Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409Y3W2

Protein Details
Accession A0A409Y3W2    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
459-489APKSAGLKKRNGPPRRRPQPKKDAKSGETSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-106RAARR
379-433RAHVKAMRAASKEKGKEGKEGAAKVPKTPRTPRSAGPRRSGKKEGEKADEEKKAD
453-483PKSAGIAPKSAGLKKRNGPPRRRPQPKKDAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013105  TPR_2  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF07719  TPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSAPTLTEFSMTSDVPGTESAPTHIVAEQSKTAGNTAIPNGTTTTTSAATAPAPTPTTEPPSDTSSVNAEEGRPSSAAPSVSVVLSAPKTTEELIAARALKRAARRQAIREKAEGHKSAGDYLVSVKNYKAAYPQYLEAIQLWGSNPTYFISLAECYRKLKWYEEAAHAATRALTLDPKNTEARYVRGVARLEQRLLKPAKIDFETVLSQDSLHLLSRAALTEVNAFIAASTQLGSHDLAPSPIDEATKDIDFGFPPLDYEGMEADELSDSSDCNHVGNGIQCRFYNHDGCARGSECQFSHAPDEKSVRDELGKNVCIYYLLDACKFGAAKCIYSHSKAALPKKGWWNNPEQVVKVKSVLEAAEKQSREQRQIENEKWRAHVKAMRAASKEKGKEGKEGAAKVPKTPRTPRSAGPRRSGKKEGEKADEEKKADGEAKEANGEAAAPTQPTEPPKSAGIAPKSAGLKKRNGPPRRRPQPKKDAKSGETSTPPSATLPKEGAPSEKAPTNGDAPKPAEGGEPKEGSGFTDYQLNAVPNDVKPDTSVTLNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.15
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.18
13 0.18
14 0.21
15 0.21
16 0.2
17 0.22
18 0.21
19 0.2
20 0.19
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.21
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.2
30 0.17
31 0.18
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.19
43 0.21
44 0.27
45 0.26
46 0.28
47 0.28
48 0.32
49 0.33
50 0.3
51 0.28
52 0.25
53 0.25
54 0.24
55 0.22
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.2
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.17
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.14
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.17
83 0.18
84 0.17
85 0.19
86 0.19
87 0.21
88 0.27
89 0.34
90 0.39
91 0.46
92 0.51
93 0.58
94 0.67
95 0.73
96 0.7
97 0.65
98 0.62
99 0.6
100 0.62
101 0.55
102 0.47
103 0.42
104 0.39
105 0.36
106 0.32
107 0.24
108 0.17
109 0.19
110 0.21
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.2
115 0.2
116 0.21
117 0.22
118 0.21
119 0.24
120 0.26
121 0.27
122 0.25
123 0.25
124 0.25
125 0.2
126 0.18
127 0.14
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.14
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.21
145 0.26
146 0.26
147 0.28
148 0.31
149 0.35
150 0.38
151 0.4
152 0.43
153 0.39
154 0.38
155 0.34
156 0.29
157 0.21
158 0.16
159 0.12
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.15
164 0.16
165 0.19
166 0.22
167 0.21
168 0.25
169 0.23
170 0.25
171 0.24
172 0.26
173 0.25
174 0.27
175 0.28
176 0.27
177 0.33
178 0.33
179 0.32
180 0.33
181 0.31
182 0.35
183 0.35
184 0.32
185 0.27
186 0.26
187 0.29
188 0.26
189 0.27
190 0.19
191 0.2
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.07
265 0.1
266 0.14
267 0.14
268 0.16
269 0.16
270 0.18
271 0.21
272 0.23
273 0.22
274 0.19
275 0.23
276 0.23
277 0.24
278 0.24
279 0.21
280 0.2
281 0.18
282 0.2
283 0.14
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.19
288 0.23
289 0.24
290 0.24
291 0.27
292 0.25
293 0.27
294 0.26
295 0.21
296 0.18
297 0.18
298 0.2
299 0.23
300 0.23
301 0.21
302 0.21
303 0.2
304 0.18
305 0.17
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.1
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.15
319 0.21
320 0.22
321 0.24
322 0.25
323 0.19
324 0.24
325 0.28
326 0.33
327 0.35
328 0.35
329 0.39
330 0.48
331 0.53
332 0.53
333 0.51
334 0.53
335 0.51
336 0.56
337 0.51
338 0.43
339 0.42
340 0.39
341 0.36
342 0.3
343 0.26
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.15
348 0.16
349 0.19
350 0.23
351 0.23
352 0.24
353 0.3
354 0.33
355 0.35
356 0.36
357 0.37
358 0.41
359 0.49
360 0.54
361 0.58
362 0.6
363 0.58
364 0.57
365 0.55
366 0.46
367 0.42
368 0.4
369 0.34
370 0.36
371 0.38
372 0.41
373 0.4
374 0.42
375 0.42
376 0.46
377 0.44
378 0.42
379 0.45
380 0.41
381 0.44
382 0.44
383 0.45
384 0.42
385 0.43
386 0.42
387 0.43
388 0.41
389 0.41
390 0.46
391 0.45
392 0.48
393 0.54
394 0.56
395 0.56
396 0.6
397 0.61
398 0.64
399 0.68
400 0.68
401 0.68
402 0.72
403 0.7
404 0.74
405 0.74
406 0.71
407 0.71
408 0.73
409 0.7
410 0.67
411 0.66
412 0.63
413 0.65
414 0.62
415 0.53
416 0.46
417 0.39
418 0.34
419 0.34
420 0.29
421 0.24
422 0.22
423 0.21
424 0.21
425 0.2
426 0.18
427 0.13
428 0.13
429 0.1
430 0.09
431 0.08
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.13
436 0.17
437 0.22
438 0.22
439 0.24
440 0.25
441 0.27
442 0.29
443 0.34
444 0.34
445 0.32
446 0.31
447 0.33
448 0.36
449 0.39
450 0.42
451 0.39
452 0.44
453 0.48
454 0.57
455 0.62
456 0.68
457 0.74
458 0.77
459 0.84
460 0.87
461 0.91
462 0.92
463 0.92
464 0.94
465 0.94
466 0.92
467 0.91
468 0.9
469 0.82
470 0.81
471 0.74
472 0.7
473 0.65
474 0.6
475 0.52
476 0.43
477 0.4
478 0.33
479 0.34
480 0.29
481 0.27
482 0.26
483 0.26
484 0.29
485 0.29
486 0.31
487 0.3
488 0.31
489 0.31
490 0.32
491 0.31
492 0.3
493 0.31
494 0.34
495 0.36
496 0.35
497 0.37
498 0.36
499 0.37
500 0.35
501 0.33
502 0.32
503 0.3
504 0.33
505 0.34
506 0.33
507 0.3
508 0.31
509 0.31
510 0.27
511 0.28
512 0.23
513 0.16
514 0.22
515 0.22
516 0.21
517 0.25
518 0.24
519 0.19
520 0.22
521 0.24
522 0.18
523 0.25
524 0.25
525 0.22
526 0.22
527 0.26
528 0.25