Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JNF4

Protein Details
Accession G8JNF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
570-613TAEGEEKAKPKRQRKTTKKAMGEGGSVAKKRTTKKQASNTTAAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
575-604EKAKPKRQRKTTKKAMGEGGSVAKKRTTKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG erc:Ecym_2004  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MNNRSSLGIPVNNQGTANSLYGAVKRPPSNSVNVGPASGNVNPLSTIQQQQATMAAQAAANQQVQQRLLLQQRLRQQQQQQQNFEQQIFQLLTTLNRKPKRLYQFTEDTDAILKKYEQFKPSFEFHIYENNYKICAPANTRLQQHQRTPQGTSEGLILNKNNETLKEFLEYVARGMIPDAIVEVLRDCNIQFYEGCLILQVYDHTNTVDVKQPQAGQGTSQQQQQSQQGPQQQRNIQQKQHLSNQGAQVSTSVPGSPPVDQAKQQTNTESESPQSQVKGDNSAKEATTGTAKDRLTTLKRPRMYRTLLKPNDLTRYYDMLSWADHTRFSDSVYQQLEAEILAITKRNLRLETNLNPFEHVDKMNSDEFLKPKWDEKTQACIYPHRELSTAASSKGVIGHIEQHEELPEHSSAYEQMMLIMSGRTTTTTTATLAASLAKRAELLGITGNSAKGSSSTGSGGSVSGSNSVAAAAVAAAAVVGSNVNNENNQFSRLKFVEQFRLNKEKKKQQAMNAAVSPAGYNQRISMSVPLTVQQIKQQKNPSGSQQAAQSMARNNSGNAAALPNGKRTATAEGEEKAKPKRQRKTTKKAMGEGGSVAKKRTTKKQASNTTAAVPGGSAAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.24
4 0.23
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.19
9 0.24
10 0.24
11 0.29
12 0.31
13 0.33
14 0.38
15 0.41
16 0.44
17 0.45
18 0.45
19 0.44
20 0.41
21 0.4
22 0.34
23 0.31
24 0.28
25 0.23
26 0.22
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.16
31 0.2
32 0.2
33 0.23
34 0.23
35 0.26
36 0.26
37 0.26
38 0.27
39 0.23
40 0.2
41 0.17
42 0.14
43 0.11
44 0.13
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.18
50 0.21
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.25
55 0.31
56 0.37
57 0.37
58 0.39
59 0.48
60 0.56
61 0.59
62 0.6
63 0.62
64 0.64
65 0.71
66 0.75
67 0.73
68 0.69
69 0.72
70 0.67
71 0.59
72 0.51
73 0.41
74 0.37
75 0.3
76 0.25
77 0.18
78 0.16
79 0.19
80 0.24
81 0.3
82 0.34
83 0.38
84 0.42
85 0.45
86 0.54
87 0.6
88 0.64
89 0.63
90 0.62
91 0.66
92 0.66
93 0.67
94 0.58
95 0.48
96 0.43
97 0.37
98 0.29
99 0.22
100 0.19
101 0.19
102 0.28
103 0.33
104 0.34
105 0.36
106 0.4
107 0.43
108 0.46
109 0.44
110 0.38
111 0.33
112 0.29
113 0.36
114 0.36
115 0.35
116 0.35
117 0.31
118 0.3
119 0.29
120 0.28
121 0.21
122 0.21
123 0.23
124 0.27
125 0.35
126 0.39
127 0.43
128 0.5
129 0.56
130 0.59
131 0.61
132 0.62
133 0.62
134 0.59
135 0.59
136 0.53
137 0.49
138 0.42
139 0.36
140 0.29
141 0.23
142 0.22
143 0.21
144 0.19
145 0.17
146 0.17
147 0.19
148 0.17
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.18
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.17
196 0.16
197 0.16
198 0.18
199 0.19
200 0.2
201 0.22
202 0.21
203 0.16
204 0.21
205 0.24
206 0.24
207 0.28
208 0.27
209 0.26
210 0.29
211 0.33
212 0.31
213 0.29
214 0.31
215 0.34
216 0.39
217 0.43
218 0.47
219 0.46
220 0.51
221 0.58
222 0.6
223 0.57
224 0.57
225 0.59
226 0.56
227 0.59
228 0.57
229 0.49
230 0.47
231 0.47
232 0.43
233 0.36
234 0.31
235 0.24
236 0.18
237 0.16
238 0.12
239 0.08
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.12
245 0.15
246 0.17
247 0.18
248 0.22
249 0.28
250 0.3
251 0.3
252 0.28
253 0.26
254 0.27
255 0.27
256 0.24
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.21
266 0.21
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.22
271 0.2
272 0.19
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.2
282 0.23
283 0.31
284 0.39
285 0.41
286 0.46
287 0.48
288 0.52
289 0.54
290 0.55
291 0.54
292 0.53
293 0.56
294 0.54
295 0.53
296 0.51
297 0.47
298 0.48
299 0.41
300 0.35
301 0.27
302 0.27
303 0.25
304 0.23
305 0.21
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.17
317 0.16
318 0.21
319 0.21
320 0.21
321 0.19
322 0.19
323 0.17
324 0.11
325 0.11
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.08
332 0.1
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.18
337 0.24
338 0.31
339 0.35
340 0.36
341 0.34
342 0.34
343 0.33
344 0.3
345 0.26
346 0.2
347 0.14
348 0.11
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.16
356 0.19
357 0.17
358 0.21
359 0.24
360 0.26
361 0.29
362 0.31
363 0.39
364 0.38
365 0.42
366 0.39
367 0.4
368 0.42
369 0.41
370 0.4
371 0.32
372 0.31
373 0.26
374 0.28
375 0.3
376 0.26
377 0.21
378 0.2
379 0.18
380 0.18
381 0.18
382 0.15
383 0.08
384 0.07
385 0.13
386 0.13
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.15
391 0.15
392 0.15
393 0.12
394 0.11
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.07
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.05
457 0.05
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.02
462 0.02
463 0.02
464 0.02
465 0.02
466 0.02
467 0.02
468 0.04
469 0.06
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.13
474 0.14
475 0.18
476 0.18
477 0.17
478 0.24
479 0.25
480 0.28
481 0.3
482 0.34
483 0.4
484 0.45
485 0.51
486 0.51
487 0.6
488 0.6
489 0.62
490 0.67
491 0.68
492 0.7
493 0.75
494 0.75
495 0.73
496 0.79
497 0.77
498 0.74
499 0.66
500 0.57
501 0.46
502 0.4
503 0.31
504 0.23
505 0.22
506 0.15
507 0.14
508 0.14
509 0.16
510 0.17
511 0.18
512 0.2
513 0.17
514 0.18
515 0.18
516 0.19
517 0.21
518 0.22
519 0.22
520 0.25
521 0.32
522 0.35
523 0.42
524 0.49
525 0.52
526 0.55
527 0.58
528 0.59
529 0.59
530 0.56
531 0.52
532 0.47
533 0.43
534 0.41
535 0.38
536 0.34
537 0.31
538 0.32
539 0.33
540 0.3
541 0.27
542 0.27
543 0.27
544 0.24
545 0.18
546 0.17
547 0.16
548 0.21
549 0.22
550 0.23
551 0.25
552 0.24
553 0.24
554 0.25
555 0.29
556 0.26
557 0.28
558 0.28
559 0.28
560 0.32
561 0.34
562 0.36
563 0.37
564 0.42
565 0.49
566 0.55
567 0.63
568 0.7
569 0.79
570 0.85
571 0.89
572 0.92
573 0.92
574 0.91
575 0.87
576 0.84
577 0.76
578 0.67
579 0.6
580 0.56
581 0.52
582 0.45
583 0.4
584 0.37
585 0.39
586 0.43
587 0.51
588 0.54
589 0.58
590 0.67
591 0.76
592 0.82
593 0.85
594 0.85
595 0.77
596 0.69
597 0.61
598 0.51
599 0.4
600 0.29