Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409Y539

Protein Details
Accession A0A409Y539    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
854-873KTYGKQGKYPPKKPANSSPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
522-540KKKDEEKAKRLQSRRRVRG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSTLLPFHKAIIEKIHDPATSDLLILARGLGLRRIICTLMKIYDSPRNLVLLVNATSEEEAAIGEELGIMGCRKPGLRIVGHETASKVRQNLYRQGGIISVTSRILVVDILQSDIPTELIAGLMVLHAEKVTPLVLEAFIVRLFREKNKTGFVKAFSDQPEHITSGFSPLKNIMKELQLRNVHIYPRFHEEIKKSLERRQADVVELSQHLTEPMTDIHNAIIQCMNATLSELKRSNTSLDLDDFNVQNAYFRSFEIIVRRQLDSVWHKVGPKTKQLVNDLGTLRRLLYYLLTYDALQFQSYLETLIAANSVTPSGGTKTHQSPWMFTDAANVIFQTAQRRCYTISSTSKKIQPVIDLTEDEEAWAALDEAEGIFVPTSDKGKQKETSPRPSWLPDGIDPVLEELPKWNLLSEVLLEIEGEMVRQDNLKKPGSSSSPTSSNTVLVMTSSTRMCNLLTEFLASMDHDAPPGSKGRRMMLSKLRAHLFWKGKMTESRDNSKTAKSKSAKDNAIPNELEDISEALKKKDEEKAKRLQSRRRVRGGAPTASGSRDNGTVVKPEPKEVVMGEADAFAQFWESQAGAILSNQPITLTDQFEGLDFESDALQTDFDDNYGLLAPEQTVIVRAYSDDTDDRLLAELKPKFIVMFDPDMDFVRRVEVGSLMLLVHGAFGSPSLPTLQVYKNSNSGMAVRVYHMVYTNSCEEHKYLTAIRKEKESFERLIKERGSMMITLTEDRRDNSDSVIKTISTRLAGGRRELNTEPSRVIVDMREFGSSLPSMLHAVNLLVIPATLTVGDYILTPDICIERKSLSDLKASLNNGRLYTQCEFMTKHYKYPILLIEFEEDKAFNLDIIPEMKTYGKQGKYPPKKPANSSPDQPGRALPSIQSKIVLLTLTFPRVRIIWSSSPYATSEIFKDLKLNNPEPDPMKAITVGADDDPDVGAGVNAAAEELLRSIPGINAQNVKVVMNRVRNIRELCELSLKQVQAIIGDEAGKACWQFMHKGDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.34
4 0.35
5 0.35
6 0.3
7 0.25
8 0.23
9 0.2
10 0.16
11 0.16
12 0.13
13 0.11
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.17
21 0.19
22 0.21
23 0.2
24 0.23
25 0.24
26 0.23
27 0.25
28 0.25
29 0.28
30 0.34
31 0.36
32 0.35
33 0.33
34 0.31
35 0.3
36 0.28
37 0.25
38 0.22
39 0.2
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.12
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.09
60 0.1
61 0.12
62 0.18
63 0.24
64 0.27
65 0.32
66 0.39
67 0.44
68 0.45
69 0.44
70 0.41
71 0.4
72 0.4
73 0.38
74 0.32
75 0.32
76 0.37
77 0.41
78 0.48
79 0.5
80 0.49
81 0.46
82 0.45
83 0.4
84 0.35
85 0.3
86 0.22
87 0.16
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.07
104 0.07
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.13
130 0.15
131 0.22
132 0.3
133 0.33
134 0.37
135 0.45
136 0.49
137 0.5
138 0.52
139 0.49
140 0.46
141 0.43
142 0.44
143 0.39
144 0.39
145 0.34
146 0.33
147 0.32
148 0.28
149 0.27
150 0.22
151 0.19
152 0.23
153 0.27
154 0.23
155 0.22
156 0.25
157 0.31
158 0.3
159 0.32
160 0.26
161 0.29
162 0.37
163 0.38
164 0.43
165 0.42
166 0.43
167 0.47
168 0.47
169 0.45
170 0.43
171 0.43
172 0.37
173 0.4
174 0.41
175 0.37
176 0.4
177 0.39
178 0.41
179 0.46
180 0.51
181 0.46
182 0.5
183 0.56
184 0.53
185 0.53
186 0.53
187 0.48
188 0.42
189 0.41
190 0.35
191 0.3
192 0.27
193 0.24
194 0.17
195 0.15
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.07
214 0.09
215 0.12
216 0.11
217 0.19
218 0.2
219 0.21
220 0.22
221 0.24
222 0.24
223 0.23
224 0.25
225 0.2
226 0.21
227 0.22
228 0.21
229 0.23
230 0.21
231 0.18
232 0.17
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.14
237 0.12
238 0.12
239 0.15
240 0.15
241 0.18
242 0.23
243 0.27
244 0.3
245 0.32
246 0.32
247 0.29
248 0.29
249 0.34
250 0.32
251 0.34
252 0.32
253 0.31
254 0.33
255 0.36
256 0.43
257 0.4
258 0.43
259 0.42
260 0.42
261 0.46
262 0.48
263 0.5
264 0.45
265 0.46
266 0.4
267 0.36
268 0.33
269 0.28
270 0.24
271 0.19
272 0.17
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.13
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.06
302 0.08
303 0.1
304 0.14
305 0.18
306 0.21
307 0.27
308 0.27
309 0.27
310 0.28
311 0.32
312 0.27
313 0.23
314 0.24
315 0.19
316 0.2
317 0.18
318 0.15
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.2
326 0.21
327 0.22
328 0.25
329 0.28
330 0.28
331 0.36
332 0.38
333 0.43
334 0.46
335 0.49
336 0.48
337 0.48
338 0.41
339 0.34
340 0.32
341 0.31
342 0.28
343 0.24
344 0.23
345 0.21
346 0.19
347 0.16
348 0.12
349 0.08
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.05
364 0.08
365 0.11
366 0.16
367 0.18
368 0.24
369 0.26
370 0.32
371 0.42
372 0.48
373 0.55
374 0.54
375 0.56
376 0.54
377 0.53
378 0.49
379 0.41
380 0.36
381 0.27
382 0.28
383 0.24
384 0.21
385 0.19
386 0.18
387 0.16
388 0.12
389 0.11
390 0.07
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.04
410 0.06
411 0.08
412 0.13
413 0.18
414 0.21
415 0.21
416 0.22
417 0.26
418 0.29
419 0.3
420 0.28
421 0.27
422 0.29
423 0.3
424 0.31
425 0.27
426 0.23
427 0.21
428 0.17
429 0.13
430 0.09
431 0.08
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.12
456 0.11
457 0.13
458 0.14
459 0.16
460 0.22
461 0.24
462 0.29
463 0.33
464 0.4
465 0.41
466 0.43
467 0.42
468 0.36
469 0.36
470 0.38
471 0.34
472 0.29
473 0.3
474 0.28
475 0.29
476 0.33
477 0.37
478 0.37
479 0.37
480 0.41
481 0.38
482 0.41
483 0.4
484 0.41
485 0.4
486 0.35
487 0.4
488 0.37
489 0.42
490 0.46
491 0.52
492 0.49
493 0.46
494 0.51
495 0.45
496 0.46
497 0.39
498 0.31
499 0.26
500 0.23
501 0.21
502 0.13
503 0.11
504 0.08
505 0.1
506 0.11
507 0.09
508 0.11
509 0.11
510 0.14
511 0.2
512 0.28
513 0.33
514 0.39
515 0.48
516 0.54
517 0.61
518 0.66
519 0.68
520 0.7
521 0.74
522 0.75
523 0.73
524 0.67
525 0.61
526 0.64
527 0.61
528 0.53
529 0.43
530 0.37
531 0.31
532 0.29
533 0.27
534 0.18
535 0.13
536 0.11
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.18
543 0.18
544 0.19
545 0.19
546 0.18
547 0.18
548 0.16
549 0.17
550 0.1
551 0.1
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.04
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.06
573 0.07
574 0.1
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.12
579 0.12
580 0.12
581 0.12
582 0.09
583 0.08
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.04
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.04
606 0.05
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.07
612 0.07
613 0.09
614 0.09
615 0.09
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.09
622 0.16
623 0.16
624 0.16
625 0.17
626 0.16
627 0.15
628 0.15
629 0.16
630 0.13
631 0.14
632 0.14
633 0.15
634 0.15
635 0.16
636 0.17
637 0.16
638 0.12
639 0.11
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.07
646 0.08
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.04
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.1
663 0.12
664 0.17
665 0.21
666 0.22
667 0.25
668 0.25
669 0.25
670 0.22
671 0.21
672 0.18
673 0.16
674 0.14
675 0.12
676 0.14
677 0.13
678 0.13
679 0.14
680 0.13
681 0.12
682 0.15
683 0.16
684 0.15
685 0.15
686 0.16
687 0.15
688 0.17
689 0.17
690 0.17
691 0.19
692 0.24
693 0.31
694 0.36
695 0.36
696 0.4
697 0.41
698 0.44
699 0.47
700 0.44
701 0.4
702 0.41
703 0.48
704 0.43
705 0.48
706 0.43
707 0.38
708 0.34
709 0.32
710 0.27
711 0.2
712 0.18
713 0.14
714 0.15
715 0.16
716 0.16
717 0.17
718 0.16
719 0.17
720 0.19
721 0.19
722 0.19
723 0.2
724 0.26
725 0.23
726 0.25
727 0.25
728 0.22
729 0.2
730 0.22
731 0.21
732 0.15
733 0.15
734 0.17
735 0.21
736 0.23
737 0.25
738 0.29
739 0.29
740 0.33
741 0.33
742 0.37
743 0.34
744 0.35
745 0.32
746 0.27
747 0.26
748 0.22
749 0.22
750 0.16
751 0.16
752 0.16
753 0.17
754 0.16
755 0.15
756 0.15
757 0.16
758 0.14
759 0.12
760 0.09
761 0.09
762 0.1
763 0.1
764 0.1
765 0.08
766 0.07
767 0.08
768 0.08
769 0.07
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.04
774 0.05
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.05
781 0.06
782 0.07
783 0.07
784 0.07
785 0.08
786 0.1
787 0.11
788 0.12
789 0.12
790 0.13
791 0.14
792 0.2
793 0.24
794 0.23
795 0.27
796 0.28
797 0.3
798 0.34
799 0.36
800 0.35
801 0.35
802 0.35
803 0.32
804 0.32
805 0.29
806 0.29
807 0.28
808 0.27
809 0.22
810 0.23
811 0.23
812 0.27
813 0.37
814 0.33
815 0.36
816 0.37
817 0.39
818 0.37
819 0.4
820 0.41
821 0.34
822 0.34
823 0.31
824 0.29
825 0.28
826 0.28
827 0.24
828 0.18
829 0.15
830 0.15
831 0.14
832 0.1
833 0.09
834 0.09
835 0.1
836 0.12
837 0.12
838 0.1
839 0.12
840 0.13
841 0.14
842 0.19
843 0.25
844 0.27
845 0.31
846 0.4
847 0.5
848 0.6
849 0.66
850 0.72
851 0.73
852 0.77
853 0.79
854 0.81
855 0.78
856 0.74
857 0.72
858 0.71
859 0.7
860 0.65
861 0.59
862 0.51
863 0.48
864 0.44
865 0.4
866 0.32
867 0.34
868 0.35
869 0.34
870 0.32
871 0.26
872 0.25
873 0.25
874 0.22
875 0.13
876 0.14
877 0.17
878 0.22
879 0.22
880 0.21
881 0.21
882 0.21
883 0.23
884 0.22
885 0.26
886 0.27
887 0.3
888 0.35
889 0.34
890 0.35
891 0.34
892 0.33
893 0.28
894 0.23
895 0.21
896 0.23
897 0.23
898 0.22
899 0.26
900 0.26
901 0.34
902 0.4
903 0.42
904 0.41
905 0.42
906 0.47
907 0.45
908 0.46
909 0.41
910 0.33
911 0.3
912 0.27
913 0.24
914 0.2
915 0.18
916 0.16
917 0.13
918 0.13
919 0.11
920 0.11
921 0.11
922 0.09
923 0.08
924 0.06
925 0.06
926 0.05
927 0.05
928 0.04
929 0.04
930 0.04
931 0.03
932 0.03
933 0.04
934 0.05
935 0.05
936 0.05
937 0.05
938 0.06
939 0.07
940 0.13
941 0.17
942 0.21
943 0.25
944 0.26
945 0.3
946 0.3
947 0.3
948 0.27
949 0.3
950 0.33
951 0.37
952 0.41
953 0.44
954 0.47
955 0.53
956 0.53
957 0.51
958 0.51
959 0.46
960 0.45
961 0.46
962 0.43
963 0.41
964 0.44
965 0.4
966 0.33
967 0.32
968 0.29
969 0.21
970 0.23
971 0.19
972 0.14
973 0.15
974 0.15
975 0.13
976 0.13
977 0.13
978 0.11
979 0.1
980 0.12
981 0.14
982 0.19