Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VGW7

Protein Details
Accession A0A409VGW7    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-246AKGKPFDDPKKDPKKRKASPSPDEPABasic
321-348VEPVKRETKAEKKEKREKEKLEKKRLAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-262AGGKKGAKGKPFDDPKKDPKKRKASPSPDEPAKKKVKPAPKVTKGRLK
325-347KRETKAEKKEKREKEKLEKKRLA
364-365KP
367-377AGSNSKKMGKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009038  GOLD_dom  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
IPR003923  TFIID_30kDa  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01105  EMP24_GP25L  
PF08313  SCA7  
PF03540  TFIID_30kDa  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MSTSNPQPASSADSQSQPNGGAATASGSSATQPAPTQSRQAAEEARKDRTLAEFMLMLDEYEPLTKIPNEVTDYYLQRVGFDCQDVRLKRLISLAAQKFVSDIAADAYQHARIRTNATGGRARVNQPLTGPGSLKLKPSPPPQSPFSWDISSPSPVSEAPSPPTSWLSARDMKLFGARPLSSTSDIGLVRCNDCGKPILRSFVTEHADNCAAIRAGGKKGAKGKPFDDPKKDPKKRKASPSPDEPAKKKVKPAPKVTKGRLKGPVDLDRHCGVINDKGVPCSRSLTCKSHSMGAKRGVLGRSRNYDELLLDWQRAHNPNFVEPVKRETKAEKKEKREKEKLEKKRLAGENAAAVGLDPASVSKKPSAGSNSKKMGKKAAAAAAAQQRLADEMREDVSEDLDDLDSEVEMEELIKSVRTAKENGVIGVPLAVPCDAGTCHTHIRLYLDIVVGSTKPDVEHDRSHVSELASKVRDLNQKLEDIRREQQYQREREEDYRNLSEATNARAVWYSIAQITVLLATCAWQLRHLKRFFEDRKTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.34
4 0.27
5 0.24
6 0.2
7 0.17
8 0.13
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.16
21 0.22
22 0.24
23 0.29
24 0.3
25 0.33
26 0.33
27 0.37
28 0.4
29 0.4
30 0.48
31 0.47
32 0.49
33 0.46
34 0.45
35 0.43
36 0.39
37 0.36
38 0.27
39 0.25
40 0.21
41 0.2
42 0.22
43 0.19
44 0.15
45 0.12
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.1
50 0.07
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.14
55 0.17
56 0.21
57 0.22
58 0.25
59 0.28
60 0.3
61 0.31
62 0.32
63 0.28
64 0.24
65 0.25
66 0.25
67 0.21
68 0.22
69 0.2
70 0.2
71 0.29
72 0.29
73 0.31
74 0.32
75 0.31
76 0.29
77 0.32
78 0.3
79 0.26
80 0.35
81 0.35
82 0.34
83 0.34
84 0.32
85 0.29
86 0.27
87 0.22
88 0.12
89 0.09
90 0.07
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.14
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.22
101 0.23
102 0.27
103 0.27
104 0.3
105 0.34
106 0.33
107 0.37
108 0.36
109 0.37
110 0.38
111 0.37
112 0.34
113 0.29
114 0.33
115 0.3
116 0.28
117 0.26
118 0.22
119 0.25
120 0.25
121 0.27
122 0.25
123 0.26
124 0.31
125 0.39
126 0.45
127 0.47
128 0.5
129 0.51
130 0.52
131 0.54
132 0.5
133 0.46
134 0.4
135 0.34
136 0.32
137 0.31
138 0.29
139 0.24
140 0.2
141 0.17
142 0.15
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.19
147 0.21
148 0.21
149 0.21
150 0.22
151 0.21
152 0.18
153 0.2
154 0.22
155 0.26
156 0.27
157 0.29
158 0.28
159 0.27
160 0.3
161 0.28
162 0.24
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.24
168 0.21
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.17
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.16
178 0.18
179 0.13
180 0.14
181 0.18
182 0.16
183 0.2
184 0.21
185 0.24
186 0.23
187 0.25
188 0.26
189 0.3
190 0.31
191 0.27
192 0.25
193 0.24
194 0.24
195 0.21
196 0.19
197 0.13
198 0.1
199 0.09
200 0.11
201 0.1
202 0.11
203 0.16
204 0.16
205 0.18
206 0.27
207 0.32
208 0.34
209 0.35
210 0.36
211 0.4
212 0.49
213 0.53
214 0.53
215 0.54
216 0.6
217 0.68
218 0.75
219 0.76
220 0.76
221 0.81
222 0.8
223 0.85
224 0.85
225 0.83
226 0.82
227 0.81
228 0.77
229 0.74
230 0.72
231 0.64
232 0.61
233 0.59
234 0.54
235 0.52
236 0.52
237 0.54
238 0.57
239 0.65
240 0.67
241 0.69
242 0.76
243 0.75
244 0.77
245 0.7
246 0.68
247 0.66
248 0.57
249 0.52
250 0.48
251 0.5
252 0.45
253 0.44
254 0.41
255 0.33
256 0.31
257 0.27
258 0.22
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.18
271 0.23
272 0.26
273 0.27
274 0.31
275 0.32
276 0.34
277 0.37
278 0.35
279 0.36
280 0.37
281 0.37
282 0.32
283 0.35
284 0.31
285 0.31
286 0.32
287 0.3
288 0.3
289 0.31
290 0.31
291 0.28
292 0.27
293 0.23
294 0.2
295 0.2
296 0.16
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.2
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.21
306 0.26
307 0.27
308 0.26
309 0.23
310 0.28
311 0.29
312 0.28
313 0.28
314 0.3
315 0.39
316 0.45
317 0.55
318 0.57
319 0.63
320 0.73
321 0.81
322 0.84
323 0.84
324 0.84
325 0.84
326 0.87
327 0.87
328 0.88
329 0.84
330 0.76
331 0.76
332 0.71
333 0.63
334 0.55
335 0.46
336 0.36
337 0.31
338 0.28
339 0.18
340 0.13
341 0.1
342 0.07
343 0.05
344 0.03
345 0.03
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.17
353 0.24
354 0.31
355 0.38
356 0.44
357 0.51
358 0.56
359 0.6
360 0.57
361 0.57
362 0.51
363 0.48
364 0.44
365 0.42
366 0.36
367 0.33
368 0.37
369 0.36
370 0.33
371 0.29
372 0.24
373 0.19
374 0.18
375 0.19
376 0.13
377 0.08
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.09
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.1
403 0.14
404 0.17
405 0.19
406 0.22
407 0.28
408 0.29
409 0.3
410 0.26
411 0.22
412 0.19
413 0.17
414 0.15
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.08
421 0.07
422 0.09
423 0.11
424 0.14
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.19
429 0.22
430 0.22
431 0.22
432 0.2
433 0.18
434 0.17
435 0.16
436 0.16
437 0.13
438 0.12
439 0.1
440 0.09
441 0.08
442 0.12
443 0.18
444 0.22
445 0.26
446 0.3
447 0.36
448 0.36
449 0.38
450 0.37
451 0.33
452 0.33
453 0.31
454 0.34
455 0.29
456 0.29
457 0.29
458 0.33
459 0.4
460 0.38
461 0.43
462 0.38
463 0.43
464 0.47
465 0.52
466 0.5
467 0.49
468 0.52
469 0.52
470 0.54
471 0.53
472 0.58
473 0.61
474 0.62
475 0.63
476 0.6
477 0.58
478 0.6
479 0.64
480 0.6
481 0.58
482 0.54
483 0.48
484 0.45
485 0.41
486 0.39
487 0.34
488 0.32
489 0.29
490 0.25
491 0.25
492 0.25
493 0.26
494 0.22
495 0.2
496 0.18
497 0.15
498 0.15
499 0.14
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.1
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.1
508 0.13
509 0.13
510 0.18
511 0.27
512 0.36
513 0.46
514 0.49
515 0.52
516 0.54
517 0.65
518 0.66