FuNGI

A0A423WQD6

Protein Details

Accession

A0A423WQD6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-52	NPPPPGAPPLRRKKKAGDPLVARKKPVVRPPPKPKNPANANANP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-44	PGAPPLRRKKKAGDPLVARKKPVVRPPPKPKN
494-509	KPKALSDKKGKSLKRP

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNAPPNGNNPPPPGAPPLRRKKKAGDPLVARKKPVVRPPPKPKNPANANANPSRSFHTQPNLLGVQAPKVDQKTQEEWRQRRQQNGGWWDPPPDAEDFREFPVFMTKREAREGVRSHVMRFAKTRTGGKVDVMDDTDFARPVTLHRKDARSLNNAQVAKEGSPSPALVDPVEAERIANIKAEKEAQRATDQAQIAPVTKDAVTKKPIQKPEKASTQTFYAKRSEAHKKEATIRYEESLPWVLEDADGKNTYVGAYTAALSESMAALQYEGDKWRLIPLEKFYKFTHKPPFKTYTIEEAERLMNKKVVQGRWAMREGEKDKVKEEMAATRQTLHGRAKVKTESETFRSAARSEKQEHDDIDFSGDEFQDDDENPTFEPDNDEEVKESRERVRREQLGARAFETIDEAKLEEELKREEIEEAARKQGFGKKIAKSLVKLERDVKYKEDRENSDDLLSESDESDVEDKEVKQEEGEKGSQDQDATNASKAEGSTSGKPKALSDKKGKSLKRPGSPNLSEMESSGNESSRKRVKKQATGSVRGSRASTPMSSSQRAKAATGAMSDGEATGGEMSDAGRTKKKVPRVTVVSGSHSKGTPTSSRAGSPAPAAGQASPGSQSPGRRELDFSQPPGPVTAADVAAALAAQPQGVTIGRLLSQFGNRIAENPTRPDQTARKDWVKFIRAVANWGEDKLLRLKNPEAGQK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.51
3	0.57
4	0.64
5	0.7
6	0.75
7	0.77
8	0.79
9	0.81
10	0.82
11	0.81
12	0.8
13	0.79
14	0.83
15	0.89
16	0.82
17	0.73
18	0.69
19	0.68
20	0.66
21	0.67
22	0.67
23	0.65
24	0.73
25	0.83
26	0.88
27	0.89
28	0.9
29	0.88
30	0.87
31	0.86
32	0.85
33	0.83
34	0.8
35	0.78
36	0.76
37	0.72
38	0.64
39	0.57
40	0.53
41	0.48
42	0.44
43	0.43
44	0.43
45	0.43
46	0.43
47	0.47
48	0.42
49	0.37
50	0.37
51	0.31
52	0.28
53	0.24
54	0.25
55	0.23
56	0.25
57	0.29
58	0.3
59	0.35
60	0.38
61	0.46
62	0.54
63	0.59
64	0.64
65	0.71
66	0.77
67	0.75
68	0.77
69	0.76
70	0.73
71	0.72
72	0.74
73	0.7
74	0.63
75	0.6
76	0.54
77	0.47
78	0.41
79	0.33
80	0.27
81	0.22
82	0.22
83	0.25
84	0.24
85	0.26
86	0.27
87	0.25
88	0.22
89	0.31
90	0.29
91	0.25
92	0.32
93	0.34
94	0.35
95	0.4
96	0.42
97	0.35
98	0.43
99	0.45
100	0.42
101	0.47
102	0.45
103	0.42
104	0.46
105	0.44
106	0.39
107	0.38
108	0.37
109	0.35
110	0.39
111	0.42
112	0.4
113	0.44
114	0.42
115	0.41
116	0.4
117	0.34
118	0.31
119	0.29
120	0.24
121	0.19
122	0.19
123	0.18
124	0.14
125	0.13
126	0.11
127	0.09
128	0.13
129	0.23
130	0.26
131	0.32
132	0.38
133	0.42
134	0.45
135	0.53
136	0.56
137	0.52
138	0.52
139	0.51
140	0.53
141	0.5
142	0.46
143	0.42
144	0.36
145	0.3
146	0.28
147	0.22
148	0.15
149	0.16
150	0.15
151	0.14
152	0.14
153	0.15
154	0.12
155	0.12
156	0.12
157	0.12
158	0.13
159	0.11
160	0.09
161	0.09
162	0.1
163	0.1
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.13
168	0.19
169	0.21
170	0.24
171	0.26
172	0.26
173	0.27
174	0.28
175	0.28
176	0.29
177	0.26
178	0.22
179	0.22
180	0.21
181	0.2
182	0.19
183	0.17
184	0.12
185	0.12
186	0.16
187	0.17
188	0.21
189	0.24
190	0.32
191	0.4
192	0.46
193	0.56
194	0.57
195	0.62
196	0.65
197	0.69
198	0.7
199	0.66
200	0.6
201	0.53
202	0.53
203	0.53
204	0.46
205	0.42
206	0.35
207	0.32
208	0.32
209	0.38
210	0.43
211	0.39
212	0.45
213	0.46
214	0.46
215	0.54
216	0.58
217	0.54
218	0.48
219	0.45
220	0.39
221	0.37
222	0.34
223	0.28
224	0.24
225	0.21
226	0.16
227	0.15
228	0.13
229	0.11
230	0.13
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.08
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.06
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.11
261	0.14
262	0.15
263	0.16
264	0.21
265	0.3
266	0.31
267	0.34
268	0.33
269	0.4
270	0.41
271	0.45
272	0.5
273	0.48
274	0.51
275	0.54
276	0.59
277	0.51
278	0.53
279	0.47
280	0.45
281	0.41
282	0.38
283	0.32
284	0.27
285	0.27
286	0.26
287	0.26
288	0.18
289	0.17
290	0.16
291	0.2
292	0.24
293	0.23
294	0.23
295	0.28
296	0.3
297	0.32
298	0.34
299	0.31
300	0.26
301	0.32
302	0.32
303	0.33
304	0.34
305	0.3
306	0.28
307	0.29
308	0.28
309	0.23
310	0.22
311	0.21
312	0.2
313	0.21
314	0.21
315	0.19
316	0.21
317	0.2
318	0.23
319	0.19
320	0.21
321	0.23
322	0.24
323	0.27
324	0.27
325	0.28
326	0.27
327	0.28
328	0.27
329	0.26
330	0.28
331	0.25
332	0.24
333	0.24
334	0.21
335	0.22
336	0.22
337	0.23
338	0.24
339	0.28
340	0.3
341	0.3
342	0.31
343	0.28
344	0.26
345	0.21
346	0.19
347	0.15
348	0.12
349	0.1
350	0.09
351	0.07
352	0.06
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.09
357	0.08
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.11
364	0.1
365	0.14
366	0.14
367	0.14
368	0.14
369	0.15
370	0.17
371	0.15
372	0.16
373	0.18
374	0.24
375	0.28
376	0.33
377	0.41
378	0.43
379	0.46
380	0.5
381	0.5
382	0.48
383	0.45
384	0.4
385	0.32
386	0.28
387	0.24
388	0.21
389	0.14
390	0.09
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.08
395	0.09
396	0.07
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.14
405	0.17
406	0.17
407	0.21
408	0.21
409	0.2
410	0.22
411	0.26
412	0.26
413	0.28
414	0.33
415	0.31
416	0.36
417	0.41
418	0.41
419	0.37
420	0.43
421	0.44
422	0.4
423	0.4
424	0.41
425	0.42
426	0.44
427	0.44
428	0.4
429	0.4
430	0.42
431	0.46
432	0.48
433	0.46
434	0.46
435	0.47
436	0.44
437	0.36
438	0.32
439	0.26
440	0.2
441	0.17
442	0.12
443	0.09
444	0.08
445	0.07
446	0.07
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.09
451	0.09
452	0.12
453	0.14
454	0.14
455	0.13
456	0.18
457	0.19
458	0.22
459	0.23
460	0.2
461	0.2
462	0.22
463	0.22
464	0.17
465	0.15
466	0.12
467	0.15
468	0.15
469	0.15
470	0.14
471	0.13
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.15
477	0.2
478	0.25
479	0.28
480	0.28
481	0.29
482	0.29
483	0.37
484	0.41
485	0.43
486	0.48
487	0.52
488	0.6
489	0.68
490	0.69
491	0.68
492	0.71
493	0.72
494	0.7
495	0.71
496	0.68
497	0.69
498	0.68
499	0.6
500	0.52
501	0.45
502	0.37
503	0.29
504	0.27
505	0.17
506	0.18
507	0.17
508	0.16
509	0.17
510	0.17
511	0.24
512	0.3
513	0.36
514	0.38
515	0.47
516	0.54
517	0.62
518	0.69
519	0.73
520	0.72
521	0.73
522	0.74
523	0.72
524	0.64
525	0.56
526	0.49
527	0.4
528	0.34
529	0.29
530	0.24
531	0.21
532	0.27
533	0.31
534	0.34
535	0.36
536	0.37
537	0.39
538	0.39
539	0.36
540	0.3
541	0.28
542	0.24
543	0.22
544	0.19
545	0.14
546	0.13
547	0.13
548	0.1
549	0.08
550	0.06
551	0.05
552	0.05
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.08
558	0.1
559	0.12
560	0.18
561	0.2
562	0.29
563	0.35
564	0.44
565	0.5
566	0.54
567	0.61
568	0.63
569	0.67
570	0.67
571	0.64
572	0.61
573	0.57
574	0.52
575	0.45
576	0.38
577	0.32
578	0.26
579	0.28
580	0.25
581	0.25
582	0.28
583	0.28
584	0.29
585	0.3
586	0.3
587	0.27
588	0.24
589	0.23
590	0.18
591	0.18
592	0.17
593	0.15
594	0.16
595	0.15
596	0.14
597	0.13
598	0.13
599	0.16
600	0.17
601	0.22
602	0.25
603	0.32
604	0.34
605	0.34
606	0.38
607	0.38
608	0.46
609	0.47
610	0.46
611	0.43
612	0.42
613	0.41
614	0.37
615	0.34
616	0.24
617	0.2
618	0.19
619	0.14
620	0.13
621	0.12
622	0.1
623	0.09
624	0.09
625	0.06
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.05
631	0.07
632	0.07
633	0.08
634	0.07
635	0.09
636	0.11
637	0.12
638	0.14
639	0.15
640	0.18
641	0.2
642	0.22
643	0.24
644	0.23
645	0.24
646	0.28
647	0.32
648	0.33
649	0.36
650	0.39
651	0.39
652	0.41
653	0.47
654	0.49
655	0.51
656	0.57
657	0.59
658	0.62
659	0.61
660	0.67
661	0.69
662	0.66
663	0.61
664	0.56
665	0.57
666	0.49
667	0.5
668	0.46
669	0.42
670	0.38
671	0.36
672	0.33
673	0.25
674	0.27
675	0.31
676	0.33
677	0.3
678	0.34
679	0.37
680	0.42

A0A423WQD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer