Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I6NDN1

Protein Details
Accession I6NDN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-211VNLPKDKKIEKLFKHKKRVYKENQIKDINNVKEKAKSKHEKRLEKLQKAGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-205KDKKIEKLFKHKKRVYKENQIKDINNVKEKAKSKHEKRLEK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG erc:Ecym_5419  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKAREHQVKEKRSVPEENELFSDSSSDNELEGFSDSEEQRNIDSNSAEIEIKSNGGGHILKKLNQSKQNNSKKAKAEDKKNAELSSIIYISRLPKGFHERELSKYFSQFGDLKQVRLARNKKTGNSRHYGFIEFVNRDDAVVAQETMNNYLLLGHLLKVVNLPKDKKIEKLFKHKKRVYKENQIKDINNVKEKAKSKHEKRLEKLQKAGISFTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.62
3 0.63
4 0.57
5 0.52
6 0.47
7 0.42
8 0.37
9 0.29
10 0.26
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.09
19 0.11
20 0.1
21 0.08
22 0.13
23 0.13
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.2
29 0.21
30 0.18
31 0.18
32 0.15
33 0.16
34 0.17
35 0.16
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.07
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.3
50 0.36
51 0.41
52 0.49
53 0.55
54 0.57
55 0.66
56 0.74
57 0.75
58 0.73
59 0.73
60 0.71
61 0.72
62 0.72
63 0.69
64 0.69
65 0.7
66 0.72
67 0.71
68 0.67
69 0.59
70 0.49
71 0.42
72 0.34
73 0.26
74 0.19
75 0.13
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.15
83 0.24
84 0.25
85 0.28
86 0.32
87 0.3
88 0.34
89 0.37
90 0.38
91 0.3
92 0.29
93 0.27
94 0.21
95 0.22
96 0.18
97 0.15
98 0.22
99 0.22
100 0.21
101 0.23
102 0.27
103 0.27
104 0.35
105 0.39
106 0.35
107 0.44
108 0.47
109 0.49
110 0.54
111 0.6
112 0.57
113 0.58
114 0.53
115 0.49
116 0.47
117 0.44
118 0.35
119 0.3
120 0.29
121 0.24
122 0.22
123 0.2
124 0.18
125 0.16
126 0.15
127 0.12
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.12
147 0.15
148 0.19
149 0.24
150 0.27
151 0.29
152 0.37
153 0.38
154 0.43
155 0.5
156 0.54
157 0.57
158 0.66
159 0.72
160 0.74
161 0.84
162 0.83
163 0.82
164 0.82
165 0.85
166 0.83
167 0.84
168 0.84
169 0.83
170 0.86
171 0.84
172 0.75
173 0.73
174 0.72
175 0.68
176 0.64
177 0.57
178 0.5
179 0.52
180 0.57
181 0.56
182 0.58
183 0.61
184 0.63
185 0.71
186 0.79
187 0.81
188 0.81
189 0.86
190 0.86
191 0.83
192 0.81
193 0.78
194 0.73
195 0.64