Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409Y4X6

Protein Details
Accession A0A409Y4X6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-138GVCWAWRRGKCQRGTKCRYQHEERTHNKNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-239RRDREKLLREERARRAEEEMRRREAERLKRER
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PF00097  zf-C3HC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22585  Rcat_RBR_DEAH12-like  
Amino Acid Sequences MSTAAQSGHAPGTSKKAFQSQKECIHWKKGNCVFGSRCRFRHDPAVKGVVTNIDVEGAGVAGAVERSEPLTARSESNRIVGSANSATTVQTTHKASENGRSQSSQSQSGVCWAWRRGKCQRGTKCRYQHEERTHNKNSGKESASKTAREAEAELKVQQVISQIRAAKALEDERTAALLAQEAERRAMEEKQARIRAEAAEKSRLACERRDREKLLREERARRAEEEMRRREAERLKRERETEEAKKQLQLQREQDAAVVEQYLIQESSLVTFSAGLKIRNVVPGFELCKITVRNLPKDARRAEIADLFLLQGVDQSEFFISHIKPEPNGSTLEATVLANVHHGQLIAEGLEGIEFRDETLTFSVSSNEGPNSMDAYTNNLPFLHVIWNGPSSSVVATYPSLAVAREQARRLDRMTYRRQQIRAETIPGTCSVRIKGLSPNIFMETSDHTDLIGDAYVCIEPVSFDLEHSFTMIREHLSCAHGVRMDTFARLANGLGPDGEVKIKVCFDQWDSVKDAKLLVERLRTRSGPYYRAWFPPQPVKYTIKIPMHQYEAQKPQWNALSERKKDVGAYVMPRIGKQGDIVFIQVMGQDKKAIGILKVRVECLASGEKLNSTYWHSSFGSNQAKAFFNRLYTEKKVFVRTDFKTRSLRISGDQHMVQEARQMIKDEVERLAQREVSTFIDRGLVGYFVREGLQKLKELLGDDNVQLDVNSRPCKIMVKGGEDATHHLHRLTEEARAASALGSILPGQIVEHDTCPVCYEDASNPEQLACGHVYCGVCLKHFLTSAVEGKSFPLTCAGNDATCNAPIAIPLIQRFLPPQVFHALVEAAFATHLEQRAEEFKYCTTPDCKQIYRRKADQASLQCPSCFSTICASCDEEGHEGMTCEERRIHKDPEEQERLNEQLAAESGYKKCPRCRIWIEKTEGCNHMACRCGVHICWKCMATFDTGNLVYDHLHAVHGNIHDEVPAGVQMGNMAQPAFLAGQADELARIEREAAARLAARQNGWGMDGNPFHRPRVGAAMAHPPPAPARAREPAPRYPDIMAYYQERRREQQAAEEEEAQRQAQELAHRQAREQQRREQDRGWCVVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.38
4 0.44
5 0.51
6 0.58
7 0.59
8 0.66
9 0.72
10 0.78
11 0.74
12 0.78
13 0.76
14 0.71
15 0.72
16 0.7
17 0.69
18 0.62
19 0.64
20 0.6
21 0.63
22 0.69
23 0.66
24 0.63
25 0.63
26 0.64
27 0.61
28 0.66
29 0.62
30 0.59
31 0.58
32 0.62
33 0.55
34 0.51
35 0.48
36 0.4
37 0.34
38 0.28
39 0.2
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.07
45 0.06
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.16
58 0.18
59 0.22
60 0.26
61 0.3
62 0.31
63 0.34
64 0.33
65 0.28
66 0.28
67 0.24
68 0.24
69 0.21
70 0.2
71 0.17
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.14
77 0.17
78 0.19
79 0.21
80 0.26
81 0.29
82 0.31
83 0.39
84 0.45
85 0.44
86 0.45
87 0.45
88 0.42
89 0.46
90 0.48
91 0.44
92 0.37
93 0.34
94 0.31
95 0.34
96 0.33
97 0.28
98 0.29
99 0.29
100 0.38
101 0.4
102 0.48
103 0.53
104 0.6
105 0.66
106 0.71
107 0.77
108 0.78
109 0.83
110 0.85
111 0.86
112 0.86
113 0.86
114 0.84
115 0.84
116 0.83
117 0.85
118 0.83
119 0.83
120 0.79
121 0.78
122 0.73
123 0.68
124 0.64
125 0.61
126 0.56
127 0.54
128 0.54
129 0.56
130 0.57
131 0.53
132 0.49
133 0.48
134 0.45
135 0.39
136 0.36
137 0.3
138 0.3
139 0.31
140 0.29
141 0.23
142 0.23
143 0.21
144 0.19
145 0.21
146 0.18
147 0.18
148 0.22
149 0.24
150 0.24
151 0.26
152 0.25
153 0.21
154 0.23
155 0.24
156 0.22
157 0.21
158 0.21
159 0.2
160 0.2
161 0.19
162 0.15
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.12
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.17
173 0.18
174 0.23
175 0.27
176 0.33
177 0.41
178 0.47
179 0.46
180 0.45
181 0.45
182 0.41
183 0.41
184 0.41
185 0.36
186 0.36
187 0.36
188 0.36
189 0.38
190 0.39
191 0.35
192 0.35
193 0.42
194 0.46
195 0.54
196 0.6
197 0.62
198 0.65
199 0.72
200 0.75
201 0.74
202 0.74
203 0.73
204 0.75
205 0.78
206 0.78
207 0.71
208 0.63
209 0.6
210 0.59
211 0.6
212 0.62
213 0.6
214 0.57
215 0.57
216 0.56
217 0.57
218 0.58
219 0.59
220 0.59
221 0.62
222 0.63
223 0.67
224 0.68
225 0.64
226 0.62
227 0.61
228 0.59
229 0.59
230 0.59
231 0.54
232 0.54
233 0.58
234 0.56
235 0.54
236 0.53
237 0.49
238 0.47
239 0.47
240 0.44
241 0.38
242 0.34
243 0.27
244 0.19
245 0.14
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.13
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.17
265 0.18
266 0.23
267 0.23
268 0.17
269 0.18
270 0.21
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.17
275 0.21
276 0.22
277 0.22
278 0.25
279 0.28
280 0.31
281 0.37
282 0.43
283 0.44
284 0.51
285 0.51
286 0.48
287 0.45
288 0.41
289 0.38
290 0.35
291 0.3
292 0.22
293 0.2
294 0.17
295 0.15
296 0.12
297 0.09
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.11
307 0.1
308 0.13
309 0.19
310 0.19
311 0.2
312 0.23
313 0.25
314 0.22
315 0.23
316 0.21
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.15
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.15
368 0.15
369 0.16
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.1
391 0.15
392 0.18
393 0.19
394 0.23
395 0.25
396 0.27
397 0.28
398 0.31
399 0.33
400 0.37
401 0.45
402 0.48
403 0.54
404 0.58
405 0.6
406 0.57
407 0.56
408 0.56
409 0.49
410 0.45
411 0.38
412 0.33
413 0.3
414 0.28
415 0.25
416 0.17
417 0.16
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.18
423 0.23
424 0.25
425 0.25
426 0.25
427 0.25
428 0.24
429 0.23
430 0.19
431 0.16
432 0.17
433 0.16
434 0.15
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.11
439 0.09
440 0.05
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.06
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.11
464 0.11
465 0.12
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.1
495 0.16
496 0.17
497 0.18
498 0.21
499 0.22
500 0.22
501 0.21
502 0.19
503 0.14
504 0.15
505 0.15
506 0.14
507 0.2
508 0.21
509 0.24
510 0.27
511 0.26
512 0.27
513 0.32
514 0.33
515 0.3
516 0.29
517 0.31
518 0.31
519 0.34
520 0.36
521 0.31
522 0.3
523 0.35
524 0.35
525 0.33
526 0.35
527 0.35
528 0.32
529 0.34
530 0.38
531 0.34
532 0.34
533 0.35
534 0.33
535 0.35
536 0.37
537 0.36
538 0.35
539 0.37
540 0.37
541 0.39
542 0.36
543 0.34
544 0.33
545 0.33
546 0.3
547 0.33
548 0.39
549 0.36
550 0.39
551 0.38
552 0.34
553 0.33
554 0.3
555 0.24
556 0.17
557 0.18
558 0.17
559 0.18
560 0.18
561 0.18
562 0.18
563 0.15
564 0.12
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.08
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.1
581 0.09
582 0.08
583 0.12
584 0.15
585 0.19
586 0.2
587 0.2
588 0.19
589 0.18
590 0.17
591 0.16
592 0.15
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.12
598 0.12
599 0.11
600 0.12
601 0.15
602 0.15
603 0.18
604 0.19
605 0.19
606 0.19
607 0.27
608 0.29
609 0.27
610 0.27
611 0.26
612 0.26
613 0.26
614 0.29
615 0.21
616 0.16
617 0.18
618 0.2
619 0.23
620 0.25
621 0.28
622 0.3
623 0.31
624 0.35
625 0.34
626 0.35
627 0.38
628 0.36
629 0.43
630 0.41
631 0.44
632 0.44
633 0.44
634 0.44
635 0.39
636 0.38
637 0.32
638 0.34
639 0.33
640 0.31
641 0.31
642 0.26
643 0.25
644 0.24
645 0.19
646 0.17
647 0.15
648 0.13
649 0.13
650 0.15
651 0.13
652 0.16
653 0.17
654 0.15
655 0.15
656 0.17
657 0.17
658 0.17
659 0.18
660 0.16
661 0.16
662 0.15
663 0.16
664 0.16
665 0.17
666 0.15
667 0.14
668 0.15
669 0.14
670 0.14
671 0.12
672 0.09
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.06
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.12
681 0.14
682 0.14
683 0.15
684 0.16
685 0.16
686 0.17
687 0.17
688 0.15
689 0.15
690 0.14
691 0.14
692 0.13
693 0.12
694 0.1
695 0.1
696 0.1
697 0.14
698 0.16
699 0.15
700 0.16
701 0.17
702 0.2
703 0.2
704 0.25
705 0.24
706 0.26
707 0.29
708 0.29
709 0.3
710 0.27
711 0.29
712 0.27
713 0.24
714 0.19
715 0.17
716 0.17
717 0.15
718 0.18
719 0.16
720 0.15
721 0.15
722 0.15
723 0.15
724 0.14
725 0.14
726 0.1
727 0.09
728 0.06
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.05
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.05
737 0.07
738 0.07
739 0.08
740 0.1
741 0.1
742 0.11
743 0.12
744 0.12
745 0.1
746 0.09
747 0.11
748 0.12
749 0.16
750 0.18
751 0.18
752 0.17
753 0.17
754 0.17
755 0.15
756 0.14
757 0.11
758 0.09
759 0.08
760 0.12
761 0.12
762 0.11
763 0.16
764 0.14
765 0.13
766 0.15
767 0.16
768 0.15
769 0.16
770 0.16
771 0.14
772 0.17
773 0.21
774 0.2
775 0.2
776 0.18
777 0.18
778 0.21
779 0.19
780 0.16
781 0.16
782 0.14
783 0.14
784 0.19
785 0.19
786 0.15
787 0.15
788 0.17
789 0.15
790 0.15
791 0.15
792 0.11
793 0.1
794 0.09
795 0.1
796 0.11
797 0.11
798 0.12
799 0.13
800 0.14
801 0.14
802 0.16
803 0.18
804 0.2
805 0.18
806 0.2
807 0.21
808 0.22
809 0.21
810 0.21
811 0.17
812 0.13
813 0.13
814 0.11
815 0.07
816 0.06
817 0.06
818 0.06
819 0.08
820 0.1
821 0.09
822 0.1
823 0.12
824 0.16
825 0.19
826 0.19
827 0.18
828 0.18
829 0.22
830 0.23
831 0.25
832 0.26
833 0.26
834 0.34
835 0.39
836 0.42
837 0.48
838 0.58
839 0.64
840 0.67
841 0.69
842 0.7
843 0.69
844 0.68
845 0.67
846 0.66
847 0.62
848 0.59
849 0.54
850 0.45
851 0.4
852 0.38
853 0.31
854 0.23
855 0.18
856 0.21
857 0.23
858 0.25
859 0.26
860 0.25
861 0.24
862 0.24
863 0.25
864 0.19
865 0.16
866 0.15
867 0.13
868 0.12
869 0.12
870 0.17
871 0.15
872 0.15
873 0.2
874 0.23
875 0.3
876 0.35
877 0.4
878 0.41
879 0.49
880 0.54
881 0.6
882 0.64
883 0.58
884 0.56
885 0.54
886 0.49
887 0.41
888 0.35
889 0.25
890 0.17
891 0.17
892 0.16
893 0.14
894 0.16
895 0.17
896 0.24
897 0.3
898 0.33
899 0.39
900 0.47
901 0.5
902 0.56
903 0.65
904 0.68
905 0.72
906 0.76
907 0.78
908 0.75
909 0.75
910 0.71
911 0.63
912 0.54
913 0.47
914 0.4
915 0.35
916 0.32
917 0.27
918 0.23
919 0.23
920 0.24
921 0.22
922 0.31
923 0.35
924 0.34
925 0.38
926 0.37
927 0.34
928 0.34
929 0.35
930 0.3
931 0.25
932 0.23
933 0.25
934 0.24
935 0.25
936 0.22
937 0.21
938 0.16
939 0.15
940 0.15
941 0.1
942 0.11
943 0.1
944 0.1
945 0.14
946 0.15
947 0.16
948 0.15
949 0.15
950 0.14
951 0.15
952 0.14
953 0.1
954 0.09
955 0.08
956 0.07
957 0.07
958 0.07
959 0.08
960 0.08
961 0.08
962 0.08
963 0.06
964 0.06
965 0.08
966 0.08
967 0.07
968 0.07
969 0.07
970 0.08
971 0.09
972 0.09
973 0.08
974 0.09
975 0.1
976 0.09
977 0.09
978 0.09
979 0.11
980 0.12
981 0.14
982 0.14
983 0.15
984 0.16
985 0.2
986 0.25
987 0.25
988 0.24
989 0.24
990 0.25
991 0.23
992 0.24
993 0.23
994 0.19
995 0.22
996 0.26
997 0.26
998 0.32
999 0.33
1000 0.33
1001 0.33
1002 0.33
1003 0.3
1004 0.34
1005 0.35
1006 0.29
1007 0.3
1008 0.39
1009 0.38
1010 0.4
1011 0.37
1012 0.29
1013 0.28
1014 0.31
1015 0.31
1016 0.25
1017 0.3
1018 0.34
1019 0.4
1020 0.48
1021 0.53
1022 0.55
1023 0.59
1024 0.58
1025 0.54
1026 0.5
1027 0.48
1028 0.43
1029 0.4
1030 0.35
1031 0.34
1032 0.39
1033 0.42
1034 0.47
1035 0.47
1036 0.48
1037 0.51
1038 0.54
1039 0.5
1040 0.51
1041 0.55
1042 0.55
1043 0.54
1044 0.55
1045 0.5
1046 0.47
1047 0.47
1048 0.37
1049 0.29
1050 0.22
1051 0.2
1052 0.18
1053 0.24
1054 0.28
1055 0.36
1056 0.42
1057 0.42
1058 0.43
1059 0.5
1060 0.58
1061 0.61
1062 0.6
1063 0.6
1064 0.65
1065 0.73
1066 0.79
1067 0.76
1068 0.74
1069 0.71