Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YV07

Protein Details
Accession A0A409YV07    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-29DEIIKSKPKGRRGVRRTSARTQVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-22KSKPKGRRGVRRT
160-182RTSIRGRRVRGRGGARKSDRPPK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDKSLDEIIKSKPKGRRGVRRTSARTQVLGKGAASPAVRARATAAVPETKAVPQATEKIIVSNLPSDVNEAQIKDLFTQTVGPLRDITLSYDASGRSKGIATVVFQKKGDGAKAFQQYNNRLIDGKRPMKIEMVLDPSKPLPLASRVAPAPAAAKTAATRTSIRGRRVRGRGGARKSDRPPKTAADLDAEMEDYTAANAPAAAATAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.68
3 0.72
4 0.71
5 0.8
6 0.82
7 0.86
8 0.85
9 0.83
10 0.82
11 0.75
12 0.7
13 0.63
14 0.58
15 0.51
16 0.45
17 0.36
18 0.29
19 0.26
20 0.26
21 0.22
22 0.19
23 0.18
24 0.22
25 0.21
26 0.19
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.21
31 0.21
32 0.19
33 0.19
34 0.2
35 0.19
36 0.16
37 0.19
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.18
42 0.18
43 0.2
44 0.19
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.15
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.12
54 0.11
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.13
62 0.13
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.12
74 0.14
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.17
90 0.2
91 0.21
92 0.21
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.23
97 0.15
98 0.13
99 0.19
100 0.24
101 0.25
102 0.25
103 0.3
104 0.31
105 0.34
106 0.34
107 0.28
108 0.24
109 0.24
110 0.28
111 0.32
112 0.34
113 0.32
114 0.32
115 0.33
116 0.33
117 0.34
118 0.29
119 0.23
120 0.26
121 0.24
122 0.22
123 0.23
124 0.21
125 0.2
126 0.18
127 0.15
128 0.1
129 0.12
130 0.15
131 0.15
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.13
139 0.13
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.19
148 0.29
149 0.34
150 0.41
151 0.46
152 0.51
153 0.58
154 0.64
155 0.66
156 0.65
157 0.69
158 0.7
159 0.72
160 0.75
161 0.72
162 0.74
163 0.75
164 0.77
165 0.71
166 0.65
167 0.62
168 0.56
169 0.57
170 0.52
171 0.46
172 0.41
173 0.38
174 0.36
175 0.32
176 0.28
177 0.2
178 0.16
179 0.14
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06