.13
628	0.12
629	0.09
630	0.09
631	0.13
632	0.14
633	0.2
634	0.25
635	0.32
636	0.37
637	0.42
638	0.45
639	0.48
640	0.51
641	0.54
642	0.61
643	0.64
644	0.69
645	0.73
646	0.8
647	0.79
648	0.84
649	0.84
650	0.84
651	0.84
652	0.83
653	0.81
654	0.78
655	0.78
656	0.74
657	0.69
658	0.6
659	0.54
660	0.46
661	0.42
662	0.38
663	0.33
664	0.34
665	0.35
666	0.4
667	0.4
668	0.39
669	0.39
670	0.37

A0A409WDZ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer