Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JSC2

Protein Details
Accession G8JSC2    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
776-807NKNSRFFKKIKKLNCTTKPNKRQQSKRGTSSAHydrophilic
859-881YGDDISKRTNKKNRSKTETVEEDHydrophilic
907-930EGNSNHGKSKRKSQGGKRLQNGAQHydrophilic
1000-1026YNCGGSNNGNRTRRRRQAKFSKPIAGQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
912-923HGKSKRKSQGGK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR018885  mRNA-bd_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR018835  RNA-binding_domain_put  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG erc:Ecym_4615  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10567  Nab6_mRNP_bdg  
PF10378  RRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MRQLGQQQQENHRKSSNSYMANNQRLGAVDQDQKHGQEQDQEQEQDQDQDEQPRPQQIHHQRFFPSGDVASSLSAAASMPPVPQTPFDPTYGASLLPSHMLMGSPFVSTPMRPQGHFHPSASSHSNHSRSFLYYPQPPILKPIPPRRRKSFSLNHSEPYQVNFKILPKGKDEYMTRSLLFSNLERQENFDIHNFLTNFIKFGPIESIYLLDDSHSILLSFLTKATCLDFYNNLLQRFSEFKSKLHSTKLSVSFVCQDETNWFRLLQMNVVTRGVTRSLCIEFEDQSMELTSDLIHEKIPWLFFSHRFVIERIDLVNAAAPKNQNFNNRYLLIHFICISMALEVEEYLQQASQKKQLGISKIQFVNVNGHSSDLSDEDAVAAANGLQRESRTSSVSSISLPISNSSDLVELFHSLDLALGIISLQVIPSEYPVPLIESHDDHLHSVTISRPSKTLTSSTSLVEMDGGPNGGTPNGSNAMQGVLLLSDPSSDGNTPSMLPNELNINTSLMPGPMGGQVLGTSQSLSLHNPNDNGGAGPSYFMDPMSGAPINQALQRQYLTGTGQVGGSNNRTVYIGNIHPRSKPEDICNVVRGGILQNIKWIHSKRICFVTFIEAAAAIQFYANASLEPIVLHGNILRVGWGQPSGELPKNIALAVTIGASRNVYVSLPEYSFKEKYINNPEFKEYHGKYKLPSEEQLRQDFTKYGQVEQINYLDDGHCCWVNFMNIAHAIRLVEDCNSLSQRNLEKFHAQFDGRYKNLIIGYGKDRCGNVNKNLTANKNSRFFKKIKKLNCTTKPNKRQQSKRGTSSASSDDARKDDASTEKVPVSSKEPVCDEILGLNDDNALAEGLGISLSSAYVNEYGDDISKRTNKKNRSKTETVEEDTGYTTSGSSDIDIIVAPPLEHNKGKEGNSNHGKSKRKSQGGKRLQNGAQDGVGGGYGGHSQHYLAGSFELVNSNTYLDSIPPLVPSPINQHFHDKSLCRGSAHVNDNNNALGGFNNYSYNCGGSNNGNRTRRRRQAKFSKPIAGQDVMSQYLEQLHHSTFLYSTNILGATTVHDPLGFYDVNANEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.58
3 0.56
4 0.53
5 0.53
6 0.58
7 0.63
8 0.68
9 0.64
10 0.54
11 0.47
12 0.41
13 0.39
14 0.32
15 0.29
16 0.29
17 0.3
18 0.35
19 0.36
20 0.36
21 0.39
22 0.38
23 0.34
24 0.35
25 0.37
26 0.39
27 0.44
28 0.44
29 0.41
30 0.42
31 0.41
32 0.36
33 0.34
34 0.32
35 0.28
36 0.34
37 0.37
38 0.38
39 0.4
40 0.44
41 0.43
42 0.41
43 0.49
44 0.51
45 0.59
46 0.58
47 0.59
48 0.55
49 0.58
50 0.58
51 0.49
52 0.42
53 0.32
54 0.28
55 0.25
56 0.22
57 0.18
58 0.16
59 0.14
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.1
68 0.12
69 0.14
70 0.16
71 0.18
72 0.24
73 0.26
74 0.27
75 0.26
76 0.25
77 0.28
78 0.27
79 0.24
80 0.17
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.18
97 0.26
98 0.28
99 0.28
100 0.32
101 0.38
102 0.46
103 0.49
104 0.45
105 0.41
106 0.41
107 0.45
108 0.46
109 0.39
110 0.36
111 0.41
112 0.46
113 0.41
114 0.41
115 0.38
116 0.37
117 0.38
118 0.37
119 0.35
120 0.35
121 0.39
122 0.42
123 0.43
124 0.39
125 0.43
126 0.42
127 0.43
128 0.46
129 0.53
130 0.57
131 0.65
132 0.73
133 0.76
134 0.79
135 0.78
136 0.79
137 0.78
138 0.77
139 0.78
140 0.74
141 0.68
142 0.63
143 0.61
144 0.52
145 0.45
146 0.41
147 0.31
148 0.28
149 0.27
150 0.27
151 0.33
152 0.38
153 0.37
154 0.36
155 0.39
156 0.39
157 0.43
158 0.43
159 0.42
160 0.41
161 0.41
162 0.36
163 0.34
164 0.32
165 0.27
166 0.27
167 0.21
168 0.24
169 0.26
170 0.29
171 0.28
172 0.32
173 0.34
174 0.33
175 0.33
176 0.28
177 0.25
178 0.22
179 0.29
180 0.25
181 0.22
182 0.26
183 0.23
184 0.21
185 0.19
186 0.22
187 0.15
188 0.16
189 0.19
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.18
217 0.27
218 0.31
219 0.3
220 0.29
221 0.28
222 0.27
223 0.29
224 0.28
225 0.29
226 0.25
227 0.26
228 0.33
229 0.39
230 0.4
231 0.44
232 0.45
233 0.4
234 0.48
235 0.51
236 0.48
237 0.42
238 0.4
239 0.38
240 0.36
241 0.33
242 0.24
243 0.19
244 0.21
245 0.23
246 0.24
247 0.2
248 0.19
249 0.18
250 0.23
251 0.23
252 0.2
253 0.23
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.23
258 0.19
259 0.2
260 0.19
261 0.14
262 0.11
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.11
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.11
285 0.12
286 0.11
287 0.14
288 0.17
289 0.19
290 0.24
291 0.26
292 0.26
293 0.27
294 0.27
295 0.27
296 0.25
297 0.23
298 0.19
299 0.16
300 0.13
301 0.12
302 0.14
303 0.12
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.19
309 0.23
310 0.29
311 0.3
312 0.33
313 0.37
314 0.36
315 0.36
316 0.33
317 0.34
318 0.26
319 0.25
320 0.21
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.12
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.11
337 0.14
338 0.19
339 0.22
340 0.22
341 0.27
342 0.3
343 0.33
344 0.37
345 0.38
346 0.4
347 0.37
348 0.38
349 0.35
350 0.32
351 0.33
352 0.26
353 0.26
354 0.18
355 0.18
356 0.17
357 0.15
358 0.15
359 0.1
360 0.09
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.03
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.09
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.16
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.02
408 0.03
409 0.02
410 0.02
411 0.02
412 0.03
413 0.03
414 0.04
415 0.06
416 0.05
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.16
434 0.17
435 0.18
436 0.18
437 0.19
438 0.21
439 0.22
440 0.22
441 0.17
442 0.19
443 0.2
444 0.2
445 0.19
446 0.18
447 0.16
448 0.14
449 0.11
450 0.08
451 0.06
452 0.06
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.05
468 0.04
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.1
490 0.11
491 0.1
492 0.11
493 0.1
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.06
509 0.06
510 0.08
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.13
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.08
520 0.07
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.08
531 0.07
532 0.06
533 0.07
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.11
538 0.09
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.09
559 0.11
560 0.13
561 0.18
562 0.22
563 0.23
564 0.24
565 0.25
566 0.3
567 0.3
568 0.29
569 0.27
570 0.3
571 0.33
572 0.33
573 0.33
574 0.28
575 0.25
576 0.23
577 0.19
578 0.13
579 0.13
580 0.12
581 0.11
582 0.14
583 0.14
584 0.16
585 0.2
586 0.2
587 0.24
588 0.28
589 0.3
590 0.3
591 0.37
592 0.36
593 0.33
594 0.32
595 0.29
596 0.24
597 0.23
598 0.19
599 0.12
600 0.11
601 0.1
602 0.09
603 0.04
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.09
630 0.13
631 0.14
632 0.14
633 0.14
634 0.16
635 0.16
636 0.16
637 0.13
638 0.09
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.05
643 0.05
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.05
650 0.06
651 0.07
652 0.09
653 0.1
654 0.11
655 0.13
656 0.17
657 0.17
658 0.17
659 0.2
660 0.19
661 0.27
662 0.36
663 0.41
664 0.4
665 0.42
666 0.44
667 0.4
668 0.42
669 0.43
670 0.34
671 0.37
672 0.38
673 0.37
674 0.35
675 0.42
676 0.45
677 0.38
678 0.42
679 0.39
680 0.42
681 0.46
682 0.48
683 0.44
684 0.39
685 0.38
686 0.34
687 0.29
688 0.29
689 0.25
690 0.22
691 0.24
692 0.24
693 0.24
694 0.25
695 0.25
696 0.18
697 0.17
698 0.17
699 0.12
700 0.11
701 0.11
702 0.11
703 0.1
704 0.09
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.12
709 0.11
710 0.12
711 0.14
712 0.15
713 0.14
714 0.13
715 0.12
716 0.11
717 0.12
718 0.1
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.11
723 0.13
724 0.12
725 0.13
726 0.17
727 0.22
728 0.26
729 0.28
730 0.29
731 0.33
732 0.34
733 0.36
734 0.36
735 0.31
736 0.29
737 0.33
738 0.37
739 0.31
740 0.32
741 0.29
742 0.28
743 0.28
744 0.28
745 0.22
746 0.18
747 0.23
748 0.26
749 0.27
750 0.26
751 0.26
752 0.26
753 0.33
754 0.35
755 0.37
756 0.41
757 0.41
758 0.44
759 0.49
760 0.49
761 0.49
762 0.49
763 0.47
764 0.47
765 0.48
766 0.48
767 0.5
768 0.5
769 0.54
770 0.59
771 0.61
772 0.62
773 0.69
774 0.73
775 0.79
776 0.84
777 0.84
778 0.83
779 0.86
780 0.88
781 0.88
782 0.89
783 0.88
784 0.89
785 0.88
786 0.9
787 0.87
788 0.84
789 0.79
790 0.73
791 0.65
792 0.59
793 0.53
794 0.45
795 0.37
796 0.32
797 0.29
798 0.26
799 0.27
800 0.22
801 0.2
802 0.19
803 0.22
804 0.25
805 0.24
806 0.26
807 0.24
808 0.25
809 0.26
810 0.24
811 0.25
812 0.29
813 0.28
814 0.29
815 0.3
816 0.3
817 0.31
818 0.29
819 0.24
820 0.17
821 0.18
822 0.16
823 0.14
824 0.12
825 0.1
826 0.09
827 0.09
828 0.08
829 0.06
830 0.04
831 0.04
832 0.04
833 0.03
834 0.03
835 0.03
836 0.03
837 0.03
838 0.03
839 0.03
840 0.03
841 0.05
842 0.06
843 0.06
844 0.07
845 0.07
846 0.08
847 0.1
848 0.11
849 0.11
850 0.17
851 0.23
852 0.29
853 0.38
854 0.46
855 0.54
856 0.65
857 0.74
858 0.79
859 0.81
860 0.83
861 0.79
862 0.8
863 0.77
864 0.71
865 0.63
866 0.53
867 0.44
868 0.38
869 0.32
870 0.23
871 0.15
872 0.11
873 0.08
874 0.08
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.06
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.07
883 0.07
884 0.07
885 0.08
886 0.12
887 0.16
888 0.18
889 0.19
890 0.24
891 0.3
892 0.32
893 0.38
894 0.38
895 0.44
896 0.52
897 0.55
898 0.57
899 0.59
900 0.66
901 0.62
902 0.7
903 0.69
904 0.7
905 0.75
906 0.78
907 0.81
908 0.83
909 0.89
910 0.83
911 0.82
912 0.75
913 0.72
914 0.64
915 0.55
916 0.43
917 0.34
918 0.28
919 0.19
920 0.16
921 0.1
922 0.06
923 0.05
924 0.06
925 0.06
926 0.07
927 0.07
928 0.07
929 0.1
930 0.11
931 0.11
932 0.1
933 0.11
934 0.11
935 0.11
936 0.12
937 0.12
938 0.11
939 0.12
940 0.12
941 0.12
942 0.11
943 0.12
944 0.11
945 0.09
946 0.11
947 0.12
948 0.12
949 0.12
950 0.14
951 0.15
952 0.15
953 0.17
954 0.23
955 0.29
956 0.33
957 0.34
958 0.42
959 0.42
960 0.46
961 0.51
962 0.45
963 0.44
964 0.48
965 0.48
966 0.4
967 0.4
968 0.43
969 0.45
970 0.5
971 0.48
972 0.45
973 0.44
974 0.45
975 0.43
976 0.36
977 0.27
978 0.19
979 0.14
980 0.13
981 0.13
982 0.12
983 0.15
984 0.15
985 0.18
986 0.18
987 0.19
988 0.16
989 0.16
990 0.18
991 0.22
992 0.31
993 0.38
994 0.46
995 0.52
996 0.6
997 0.68
998 0.76
999 0.78
1000 0.8
1001 0.81
1002 0.83
1003 0.87
1004 0.9
1005 0.91
1006 0.88
1007 0.87
1008 0.8
1009 0.76
1010 0.71
1011 0.62
1012 0.51
1013 0.45
1014 0.41
1015 0.34
1016 0.31
1017 0.24
1018 0.19
1019 0.22
1020 0.22
1021 0.19
1022 0.18
1023 0.17
1024 0.19
1025 0.2
1026 0.2
1027 0.16
1028 0.18
1029 0.19
1030 0.17
1031 0.16
1032 0.16
1033 0.15
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.11
1037 0.11
1038 0.13
1039 0.14
1040 0.12
1041 0.12
1042 0.12
1043 0.14
1044 0.18
1045 0.14
1046 0.12
1047 0.18