Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A423WLY2

Protein Details
Accession A0A423WLY2    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-161ERSVYKKIPLGKPKKDPKEGTBasic
249-268SPEDSKKKSREKGSERPKETBasic
603-630GNTTSGEQQQPKRSRRRGRGRGGNGGGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-268KRANKAKEAASSKSSKHARQESQGTKGKASASSPEDSKKKSREKGSERPKET
385-405EKSSRSGRSRRGKEPKAAEPK
614-627KRSRRRGRGRGGNG
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF03467  Smg4_UPF3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTAQQGNSAPKQAGILPIRPAQGQAQTPSPADGSKSAKSKTAAQDGVKIKIRRLPPGITEQEFEVILGDAWKAGNGKVGWFEFHAGHIPKSASKEPTPAFALLQVKEKDADDLSQVVQNAIWEDAKGTFNSPSLVGPPSMERSVYKKIPLGKPKKDPKEGTIDQDEDYMAFLASLAEDPTMKQNAEELNAEDMAEPASDTKTTTTPLVQAILDNREKRANKAKEAASSKSSKHARQESQGTKGKASASSPEDSKKKSREKGSERPKETVRILRKQTATEAAAEAAKAVAKDIKAGASASDVANSRRAGIQGVANILKRDLGLSSGSAARKARQEMAKQESSKKTEPDTKGKDTKGKENNTSSAGTSSTQAPEQPSTPTAPKAQAEKSSRSGRSRRGKEPKAAEPKAGGSSETPAATTKAPVILQKKKDDTAVTSSTKDQTPAPATKPASKPTALTATPTPPTGPRAATAKGSQAQKKSNTPVPASGATRAFLKHANPSQGVTEALLKESMLGFGGVTFVEIDRRKGFAYVDFADHEGLAKAMAASPVSVAQATVQVLERKEQSKKTAPTPSNPTPTAAASSTSAAAGPSNPPTAPSSNADKSGNTTSGEQQQPKRSRRRGRGRGGNGGGAGSAEGKSADQSASGGAGASTPAAASSSNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.32
4 0.36
5 0.37
6 0.36
7 0.36
8 0.31
9 0.33
10 0.34
11 0.32
12 0.33
13 0.34
14 0.34
15 0.34
16 0.31
17 0.25
18 0.23
19 0.26
20 0.27
21 0.3
22 0.36
23 0.36
24 0.4
25 0.41
26 0.47
27 0.49
28 0.54
29 0.53
30 0.49
31 0.57
32 0.55
33 0.6
34 0.6
35 0.53
36 0.47
37 0.47
38 0.49
39 0.49
40 0.5
41 0.47
42 0.44
43 0.52
44 0.56
45 0.52
46 0.49
47 0.42
48 0.38
49 0.33
50 0.28
51 0.19
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.2
65 0.21
66 0.21
67 0.21
68 0.24
69 0.18
70 0.19
71 0.25
72 0.22
73 0.22
74 0.24
75 0.24
76 0.25
77 0.3
78 0.34
79 0.33
80 0.33
81 0.4
82 0.38
83 0.41
84 0.41
85 0.36
86 0.31
87 0.31
88 0.34
89 0.27
90 0.34
91 0.3
92 0.28
93 0.29
94 0.28
95 0.25
96 0.22
97 0.21
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.17
102 0.17
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.13
123 0.13
124 0.15
125 0.18
126 0.18
127 0.18
128 0.18
129 0.22
130 0.29
131 0.31
132 0.31
133 0.31
134 0.39
135 0.47
136 0.56
137 0.61
138 0.62
139 0.69
140 0.77
141 0.83
142 0.83
143 0.78
144 0.72
145 0.72
146 0.66
147 0.62
148 0.58
149 0.5
150 0.41
151 0.38
152 0.33
153 0.23
154 0.2
155 0.14
156 0.08
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.1
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.14
171 0.15
172 0.18
173 0.18
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.08
182 0.07
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.19
199 0.24
200 0.23
201 0.23
202 0.29
203 0.3
204 0.34
205 0.42
206 0.42
207 0.42
208 0.48
209 0.5
210 0.5
211 0.54
212 0.52
213 0.46
214 0.44
215 0.4
216 0.42
217 0.44
218 0.39
219 0.43
220 0.48
221 0.47
222 0.5
223 0.59
224 0.55
225 0.58
226 0.61
227 0.54
228 0.46
229 0.44
230 0.39
231 0.31
232 0.27
233 0.24
234 0.21
235 0.22
236 0.23
237 0.27
238 0.29
239 0.31
240 0.37
241 0.4
242 0.46
243 0.51
244 0.58
245 0.62
246 0.67
247 0.74
248 0.79
249 0.8
250 0.75
251 0.73
252 0.66
253 0.61
254 0.56
255 0.54
256 0.51
257 0.49
258 0.5
259 0.52
260 0.51
261 0.47
262 0.45
263 0.41
264 0.34
265 0.26
266 0.22
267 0.16
268 0.15
269 0.13
270 0.11
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.1
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.1
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.21
319 0.23
320 0.26
321 0.31
322 0.37
323 0.41
324 0.4
325 0.45
326 0.45
327 0.45
328 0.44
329 0.39
330 0.37
331 0.4
332 0.43
333 0.46
334 0.47
335 0.49
336 0.52
337 0.53
338 0.56
339 0.5
340 0.54
341 0.53
342 0.52
343 0.51
344 0.48
345 0.48
346 0.44
347 0.42
348 0.33
349 0.26
350 0.21
351 0.16
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.15
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.19
367 0.2
368 0.23
369 0.24
370 0.29
371 0.32
372 0.34
373 0.39
374 0.43
375 0.46
376 0.48
377 0.51
378 0.53
379 0.59
380 0.62
381 0.66
382 0.69
383 0.7
384 0.72
385 0.73
386 0.73
387 0.73
388 0.67
389 0.58
390 0.49
391 0.45
392 0.4
393 0.34
394 0.24
395 0.14
396 0.15
397 0.16
398 0.14
399 0.12
400 0.1
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.16
408 0.22
409 0.29
410 0.34
411 0.4
412 0.42
413 0.41
414 0.43
415 0.4
416 0.36
417 0.34
418 0.35
419 0.31
420 0.29
421 0.3
422 0.29
423 0.28
424 0.26
425 0.21
426 0.2
427 0.23
428 0.25
429 0.26
430 0.31
431 0.33
432 0.39
433 0.42
434 0.41
435 0.39
436 0.36
437 0.34
438 0.31
439 0.35
440 0.28
441 0.27
442 0.26
443 0.26
444 0.26
445 0.26
446 0.23
447 0.18
448 0.21
449 0.21
450 0.19
451 0.17
452 0.2
453 0.21
454 0.23
455 0.23
456 0.25
457 0.28
458 0.34
459 0.37
460 0.38
461 0.43
462 0.45
463 0.5
464 0.51
465 0.51
466 0.5
467 0.47
468 0.45
469 0.43
470 0.42
471 0.38
472 0.35
473 0.3
474 0.25
475 0.25
476 0.22
477 0.19
478 0.18
479 0.18
480 0.23
481 0.27
482 0.31
483 0.31
484 0.32
485 0.31
486 0.3
487 0.28
488 0.21
489 0.2
490 0.15
491 0.15
492 0.14
493 0.12
494 0.12
495 0.11
496 0.1
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.11
507 0.12
508 0.16
509 0.17
510 0.19
511 0.19
512 0.2
513 0.21
514 0.19
515 0.24
516 0.23
517 0.23
518 0.23
519 0.23
520 0.22
521 0.21
522 0.18
523 0.12
524 0.1
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.09
539 0.09
540 0.1
541 0.12
542 0.16
543 0.16
544 0.2
545 0.24
546 0.27
547 0.33
548 0.36
549 0.41
550 0.47
551 0.52
552 0.57
553 0.63
554 0.62
555 0.63
556 0.68
557 0.69
558 0.67
559 0.62
560 0.56
561 0.48
562 0.46
563 0.41
564 0.33
565 0.26
566 0.19
567 0.2
568 0.18
569 0.16
570 0.15
571 0.11
572 0.11
573 0.1
574 0.12
575 0.14
576 0.16
577 0.15
578 0.17
579 0.21
580 0.23
581 0.25
582 0.27
583 0.32
584 0.33
585 0.38
586 0.37
587 0.34
588 0.36
589 0.38
590 0.36
591 0.3
592 0.29
593 0.29
594 0.37
595 0.44
596 0.46
597 0.48
598 0.56
599 0.64
600 0.71
601 0.77
602 0.79
603 0.82
604 0.86
605 0.9
606 0.9
607 0.91
608 0.93
609 0.9
610 0.9
611 0.83
612 0.76
613 0.65
614 0.54
615 0.43
616 0.32
617 0.24
618 0.15
619 0.11
620 0.08
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.07
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.06
637 0.05
638 0.05
639 0.06